MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 plasmid pXAC64

Total Repeats: 1326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003922	TCA	2	6	23377	23382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264251
502	NC_003922	CCG	2	6	23397	23402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264251
503	NC_003922	TGA	2	6	23441	23446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21264251
504	NC_003922	TTC	2	6	23623	23628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21264252
505	NC_003922	CGGGT	2	10	23629	23638	0 %	20 %	60 %	20 %	21264252
506	NC_003922	TCA	2	6	23640	23645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264252
507	NC_003922	TGG	2	6	23683	23688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21264252
508	NC_003922	GATTCG	2	12	23720	23731	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	21264252
509	NC_003922	GGT	2	6	23741	23746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21264252
510	NC_003922	TGC	2	6	23777	23782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264252
511	NC_003922	CTT	2	6	23803	23808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21264252
512	NC_003922	GCC	2	6	23948	23953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264252
513	NC_003922	GTCAG	2	10	23987	23996	20 %	20 %	40 %	20 %	21264252
514	NC_003922	CAG	2	6	24020	24025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_003922	ATG	2	6	24046	24051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_003922	TG	3	6	24050	24055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_003922	AGC	2	6	24357	24362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264253
518	NC_003922	CGC	2	6	24399	24404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264253
519	NC_003922	CCGA	2	8	24523	24530	25 %	0 %	25 %	50 %	21264253
520	NC_003922	GC	3	6	24577	24582	0 %	0 %	50 %	50 %	21264253
521	NC_003922	TGC	2	6	24598	24603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264253
522	NC_003922	AAG	2	6	24618	24623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21264253
523	NC_003922	GCCG	2	8	24677	24684	0 %	0 %	50 %	50 %	21264253
524	NC_003922	GCTG	2	8	24710	24717	0 %	25 %	50 %	25 %	21264253
525	NC_003922	GGA	2	6	24737	24742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21264253
526	NC_003922	ACC	2	6	24758	24763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264254
527	NC_003922	CGA	2	6	24806	24811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264254
528	NC_003922	GCT	2	6	24874	24879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264254
529	NC_003922	CGC	2	6	24896	24901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264254
530	NC_003922	AGG	2	6	24911	24916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21264254
531	NC_003922	CCG	2	6	24982	24987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_003922	GC	3	6	25092	25097	0 %	0 %	50 %	50 %	21264255
533	NC_003922	CG	3	6	25098	25103	0 %	0 %	50 %	50 %	21264255
534	NC_003922	CAG	2	6	25244	25249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264255
535	NC_003922	T	6	6	25431	25436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_003922	CAC	2	6	25506	25511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_003922	GGA	2	6	25686	25691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21264256
538	NC_003922	CAA	2	6	25734	25739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21264256
539	NC_003922	GC	3	6	25747	25752	0 %	0 %	50 %	50 %	21264256
540	NC_003922	GCT	2	6	25818	25823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264256
541	NC_003922	TAC	2	6	25924	25929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264256
542	NC_003922	TCG	2	6	25991	25996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_003922	GTC	2	6	26011	26016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_003922	TGCC	2	8	26036	26043	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
545	NC_003922	CCGCA	2	10	26048	26057	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
546	NC_003922	CCG	3	9	26063	26071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_003922	AGC	2	6	26078	26083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_003922	A	6	6	26099	26104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_003922	C	6	6	26153	26158	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
550	NC_003922	CG	4	8	26361	26368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
551	NC_003922	GC	3	6	26399	26404	0 %	0 %	50 %	50 %	21264257
552	NC_003922	TCG	2	6	26420	26425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264257
553	NC_003922	TCA	2	6	26471	26476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264257
554	NC_003922	GAA	2	6	26493	26498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21264257
555	NC_003922	CGA	2	6	26519	26524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264257
556	NC_003922	ACC	2	6	26608	26613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264257
557	NC_003922	CGA	2	6	26656	26661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264257
558	NC_003922	GCT	2	6	26724	26729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264257
559	NC_003922	CGC	2	6	26746	26751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264257
560	NC_003922	GGCT	2	8	26836	26843	0 %	25 %	50 %	25 %	21264258
561	NC_003922	TCG	2	6	26933	26938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264258
562	NC_003922	GC	3	6	27017	27022	0 %	0 %	50 %	50 %	21264258
563	NC_003922	CGC	2	6	27028	27033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264258
564	NC_003922	CGC	2	6	27109	27114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264258
565	NC_003922	GCC	2	6	27147	27152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264258
566	NC_003922	GTCG	2	8	27234	27241	0 %	25 %	50 %	25 %	21264258
567	NC_003922	TCG	2	6	27259	27264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264258
568	NC_003922	TCG	2	6	27363	27368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264258
569	NC_003922	TCG	2	6	27370	27375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264258
570	NC_003922	GTT	2	6	27384	27389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21264258
571	NC_003922	CGC	2	6	27443	27448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264258
572	NC_003922	GTG	2	6	27471	27476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21264258
573	NC_003922	AAC	2	6	27529	27534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21264258
574	NC_003922	CTG	2	6	27559	27564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264258
575	NC_003922	CG	3	6	27589	27594	0 %	0 %	50 %	50 %	21264258
