MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas campestris pv. campestris str. ATCC 33913 chromosome

Total Repeats: 127852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003902	CGA	2	6	39533	39538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_003902	GAA	2	6	39543	39548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_003902	CGG	3	9	39596	39604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_003902	CGC	2	6	39608	39613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229510
1005	NC_003902	GGC	2	6	39647	39652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229510
1006	NC_003902	CCAG	2	8	39664	39671	25 %	0 %	25 %	50 %	21229510
1007	NC_003902	TCG	2	6	39696	39701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229510
1008	NC_003902	TGC	2	6	39721	39726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229510
1009	NC_003902	GGC	2	6	39742	39747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229510
1010	NC_003902	GT	3	6	39754	39759	0 %	50 %	50 %	0 %	21229510
1011	NC_003902	CGG	2	6	39790	39795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229510
1012	NC_003902	AGGCC	2	10	39865	39874	20 %	0 %	40 %	40 %	21229510
1013	NC_003902	CAGCAC	2	12	39914	39925	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	21229510
1014	NC_003902	GCA	2	6	39947	39952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229510
1015	NC_003902	CCA	2	6	39970	39975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229510
1016	NC_003902	CG	3	6	40016	40021	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
1017	NC_003902	CGC	2	6	40039	40044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229510
1018	NC_003902	CAGG	2	8	40058	40065	25 %	0 %	50 %	25 %	21229510
1019	NC_003902	GC	3	6	40088	40093	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
1020	NC_003902	GTG	2	6	40111	40116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229510
1021	NC_003902	CAC	2	6	40121	40126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229510
1022	NC_003902	GCCG	2	8	40129	40136	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
1023	NC_003902	TCCAGC	2	12	40176	40187	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	21229510
1024	NC_003902	GC	4	8	40307	40314	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
1025	NC_003902	CGGT	2	8	40323	40330	0 %	25 %	50 %	25 %	21229510
1026	NC_003902	GGT	2	6	40348	40353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229510
1027	NC_003902	CGC	2	6	40354	40359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229510
1028	NC_003902	TTG	2	6	40365	40370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21229510
1029	NC_003902	CGT	2	6	40456	40461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229510
1030	NC_003902	CAG	2	6	40532	40537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229510
1031	NC_003902	ACGC	2	8	40568	40575	25 %	0 %	25 %	50 %	21229510
1032	NC_003902	CTT	2	6	40600	40605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21229510
1033	NC_003902	CAG	2	6	40610	40615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229510
1034	NC_003902	GAA	2	6	40619	40624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21229510
1035	NC_003902	AGT	2	6	40654	40659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229510
1036	NC_003902	CG	3	6	40661	40666	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
1037	NC_003902	GTT	2	6	40703	40708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21229510
1038	NC_003902	ATC	2	6	40746	40751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21229510
1039	NC_003902	GCCGAA	2	12	40760	40771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229510
1040	NC_003902	GCC	2	6	40823	40828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229510
1041	NC_003902	CCA	2	6	40867	40872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229510
1042	NC_003902	GCC	2	6	40952	40957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229510
1043	NC_003902	CGG	2	6	41005	41010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229510
1044	NC_003902	CCA	2	6	41035	41040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229510
1045	NC_003902	TCGA	2	8	41106	41113	25 %	25 %	25 %	25 %	21229510
1046	NC_003902	GCG	3	9	41128	41136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229510
1047	NC_003902	GCC	2	6	41213	41218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229510
1048	NC_003902	GCA	2	6	41254	41259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229510
1049	NC_003902	CGC	2	6	41359	41364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229510
1050	NC_003902	TGC	2	6	41377	41382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229510
1051	NC_003902	GCCC	2	8	41383	41390	0 %	0 %	25 %	75 %	21229510
1052	NC_003902	CGG	2	6	41455	41460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229510
1053	NC_003902	GCA	2	6	41473	41478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229510
1054	NC_003902	CGG	2	6	41482	41487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229510
1055	NC_003902	GC	3	6	41523	41528	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
1056	NC_003902	GC	3	6	41622	41627	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
1057	NC_003902	CGC	2	6	41668	41673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229510
1058	NC_003902	GCC	2	6	41693	41698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229510
1059	NC_003902	GC	3	6	41786	41791	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
1060	NC_003902	CCA	2	6	41815	41820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229510
1061	NC_003902	CGA	2	6	41836	41841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229510
1062	NC_003902	AAC	2	6	41847	41852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21229510
1063	NC_003902	GC	3	6	41854	41859	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
1064	NC_003902	GAT	2	6	41897	41902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229510
