MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 127074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003919	GCAC	2	8	41254	41261	25 %	0 %	25 %	50 %	21240807
1002	NC_003919	CG	3	6	41270	41275	0 %	0 %	50 %	50 %	21240807
1003	NC_003919	CGC	2	6	41303	41308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240807
1004	NC_003919	CCA	2	6	41342	41347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240807
1005	NC_003919	CGA	2	6	41363	41368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240807
1006	NC_003919	GC	3	6	41381	41386	0 %	0 %	50 %	50 %	21240807
1007	NC_003919	GAT	2	6	41424	41429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240807
1008	NC_003919	GCG	2	6	41463	41468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240807
1009	NC_003919	GCAG	2	8	41582	41589	25 %	0 %	50 %	25 %	21240807
1010	NC_003919	CG	4	8	41606	41613	0 %	0 %	50 %	50 %	21240807
1011	NC_003919	GAT	2	6	41625	41630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240807
1012	NC_003919	CGCAG	2	10	41642	41651	20 %	0 %	40 %	40 %	21240807
1013	NC_003919	GGT	2	6	41666	41671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240807
1014	NC_003919	CAG	2	6	41691	41696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240807
1015	NC_003919	CAG	3	9	41739	41747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240807
1016	NC_003919	CACCG	2	10	41751	41760	20 %	0 %	20 %	60 %	21240807
1017	NC_003919	GC	4	8	41761	41768	0 %	0 %	50 %	50 %	21240807
1018	NC_003919	CCT	2	6	41780	41785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21240807
1019	NC_003919	CTT	2	6	41816	41821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240807
1020	NC_003919	CAG	2	6	41877	41882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240807
1021	NC_003919	GCTG	2	8	41897	41904	0 %	25 %	50 %	25 %	21240807
1022	NC_003919	GGT	2	6	41982	41987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240807
1023	NC_003919	CGG	2	6	42024	42029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240807
1024	NC_003919	AGT	2	6	42059	42064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240807
1025	NC_003919	GGC	2	6	42083	42088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240807
1026	NC_003919	GTC	2	6	42108	42113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240807
1027	NC_003919	GCA	2	6	42158	42163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240807
1028	NC_003919	CTC	2	6	42234	42239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21240807
1029	NC_003919	CTG	2	6	42285	42290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240807
1030	NC_003919	GC	4	8	42310	42317	0 %	0 %	50 %	50 %	21240807
1031	NC_003919	CGC	2	6	42356	42361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240807
1032	NC_003919	CAT	2	6	42378	42383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240807
1033	NC_003919	CGGC	2	8	42422	42429	0 %	0 %	50 %	50 %	21240807
1034	NC_003919	CCA	2	6	42455	42460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240807
1035	NC_003919	GC	3	6	42489	42494	0 %	0 %	50 %	50 %	21240807
1036	NC_003919	CGA	2	6	42548	42553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240807
1037	NC_003919	GCCG	2	8	42555	42562	0 %	0 %	50 %	50 %	21240807
1038	NC_003919	CGG	2	6	42648	42653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240807
1039	NC_003919	GCA	2	6	42674	42679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240807
1040	NC_003919	TGT	2	6	42713	42718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240807
1041	NC_003919	TGC	2	6	42800	42805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240807
1042	NC_003919	GC	3	6	42804	42809	0 %	0 %	50 %	50 %	21240807
1043	NC_003919	AGC	2	6	42862	42867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240807
1044	NC_003919	TGG	2	6	42905	42910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240807
1045	NC_003919	TGG	2	6	42919	42924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240807
1046	NC_003919	GGA	2	6	42939	42944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21240807
1047	NC_003919	CGCTG	2	10	42950	42959	0 %	20 %	40 %	40 %	21240807
1048	NC_003919	GCA	2	6	42992	42997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240807
1049	NC_003919	GTG	2	6	43033	43038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240807
1050	NC_003919	GC	3	6	43075	43080	0 %	0 %	50 %	50 %	21240807
1051	NC_003919	CAC	2	6	43209	43214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240807
1052	NC_003919	GCA	2	6	43279	43284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240807
1053	NC_003919	ACACC	2	10	43307	43316	40 %	0 %	0 %	60 %	21240807
1054	NC_003919	CG	3	6	43352	43357	0 %	0 %	50 %	50 %	21240807
1055	NC_003919	CAG	2	6	43392	43397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240807
1056	NC_003919	CGG	2	6	43424	43429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240807
1057	NC_003919	CCG	2	6	43435	43440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240807
1058	NC_003919	CCA	2	6	43478	43483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240807
1059	NC_003919	GC	3	6	43484	43489	0 %	0 %	50 %	50 %	21240807
1060	NC_003919	GTC	2	6	43500	43505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240807
