MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 53168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004556	GTTG	2	8	219759	219766	0 %	50 %	50 %	0 %	28198104
4502	NC_004556	TGC	3	9	219801	219809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198104
4503	NC_004556	CGA	2	6	219818	219823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198104
4504	NC_004556	CAG	2	6	219839	219844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198104
4505	NC_004556	AAG	2	6	219859	219864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198104
4506	NC_004556	TGG	2	6	219933	219938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198104
4507	NC_004556	GACG	2	8	219960	219967	25 %	0 %	50 %	25 %	28198104
4508	NC_004556	TTC	2	6	219973	219978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198104
4509	NC_004556	GAT	2	6	219988	219993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198104
4510	NC_004556	GATG	2	8	220170	220177	25 %	25 %	50 %	0 %	28198104
4511	NC_004556	ATTG	2	8	220236	220243	25 %	50 %	25 %	0 %	28198104
4512	NC_004556	CAA	2	6	220248	220253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28198104
4513	NC_004556	TGC	2	6	220380	220385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198104
4514	NC_004556	TTG	2	6	220403	220408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198104
4515	NC_004556	TGCG	2	8	220421	220428	0 %	25 %	50 %	25 %	28198104
4516	NC_004556	AG	3	6	220450	220455	50 %	0 %	50 %	0 %	28198104
4517	NC_004556	TTC	2	6	220459	220464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198104
4518	NC_004556	TGC	2	6	220579	220584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198105
4519	NC_004556	TCA	2	6	220732	220737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198105
4520	NC_004556	TTA	2	6	220779	220784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28198105
4521	NC_004556	TG	3	6	220830	220835	0 %	50 %	50 %	0 %	28198105
4522	NC_004556	GTG	3	9	220833	220841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198105
4523	NC_004556	CTC	2	6	220852	220857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28198105
4524	NC_004556	CAG	2	6	220896	220901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198105
4525	NC_004556	GGT	2	6	220904	220909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198105
4526	NC_004556	TTG	2	6	220954	220959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198105
4527	NC_004556	CCA	2	6	220970	220975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198105
4528	NC_004556	A	6	6	220981	220986	100 %	0 %	0 %	0 %	28198105
4529	NC_004556	GCA	2	6	221067	221072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198105
4530	NC_004556	GTG	3	9	221082	221090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198105
4531	NC_004556	CCCAAG	2	12	221094	221105	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	28198105
4532	NC_004556	ATCA	2	8	221144	221151	50 %	25 %	0 %	25 %	28198105
4533	NC_004556	GCA	3	9	221251	221259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_004556	GGTT	2	8	221271	221278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_004556	T	6	6	221287	221292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_004556	TGG	2	6	221379	221384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_004556	TCG	2	6	221407	221412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_004556	CAT	2	6	221442	221447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_004556	TTGA	2	8	221449	221456	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_004556	GTT	2	6	221540	221545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_004556	TC	3	6	221565	221570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4542	NC_004556	TGA	2	6	221673	221678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_004556	GAAGG	2	10	221719	221728	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_004556	CTAT	2	8	221777	221784	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4545	NC_004556	GTTG	2	8	221887	221894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_004556	TCT	2	6	221930	221935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_004556	TGG	2	6	221964	221969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_004556	T	7	7	221993	221999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_004556	GTAG	2	8	222027	222034	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_004556	TTA	2	6	222098	222103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_004556	TAT	2	6	222116	222121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_004556	ATA	2	6	222124	222129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_004556	TCA	2	6	222164	222169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_004556	AAC	2	6	222199	222204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28198106
4555	NC_004556	TGA	2	6	222363	222368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198106
4556	NC_004556	TCT	2	6	222419	222424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198106
4557	NC_004556	AACA	2	8	222454	222461	75 %	0 %	0 %	25 %	28198106
4558	NC_004556	TCA	2	6	222496	222501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198106
4559	NC_004556	TCG	2	6	222508	222513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198106
4560	NC_004556	GCT	2	6	222539	222544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198106
4561	NC_004556	TG	3	6	222578	222583	0 %	50 %	50 %	0 %	28198106
4562	NC_004556	ATCT	2	8	222606	222613	25 %	50 %	0 %	25 %	28198106
4563	NC_004556	GAA	2	6	222646	222651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198106
4564	NC_004556	GAT	2	6	222661	222666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198106
4565	NC_004556	AAT	2	6	222687	222692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28198106
