MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 53168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004556	CGTG	2	8	242716	242723	0 %	25 %	50 %	25 %	28198120
5002	NC_004556	ATC	2	6	242797	242802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198121
5003	NC_004556	CGG	2	6	242831	242836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198121
5004	NC_004556	GAA	2	6	242838	242843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198121
5005	NC_004556	CGAT	2	8	242879	242886	25 %	25 %	25 %	25 %	28198121
5006	NC_004556	CCG	2	6	242913	242918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198121
5007	NC_004556	TGA	2	6	242934	242939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198121
5008	NC_004556	TGA	2	6	242988	242993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198121
5009	NC_004556	CAG	2	6	243115	243120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198121
5010	NC_004556	GTT	2	6	243121	243126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198121
5011	NC_004556	ATTGT	2	10	243562	243571	20 %	60 %	20 %	0 %	28198121
5012	NC_004556	TTG	2	6	243635	243640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198121
5013	NC_004556	GAG	2	6	243643	243648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198121
5014	NC_004556	GGC	2	6	243706	243711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198121
5015	NC_004556	TGA	2	6	243758	243763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198121
5016	NC_004556	CCG	2	6	243764	243769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198121
5017	NC_004556	TGC	2	6	243777	243782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198121
5018	NC_004556	AGC	2	6	243797	243802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198121
5019	NC_004556	GCC	2	6	243805	243810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198121
5020	NC_004556	GAG	2	6	243844	243849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198121
5021	NC_004556	TTG	2	6	243950	243955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198121
5022	NC_004556	AGG	2	6	244010	244015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198121
5023	NC_004556	TGC	2	6	244089	244094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198121
5024	NC_004556	GCT	2	6	244132	244137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198121
5025	NC_004556	TCG	2	6	244145	244150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198121
5026	NC_004556	TGC	2	6	244200	244205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198121
5027	NC_004556	AAC	2	6	244256	244261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_004556	GCA	2	6	244346	244351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198122
5029	NC_004556	GGCTGG	2	12	244415	244426	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	28198122
5030	NC_004556	GCT	2	6	244478	244483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198122
5031	NC_004556	CGC	2	6	244494	244499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198122
5032	NC_004556	AAG	2	6	244579	244584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198122
5033	NC_004556	CAA	2	6	244604	244609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28198122
5034	NC_004556	C	6	6	244656	244661	0 %	0 %	0 %	100 %	28198122
5035	NC_004556	ACC	2	6	244688	244693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198122
5036	NC_004556	GCTG	2	8	244700	244707	0 %	25 %	50 %	25 %	28198122
5037	NC_004556	GAA	2	6	244740	244745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198122
5038	NC_004556	AGC	3	9	244768	244776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198122
5039	NC_004556	GAG	2	6	244806	244811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198122
5040	NC_004556	GAA	3	9	244830	244838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198122
5041	NC_004556	AGA	2	6	244858	244863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198122
5042	NC_004556	GAG	2	6	244881	244886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198122
5043	NC_004556	GAG	2	6	244941	244946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198122
5044	NC_004556	CTG	2	6	244984	244989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198122
5045	NC_004556	TGG	2	6	245030	245035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198122
5046	NC_004556	GAT	2	6	245082	245087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198122
5047	NC_004556	GCT	2	6	245124	245129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198122
5048	NC_004556	AC	3	6	245152	245157	50 %	0 %	0 %	50 %	28198122
5049	NC_004556	AGG	2	6	245165	245170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198122
5050	NC_004556	GTG	2	6	245224	245229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198122
5051	NC_004556	GTG	2	6	245259	245264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198122
5052	NC_004556	GTG	2	6	245329	245334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198122
5053	NC_004556	GTT	2	6	245348	245353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198122
5054	NC_004556	AGC	2	6	245448	245453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198122
5055	NC_004556	TCG	2	6	245579	245584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198122
5056	NC_004556	TGG	2	6	245609	245614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198122
5057	NC_004556	CGC	2	6	245690	245695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198122
5058	NC_004556	GC	5	10	245708	245717	0 %	0 %	50 %	50 %	28198122
