MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 127074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_003919	GTT	2	6	557971	557976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77748527
14002	NC_003919	CGCC	2	8	557984	557991	0 %	0 %	25 %	75 %	77748527
14003	NC_003919	GC	3	6	558040	558045	0 %	0 %	50 %	50 %	77748527
14004	NC_003919	TTC	2	6	558046	558051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77748527
14005	NC_003919	GAG	2	6	558104	558109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77748527
14006	NC_003919	CTT	2	6	558129	558134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77748527
14007	NC_003919	CTGC	2	8	558222	558229	0 %	25 %	25 %	50 %	77748527
14008	NC_003919	AGC	2	6	558230	558235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77748527
14009	NC_003919	CTC	2	6	558266	558271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14010	NC_003919	A	6	6	558288	558293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_003919	TGT	2	6	558335	558340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21241240
14012	NC_003919	CTT	2	6	558373	558378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21241240
14013	NC_003919	GA	3	6	558470	558475	50 %	0 %	50 %	0 %	21241240
14014	NC_003919	GTC	2	6	558535	558540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21241240
14015	NC_003919	CG	3	6	558552	558557	0 %	0 %	50 %	50 %	21241240
14016	NC_003919	GAGATG	2	12	558566	558577	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	21241240
14017	NC_003919	CG	3	6	558597	558602	0 %	0 %	50 %	50 %	21241240
14018	NC_003919	CCG	2	6	558629	558634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21241240
14019	NC_003919	CAG	2	6	558703	558708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21241240
14020	NC_003919	CGG	2	6	558757	558762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21241240
14021	NC_003919	CGC	2	6	558807	558812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21241240
14022	NC_003919	CTG	2	6	558837	558842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21241240
14023	NC_003919	GGT	2	6	558917	558922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21241240
14024	NC_003919	GCCGCG	2	12	558926	558937	0 %	0 %	50 %	50 %	21241240
14025	NC_003919	CTGC	2	8	558969	558976	0 %	25 %	25 %	50 %	21241240
14026	NC_003919	CAA	2	6	558990	558995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21241240
14027	NC_003919	GTC	2	6	559101	559106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21241240
14028	NC_003919	CGC	2	6	559160	559165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21241241
14029	NC_003919	GATC	2	8	559328	559335	25 %	25 %	25 %	25 %	21241241
14030	NC_003919	CGG	2	6	559418	559423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21241241
14031	NC_003919	GTC	2	6	559432	559437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21241241
14032	NC_003919	GGC	2	6	559476	559481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21241241
14033	NC_003919	GGCGC	2	10	559483	559492	0 %	0 %	60 %	40 %	21241241
14034	NC_003919	CTG	2	6	559502	559507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21241241
14035	NC_003919	CGC	2	6	559509	559514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21241241
14036	NC_003919	CTG	2	6	559526	559531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21241241
14037	NC_003919	TCC	2	6	559612	559617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14038	NC_003919	GC	3	6	559641	559646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14039	NC_003919	GC	3	6	559659	559664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14040	NC_003919	GCG	2	6	559701	559706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14041	NC_003919	GGCC	2	8	559707	559714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14042	NC_003919	GTC	2	6	559796	559801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21241242
14043	NC_003919	GC	3	6	559944	559949	0 %	0 %	50 %	50 %	21241242
14044	NC_003919	TGC	2	6	559972	559977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21241242
14045	NC_003919	GTT	2	6	560050	560055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21241242
14046	NC_003919	GCG	2	6	560087	560092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21241242
14047	NC_003919	GTA	2	6	560095	560100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21241242
14048	NC_003919	CAC	2	6	560199	560204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21241242
14049	NC_003919	TGC	2	6	560304	560309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21241242
14050	NC_003919	GTT	2	6	560316	560321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21241242
14051	NC_003919	TGCGC	2	10	560418	560427	0 %	20 %	40 %	40 %	21241242
14052	NC_003919	AGGC	2	8	560429	560436	25 %	0 %	50 %	25 %	21241242
14053	NC_003919	CG	3	6	560439	560444	0 %	0 %	50 %	50 %	21241242
14054	NC_003919	AC	3	6	560491	560496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14055	NC_003919	GTG	2	6	560510	560515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_003919	ACC	2	6	560569	560574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14057	NC_003919	GCG	2	6	560639	560644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14058	NC_003919	GCC	2	6	560657	560662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14059	NC_003919	CAAT	2	8	560687	560694	50 %	25 %	0 %	25 %	21241243
14060	NC_003919	CGAT	2	8	560748	560755	25 %	25 %	25 %	25 %	21241243
14061	NC_003919	CGGC	2	8	560761	560768	0 %	0 %	50 %	50 %	21241243
14062	NC_003919	CGGGC	2	10	560774	560783	0 %	0 %	60 %	40 %	21241243
14063	NC_003919	CGG	2	6	560843	560848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21241243
14064	NC_003919	CGGC	2	8	560872	560879	0 %	0 %	50 %	50 %	21241243