4566	NC_004556	AGT	2	6	222710	222715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_004556	TTG	2	6	222763	222768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_004556	AT	3	6	222776	222781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_004556	TTG	2	6	222865	222870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_004556	GCC	2	6	222911	222916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4571	NC_004556	GTAAA	2	10	222949	222958	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_004556	TGT	2	6	222997	223002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_004556	CTTC	2	8	223017	223024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4574	NC_004556	CGTA	2	8	223074	223081	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4575	NC_004556	GTG	2	6	223169	223174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_004556	AGG	2	6	223181	223186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_004556	ACG	2	6	223214	223219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_004556	ATA	3	9	223262	223270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_004556	CTT	2	6	223324	223329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_004556	TGT	2	6	223385	223390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_004556	GT	3	6	223402	223407	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_004556	CTA	2	6	223453	223458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_004556	ATCA	2	8	223468	223475	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4584	NC_004556	TTA	2	6	223557	223562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_004556	TCT	2	6	223674	223679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_004556	AGT	2	6	223697	223702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_004556	CT	3	6	223707	223712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4588	NC_004556	TGA	2	6	223742	223747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_004556	AAT	2	6	223770	223775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_004556	CAC	2	6	223834	223839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4591	NC_004556	TGT	2	6	223882	223887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_004556	GAG	2	6	223960	223965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_004556	GT	3	6	223982	223987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_004556	TGA	2	6	224041	224046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_004556	GT	4	8	224054	224061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_004556	ATTT	2	8	224088	224095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_004556	TGGA	2	8	224098	224105	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_004556	TGA	2	6	224159	224164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_004556	AAAT	2	8	224177	224184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_004556	TG	3	6	224199	224204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_004556	GAGT	2	8	224206	224213	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_004556	CGACAT	2	12	224251	224262	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_004556	GTT	2	6	224328	224333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_004556	GA	3	6	224334	224339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_004556	GA	3	6	224388	224393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_004556	ATG	2	6	224396	224401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_004556	TCT	2	6	224449	224454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_004556	GTT	2	6	224527	224532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_004556	GC	3	6	224670	224675	0 %	0 %	50 %	50 %	28198107
4610	NC_004556	TTG	2	6	224755	224760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198107
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4612	NC_004556	TTG	2	6	224839	224844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198107
4613	NC_004556	GTT	2	6	224901	224906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198107
4614	NC_004556	GAG	2	6	224932	224937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198107
4615	NC_004556	TGG	2	6	224957	224962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198107
4616	NC_004556	TTG	2	6	225083	225088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198107
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4618	NC_004556	TGACA	2	10	225144	225153	40 %	20 %	20 %	20 %	28198107
4619	NC_004556	TGA	2	6	225225	225230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198107
4620	NC_004556	GGCGA	2	10	225286	225295	20 %	0 %	60 %	20 %	28198107
4621	NC_004556	GCA	2	6	225324	225329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198107
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4623	NC_004556	ATC	2	6	225428	225433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198107
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4629	NC_004556	GGT	2	6	225547	225552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198107
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4754	NC_004556	AGG	2	6	231963	231968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198112
4755	NC_004556	GGTG	2	8	232039	232046	0 %	25 %	75 %	0 %	28198112
4756	NC_004556	TTGG	2	8	232090	232097	0 %	50 %	50 %	0 %	28198112
4757	NC_004556	TGGG	2	8	232104	232111	0 %	25 %	75 %	0 %	28198112
4758	NC_004556	GAG	2	6	232211	232216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198112
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4762	NC_004556	GTG	2	6	232425	232430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198112
4763	NC_004556	GAC	2	6	232447	232452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198112
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4766	NC_004556	CTG	2	6	232551	232556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198112
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4769	NC_004556	TGA	2	6	232726	232731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198112
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4772	NC_004556	GAAG	2	8	232924	232931	50 %	0 %	50 %	0 %	28198112
4773	NC_004556	A	6	6	232969	232974	100 %	0 %	0 %	0 %	28198112
4774	NC_004556	ACC	2	6	232982	232987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198112
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4778	NC_004556	TCTT	2	8	233135	233142	0 %	75 %	0 %	25 %	28198112
4779	NC_004556	GTCG	2	8	233290	233297	0 %	25 %	50 %	25 %	28198112
4780	NC_004556	GAG	2	6	233342	233347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198112
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4782	NC_004556	CT	3	6	233552	233557	0 %	50 %	0 %	50 %	28198112
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4784	NC_004556	AAC	2	6	233616	233621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4804	NC_004556	GTT	2	6	234705	234710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4874	NC_004556	GT	3	6	237889	237894	0 %	50 %	50 %	0 %	28198117
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