1061	NC_003919	TCG	2	6	43543	43548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240807
1062	NC_003919	TGT	2	6	43556	43561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240807
1063	NC_003919	CGT	3	9	43568	43576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240807
1064	NC_003919	G	6	6	43595	43600	0 %	0 %	100 %	0 %	21240807
1065	NC_003919	GCG	2	6	43631	43636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_003919	ACG	2	6	43637	43642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_003919	GAT	2	6	43683	43688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_003919	TGG	2	6	43881	43886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240808
1069	NC_003919	CCA	2	6	43974	43979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240808
1070	NC_003919	CGG	2	6	44014	44019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240808
1071	NC_003919	GCAG	2	8	44119	44126	25 %	0 %	50 %	25 %	21240808
1072	NC_003919	GC	3	6	44180	44185	0 %	0 %	50 %	50 %	21240808
1073	NC_003919	TGC	2	6	44291	44296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_003919	CAA	2	6	44300	44305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_003919	TTC	2	6	44350	44355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_003919	GCC	2	6	44370	44375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_003919	CCG	2	6	44380	44385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_003919	CGG	2	6	44395	44400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_003919	GCC	2	6	44427	44432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_003919	CG	3	6	44471	44476	0 %	0 %	50 %	50 %	21240809
1081	NC_003919	GCC	2	6	44521	44526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240809
1082	NC_003919	TGCCGA	2	12	44576	44587	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	21240809
1083	NC_003919	CCG	2	6	44619	44624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240809
1084	NC_003919	GCG	3	9	44690	44698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240809
1085	NC_003919	CGTG	2	8	44732	44739	0 %	25 %	50 %	25 %	21240809
1086	NC_003919	GCG	3	9	44792	44800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240809
1087	NC_003919	CTG	3	9	44814	44822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240809
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1089	NC_003919	CG	3	6	44906	44911	0 %	0 %	50 %	50 %	21240809
1090	NC_003919	TCGT	2	8	44918	44925	0 %	50 %	25 %	25 %	21240809
1091	NC_003919	CG	4	8	44976	44983	0 %	0 %	50 %	50 %	21240809
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1094	NC_003919	CAG	2	6	45066	45071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240809
1095	NC_003919	CGA	3	9	45101	45109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240809
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1097	NC_003919	AGC	2	6	45258	45263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240809
1098	NC_003919	CG	3	6	45267	45272	0 %	0 %	50 %	50 %	21240809
1099	NC_003919	GT	3	6	45336	45341	0 %	50 %	50 %	0 %	21240809
1100	NC_003919	CAG	2	6	45565	45570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_003919	GCT	2	6	45583	45588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_003919	CGC	2	6	45608	45613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_003919	CGG	2	6	45619	45624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_003919	CGCC	2	8	45629	45636	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1105	NC_003919	GTCA	2	8	45657	45664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_003919	CAA	2	6	45722	45727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_003919	TGT	2	6	45754	45759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240810
1108	NC_003919	CGC	3	9	45787	45795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240810
1109	NC_003919	GGT	2	6	45836	45841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240810
1110	NC_003919	GC	3	6	45852	45857	0 %	0 %	50 %	50 %	21240810
1111	NC_003919	CGC	2	6	45859	45864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240810
1112	NC_003919	GACG	2	8	45865	45872	25 %	0 %	50 %	25 %	21240810
1113	NC_003919	CG	3	6	45898	45903	0 %	0 %	50 %	50 %	21240810
1114	NC_003919	GCC	2	6	45927	45932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240810
1115	NC_003919	CAC	2	6	45943	45948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240810
1116	NC_003919	ACA	2	6	46030	46035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240810
1117	NC_003919	GCAGCG	2	12	46038	46049	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	21240810
1118	NC_003919	ATC	2	6	46068	46073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240810
1119	NC_003919	TGC	2	6	46136	46141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_003919	CGC	2	6	46167	46172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_003919	GGC	2	6	46178	46183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_003919	GC	3	6	46192	46197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_003919	GC	3	6	46260	46265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_003919	ACG	2	6	46410	46415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240811