14065	NC_003919	GAA	2	6	560889	560894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21241243
14066	NC_003919	ATG	2	6	560916	560921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21241243
14067	NC_003919	GCCG	2	8	560926	560933	0 %	0 %	50 %	50 %	21241243
14068	NC_003919	CAG	2	6	560969	560974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21241243
14069	NC_003919	CGG	2	6	560986	560991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21241243
14070	NC_003919	CGG	2	6	560998	561003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21241243
14071	NC_003919	TCG	2	6	561093	561098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21241243
14072	NC_003919	CACCGG	2	12	561257	561268	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	21241243
14073	NC_003919	CCA	2	6	561352	561357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21241243
14074	NC_003919	GGT	2	6	561358	561363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21241243
14075	NC_003919	TCGGG	2	10	561436	561445	0 %	20 %	60 %	20 %	21241243
14076	NC_003919	CAC	2	6	561449	561454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21241243
14077	NC_003919	CGGT	2	8	561471	561478	0 %	25 %	50 %	25 %	21241243
14078	NC_003919	CCA	2	6	561481	561486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21241243
14079	NC_003919	CGG	2	6	561514	561519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21241243
14080	NC_003919	CGG	2	6	561659	561664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14081	NC_003919	CGC	2	6	561705	561710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14082	NC_003919	CG	3	6	561734	561739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14083	NC_003919	GTC	2	6	561757	561762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21241244
14084	NC_003919	CGGG	2	8	561771	561778	0 %	0 %	75 %	25 %	21241244
14085	NC_003919	GGT	2	6	561886	561891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21241244
14086	NC_003919	TGA	2	6	561897	561902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21241244
14087	NC_003919	GC	3	6	561949	561954	0 %	0 %	50 %	50 %	21241244
14088	NC_003919	CCA	2	6	561993	561998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21241244
14089	NC_003919	CCG	2	6	561999	562004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21241244
14090	NC_003919	ACC	2	6	562041	562046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21241244
14091	NC_003919	CGC	2	6	562079	562084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21241244
14092	NC_003919	GCCA	2	8	562100	562107	25 %	0 %	25 %	50 %	21241244
14093	NC_003919	CGC	2	6	562114	562119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21241244
14094	NC_003919	CG	3	6	562162	562167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14095	NC_003919	A	6	6	562239	562244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_003919	ATC	2	6	562251	562256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14097	NC_003919	GCAC	3	12	562274	562285	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14098	NC_003919	ATCGGT	2	12	562338	562349	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	77748528
14099	NC_003919	CCGG	2	8	562366	562373	0 %	0 %	50 %	50 %	77748528
14100	NC_003919	TGG	2	6	562394	562399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77748528
14101	NC_003919	GTC	3	9	562434	562442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77748528
14102	NC_003919	CCGA	2	8	562471	562478	25 %	0 %	25 %	50 %	77748528
14103	NC_003919	CGC	2	6	562538	562543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77748528
14104	NC_003919	CTG	2	6	562546	562551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77748528
14105	NC_003919	TGC	2	6	562571	562576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77748528
14106	NC_003919	CGG	2	6	562613	562618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748528
14107	NC_003919	CGC	2	6	562677	562682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77748528
14108	NC_003919	CGC	2	6	562881	562886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77748528
14109	NC_003919	CGAAGC	2	12	562973	562984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77748528
14110	NC_003919	GCCG	2	8	562998	563005	0 %	0 %	50 %	50 %	77748528
14111	NC_003919	CCG	2	6	563014	563019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77748528
14112	NC_003919	GCG	2	6	563104	563109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748528
14113	NC_003919	AGCG	2	8	563112	563119	25 %	0 %	50 %	25 %	77748528
14114	NC_003919	GGGT	2	8	563120	563127	0 %	25 %	75 %	0 %	77748528
14115	NC_003919	GGCGC	2	10	563150	563159	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14116	NC_003919	GTAC	2	8	563169	563176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14117	NC_003919	ACTG	2	8	563273	563280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14118	NC_003919	CGG	2	6	563313	563318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14119	NC_003919	CGG	2	6	563347	563352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14120	NC_003919	CCG	2	6	563452	563457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21241246
14121	NC_003919	AAC	2	6	563484	563489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21241246
14122	NC_003919	CCA	3	9	563674	563682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21241246
14123	NC_003919	AGCC	2	8	563699	563706	25 %	0 %	25 %	50 %	21241246
14124	NC_003919	TGC	2	6	563803	563808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21241246
