MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 53168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004556	GT	3	6	288990	288995	0 %	50 %	50 %	0 %	28198153
6002	NC_004556	TCTG	2	8	289010	289017	0 %	50 %	25 %	25 %	28198153
6003	NC_004556	ATG	2	6	289023	289028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198153
6004	NC_004556	GTG	2	6	289045	289050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198153
6005	NC_004556	GCG	2	6	289068	289073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198153
6006	NC_004556	GCA	2	6	289085	289090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198153
6007	NC_004556	GTC	2	6	289107	289112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198153
6008	NC_004556	AGG	2	6	289129	289134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198153
6009	NC_004556	TTGG	2	8	289139	289146	0 %	50 %	50 %	0 %	28198153
6010	NC_004556	GGA	2	6	289151	289156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198153
6011	NC_004556	GC	3	6	289230	289235	0 %	0 %	50 %	50 %	28198153
6012	NC_004556	GTAT	2	8	289267	289274	25 %	50 %	25 %	0 %	28198153
6013	NC_004556	ACG	2	6	289301	289306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198153
6014	NC_004556	TCT	2	6	289307	289312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198153
6015	NC_004556	GAGGG	2	10	289407	289416	20 %	0 %	80 %	0 %	28198153
6016	NC_004556	GCT	2	6	289551	289556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_004556	AGC	2	6	289573	289578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_004556	CAGC	2	8	289600	289607	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6019	NC_004556	TACG	2	8	289614	289621	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6020	NC_004556	GT	3	6	289647	289652	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_004556	TGA	2	6	289683	289688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_004556	ACGA	2	8	289689	289696	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6023	NC_004556	CTGG	2	8	289720	289727	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6024	NC_004556	CTG	2	6	289800	289805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198154
6025	NC_004556	CGA	2	6	289872	289877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198154
6026	NC_004556	GCG	2	6	289895	289900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198154
6027	NC_004556	GCCA	2	8	289909	289916	25 %	0 %	25 %	50 %	28198154
6028	NC_004556	CCAG	2	8	290025	290032	25 %	0 %	25 %	50 %	28198154
6029	NC_004556	GTT	2	6	290050	290055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198154
6030	NC_004556	GGTCC	2	10	290073	290082	0 %	20 %	40 %	40 %	28198154
6031	NC_004556	GGC	2	6	290178	290183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198154
6032	NC_004556	GTT	2	6	290313	290318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198154
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6034	NC_004556	T	6	6	290371	290376	0 %	100 %	0 %	0 %	28198154
6035	NC_004556	GCC	2	6	290413	290418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198154
6036	NC_004556	GT	3	6	290465	290470	0 %	50 %	50 %	0 %	28198154
6037	NC_004556	AGTTG	2	10	290478	290487	20 %	40 %	40 %	0 %	28198154
6038	NC_004556	TGG	2	6	290532	290537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198154
6039	NC_004556	GAT	2	6	290566	290571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198154
6040	NC_004556	CCG	2	6	290585	290590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198154
6041	NC_004556	TTC	2	6	290626	290631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198154
6042	NC_004556	GT	3	6	290652	290657	0 %	50 %	50 %	0 %	28198154
6043	NC_004556	CGCGTA	2	12	290667	290678	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	28198154
6044	NC_004556	TGGTGT	2	12	290707	290718	0 %	50 %	50 %	0 %	28198154
6045	NC_004556	CCG	2	6	290730	290735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198154
6046	NC_004556	GCTT	2	8	290804	290811	0 %	50 %	25 %	25 %	28198154
6047	NC_004556	GTA	2	6	290943	290948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198154
6048	NC_004556	GCGGCA	2	12	290963	290974	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	28198154
6049	NC_004556	TGG	2	6	291072	291077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198154
6050	NC_004556	TGG	2	6	291122	291127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_004556	TAC	2	6	291165	291170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_004556	TCA	2	6	291276	291281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198155
6053	NC_004556	GAT	2	6	291403	291408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198155
6054	NC_004556	TGA	2	6	291414	291419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198155
6055	NC_004556	GT	3	6	291434	291439	0 %	50 %	50 %	0 %	28198155
6056	NC_004556	CAG	2	6	291451	291456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198155
6057	NC_004556	GTA	2	6	291462	291467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198155
6058	NC_004556	CTT	2	6	291588	291593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198155
6059	NC_004556	TAG	2	6	291607	291612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198155
6060	NC_004556	CGA	2	6	291639	291644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198155
6061	NC_004556	GTT	2	6	291723	291728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198155
6062	NC_004556	GAT	2	6	291729	291734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198155
6063	NC_004556	GAA	3	9	291787	291795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198155
6064	NC_004556	TG	4	8	291834	291841	0 %	50 %	50 %	0 %	28198155
6065	NC_004556	TTG	2	6	291949	291954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198155
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6074	NC_004556	GT	3	6	292321	292326	0 %	50 %	50 %	0 %	28198155
6075	NC_004556	CTG	2	6	292444	292449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198156
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6078	NC_004556	TG	3	6	292513	292518	0 %	50 %	50 %	0 %	28198156