1065	NC_003902	CGG	2	6	41937	41942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229510
1066	NC_003902	CGC	2	6	41959	41964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229510
1067	NC_003902	CGG	2	6	41988	41993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229510
1068	NC_003902	CG	4	8	42079	42086	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
1069	NC_003902	GAT	2	6	42098	42103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229510
1070	NC_003902	CGCAG	2	10	42115	42124	20 %	0 %	40 %	40 %	21229510
1071	NC_003902	GGT	2	6	42139	42144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229510
1072	NC_003902	CAG	3	9	42212	42220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229510
1073	NC_003902	GCG	2	6	42240	42245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229510
1074	NC_003902	GGCC	2	8	42274	42281	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
1075	NC_003902	CTT	2	6	42289	42294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21229510
1076	NC_003902	CAG	2	6	42350	42355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229510
1077	NC_003902	GCTG	2	8	42370	42377	0 %	25 %	50 %	25 %	21229510
1078	NC_003902	GTG	2	6	42456	42461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229510
1079	NC_003902	CGG	2	6	42497	42502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229510
1080	NC_003902	AGT	2	6	42532	42537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229510
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1082	NC_003902	GTC	2	6	42581	42586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229510
1083	NC_003902	TTC	2	6	42707	42712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21229510
1084	NC_003902	AGGT	2	8	42744	42751	25 %	25 %	50 %	0 %	21229510
1085	NC_003902	CTG	2	6	42758	42763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229510
1086	NC_003902	GCGCAC	2	12	42781	42792	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	21229510
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1088	NC_003902	GATC	2	8	42841	42848	25 %	25 %	25 %	25 %	21229510
1089	NC_003902	CAT	2	6	42851	42856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21229510
1090	NC_003902	CGGC	2	8	42895	42902	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
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1092	NC_003902	GC	3	6	42962	42967	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
1093	NC_003902	GCCG	2	8	43028	43035	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
1094	NC_003902	CGG	2	6	43121	43126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229510
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1098	NC_003902	CATG	2	8	43213	43220	25 %	25 %	25 %	25 %	21229510
1099	NC_003902	GCG	2	6	43255	43260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229510
1100	NC_003902	TGG	2	6	43378	43383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229510
1101	NC_003902	GAT	2	6	43413	43418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229510
1102	NC_003902	CGCTG	2	10	43423	43432	0 %	20 %	40 %	40 %	21229510
1103	NC_003902	GCA	2	6	43465	43470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229510
1104	NC_003902	GTG	2	6	43506	43511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229510
1105	NC_003902	CGGCG	2	10	43546	43555	0 %	0 %	60 %	40 %	21229510
1106	NC_003902	GC	3	6	43556	43561	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
1107	NC_003902	CAC	2	6	43682	43687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229510
1108	NC_003902	GC	3	6	43748	43753	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
1109	NC_003902	GCCG	2	8	43787	43794	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
1110	NC_003902	CAG	2	6	43865	43870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229510
1111	NC_003902	CGG	2	6	43897	43902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229510
1112	NC_003902	CGC	2	6	43906	43911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229510
1113	NC_003902	CAGCG	2	10	43931	43940	20 %	0 %	40 %	40 %	21229510
1114	NC_003902	GTC	2	6	43973	43978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229510
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1116	NC_003902	CG	4	8	44020	44027	0 %	0 %	50 %	50 %	21229510
1117	NC_003902	TGT	2	6	44029	44034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21229510
1118	NC_003902	GTC	2	6	44045	44050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229510
1119	NC_003902	G	6	6	44068	44073	0 %	0 %	100 %	0 %	21229510
1120	NC_003902	CGA	2	6	44108	44113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_003902	ATC	2	6	44156	44161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_003902	CAG	2	6	44236	44241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_003902	CTG	2	6	44269	44274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_003902	CGT	2	6	44402	44407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229511
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1126	NC_003902	CGG	2	6	44534	44539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229511
1127	NC_003902	TGC	2	6	44542	44547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229511
1128	NC_003902	CAGGC	2	10	44626	44635	20 %	0 %	40 %	40 %	21229511
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1259	NC_003902	CGG	2	6	49476	49481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1260	NC_003902	GCC	2	6	49489	49494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1261	NC_003902	AGC	2	6	49520	49525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1262	NC_003902	GCCAC	2	10	49560	49569	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1263	NC_003902	TGCAG	2	10	49587	49596	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1264	NC_003902	ACC	3	9	49674	49682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1265	NC_003902	ACC	2	6	49715	49720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229516
1266	NC_003902	GCA	2	6	49721	49726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229516
