MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 37708

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002488	GCT	2	6	82	87	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002488	CAT	2	6	92	97	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002488	TGA	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002488	AGA	2	6	193	198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836606
5	NC_002488	GTG	2	6	237	242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836606
6	NC_002488	GTC	2	6	248	253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836606
7	NC_002488	TAG	2	6	285	290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836606
8	NC_002488	AGT	2	6	349	354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836606
9	NC_002488	ACA	2	6	380	385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836606
10	NC_002488	TTG	2	6	477	482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836606
11	NC_002488	TGC	2	6	508	513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836606
12	NC_002488	TGG	2	6	571	576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836606
13	NC_002488	TGC	2	6	607	612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836606
14	NC_002488	AAG	2	6	798	803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836606
15	NC_002488	ACA	2	6	841	846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836606
16	NC_002488	ATT	2	6	848	853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836606
17	NC_002488	CCT	2	6	944	949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836606
18	NC_002488	GTG	2	6	996	1001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836606
19	NC_002488	TAG	2	6	1086	1091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836606
20	NC_002488	CAA	2	6	1169	1174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836606
21	NC_002488	ATT	2	6	1212	1217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836606
22	NC_002488	ACA	2	6	1361	1366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836606
23	NC_002488	ACT	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_002488	GAT	2	6	1599	1604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002488	ACA	2	6	1653	1658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_002488	ACC	8	24	1690	1713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_002488	TAA	2	6	1859	1864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836607
28	NC_002488	GAT	2	6	1914	1919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836607
29	NC_002488	AAT	2	6	1929	1934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836607
30	NC_002488	GAT	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836607
31	NC_002488	TAT	3	9	2136	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836607
32	NC_002488	TTA	2	6	2155	2160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836607
33	NC_002488	CAA	2	6	2197	2202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836607
34	NC_002488	TTA	2	6	2211	2216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836607
35	NC_002488	ATT	2	6	2335	2340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836607
36	NC_002488	TTA	2	6	2374	2379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836607
37	NC_002488	GGC	2	6	2565	2570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836607
38	NC_002488	GTG	2	6	2594	2599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836607
39	NC_002488	AAG	3	9	2654	2662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836607
40	NC_002488	AGG	2	6	2666	2671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836607
41	NC_002488	GTG	2	6	2753	2758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836607
42	NC_002488	TTC	2	6	2790	2795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836607
43	NC_002488	AGT	2	6	2835	2840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836607
44	NC_002488	ATC	2	6	2896	2901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_002488	TAA	2	6	2944	2949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002488	TTA	2	6	3041	3046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002488	ATG	2	6	3058	3063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002488	TTA	2	6	3082	3087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002488	TCA	2	6	3100	3105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_002488	TTC	2	6	3106	3111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_002488	GTT	2	6	3195	3200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836608
52	NC_002488	TGC	2	6	3496	3501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836608
53	NC_002488	AGT	2	6	3527	3532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836608
54	NC_002488	TCA	2	6	3540	3545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836608
55	NC_002488	ACG	2	6	3562	3567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836608
56	NC_002488	ATT	2	6	3586	3591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836608
57	NC_002488	AAC	2	6	3645	3650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836608
58	NC_002488	AAC	2	6	3768	3773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836608
59	NC_002488	CGT	2	6	3845	3850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836608
60	NC_002488	ATT	2	6	4291	4296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002488	TCT	2	6	4337	4342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_002488	GCT	2	6	4421	4426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_002488	ATT	2	6	4444	4449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002488	ATA	2	6	4490	4495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002488	GCT	2	6	4786	4791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
66	NC_002488	GGC	2	6	4799	4804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836610
67	NC_002488	TAC	2	6	4830	4835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836610
68	NC_002488	CAC	2	6	4904	4909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836610
69	NC_002488	AGA	2	6	5047	5052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836610
70	NC_002488	TGG	2	6	5095	5100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836610
71	NC_002488	CGA	2	6	5107	5112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836610
72	NC_002488	TGG	2	6	5131	5136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836610
73	NC_002488	CAA	2	6	5219	5224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836610
74	NC_002488	TAC	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836610
75	NC_002488	GTG	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836610
76	NC_002488	GGT	2	6	5453	5458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836610
77	NC_002488	TTG	2	6	5544	5549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836610
78	NC_002488	TGG	2	6	5626	5631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836610
79	NC_002488	TGC	2	6	5653	5658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
80	NC_002488	TGA	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836610
81	NC_002488	TTC	2	6	5791	5796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836610
82	NC_002488	GGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836610
83	NC_002488	TGC	2	6	5926	5931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
84	NC_002488	GCT	2	6	5945	5950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