1125	NC_003919	TTC	2	6	46418	46423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240811
1126	NC_003919	GC	3	6	46442	46447	0 %	0 %	50 %	50 %	21240811
1127	NC_003919	CTG	2	6	46469	46474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240811
1128	NC_003919	CG	3	6	46540	46545	0 %	0 %	50 %	50 %	21240811
1129	NC_003919	TCA	2	6	46600	46605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240811
1130	NC_003919	CGA	2	6	46634	46639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240811
1131	NC_003919	GCGCA	2	10	46647	46656	20 %	0 %	40 %	40 %	21240811
1132	NC_003919	ACG	2	6	46678	46683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240811
1133	NC_003919	GC	3	6	46692	46697	0 %	0 %	50 %	50 %	21240811
1134	NC_003919	ATC	2	6	46698	46703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240811
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1137	NC_003919	TGC	2	6	46849	46854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240811
1138	NC_003919	GGA	2	6	46901	46906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21240811
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1141	NC_003919	TGC	2	6	46991	46996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240811
1142	NC_003919	CGGCG	2	10	47024	47033	0 %	0 %	60 %	40 %	21240811
1143	NC_003919	CGC	2	6	47055	47060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240811
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1150	NC_003919	GCT	2	6	47438	47443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240811
1151	NC_003919	CG	3	6	47449	47454	0 %	0 %	50 %	50 %	21240811
1152	NC_003919	GCA	2	6	47543	47548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1153	NC_003919	TGC	2	6	47571	47576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1154	NC_003919	TGCA	2	8	47681	47688	25 %	25 %	25 %	25 %	21240812
1155	NC_003919	GCC	2	6	47705	47710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240812
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1159	NC_003919	TGC	2	6	47816	47821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240812
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1162	NC_003919	CGT	2	6	48001	48006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240812
1163	NC_003919	CTG	2	6	48020	48025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240812
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1168	NC_003919	TGGA	2	8	48474	48481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1169	NC_003919	TGG	2	6	48660	48665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240813
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1202	NC_003919	CGC	2	6	50132	50137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1203	NC_003919	CAT	2	6	50151	50156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240815
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1245	NC_003919	TGG	3	9	52243	52251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240816
1246	NC_003919	CTAT	2	8	52289	52296	25 %	50 %	0 %	25 %	21240816
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1249	NC_003919	CGA	2	6	52518	52523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1250	NC_003919	GC	3	6	52528	52533	0 %	0 %	50 %	50 %	21240817
1251	NC_003919	CTG	2	6	52542	52547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240817
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1254	NC_003919	GTCG	2	8	52668	52675	0 %	25 %	50 %	25 %	21240817
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1478	NC_003919	CGA	2	6	61301	61306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240824
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1480	NC_003919	GGTC	2	8	61321	61328	0 %	25 %	50 %	25 %	21240824
1481	NC_003919	GCAG	2	8	61392	61399	25 %	0 %	50 %	25 %	21240824
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1485	NC_003919	GGGC	2	8	61552	61559	0 %	0 %	75 %	25 %	21240824
1486	NC_003919	CGC	2	6	61597	61602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240824
1487	NC_003919	AAG	2	6	61611	61616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21240824
1488	NC_003919	CGC	2	6	61617	61622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240824
1489	NC_003919	CCG	2	6	61719	61724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1490	NC_003919	GCG	2	6	61738	61743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1491	NC_003919	GCC	2	6	61801	61806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1492	NC_003919	CGG	2	6	61855	61860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1493	NC_003919	CAG	2	6	61967	61972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240825
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1495	NC_003919	CG	3	6	62168	62173	0 %	0 %	50 %	50 %	21240825
1496	NC_003919	GC	4	8	62200	62207	0 %	0 %	50 %	50 %	21240825
1497	NC_003919	CGG	2	6	62218	62223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240825
1498	NC_003919	CGGT	2	8	62235	62242	0 %	25 %	50 %	25 %	21240825
1499	NC_003919	GGC	2	6	62339	62344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240825
1500	NC_003919	GCA	2	6	62398	62403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240825

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