MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 53168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004556	CAG	2	6	24001	24006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197963
502	NC_004556	AGTT	2	8	24015	24022	25 %	50 %	25 %	0 %	28197963
503	NC_004556	CTT	2	6	24024	24029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28197963
504	NC_004556	TG	3	6	24076	24081	0 %	50 %	50 %	0 %	28197963
505	NC_004556	GAC	2	6	24089	24094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197963
506	NC_004556	G	6	6	24113	24118	0 %	0 %	100 %	0 %	28197963
507	NC_004556	CAT	2	6	24160	24165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197963
508	NC_004556	GCG	2	6	24273	24278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28197963
509	NC_004556	TATG	2	8	24303	24310	25 %	50 %	25 %	0 %	28197963
510	NC_004556	AC	3	6	24315	24320	50 %	0 %	0 %	50 %	28197963
511	NC_004556	AAC	2	6	24329	24334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197963
512	NC_004556	GGC	2	6	24356	24361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28197963
513	NC_004556	TC	3	6	24375	24380	0 %	50 %	0 %	50 %	28197963
514	NC_004556	ACG	2	6	24411	24416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197963
515	NC_004556	GCAA	2	8	24440	24447	50 %	0 %	25 %	25 %	28197964
516	NC_004556	A	6	6	24446	24451	100 %	0 %	0 %	0 %	28197964
517	NC_004556	TATT	2	8	24492	24499	25 %	75 %	0 %	0 %	28197964
518	NC_004556	CAA	2	6	24550	24555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197964
519	NC_004556	GC	3	6	24616	24621	0 %	0 %	50 %	50 %	28197964
520	NC_004556	AGCGA	2	10	24629	24638	40 %	0 %	40 %	20 %	28197964
521	NC_004556	ACA	2	6	24651	24656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197964
522	NC_004556	AATGG	2	10	24659	24668	40 %	20 %	40 %	0 %	28197964
523	NC_004556	TCG	2	6	24709	24714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197964
524	NC_004556	GGC	2	6	24736	24741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28197964
525	NC_004556	GCC	2	6	24785	24790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197964
526	NC_004556	GAG	2	6	24895	24900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28197964
527	NC_004556	AATTG	2	10	24954	24963	40 %	40 %	20 %	0 %	28197965
528	NC_004556	CTG	2	6	24985	24990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197965
529	NC_004556	GTC	2	6	24991	24996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197965
530	NC_004556	GTC	2	6	25025	25030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197965
531	NC_004556	ACG	3	9	25039	25047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197965
532	NC_004556	GCC	2	6	25058	25063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197965
533	NC_004556	GGT	2	6	25120	25125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197965
534	NC_004556	ACA	2	6	25136	25141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197965
535	NC_004556	GTT	2	6	25150	25155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197965
536	NC_004556	TGG	2	6	25221	25226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197965
537	NC_004556	TCTG	2	8	25269	25276	0 %	50 %	25 %	25 %	28197965
538	NC_004556	ACAAT	2	10	25319	25328	60 %	20 %	0 %	20 %	28197965
539	NC_004556	GCC	2	6	25345	25350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197965
540	NC_004556	ATG	2	6	25372	25377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197965
541	NC_004556	CAG	2	6	25390	25395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197965
542	NC_004556	CACT	2	8	25467	25474	25 %	25 %	0 %	50 %	28197965
543	NC_004556	ATC	2	6	25537	25542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197965
544	NC_004556	GTGCA	2	10	25553	25562	20 %	20 %	40 %	20 %	28197965
545	NC_004556	TTA	2	6	25684	25689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197965
546	NC_004556	GAC	2	6	25773	25778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197965
547	NC_004556	AAC	2	6	25798	25803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197965
548	NC_004556	ACAG	2	8	25879	25886	50 %	0 %	25 %	25 %	28197966
549	NC_004556	TAC	2	6	25909	25914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197966
550	NC_004556	TGC	3	9	25915	25923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197966
551	NC_004556	ACG	2	6	25959	25964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197966
552	NC_004556	AGC	2	6	26027	26032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197966
553	NC_004556	GAG	2	6	26046	26051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28197966
554	NC_004556	TCA	2	6	26053	26058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197966
555	NC_004556	ATC	2	6	26156	26161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197966
556	NC_004556	AGC	2	6	26169	26174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197966
557	NC_004556	TTG	2	6	26186	26191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197966
558	NC_004556	CAT	2	6	26360	26365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197966
559	NC_004556	AGC	2	6	26373	26378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197966
560	NC_004556	ATG	2	6	26392	26397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197966
561	NC_004556	GC	3	6	26399	26404	0 %	0 %	50 %	50 %	28197966
562	NC_004556	TCA	2	6	26428	26433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197966
563	NC_004556	TTAA	2	8	26434	26441	50 %	50 %	0 %	0 %	28197966
564	NC_004556	TTC	2	6	26448	26453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_004556	A	7	7	26468	26474	100 %	0 %	0 %	0 %	28197967
