MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 127074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_003919	ATGC	2	8	179918	179925	25 %	25 %	25 %	25 %	21240922
4502	NC_003919	CAT	2	6	179954	179959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240922
4503	NC_003919	TGCG	2	8	179983	179990	0 %	25 %	50 %	25 %	21240922
4504	NC_003919	CG	3	6	180033	180038	0 %	0 %	50 %	50 %	21240922
4505	NC_003919	AAG	2	6	180118	180123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21240922
4506	NC_003919	CTG	2	6	180147	180152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240922
4507	NC_003919	ACC	2	6	180163	180168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240922
4508	NC_003919	GC	3	6	180211	180216	0 %	0 %	50 %	50 %	21240922
4509	NC_003919	CGC	2	6	180278	180283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240922
4510	NC_003919	CAG	2	6	180348	180353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240922
4511	NC_003919	CG	3	6	180402	180407	0 %	0 %	50 %	50 %	21240922
4512	NC_003919	GCAT	2	8	180484	180491	25 %	25 %	25 %	25 %	21240922
4513	NC_003919	GAGT	2	8	180498	180505	25 %	25 %	50 %	0 %	21240922
4514	NC_003919	GC	3	6	180535	180540	0 %	0 %	50 %	50 %	21240922
4515	NC_003919	GC	3	6	180588	180593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4516	NC_003919	CTT	2	6	180596	180601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_003919	CCA	2	6	180614	180619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_003919	GAA	2	6	180637	180642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_003919	TAA	2	6	180673	180678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_003919	ACT	2	6	180792	180797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_003919	TTC	2	6	180882	180887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240923
4522	NC_003919	C	6	6	181014	181019	0 %	0 %	0 %	100 %	21240923
4523	NC_003919	ATC	2	6	181102	181107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240923
4524	NC_003919	TGG	2	6	181184	181189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240923
4525	NC_003919	TG	3	6	181190	181195	0 %	50 %	50 %	0 %	21240923
4526	NC_003919	GAG	2	6	181339	181344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21240923
4527	NC_003919	GGC	2	6	181360	181365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240923
4528	NC_003919	TGC	2	6	181466	181471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240923
4529	NC_003919	GAT	2	6	181537	181542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240923
4530	NC_003919	CA	3	6	181598	181603	50 %	0 %	0 %	50 %	21240923
4531	NC_003919	GATT	2	8	181626	181633	25 %	50 %	25 %	0 %	21240923
4532	NC_003919	GTA	2	6	181702	181707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240923
4533	NC_003919	GAGC	2	8	181783	181790	25 %	0 %	50 %	25 %	21240923
4534	NC_003919	GTT	2	6	181846	181851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240923
4535	NC_003919	TTG	2	6	181859	181864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240923
4536	NC_003919	GAT	2	6	181948	181953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240923
4537	NC_003919	GTTTT	2	10	181966	181975	0 %	80 %	20 %	0 %	21240923
4538	NC_003919	CCG	2	6	182059	182064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4539	NC_003919	CTTAA	2	10	182103	182112	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4540	NC_003919	GTC	2	6	182182	182187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_003919	GGC	2	6	182260	182265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_003919	CG	4	8	182398	182405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4543	NC_003919	CGA	2	6	182410	182415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_003919	GCG	2	6	182427	182432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_003919	CGT	2	6	182478	182483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_003919	CTT	2	6	182511	182516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_003919	TAC	2	6	182544	182549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240924
4548	NC_003919	CT	3	6	182579	182584	0 %	50 %	0 %	50 %	21240924
4549	NC_003919	GTC	3	9	182585	182593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240924
4550	NC_003919	TGC	2	6	182661	182666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240924
4551	NC_003919	TGGAA	2	10	182734	182743	40 %	20 %	40 %	0 %	21240924
4552	NC_003919	GCC	2	6	182786	182791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240924
4553	NC_003919	GCG	2	6	182796	182801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240924
4554	NC_003919	CGG	2	6	182832	182837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240924
4555	NC_003919	GTT	2	6	182873	182878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240924
4556	NC_003919	GCA	2	6	183296	183301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240924
4557	NC_003919	CAT	2	6	183413	183418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_003919	TTG	2	6	183429	183434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_003919	ATG	2	6	183438	183443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_003919	GTGC	2	8	183471	183478	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4561	NC_003919	TGT	2	6	183515	183520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240925
4562	NC_003919	GCT	2	6	183534	183539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240925
4563	NC_003919	TGCG	2	8	183557	183564	0 %	25 %	50 %	25 %	21240925
4564	NC_003919	CT	3	6	183608	183613	0 %	50 %	0 %	50 %	21240925
4565	NC_003919	CGCTG	2	10	183623	183632	0 %	20 %	40 %	40 %	21240925
4566	NC_003919	AGC	2	6	183737	183742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240925
4567	NC_003919	CAG	2	6	183784	183789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240925
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4569	NC_003919	GCT	2	6	183846	183851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240925
4570	NC_003919	CTG	2	6	183868	183873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240925
4571	NC_003919	CGC	2	6	183960	183965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240925
4572	NC_003919	TAG	2	6	184181	184186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240925
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4574	NC_003919	GTA	2	6	184431	184436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240926
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4576	NC_003919	CGG	2	6	184470	184475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240926
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4579	NC_003919	GCC	2	6	184527	184532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240926
4580	NC_003919	GAA	2	6	184586	184591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_003919	TAC	2	6	184640	184645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240927
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4583	NC_003919	CAC	2	6	184712	184717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240927
4584	NC_003919	GGC	2	6	184888	184893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240927
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4586	NC_003919	GCGA	2	8	184946	184953	25 %	0 %	50 %	25 %	21240927
4587	NC_003919	GATC	2	8	185002	185009	25 %	25 %	25 %	25 %	21240927
4588	NC_003919	CAGG	2	8	185017	185024	25 %	0 %	50 %	25 %	21240927
4589	NC_003919	TCG	2	6	185025	185030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240927
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4592	NC_003919	GTCT	2	8	185140	185147	0 %	50 %	25 %	25 %	21240927
4593	NC_003919	GCA	2	6	185196	185201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240927
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4595	NC_003919	GGC	2	6	185277	185282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240927
4596	NC_003919	CCA	2	6	185292	185297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240927
4597	NC_003919	CGC	2	6	185302	185307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240927
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4599	NC_003919	GCG	2	6	185601	185606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_003919	TCGG	2	8	185644	185651	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4601	NC_003919	GA	3	6	185668	185673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_003919	CGCC	2	8	185676	185683	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4603	NC_003919	TGG	2	6	185685	185690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_003919	TTGG	2	8	185714	185721	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_003919	G	7	7	185882	185888	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_003919	GTCG	2	8	185953	185960	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4607	NC_003919	TGG	2	6	186009	186014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_003919	GCG	2	6	186016	186021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_003919	CG	3	6	186020	186025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_003919	GTGCGC	2	12	186085	186096	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_003919	CTG	2	6	186105	186110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_003919	AGC	2	6	186170	186175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77748512
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4615	NC_003919	GTG	2	6	186211	186216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77748512
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4618	NC_003919	GGC	2	6	186312	186317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748512
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4995	NC_003919	CGCTGC	2	12	201331	201342	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	21240936
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4998	NC_003919	GCT	2	6	201521	201526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4999	NC_003919	TGG	2	6	201532	201537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240937
5000	NC_003919	TGC	2	6	201613	201618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240937

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