MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 127074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_003919	GCC	2	6	240693	240698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240969
6002	NC_003919	CGC	2	6	240741	240746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240969
6003	NC_003919	CAA	2	6	240872	240877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240969
6004	NC_003919	CGG	2	6	240887	240892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240969
6005	NC_003919	CAGCG	2	10	240893	240902	20 %	0 %	40 %	40 %	21240969
6006	NC_003919	ATGCG	2	10	240907	240916	20 %	20 %	40 %	20 %	21240969
6007	NC_003919	GCA	2	6	240919	240924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240969
6008	NC_003919	TGC	2	6	240964	240969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240969
6009	NC_003919	GTG	2	6	240976	240981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240969
6010	NC_003919	CGGG	2	8	240994	241001	0 %	0 %	75 %	25 %	21240969
6011	NC_003919	CG	4	8	241057	241064	0 %	0 %	50 %	50 %	21240969
6012	NC_003919	CAA	2	6	241067	241072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240969
6013	NC_003919	TGG	3	9	241126	241134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240969
6014	NC_003919	CGC	2	6	241137	241142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240969
6015	NC_003919	ACA	2	6	241189	241194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240969
6016	NC_003919	GTG	2	6	241206	241211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240969
6017	NC_003919	CGA	2	6	241214	241219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240969
6018	NC_003919	GC	3	6	241221	241226	0 %	0 %	50 %	50 %	21240969
6019	NC_003919	CG	3	6	241294	241299	0 %	0 %	50 %	50 %	21240969
6020	NC_003919	GCC	2	6	241304	241309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240969
6021	NC_003919	CCA	2	6	241390	241395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240969
6022	NC_003919	GCCCG	2	10	241409	241418	0 %	0 %	40 %	60 %	21240969
6023	NC_003919	GCT	2	6	241514	241519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240969
6024	NC_003919	GCA	2	6	241592	241597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_003919	GCA	2	6	241614	241619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_003919	TGGA	2	8	241629	241636	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_003919	TCG	2	6	241675	241680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_003919	GCG	2	6	241721	241726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_003919	GGC	2	6	241782	241787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_003919	GCC	2	6	241959	241964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240970
6031	NC_003919	GCC	2	6	241971	241976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240970
6032	NC_003919	GC	3	6	242039	242044	0 %	0 %	50 %	50 %	21240970
6033	NC_003919	CTG	2	6	242085	242090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240970
6034	NC_003919	GGT	2	6	242105	242110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240970
6035	NC_003919	GCA	2	6	242128	242133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240970
6036	NC_003919	GAC	2	6	242159	242164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240970
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6038	NC_003919	GCGG	2	8	242240	242247	0 %	0 %	75 %	25 %	21240970
6039	NC_003919	CGGC	2	8	242296	242303	0 %	0 %	50 %	50 %	21240970
6040	NC_003919	TG	3	6	242313	242318	0 %	50 %	50 %	0 %	21240970
6041	NC_003919	GGT	2	6	242336	242341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240970
6042	NC_003919	GCA	2	6	242347	242352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240970
6043	NC_003919	GCAT	2	8	242376	242383	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6044	NC_003919	GCG	2	6	242413	242418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_003919	GCT	2	6	242424	242429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_003919	CCT	2	6	242445	242450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_003919	TCG	2	6	242471	242476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_003919	CG	3	6	242503	242508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_003919	GGC	2	6	242514	242519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_003919	GCGTT	2	10	242520	242529	0 %	40 %	40 %	20 %	21240971
6051	NC_003919	TGT	2	6	242557	242562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240971
6052	NC_003919	TGC	2	6	242563	242568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240971
6053	NC_003919	GTG	2	6	242604	242609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240971
6054	NC_003919	ACG	2	6	242641	242646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240971
6055	NC_003919	GGA	2	6	242654	242659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21240971
6056	NC_003919	GAT	2	6	242663	242668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240971
6057	NC_003919	TGG	2	6	242673	242678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240971
6058	NC_003919	CGC	2	6	242728	242733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240971
6059	NC_003919	CAGC	2	8	242795	242802	25 %	0 %	25 %	50 %	21240971
6060	NC_003919	TGG	2	6	242848	242853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240971
6061	NC_003919	GCTG	2	8	242854	242861	0 %	25 %	50 %	25 %	21240971
6062	NC_003919	CCA	2	6	242885	242890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240971
6063	NC_003919	TGC	2	6	242920	242925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240971
6064	NC_003919	TGC	3	9	242932	242940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240971
6065	NC_003919	GC	3	6	243018	243023	0 %	0 %	50 %	50 %	21240971
6066	NC_003919	GGT	2	6	243104	243109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240971
6067	NC_003919	TTC	2	6	243132	243137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240971
6068	NC_003919	CTG	2	6	243153	243158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240971
6069	NC_003919	CG	3	6	243204	243209	0 %	0 %	50 %	50 %	21240971
6070	NC_003919	CGT	2	6	243225	243230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240971
6071	NC_003919	TCG	2	6	243259	243264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240971
6072	NC_003919	CGA	2	6	243283	243288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_003919	ACT	2	6	243354	243359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240972
