MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Xanthomonas campestris pv. campestris str. ATCC 33913 chromosome

Total Repeats: 4701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003902	GCCTG	2	10	820	829	0 %	20 %	40 %	40 %	21229479
2	NC_003902	ACCAC	2	10	1264	1273	40 %	0 %	0 %	60 %	21229479
3	NC_003902	CCGCG	2	10	7241	7250	0 %	0 %	40 %	60 %	21229482
4	NC_003902	TGCGG	2	10	9466	9475	0 %	20 %	60 %	20 %	21229485
5	NC_003902	CAACA	2	10	12975	12984	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_003902	GCGAT	2	10	13133	13142	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_003902	ATCGC	2	10	13335	13344	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_003902	CAAAC	2	10	13444	13453	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_003902	TCCAC	2	10	13832	13841	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_003902	CCATG	2	10	19435	19444	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_003902	CCGCG	2	10	21105	21114	0 %	0 %	40 %	60 %	21229496
12	NC_003902	CGGTG	2	10	21484	21493	0 %	20 %	60 %	20 %	21229496
13	NC_003902	CGGCC	2	10	21643	21652	0 %	0 %	40 %	60 %	21229496
14	NC_003902	GCCCT	2	10	21768	21777	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_003902	CCTGC	2	10	22159	22168	0 %	20 %	20 %	60 %	21229498
16	NC_003902	TGGCG	2	10	22387	22396	0 %	20 %	60 %	20 %	21229498
17	NC_003902	GTTGC	2	10	23118	23127	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_003902	TGCGC	2	10	26560	26569	0 %	20 %	40 %	40 %	21229500
19	NC_003902	CGGGT	2	10	27033	27042	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_003902	CGGGC	2	10	28099	28108	0 %	0 %	60 %	40 %	21229502
21	NC_003902	CCAGC	2	10	31019	31028	20 %	0 %	20 %	60 %	21229504
22	NC_003902	CTTGC	2	10	32585	32594	0 %	40 %	20 %	40 %	21229505
23	NC_003902	CGCAG	2	10	33361	33370	20 %	0 %	40 %	40 %	21229505
24	NC_003902	CCAGC	2	10	34160	34169	20 %	0 %	20 %	60 %	21229506
25	NC_003902	TGCGC	2	10	36053	36062	0 %	20 %	40 %	40 %	21229507
26	NC_003902	GCCGC	2	10	36150	36159	0 %	0 %	40 %	60 %	21229507
27	NC_003902	CGCGA	2	10	36900	36909	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_003902	GGTTA	2	10	37784	37793	20 %	40 %	40 %	0 %	21229508
29	NC_003902	CTGGT	2	10	38147	38156	0 %	40 %	40 %	20 %	21229509
30	NC_003902	GCCGG	2	10	39011	39020	0 %	0 %	60 %	40 %	21229509
31	NC_003902	AGGCC	2	10	39865	39874	20 %	0 %	40 %	40 %	21229510
32	NC_003902	CGCAG	2	10	42115	42124	20 %	0 %	40 %	40 %	21229510
33	NC_003902	CGCTG	2	10	43423	43432	0 %	20 %	40 %	40 %	21229510
34	NC_003902	CGGCG	2	10	43546	43555	0 %	0 %	60 %	40 %	21229510
35	NC_003902	CAGCG	2	10	43931	43940	20 %	0 %	40 %	40 %	21229510
36	NC_003902	CAGGC	2	10	44626	44635	20 %	0 %	40 %	40 %	21229511
37	NC_003902	CCGGC	2	10	44762	44771	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_003902	CAGCC	2	10	47388	47397	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_003902	GGTGA	2	10	47739	47748	20 %	20 %	60 %	0 %	21229514
40	NC_003902	AGTGG	2	10	48901	48910	20 %	20 %	60 %	0 %	21229515
41	NC_003902	GCTCG	2	10	49324	49333	0 %	20 %	40 %	40 %	21229515
42	NC_003902	GCCAC	2	10	49560	49569	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_003902	TGCAG	2	10	49587	49596	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_003902	AGGCG	2	10	52774	52783	20 %	0 %	60 %	20 %	21229520
45	NC_003902	ACCGC	2	10	53841	53850	20 %	0 %	20 %	60 %	21229521
46	NC_003902	GCGCA	2	10	54313	54322	20 %	0 %	40 %	40 %	21229522
47	NC_003902	TAGCG	2	10	54779	54788	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_003902	CGGTG	2	10	55046	55055	0 %	20 %	60 %	20 %	21229523
49	NC_003902	CGTGG	2	10	55100	55109	0 %	20 %	60 %	20 %	21229523