85	NC_002488	TCG	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
86	NC_002488	CTG	2	6	6075	6080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
87	NC_002488	CAT	3	9	6271	6279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836610
88	NC_002488	GCC	2	6	6388	6393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836610
89	NC_002488	CCT	2	6	6607	6612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836610
90	NC_002488	TGA	2	6	6754	6759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836610
91	NC_002488	GCC	2	6	6770	6775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836610
92	NC_002488	TTG	2	6	6776	6781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836610
93	NC_002488	TGC	2	6	6879	6884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
94	NC_002488	GAA	2	6	6982	6987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836610
95	NC_002488	AGC	2	6	7035	7040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836610
96	NC_002488	TAC	2	6	7048	7053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836610
97	NC_002488	TGC	2	6	7105	7110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
98	NC_002488	TTA	2	6	7210	7215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002488	GTT	2	6	7228	7233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002488	TGG	2	6	7505	7510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002488	GTT	3	9	7536	7544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002488	TGA	2	6	7572	7577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002488	CAT	2	6	7582	7587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_002488	TGC	2	6	7638	7643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_002488	TCG	2	6	7769	7774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_002488	ATT	2	6	7800	7805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002488	ATT	2	6	7933	7938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002488	TAC	2	6	8019	8024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_002488	GAA	2	6	8108	8113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836611
110	NC_002488	TGA	2	6	8145	8150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836611
111	NC_002488	GTG	2	6	8238	8243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836611
112	NC_002488	GCA	3	9	8248	8256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836611
113	NC_002488	TTG	2	6	8283	8288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836611
114	NC_002488	AAC	2	6	8502	8507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836611
115	NC_002488	GCT	2	6	8510	8515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836611
116	NC_002488	CGT	2	6	8539	8544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836611
117	NC_002488	TCA	2	6	8551	8556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836611
118	NC_002488	GAG	2	6	8558	8563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836611
119	NC_002488	TGC	2	6	8641	8646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836611
120	NC_002488	TTG	2	6	8693	8698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836611
121	NC_002488	TTG	2	6	8733	8738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836611
122	NC_002488	GAA	2	6	8794	8799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836611
123	NC_002488	CCG	2	6	8825	8830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836611
124	NC_002488	AGC	2	6	8880	8885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836611
125	NC_002488	GCA	2	6	8954	8959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836611
126	NC_002488	AGA	2	6	8961	8966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836611
127	NC_002488	TCT	2	6	8974	8979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_002488	GGT	2	6	9126	9131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836612
129	NC_002488	CTG	2	6	9142	9147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836612
130	NC_002488	ATC	2	6	9178	9183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836612
131	NC_002488	TGC	2	6	9185	9190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836612
132	NC_002488	CTC	2	6	9254	9259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836612
133	NC_002488	GCT	2	6	9408	9413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836612
134	NC_002488	GCA	2	6	9440	9445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836612
135	NC_002488	AAC	2	6	9486	9491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836612
136	NC_002488	TGC	2	6	9505	9510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836612
137	NC_002488	TTA	2	6	9667	9672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836612
138	NC_002488	TGC	2	6	9683	9688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836612
139	NC_002488	TTA	2	6	9720	9725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836612
140	NC_002488	GTG	2	6	9870	9875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836612
141	NC_002488	ACA	2	6	9955	9960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836612
142	NC_002488	TTA	2	6	10052	10057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836612
143	NC_002488	GAA	2	6	10094	10099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836612
144	NC_002488	GCT	2	6	10101	10106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836612
145	NC_002488	ACG	2	6	10117	10122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836612
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149	NC_002488	CTA	2	6	10466	10471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_002488	TGG	2	6	10587	10592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002488	GCG	2	6	10598	10603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_002488	GAA	2	6	10709	10714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836614
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166	NC_002488	ATA	2	6	11372	11377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_002488	ATC	2	6	11435	11440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_002488	AAC	2	6	11441	11446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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240	NC_002488	CTT	2	6	17016	17021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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255	NC_002488	TCA	2	6	18039	18044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_002488	CAT	2	6	18059	18064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_002488	TGA	2	6	18211	18216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_002488	CTG	2	6	18247	18252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_002488	GTC	2	6	18474	18479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836623
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262	NC_002488	TGA	2	6	18616	18621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836623
263	NC_002488	GCC	2	6	18628	18633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836623
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280	NC_002488	GTG	2	6	19343	19348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_002488	TTG	2	6	19857	19862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_002488	AAG	2	6	20198	20203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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