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6075	NC_003919	GCTG	2	8	243369	243376	0 %	25 %	50 %	25 %	21240972
6076	NC_003919	GCA	2	6	243405	243410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240972
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6080	NC_003919	GCG	2	6	243453	243458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240972
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6083	NC_003919	GCC	2	6	243538	243543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240972
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6087	NC_003919	CGG	2	6	243667	243672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240972
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6093	NC_003919	TGCG	2	8	243822	243829	0 %	25 %	50 %	25 %	21240972
6094	NC_003919	CGC	2	6	243832	243837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240972
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6096	NC_003919	GGC	2	6	243859	243864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240972
6097	NC_003919	GCC	2	6	243887	243892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240972
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6104	NC_003919	AC	3	6	244060	244065	50 %	0 %	0 %	50 %	21240972
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6107	NC_003919	GGGC	2	8	244240	244247	0 %	0 %	75 %	25 %	21240972
6108	NC_003919	ATG	2	6	244327	244332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240972
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6110	NC_003919	TGC	2	6	244491	244496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_003919	GGT	2	6	244515	244520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_003919	TGC	2	6	244556	244561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_003919	CCG	2	6	244622	244627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_003919	GCC	2	6	244687	244692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240973
6115	NC_003919	GC	3	6	244696	244701	0 %	0 %	50 %	50 %	21240973
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6118	NC_003919	CGA	2	6	244782	244787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240973
6119	NC_003919	CGC	3	9	244833	244841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240973
6120	NC_003919	GCTG	2	8	244847	244854	0 %	25 %	50 %	25 %	21240973
6121	NC_003919	GCA	3	9	244866	244874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240973
6122	NC_003919	GGCGCT	2	12	244884	244895	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	21240973
6123	NC_003919	CGCTGA	2	12	244913	244924	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	21240973
6124	NC_003919	ACCTGC	2	12	244940	244951	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	21240973
6125	NC_003919	GC	3	6	244953	244958	0 %	0 %	50 %	50 %	21240973
6126	NC_003919	CG	3	6	244976	244981	0 %	0 %	50 %	50 %	21240973
6127	NC_003919	TCTG	2	8	244983	244990	0 %	50 %	25 %	25 %	21240973
6128	NC_003919	CCG	2	6	244991	244996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240973
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6130	NC_003919	GC	3	6	245074	245079	0 %	0 %	50 %	50 %	21240973
6131	NC_003919	CCG	2	6	245114	245119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240973
6132	NC_003919	CG	3	6	245118	245123	0 %	0 %	50 %	50 %	21240973
6133	NC_003919	GAC	2	6	245188	245193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240973
6134	NC_003919	CG	3	6	245194	245199	0 %	0 %	50 %	50 %	21240973
6135	NC_003919	GCT	2	6	245205	245210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240973
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6138	NC_003919	GCC	2	6	245387	245392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240973
6139	NC_003919	GAC	2	6	245395	245400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240973
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6143	NC_003919	CCG	2	6	245550	245555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240973
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6149	NC_003919	GC	3	6	245668	245673	0 %	0 %	50 %	50 %	21240973
6150	NC_003919	CGGT	2	8	245687	245694	0 %	25 %	50 %	25 %	21240973
6151	NC_003919	CGCAGG	2	12	245699	245710	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	21240973
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6153	NC_003919	CGA	2	6	245799	245804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240973
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6174	NC_003919	CGC	2	6	246524	246529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240973
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6179	NC_003919	GTAC	2	8	246890	246897	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6180	NC_003919	GCG	2	6	246898	246903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6181	NC_003919	GGC	2	6	246937	246942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6182	NC_003919	GCC	2	6	247059	247064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240974
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6202	NC_003919	CGGC	2	8	247670	247677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6203	NC_003919	GCA	2	6	247681	247686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6227	NC_003919	TGC	2	6	248753	248758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6233	NC_003919	GCAG	2	8	248966	248973	25 %	0 %	50 %	25 %	21240976
6234	NC_003919	GC	3	6	248976	248981	0 %	0 %	50 %	50 %	21240976
6235	NC_003919	GCC	2	6	249072	249077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240976
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6240	NC_003919	ACC	2	6	249232	249237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240976
6241	NC_003919	GGC	2	6	249340	249345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240976
6242	NC_003919	CGA	2	6	249353	249358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240976
6243	NC_003919	TGC	2	6	249412	249417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240976
6244	NC_003919	GC	4	8	249416	249423	0 %	0 %	50 %	50 %	21240976
6245	NC_003919	GGC	2	6	249426	249431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240976
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6247	NC_003919	G	6	6	249457	249462	0 %	0 %	100 %	0 %	21240976
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