50	NC_003902	GCGCC	2	10	56043	56052	0 %	0 %	40 %	60 %	21229524
51	NC_003902	GTGGC	2	10	56059	56068	0 %	20 %	60 %	20 %	21229524
52	NC_003902	ACGAC	2	10	56925	56934	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_003902	GCATC	2	10	57556	57565	20 %	20 %	20 %	40 %	21229525
54	NC_003902	TGGTC	2	10	58266	58275	0 %	40 %	40 %	20 %	21229525
55	NC_003902	GGCAA	2	10	58897	58906	40 %	0 %	40 %	20 %	21229526
56	NC_003902	TGGCC	2	10	59041	59050	0 %	20 %	40 %	40 %	21229526
57	NC_003902	CCCAG	2	10	61032	61041	20 %	0 %	20 %	60 %	77747725
58	NC_003902	GCGCG	2	10	62388	62397	0 %	0 %	60 %	40 %	77747725
59	NC_003902	GCGCA	2	10	63235	63244	20 %	0 %	40 %	40 %	77747725
60	NC_003902	GGCCG	2	10	63493	63502	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
61	NC_003902	ATTAA	2	10	63595	63604	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003902	CGGCG	2	10	64702	64711	0 %	0 %	60 %	40 %	21229529
63	NC_003902	CCGCG	2	10	66888	66897	0 %	0 %	40 %	60 %	21229530
64	NC_003902	GCGCG	2	10	68241	68250	0 %	0 %	60 %	40 %	77747726
65	NC_003902	GCTGG	2	10	68264	68273	0 %	20 %	60 %	20 %	77747726
66	NC_003902	GCGGG	2	10	74067	74076	0 %	0 %	80 %	20 %	21229536
67	NC_003902	CGGCG	2	10	74283	74292	0 %	0 %	60 %	40 %	21229536
68	NC_003902	GCCCA	2	10	75826	75835	20 %	0 %	20 %	60 %	21229538
69	NC_003902	GGGCA	2	10	76361	76370	20 %	0 %	60 %	20 %	21229539
70	NC_003902	CGTTT	2	10	77038	77047	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_003902	TGCTT	2	10	77331	77340	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_003902	GGGTG	2	10	77424	77433	0 %	20 %	80 %	0 %	21229541
73	NC_003902	AGCGC	2	10	79080	79089	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_003902	CCAGG	2	10	79627	79636	20 %	0 %	40 %	40 %	21229542
75	NC_003902	TCTTG	2	10	81623	81632	0 %	60 %	20 %	20 %	77747728
76	NC_003902	AAGAA	2	10	83465	83474	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003902	GCGCG	2	10	83520	83529	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
78	NC_003902	TGGCT	2	10	84254	84263	0 %	40 %	40 %	20 %	21229546
79	NC_003902	ACCAA	2	10	85721	85730	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_003902	GTCGC	2	10	85801	85810	0 %	20 %	40 %	40 %	21229548
81	NC_003902	GCTGG	2	10	86073	86082	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_003902	ACGGT	2	10	89486	89495	20 %	20 %	40 %	20 %	77747730
83	NC_003902	AGCGC	2	10	89620	89629	20 %	0 %	40 %	40 %	77747730
84	NC_003902	CGCTG	2	10	89711	89720	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_003902	GCGGG	2	10	90639	90648	0 %	0 %	80 %	20 %	21229553
86	NC_003902	GCCAC	2	10	90758	90767	20 %	0 %	20 %	60 %	21229553
87	NC_003902	CGGCG	2	10	91856	91865	0 %	0 %	60 %	40 %	21229554
88	NC_003902	GTCCA	2	10	92206	92215	20 %	20 %	20 %	40 %	21229555
89	NC_003902	CGGTG	2	10	93919	93928	0 %	20 %	60 %	20 %	21229557
90	NC_003902	ATGGC	2	10	93990	93999	20 %	20 %	40 %	20 %	21229557
91	NC_003902	GGCCG	2	10	94138	94147	0 %	0 %	60 %	40 %	21229557
92	NC_003902	GGTGG	2	10	94241	94250	0 %	20 %	80 %	0 %	21229557
93	NC_003902	TGCAA	2	10	94877	94886	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_003902	TGCGC	2	10	94919	94928	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_003902	CTGCG	2	10	95760	95769	0 %	20 %	40 %	40 %	21229558
96	NC_003902	CCGCA	2	10	96453	96462	20 %	0 %	20 %	60 %	21229559
97	NC_003902	CCGAC	2	10	96560	96569	20 %	0 %	20 %	60 %	21229559
98	NC_003902	GCAAT	2	10	97978	97987	40 %	20 %	20 %	20 %	21229561
99	NC_003902	TGCCC	2	10	99404	99413	0 %	20 %	20 %	60 %	21229562
100	NC_003902	TCCAG	2	10	99674	99683	20 %	20 %	20 %	40 %	21229562