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6091	NC_004556	AGA	2	6	293117	293122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198157
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6099	NC_004556	CGCTT	2	10	293547	293556	0 %	40 %	20 %	40 %	28198158
6100	NC_004556	TGC	2	6	293565	293570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198158
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6104	NC_004556	CGA	2	6	293868	293873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_004556	CAT	2	6	293908	293913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77747636
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6107	NC_004556	TGG	2	6	293954	293959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77747636
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6109	NC_004556	ATG	2	6	294018	294023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77747636
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6111	NC_004556	GCC	2	6	294221	294226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77747636
6112	NC_004556	ATCAC	2	10	294327	294336	40 %	20 %	0 %	40 %	77747636
6113	NC_004556	CGA	2	6	294502	294507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77747636
6114	NC_004556	GC	3	6	294512	294517	0 %	0 %	50 %	50 %	77747636
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6116	NC_004556	TGC	2	6	294562	294567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77747636
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6122	NC_004556	GC	3	6	294974	294979	0 %	0 %	50 %	50 %	77747636
6123	NC_004556	GAT	2	6	294983	294988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77747636
6124	NC_004556	GTC	2	6	295058	295063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77747636
6125	NC_004556	CTG	2	6	295114	295119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77747636
6126	NC_004556	TTG	2	6	295127	295132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77747636
6127	NC_004556	TGGT	2	8	295161	295168	0 %	50 %	50 %	0 %	77747636
6128	NC_004556	TGA	2	6	295202	295207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77747636
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6132	NC_004556	GTAG	2	8	295323	295330	25 %	25 %	50 %	0 %	77747636
6133	NC_004556	GCT	2	6	295385	295390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6135	NC_004556	ATG	2	6	295435	295440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6137	NC_004556	TA	3	6	295574	295579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6153	NC_004556	TGA	2	6	296335	296340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198160
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6157	NC_004556	CGT	2	6	296620	296625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6159	NC_004556	CATTA	2	10	296723	296732	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6160	NC_004556	A	6	6	296746	296751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6161	NC_004556	TTA	2	6	296756	296761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6162	NC_004556	GTA	2	6	296811	296816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6163	NC_004556	GGTA	2	8	296876	296883	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6211	NC_004556	T	6	6	299353	299358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6212	NC_004556	T	6	6	299365	299370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6213	NC_004556	T	6	6	299409	299414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6215	NC_004556	ATT	2	6	299452	299457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6216	NC_004556	TTAAA	2	10	299463	299472	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6217	NC_004556	T	7	7	299504	299510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6221	NC_004556	CGT	2	6	299602	299607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6223	NC_004556	TGA	2	6	299661	299666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6224	NC_004556	GCAT	2	8	299687	299694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6225	NC_004556	CTTG	2	8	299878	299885	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6226	NC_004556	GTAT	2	8	299964	299971	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6227	NC_004556	GT	3	6	299987	299992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6228	NC_004556	GCT	3	9	300011	300019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6230	NC_004556	ATT	2	6	300134	300139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6231	NC_004556	GTT	2	6	300158	300163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6233	NC_004556	GCC	2	6	300316	300321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6234	NC_004556	AAG	2	6	300364	300369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6238	NC_004556	AGT	2	6	300483	300488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161484696
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6240	NC_004556	CTTGA	2	10	300517	300526	20 %	40 %	20 %	20 %	161484696
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6242	NC_004556	ATCC	2	8	300618	300625	25 %	25 %	0 %	50 %	161484696
6243	NC_004556	CGA	2	6	300684	300689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161484696
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6247	NC_004556	TCT	2	6	300864	300869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161484696
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6249	NC_004556	CGG	2	6	300989	300994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161484696
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6251	NC_004556	GGT	2	6	301096	301101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161484696
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6253	NC_004556	GGC	2	6	301321	301326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161484696
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6255	NC_004556	CGT	2	6	301386	301391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484696
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