566	NC_004556	CAA	2	6	26710	26715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197967
567	NC_004556	TAC	2	6	26806	26811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197967
568	NC_004556	GCC	2	6	26846	26851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197967
569	NC_004556	TGG	2	6	26887	26892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197967
570	NC_004556	CGT	2	6	26972	26977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197967
571	NC_004556	AAC	2	6	27026	27031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197967
572	NC_004556	TCCGTA	2	12	27033	27044	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28197967
573	NC_004556	TTC	2	6	27130	27135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28197967
574	NC_004556	GT	3	6	27194	27199	0 %	50 %	50 %	0 %	28197967
575	NC_004556	TTGA	2	8	27332	27339	25 %	50 %	25 %	0 %	28197967
576	NC_004556	TGG	2	6	27340	27345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197967
577	NC_004556	TTG	2	6	27369	27374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197967
578	NC_004556	GAA	2	6	27403	27408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197967
579	NC_004556	TGC	2	6	27475	27480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197967
580	NC_004556	ACC	2	6	27485	27490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28197967
581	NC_004556	TCA	2	6	27525	27530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197967
582	NC_004556	TAC	2	6	27602	27607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197967
583	NC_004556	TGAA	2	8	27672	27679	50 %	25 %	25 %	0 %	28197967
584	NC_004556	CAG	2	6	27686	27691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197967
585	NC_004556	TGCC	2	8	27739	27746	0 %	25 %	25 %	50 %	28197967
586	NC_004556	TGT	2	6	27754	27759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197967
587	NC_004556	CAG	2	6	27917	27922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197967
588	NC_004556	GCT	2	6	28045	28050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197967
589	NC_004556	TGG	2	6	28071	28076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197967
590	NC_004556	CAAC	2	8	28104	28111	50 %	0 %	0 %	50 %	28197967
591	NC_004556	TGCC	2	8	28149	28156	0 %	25 %	25 %	50 %	28197967
592	NC_004556	TGG	2	6	28202	28207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197967
593	NC_004556	GCGG	2	8	28252	28259	0 %	0 %	75 %	25 %	28197967
594	NC_004556	GCC	2	6	28274	28279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197967
595	NC_004556	AGCC	2	8	28297	28304	25 %	0 %	25 %	50 %	28197967
596	NC_004556	GGGAC	2	10	28349	28358	20 %	0 %	60 %	20 %	28197967
597	NC_004556	TACC	2	8	28396	28403	25 %	25 %	0 %	50 %	28197967
598	NC_004556	GTG	2	6	28431	28436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197967
599	NC_004556	GC	3	6	28470	28475	0 %	0 %	50 %	50 %	28197967
600	NC_004556	CCA	2	6	28539	28544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28197967
601	NC_004556	GCA	2	6	28603	28608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197967
602	NC_004556	ATTA	2	8	28610	28617	50 %	50 %	0 %	0 %	28197967
603	NC_004556	GTG	2	6	28623	28628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197967
604	NC_004556	TCCGCA	2	12	28662	28673	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	28197967
605	NC_004556	CAT	2	6	28678	28683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197967
606	NC_004556	CGC	2	6	28783	28788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197967
607	NC_004556	CAG	2	6	28790	28795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197967
608	NC_004556	GGT	2	6	28810	28815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197967
609	NC_004556	TAC	2	6	28946	28951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197967
610	NC_004556	CCG	2	6	28968	28973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197967
611	NC_004556	TGG	2	6	29013	29018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197967
612	NC_004556	GGC	2	6	29033	29038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28197967
613	NC_004556	GACC	2	8	29062	29069	25 %	0 %	25 %	50 %	28197967
614	NC_004556	GGC	2	6	29114	29119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28197967
615	NC_004556	GAT	2	6	29143	29148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197967
616	NC_004556	TGA	2	6	29229	29234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197967
617	NC_004556	CCAG	2	8	29313	29320	25 %	0 %	25 %	50 %	28197967
618	NC_004556	CTG	2	6	29357	29362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197967
619	NC_004556	GCGT	2	8	29518	29525	0 %	25 %	50 %	25 %	28197967
620	NC_004556	AGG	2	6	29550	29555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28197967
621	NC_004556	ACG	2	6	29588	29593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197967
622	NC_004556	TTG	2	6	29628	29633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197967
623	NC_004556	GAT	2	6	29749	29754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197967
624	NC_004556	GCG	2	6	29777	29782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28197967
625	NC_004556	TGG	2	6	29869	29874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197967
626	NC_004556	T	6	6	29891	29896	0 %	100 %	0 %	0 %	28197967
627	NC_004556	TGG	3	9	29908	29916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197967
628	NC_004556	GTG	3	9	29919	29927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197967
629	NC_004556	GGTGTG	2	12	29951	29962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197967
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