MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas campestris pv. campestris str. ATCC 33913 chromosome

Total Repeats: 127852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_003902	TGT	2	6	194408	194413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21229626
5002	NC_003902	TGC	3	9	194429	194437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229626
5003	NC_003902	GGT	2	6	194511	194516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229626
5004	NC_003902	GCA	2	6	194523	194528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229626
5005	NC_003902	CCG	2	6	194534	194539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229626
5006	NC_003902	CGT	2	6	194552	194557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229626
5007	NC_003902	GTT	2	6	194571	194576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21229626
5008	NC_003902	TGC	2	6	194597	194602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229626
5009	NC_003902	GTG	2	6	194603	194608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229626
5010	NC_003902	TGG	2	6	194645	194650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229626
5011	NC_003902	GTC	2	6	194688	194693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229626
5012	NC_003902	TTC	2	6	194698	194703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21229626
5013	NC_003902	GGC	2	6	194704	194709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229626
5014	NC_003902	CGG	2	6	194738	194743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229626
5015	NC_003902	GGC	2	6	194746	194751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229626
5016	NC_003902	GAT	2	6	194754	194759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229626
5017	NC_003902	GAT	2	6	194766	194771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229626
5018	NC_003902	CCG	2	6	194816	194821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229626
5019	NC_003902	TGG	2	6	194825	194830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229626
5020	NC_003902	GCC	2	6	194841	194846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229626
5021	NC_003902	CGGCCG	2	12	194870	194881	0 %	0 %	50 %	50 %	21229626
5022	NC_003902	CGGC	2	8	194912	194919	0 %	0 %	50 %	50 %	21229626
5023	NC_003902	TGA	2	6	194936	194941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229626
5024	NC_003902	CCG	2	6	194942	194947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229626
5025	NC_003902	ATG	2	6	194950	194955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229626
5026	NC_003902	GC	3	6	194974	194979	0 %	0 %	50 %	50 %	21229626
5027	NC_003902	GGGCCT	2	12	195051	195062	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	21229626
5028	NC_003902	GGT	2	6	195129	195134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229626
5029	NC_003902	TTC	2	6	195187	195192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21229626
5030	NC_003902	CG	3	6	195210	195215	0 %	0 %	50 %	50 %	21229626
5031	NC_003902	CAC	2	6	195216	195221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229626
5032	NC_003902	TTGC	2	8	195268	195275	0 %	50 %	25 %	25 %	21229626
5033	NC_003902	CGG	4	12	195290	195301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229626
5034	NC_003902	TGA	2	6	195347	195352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21229626
5035	NC_003902	GTG	2	6	195355	195360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229626
5036	NC_003902	TGC	4	12	195362	195373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229626
5037	NC_003902	GGT	2	6	195432	195437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229626
5038	NC_003902	CGG	2	6	195489	195494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229626
5039	NC_003902	CGC	2	6	195509	195514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229626
5040	NC_003902	GTT	2	6	195528	195533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21229626
5041	NC_003902	CTGG	2	8	195594	195601	0 %	25 %	50 %	25 %	21229626
5042	NC_003902	TTC	2	6	195631	195636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21229626
5043	NC_003902	GC	3	6	195669	195674	0 %	0 %	50 %	50 %	21229626
5044	NC_003902	CGG	2	6	195689	195694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_003902	CGGC	2	8	195716	195723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_003902	GCCG	2	8	195733	195740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_003902	GA	3	6	195769	195774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_003902	ACC	2	6	195789	195794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229627
5049	NC_003902	C	6	6	195793	195798	0 %	0 %	0 %	100 %	21229627
5050	NC_003902	ACC	2	6	195816	195821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229627
5051	NC_003902	GCT	3	9	195824	195832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229627
5052	NC_003902	CCG	3	9	195850	195858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229627
5053	NC_003902	ACT	2	6	195973	195978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21229627
5054	NC_003902	TTCG	2	8	195992	195999	0 %	50 %	25 %	25 %	21229627
5055	NC_003902	CG	3	6	196030	196035	0 %	0 %	50 %	50 %	21229627
5056	NC_003902	GCCAT	2	10	196060	196069	20 %	20 %	20 %	40 %	21229627
5057	NC_003902	CTA	2	6	196124	196129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21229627
5058	NC_003902	CGGCG	2	10	196141	196150	0 %	0 %	60 %	40 %	21229627
5059	NC_003902	GCA	2	6	196168	196173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229627
5060	NC_003902	GTG	2	6	196179	196184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229627
5061	NC_003902	CGA	2	6	196190	196195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229627
5062	NC_003902	GCG	3	9	196297	196305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229627
5063	NC_003902	CGA	2	6	196322	196327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229627
5064	NC_003902	GGT	2	6	196337	196342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229627
5065	NC_003902	ACG	2	6	196363	196368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229627
5066	NC_003902	TAC	2	6	196446	196451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21229627