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1268	NC_003902	GCC	2	6	49877	49882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229516
1269	NC_003902	GGC	2	6	49915	49920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229516
1270	NC_003902	GGC	2	6	49954	49959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229516
1271	NC_003902	TGC	2	6	50024	50029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229516
1272	NC_003902	GGT	2	6	50052	50057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229516
1273	NC_003902	TGG	2	6	50123	50128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229516
1274	NC_003902	CCG	2	6	50150	50155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229516
1275	NC_003902	GC	3	6	50159	50164	0 %	0 %	50 %	50 %	21229516
1276	NC_003902	CAA	2	6	50181	50186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21229516
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1278	NC_003902	CGG	2	6	50240	50245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229516
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1280	NC_003902	GTG	2	6	50311	50316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229516
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1284	NC_003902	GT	3	6	50513	50518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1285	NC_003902	CCA	2	6	50583	50588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1286	NC_003902	GGCG	2	8	50589	50596	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1287	NC_003902	TGGC	2	8	50597	50604	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1288	NC_003902	GC	3	6	50643	50648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1289	NC_003902	GC	3	6	50660	50665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1290	NC_003902	CG	3	6	50697	50702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1291	NC_003902	ATC	2	6	50709	50714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1292	NC_003902	ATC	2	6	50716	50721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1293	NC_003902	GC	4	8	50763	50770	0 %	0 %	50 %	50 %	21229518
1294	NC_003902	CG	4	8	50796	50803	0 %	0 %	50 %	50 %	21229518
1295	NC_003902	GCC	2	6	50810	50815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229518
1296	NC_003902	GGC	2	6	50879	50884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229518
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1300	NC_003902	CGGA	2	8	51017	51024	25 %	0 %	50 %	25 %	21229518
1301	NC_003902	TGC	2	6	51079	51084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229518
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1304	NC_003902	CG	4	8	51246	51253	0 %	0 %	50 %	50 %	21229518
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1314	NC_003902	GC	3	6	51678	51683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1315	NC_003902	GCAA	2	8	51769	51776	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1316	NC_003902	GC	3	6	51815	51820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1317	NC_003902	GC	3	6	51843	51848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1318	NC_003902	CG	3	6	51876	51881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1319	NC_003902	GC	3	6	51885	51890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1320	NC_003902	CAG	2	6	51956	51961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229519
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1322	NC_003902	CAG	2	6	51980	51985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229519
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1328	NC_003902	GCA	2	6	52162	52167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229519
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1331	NC_003902	GC	3	6	52208	52213	0 %	0 %	50 %	50 %	21229519
1332	NC_003902	CAC	3	9	52214	52222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229519
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1334	NC_003902	CCTGCA	2	12	52248	52259	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	21229520
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1352	NC_003902	GCA	2	6	52950	52955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1354	NC_003902	AGCG	2	8	53000	53007	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1355	NC_003902	CTG	2	6	53061	53066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229521
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1361	NC_003902	CGG	2	6	53242	53247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229521
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1370	NC_003902	CAC	2	6	53597	53602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229521
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1372	NC_003902	GCC	3	9	53787	53795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229521
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1376	NC_003902	CTG	2	6	53913	53918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229521
1377	NC_003902	GC	3	6	53925	53930	0 %	0 %	50 %	50 %	21229521
1378	NC_003902	A	6	6	53956	53961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1379	NC_003902	CATC	2	8	54030	54037	25 %	25 %	0 %	50 %	21229522
1380	NC_003902	GCT	2	6	54128	54133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229522
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1382	NC_003902	CG	3	6	54166	54171	0 %	0 %	50 %	50 %	21229522
1383	NC_003902	GT	3	6	54183	54188	0 %	50 %	50 %	0 %	21229522
1384	NC_003902	AG	3	6	54214	54219	50 %	0 %	50 %	0 %	21229522
1385	NC_003902	GCGCA	2	10	54313	54322	20 %	0 %	40 %	40 %	21229522
1386	NC_003902	CCG	2	6	54385	54390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229522
1387	NC_003902	GGT	2	6	54398	54403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229522
1388	NC_003902	TGA	2	6	54416	54421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229522
1389	NC_003902	GCA	2	6	54441	54446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229522
1390	NC_003902	AG	3	6	54484	54489	50 %	0 %	50 %	0 %	21229522
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