101	NC_003902	CGCAG	2	10	99995	100004	20 %	0 %	40 %	40 %	21229563
102	NC_003902	CGATG	2	10	101469	101478	20 %	20 %	40 %	20 %	21229564
103	NC_003902	CTGTC	2	10	101686	101695	0 %	40 %	20 %	40 %	21229565
104	NC_003902	TGGCC	2	10	103199	103208	0 %	20 %	40 %	40 %	21229565
105	NC_003902	CAGGG	2	10	103429	103438	20 %	0 %	60 %	20 %	21229565
106	NC_003902	GCGCG	2	10	104130	104139	0 %	0 %	60 %	40 %	21229566
107	NC_003902	GCGGG	2	10	104739	104748	0 %	0 %	80 %	20 %	21229566
108	NC_003902	GGCCG	2	10	104848	104857	0 %	0 %	60 %	40 %	21229566
109	NC_003902	ACCAC	2	10	106298	106307	40 %	0 %	0 %	60 %	21229567
110	NC_003902	CCGCA	2	10	106650	106659	20 %	0 %	20 %	60 %	21229567
111	NC_003902	GCAGC	2	10	106925	106934	20 %	0 %	40 %	40 %	21229567
112	NC_003902	GCGCC	2	10	106959	106968	0 %	0 %	40 %	60 %	21229567
113	NC_003902	ACGGC	2	10	108109	108118	20 %	0 %	40 %	40 %	21229569
114	NC_003902	CGGCG	2	10	111274	111283	0 %	0 %	60 %	40 %	21229571
115	NC_003902	GCCGG	2	10	112108	112117	0 %	0 %	60 %	40 %	21229572
116	NC_003902	GCACG	2	10	118887	118896	20 %	0 %	40 %	40 %	21229575
117	NC_003902	GGTGC	2	10	119780	119789	0 %	20 %	60 %	20 %	21229576
118	NC_003902	CAGCG	2	10	120110	120119	20 %	0 %	40 %	40 %	21229576
119	NC_003902	CACCG	2	10	120296	120305	20 %	0 %	20 %	60 %	21229576
120	NC_003902	GAGCT	2	10	120848	120857	20 %	20 %	40 %	20 %	21229576
121	NC_003902	CACCG	2	10	120967	120976	20 %	0 %	20 %	60 %	21229576
122	NC_003902	CCCGG	2	10	121271	121280	0 %	0 %	40 %	60 %	21229576
123	NC_003902	CACAA	2	10	124652	124661	60 %	0 %	0 %	40 %	21229580
124	NC_003902	CGGCG	2	10	125810	125819	0 %	0 %	60 %	40 %	21229581
125	NC_003902	TCCGC	2	10	126287	126296	0 %	20 %	20 %	60 %	21229582
126	NC_003902	CGGGG	2	10	127281	127290	0 %	0 %	80 %	20 %	21229583
127	NC_003902	TCGGC	2	10	130430	130439	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_003902	TCGGC	2	10	130614	130623	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_003902	TCGGC	2	10	130799	130808	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_003902	CAGAC	2	10	130960	130969	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_003902	CGCGT	2	10	131684	131693	0 %	20 %	40 %	40 %	21229584
132	NC_003902	GGCGC	2	10	132817	132826	0 %	0 %	60 %	40 %	21229585
133	NC_003902	CAGCG	2	10	133103	133112	20 %	0 %	40 %	40 %	21229585
134	NC_003902	GCGCC	2	10	134655	134664	0 %	0 %	40 %	60 %	21229586
135	NC_003902	GCTGG	2	10	135984	135993	0 %	20 %	60 %	20 %	21229588
136	NC_003902	GGTCG	2	10	136467	136476	0 %	20 %	60 %	20 %	21229588
137	NC_003902	GCCGC	2	10	137088	137097	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_003902	TGAAC	2	10	137864	137873	40 %	20 %	20 %	20 %	21229589
139	NC_003902	CGCTG	2	10	138095	138104	0 %	20 %	40 %	40 %	21229590
140	NC_003902	TGTCC	2	10	138978	138987	0 %	40 %	20 %	40 %	21229592
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142	NC_003902	CCAGC	2	10	140440	140449	20 %	0 %	20 %	60 %	21229592
143	NC_003902	GCGCC	2	10	140578	140587	0 %	0 %	40 %	60 %	21229592
144	NC_003902	GGCAC	2	10	142374	142383	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_003902	GGCCT	2	10	143019	143028	0 %	20 %	40 %	40 %	21229593
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147	NC_003902	CAGCG	2	10	144598	144607	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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191	NC_003902	ACCAA	2	10	199231	199240	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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409	NC_003902	GCCGC	2	10	409249	409258	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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