5067	NC_003902	ACC	2	6	196455	196460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229627
5068	NC_003902	CCG	2	6	196474	196479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229627
5069	NC_003902	CCG	2	6	196482	196487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229627
5070	NC_003902	CG	3	6	196508	196513	0 %	0 %	50 %	50 %	21229627
5071	NC_003902	CAA	2	6	196550	196555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21229627
5072	NC_003902	CGA	2	6	196580	196585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229627
5073	NC_003902	GTG	2	6	196589	196594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229627
5074	NC_003902	GCCAC	2	10	196603	196612	20 %	0 %	20 %	60 %	21229627
5075	NC_003902	TGG	2	6	196615	196620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229627
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5077	NC_003902	GCG	2	6	196744	196749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229627
5078	NC_003902	GAA	2	6	196766	196771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21229627
5079	NC_003902	GAC	2	6	196812	196817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229627
5080	NC_003902	CGC	2	6	196823	196828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229627
5081	NC_003902	TTC	2	6	196851	196856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21229627
5082	NC_003902	GCC	2	6	196863	196868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229627
5083	NC_003902	TGC	2	6	196903	196908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229627
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5085	NC_003902	CG	3	6	196933	196938	0 %	0 %	50 %	50 %	21229627
5086	NC_003902	CGC	2	6	196945	196950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229627
5087	NC_003902	CGGG	2	8	197008	197015	0 %	0 %	75 %	25 %	21229627
5088	NC_003902	GGGCG	2	10	197018	197027	0 %	0 %	80 %	20 %	21229627
5089	NC_003902	CTG	2	6	197028	197033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229627
5090	NC_003902	GCA	2	6	197065	197070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229627
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5092	NC_003902	CAG	2	6	197129	197134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229627
5093	NC_003902	GCG	2	6	197140	197145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229627
5094	NC_003902	CAC	2	6	197207	197212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229627
5095	NC_003902	ACC	2	6	197251	197256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229627
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5097	NC_003902	CTG	2	6	197447	197452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_003902	GCCC	2	8	197500	197507	0 %	0 %	25 %	75 %	21229628
5099	NC_003902	CG	3	6	197572	197577	0 %	0 %	50 %	50 %	21229628
5100	NC_003902	AAG	2	6	197594	197599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21229628
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5104	NC_003902	GC	3	6	197790	197795	0 %	0 %	50 %	50 %	21229628
5105	NC_003902	TGG	2	6	197826	197831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21229628
5106	NC_003902	ACC	2	6	198008	198013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229628
5107	NC_003902	GGC	2	6	198055	198060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229628
5108	NC_003902	CTCG	2	8	198073	198080	0 %	25 %	25 %	50 %	21229628
5109	NC_003902	CTC	2	6	198124	198129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21229628
5110	NC_003902	CCG	2	6	198141	198146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229628
5111	NC_003902	GCC	2	6	198184	198189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229628
5112	NC_003902	GCT	3	9	198247	198255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229628
5113	NC_003902	AAG	2	6	198260	198265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21229628
5114	NC_003902	ACG	2	6	198291	198296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229628
5115	NC_003902	GC	3	6	198328	198333	0 %	0 %	50 %	50 %	21229628
5116	NC_003902	GAC	2	6	198374	198379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229628
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5118	NC_003902	GCC	2	6	198423	198428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229628
5119	NC_003902	CCG	3	9	198450	198458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229628
5120	NC_003902	CCG	2	6	198542	198547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229628
5121	NC_003902	GC	3	6	198583	198588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5122	NC_003902	CTCC	2	8	198656	198663	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5123	NC_003902	CGG	2	6	198688	198693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_003902	TAGG	2	8	198728	198735	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5131	NC_003902	GC	3	6	198982	198987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5133	NC_003902	AGG	2	6	199208	199213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_003902	ACCAA	2	10	199231	199240	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5135	NC_003902	GC	3	6	199258	199263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5247	NC_003902	GGC	2	6	203033	203038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229632
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5250	NC_003902	CCG	2	6	203209	203214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229632
5251	NC_003902	CAGC	2	8	203273	203280	25 %	0 %	25 %	50 %	21229632
5252	NC_003902	TGC	2	6	203353	203358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229632
5253	NC_003902	TGC	2	6	203368	203373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229632
5254	NC_003902	CTA	2	6	203420	203425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21229632
5255	NC_003902	CGT	2	6	203426	203431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229632
5256	NC_003902	GCC	2	6	203478	203483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229632
5257	NC_003902	GCA	2	6	203509	203514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229632