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14147	NC_003919	AAAG	2	8	564609	564616	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14150	NC_003919	GCT	2	6	564768	564773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14185	NC_003919	TGG	2	6	566255	566260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14186	NC_003919	CGT	2	6	566269	566274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14226	NC_003919	CCGCA	2	10	567940	567949	20 %	0 %	20 %	60 %	77748529
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14231	NC_003919	CG	3	6	568251	568256	0 %	0 %	50 %	50 %	77748529
14232	NC_003919	CG	3	6	568286	568291	0 %	0 %	50 %	50 %	77748529
14233	NC_003919	TGC	2	6	568299	568304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77748529
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14235	NC_003919	GCG	2	6	568331	568336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748529
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14238	NC_003919	GCT	2	6	568423	568428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77748529
14239	NC_003919	AGC	2	6	568488	568493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77748529
14240	NC_003919	GCG	2	6	568494	568499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748529
14241	NC_003919	TGG	2	6	568518	568523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77748529
14242	NC_003919	GCG	2	6	568538	568543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748529
14243	NC_003919	TTC	2	6	568562	568567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77748529
14244	NC_003919	ATGCCA	2	12	568581	568592	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	77748529
14245	NC_003919	GC	3	6	568606	568611	0 %	0 %	50 %	50 %	77748529
14246	NC_003919	CGGC	2	8	568623	568630	0 %	0 %	50 %	50 %	77748529
14247	NC_003919	GC	3	6	568629	568634	0 %	0 %	50 %	50 %	77748529
14248	NC_003919	ACCA	2	8	568655	568662	50 %	0 %	0 %	50 %	77748529
14249	NC_003919	GC	3	6	568680	568685	0 %	0 %	50 %	50 %	77748529
14250	NC_003919	GTCG	2	8	568792	568799	0 %	25 %	50 %	25 %	77748529
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14356	NC_003919	CG	3	6	573239	573244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14357	NC_003919	AATCG	2	10	573462	573471	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14358	NC_003919	ACG	2	6	573547	573552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21241256
14359	NC_003919	CGTG	2	8	573562	573569	0 %	25 %	50 %	25 %	21241256
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14364	NC_003919	CGGT	2	8	573733	573740	0 %	25 %	50 %	25 %	21241256
14365	NC_003919	GGC	2	6	573758	573763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21241256
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14371	NC_003919	GTC	2	6	574005	574010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21241256
14372	NC_003919	GAT	2	6	574023	574028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21241256
14373	NC_003919	GTA	2	6	574050	574055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21241256
14374	NC_003919	GCCG	2	8	574062	574069	0 %	0 %	50 %	50 %	21241256
14375	NC_003919	AGGG	2	8	574162	574169	25 %	0 %	75 %	0 %	21241256
14376	NC_003919	CGT	2	6	574185	574190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21241256
14377	NC_003919	CGT	2	6	574200	574205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21241256
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14380	NC_003919	ACG	2	6	574497	574502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21241257
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14391	NC_003919	T	9	9	575252	575260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14392	NC_003919	T	6	6	575266	575271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14393	NC_003919	GAG	2	6	575276	575281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14394	NC_003919	GGCC	2	8	575312	575319	0 %	0 %	50 %	50 %	21241258
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14399	NC_003919	GCTT	2	8	575695	575702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14400	NC_003919	TGG	2	6	575766	575771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14401	NC_003919	TCA	2	6	575820	575825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21241259
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14404	NC_003919	TCA	2	6	575922	575927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21241259
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14445	NC_003919	GTGCT	2	10	577854	577863	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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14483	NC_003919	CTG	2	6	579765	579770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14487	NC_003919	G	8	8	579880	579887	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14488	NC_003919	AG	3	6	579909	579914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14489	NC_003919	GCC	2	6	580005	580010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14490	NC_003919	AC	3	6	580017	580022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14491	NC_003919	GGCG	2	8	580063	580070	0 %	0 %	75 %	25 %	21241265
14492	NC_003919	CAG	2	6	580079	580084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21241265
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14494	NC_003919	GCGG	2	8	580157	580164	0 %	0 %	75 %	25 %	21241265
14495	NC_003919	CCG	2	6	580175	580180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21241265
14496	NC_003919	GC	3	6	580201	580206	0 %	0 %	50 %	50 %	21241265
14497	NC_003919	GGA	2	6	580220	580225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21241265
14498	NC_003919	GGC	3	9	580271	580279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21241265
14499	NC_003919	GTT	2	6	580288	580293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21241265
14500	NC_003919	GAT	2	6	580295	580300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21241265

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