576	NC_003922	ATG	2	6	27667	27672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21264258
577	NC_003922	CGA	2	6	27833	27838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264258
578	NC_003922	CGA	2	6	27852	27857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264258
579	NC_003922	TCGT	2	8	27925	27932	0 %	50 %	25 %	25 %	21264258
580	NC_003922	GCCG	2	8	27933	27940	0 %	0 %	50 %	50 %	21264258
581	NC_003922	CGA	2	6	27941	27946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264258
582	NC_003922	GCT	2	6	28043	28048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264258
583	NC_003922	GCGA	2	8	28099	28106	25 %	0 %	50 %	25 %	21264258
584	NC_003922	AGC	2	6	28118	28123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264258
585	NC_003922	G	7	7	28155	28161	0 %	0 %	100 %	0 %	21264258
586	NC_003922	GGC	2	6	28171	28176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264258
587	NC_003922	GCC	2	6	28181	28186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264258
588	NC_003922	GGT	2	6	28212	28217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21264258
589	NC_003922	CAA	2	6	28390	28395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21264259
590	NC_003922	ATT	2	6	28413	28418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21264259
591	NC_003922	CGG	2	6	28422	28427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264259
592	NC_003922	CGA	2	6	28429	28434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
593	NC_003922	CTA	2	6	28435	28440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264259
594	NC_003922	CAAGGC	2	12	28466	28477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
595	NC_003922	GCTTG	2	10	28486	28495	0 %	40 %	40 %	20 %	21264259
596	NC_003922	GCT	2	6	28528	28533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264259
597	NC_003922	CGGC	2	8	28537	28544	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
598	NC_003922	GAC	2	6	28567	28572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
599	NC_003922	CGAC	2	8	28581	28588	25 %	0 %	25 %	50 %	21264259
600	NC_003922	AAG	2	6	28592	28597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21264259
601	NC_003922	TTG	2	6	28653	28658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21264259
602	NC_003922	CG	3	6	28701	28706	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
603	NC_003922	GAA	2	6	28741	28746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21264259
604	NC_003922	GC	3	6	28870	28875	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
605	NC_003922	GC	3	6	28888	28893	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
606	NC_003922	GCA	2	6	28921	28926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
607	NC_003922	A	6	6	29208	29213	100 %	0 %	0 %	0 %	21264259
608	NC_003922	AGGC	2	8	29271	29278	25 %	0 %	50 %	25 %	21264259
609	NC_003922	CGG	2	6	29287	29292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264259
610	NC_003922	CGA	2	6	29334	29339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
611	NC_003922	GC	3	6	29348	29353	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
612	NC_003922	CGT	2	6	29371	29376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264259
613	NC_003922	ACC	2	6	29391	29396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264259
614	NC_003922	CACCGC	2	12	29434	29445	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	21264259
615	NC_003922	TCG	2	6	29505	29510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264259
616	NC_003922	TCG	2	6	29579	29584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264259
617	NC_003922	GCA	2	6	29638	29643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
618	NC_003922	CAG	2	6	29682	29687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
619	NC_003922	CGG	2	6	29781	29786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264259
620	NC_003922	CCG	2	6	29787	29792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264259
621	NC_003922	TCG	2	6	29874	29879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264259
622	NC_003922	TCA	2	6	29937	29942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264259
623	NC_003922	TACCG	2	10	29969	29978	20 %	20 %	20 %	40 %	21264259
624	NC_003922	ATC	2	6	30092	30097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264259
625	NC_003922	CGT	2	6	30115	30120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264259
626	NC_003922	CAG	2	6	30242	30247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
627	NC_003922	TCGC	2	8	30347	30354	0 %	25 %	25 %	50 %	21264259
628	NC_003922	CCGA	2	8	30386	30393	25 %	0 %	25 %	50 %	21264259
629	NC_003922	CGC	2	6	30482	30487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264259
630	NC_003922	ACC	3	9	30725	30733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264259
631	NC_003922	ACC	2	6	30771	30776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264259
632	NC_003922	GC	3	6	30781	30786	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
633	NC_003922	CGG	2	6	30880	30885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264259
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650	NC_003922	GCA	2	6	31569	31574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264260
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652	NC_003922	GCA	2	6	31605	31610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264260
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744	NC_003922	GCC	2	6	35779	35784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264266
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749	NC_003922	TGCGT	2	10	35905	35914	0 %	40 %	40 %	20 %	21264266
750	NC_003922	GCC	2	6	35947	35952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264266
751	NC_003922	CCG	2	6	36046	36051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264266
752	NC_003922	GCA	2	6	36094	36099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264266
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755	NC_003922	CCA	2	6	36137	36142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264266
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757	NC_003922	TCC	2	6	36190	36195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21264266
758	NC_003922	TTGT	2	8	36202	36209	0 %	75 %	25 %	0 %	21264266
759	NC_003922	GC	3	6	36260	36265	0 %	0 %	50 %	50 %	21264267
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761	NC_003922	TCGCG	2	10	36362	36371	0 %	20 %	40 %	40 %	21264267
762	NC_003922	CAT	2	6	36462	36467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264267
763	NC_003922	CGC	2	6	36631	36636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264267
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