5258	NC_003902	GCA	2	6	203525	203530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229632
5259	NC_003902	CTG	2	6	203556	203561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229632
5260	NC_003902	GCT	2	6	203626	203631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5261	NC_003902	GTT	2	6	203673	203678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_003902	GCG	2	6	203821	203826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5263	NC_003902	ACC	2	6	203834	203839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5264	NC_003902	GC	3	6	203896	203901	0 %	0 %	50 %	50 %	21229633
5265	NC_003902	CGGT	2	8	203946	203953	0 %	25 %	50 %	25 %	21229633
5266	NC_003902	CATCG	2	10	203960	203969	20 %	20 %	20 %	40 %	21229633
5267	NC_003902	TCT	2	6	204000	204005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21229633
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5269	NC_003902	GC	3	6	204125	204130	0 %	0 %	50 %	50 %	21229633
5270	NC_003902	CCA	2	6	204172	204177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229633
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5272	NC_003902	CCA	2	6	204223	204228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229633
5273	NC_003902	GTGCG	2	10	204244	204253	0 %	20 %	60 %	20 %	21229633
5274	NC_003902	AGC	2	6	204282	204287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229633
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5276	NC_003902	CGGC	2	8	204310	204317	0 %	0 %	50 %	50 %	21229633
5277	NC_003902	GTC	2	6	204335	204340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229633
5278	NC_003902	GC	4	8	204355	204362	0 %	0 %	50 %	50 %	21229633
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5280	NC_003902	TCG	2	6	204408	204413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229633
5281	NC_003902	CAG	2	6	204440	204445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229633
5282	NC_003902	GTC	2	6	204452	204457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229633
5283	NC_003902	GCA	2	6	204499	204504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229633
5284	NC_003902	GC	3	6	204571	204576	0 %	0 %	50 %	50 %	21229633
5285	NC_003902	GC	3	6	204832	204837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5286	NC_003902	GTCAT	2	10	204842	204851	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5287	NC_003902	CGA	2	6	204855	204860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5288	NC_003902	GCG	2	6	204862	204867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5289	NC_003902	ACGCC	2	10	204879	204888	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5290	NC_003902	AC	3	6	204896	204901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5291	NC_003902	GCCA	2	8	204906	204913	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5292	NC_003902	CGTCGC	2	12	204924	204935	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	21229634
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5294	NC_003902	GCCG	2	8	204991	204998	0 %	0 %	50 %	50 %	21229634
5295	NC_003902	GCC	2	6	205166	205171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21229634
5296	NC_003902	GACGA	2	10	205202	205211	40 %	0 %	40 %	20 %	21229634
5297	NC_003902	GCG	2	6	205239	205244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21229634
5298	NC_003902	TCA	2	6	205374	205379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21229634
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5300	NC_003902	CCA	2	6	205456	205461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21229634
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5303	NC_003902	GCA	2	6	205512	205517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229634
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5317	NC_003902	TGC	3	9	205921	205929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5318	NC_003902	GCT	2	6	205984	205989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229635
5319	NC_003902	GCA	3	9	206004	206012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21229635
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5322	NC_003902	GCCT	2	8	206051	206058	0 %	25 %	25 %	50 %	21229635
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5332	NC_003902	CAGGTG	2	12	206273	206284	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	21229635
5333	NC_003902	TGC	2	6	206367	206372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21229635
5334	NC_003902	CCG	2	6	206437	206442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5336	NC_003902	CAA	2	6	206499	206504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5337	NC_003902	GCCA	2	8	206578	206585	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5338	NC_003902	GTC	2	6	206590	206595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5340	NC_003902	CGC	2	6	206639	206644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5341	NC_003902	CGAT	2	8	206652	206659	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5342	NC_003902	TGCC	2	8	206671	206678	0 %	25 %	25 %	50 %	77747735
5343	NC_003902	CGCTG	2	10	206705	206714	0 %	20 %	40 %	40 %	77747735
5344	NC_003902	CGCC	2	8	206734	206741	0 %	0 %	25 %	75 %	77747735
5345	NC_003902	CG	3	6	206744	206749	0 %	0 %	50 %	50 %	77747735
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5361	NC_003902	CGGT	2	8	207445	207452	0 %	25 %	50 %	25 %	77747735
5362	NC_003902	TTC	2	6	207474	207479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77747735
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5376	NC_003902	CAC	2	6	207989	207994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77747735
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5488	NC_003902	AGG	2	6	212862	212867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5489	NC_003902	GCC	2	6	212896	212901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5490	NC_003902	CAT	2	6	212910	212915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5498	NC_003902	GCG	2	6	213275	213280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77747737
5499	NC_003902	CG	3	6	213301	213306	0 %	0 %	50 %	50 %	77747737
5500	NC_003902	GC	3	6	213338	213343	0 %	0 %	50 %	50 %	77747737

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