5059	NC_004556	TGC	2	6	245753	245758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198122
5060	NC_004556	GAT	2	6	245760	245765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198122
5061	NC_004556	AGG	2	6	245785	245790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198122
5062	NC_004556	ACA	2	6	245795	245800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28198122
5063	NC_004556	GGC	2	6	245807	245812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198122
5064	NC_004556	CTG	2	6	245857	245862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198122
5065	NC_004556	A	6	6	245876	245881	100 %	0 %	0 %	0 %	28198122
5066	NC_004556	GTT	2	6	245885	245890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198122
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5069	NC_004556	GTT	2	6	245975	245980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198122
5070	NC_004556	GCA	2	6	246104	246109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198122
5071	NC_004556	GTGC	2	8	246162	246169	0 %	25 %	50 %	25 %	28198122
5072	NC_004556	ACCA	2	8	246190	246197	50 %	0 %	0 %	50 %	28198122
5073	NC_004556	TGC	2	6	246200	246205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198122
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5080	NC_004556	TGTTGG	2	12	246515	246526	0 %	50 %	50 %	0 %	28198122
5081	NC_004556	GAG	2	6	246723	246728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198122
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5085	NC_004556	ACGT	2	8	247007	247014	25 %	25 %	25 %	25 %	28198122
5086	NC_004556	TGT	2	6	247053	247058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_004556	TTTC	2	8	247103	247110	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5088	NC_004556	AAAAT	2	10	247112	247121	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_004556	CCG	2	6	247176	247181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198123
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5092	NC_004556	ATT	2	6	247452	247457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28198123
5093	NC_004556	ACC	2	6	247470	247475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198123
5094	NC_004556	GTTC	2	8	247570	247577	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5095	NC_004556	CTT	2	6	247593	247598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198124
5096	NC_004556	TCG	2	6	247620	247625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198124
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5099	NC_004556	G	7	7	247716	247722	0 %	0 %	100 %	0 %	28198124
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5102	NC_004556	ACG	2	6	247823	247828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198124
5103	NC_004556	CAC	2	6	247845	247850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198124
5104	NC_004556	GAC	3	9	247851	247859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198124
5105	NC_004556	GAT	2	6	247861	247866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198124
5106	NC_004556	TTAC	2	8	247882	247889	25 %	50 %	0 %	25 %	28198124
5107	NC_004556	ATTG	2	8	247941	247948	25 %	50 %	25 %	0 %	28198124
5108	NC_004556	G	6	6	247992	247997	0 %	0 %	100 %	0 %	28198124
5109	NC_004556	GTG	2	6	248024	248029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198124
5110	NC_004556	TGAGGT	2	12	248052	248063	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	28198124
5111	NC_004556	T	7	7	248081	248087	0 %	100 %	0 %	0 %	28198124
5112	NC_004556	CGC	2	6	248093	248098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198124
5113	NC_004556	AT	3	6	248133	248138	50 %	50 %	0 %	0 %	28198124
5114	NC_004556	GCG	2	6	248177	248182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198124
5115	NC_004556	CGT	2	6	248203	248208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198124
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5117	NC_004556	GCTT	2	8	248359	248366	0 %	50 %	25 %	25 %	28198124
5118	NC_004556	TTG	2	6	248473	248478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198124
5119	NC_004556	T	6	6	248513	248518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_004556	GGT	2	6	248623	248628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_004556	TCGA	2	8	248687	248694	25 %	25 %	25 %	25 %	28198125
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5123	NC_004556	CAT	2	6	248822	248827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198125
5124	NC_004556	CGT	2	6	248861	248866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198125
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5127	NC_004556	GTT	2	6	248911	248916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198125
5128	NC_004556	TTCGCC	2	12	248949	248960	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5129	NC_004556	CAT	2	6	249076	249081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198126
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5249	NC_004556	GCA	2	6	255071	255076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198129
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5370	NC_004556	GTT	2	6	260891	260896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198132
5371	NC_004556	TTA	2	6	260909	260914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28198132
5372	NC_004556	GCG	2	6	260929	260934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198132
5373	NC_004556	CGT	2	6	260943	260948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198132
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