MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 56495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002488	TGA	2	6	195105	195110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836790
4002	NC_002488	CAT	2	6	195142	195147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836790
4003	NC_002488	ATG	2	6	195263	195268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836790
4004	NC_002488	ATT	2	6	195322	195327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836790
4005	NC_002488	T	6	6	195346	195351	0 %	100 %	0 %	0 %	15836790
4006	NC_002488	AAG	2	6	195362	195367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836790
4007	NC_002488	AGT	2	6	195407	195412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_002488	T	6	6	195460	195465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_002488	GCT	2	6	195514	195519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_002488	GCT	2	6	195546	195551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_002488	TG	3	6	195626	195631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_002488	GCG	2	6	195662	195667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_002488	CTG	2	6	195722	195727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836791
4014	NC_002488	GTG	2	6	195851	195856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836791
4015	NC_002488	CAG	2	6	195878	195883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836791
4016	NC_002488	TCT	2	6	195964	195969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836791
4017	NC_002488	CGA	2	6	195976	195981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836791
4018	NC_002488	GCT	2	6	195996	196001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836791
4019	NC_002488	GC	3	6	196014	196019	0 %	0 %	50 %	50 %	15836791
4020	NC_002488	ACTG	2	8	196148	196155	25 %	25 %	25 %	25 %	15836791
4021	NC_002488	CGG	2	6	196261	196266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836791
4022	NC_002488	AGC	2	6	196293	196298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836791
4023	NC_002488	GC	3	6	196445	196450	0 %	0 %	50 %	50 %	15836791
4024	NC_002488	ATG	2	6	196452	196457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836791
4025	NC_002488	CCAA	2	8	196543	196550	50 %	0 %	0 %	50 %	77747493
4026	NC_002488	GTT	2	6	196592	196597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77747493
4027	NC_002488	AGC	2	6	196599	196604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77747493
4028	NC_002488	TGT	2	6	196615	196620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77747493
4029	NC_002488	CAG	2	6	196649	196654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77747493
4030	NC_002488	CCGC	2	8	196659	196666	0 %	0 %	25 %	75 %	77747493
4031	NC_002488	AGCA	2	8	196667	196674	50 %	0 %	25 %	25 %	77747493
4032	NC_002488	TTTC	2	8	196795	196802	0 %	75 %	0 %	25 %	77747493
4033	NC_002488	GGCT	2	8	196846	196853	0 %	25 %	50 %	25 %	77747493
4034	NC_002488	CAG	2	6	196873	196878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77747493
4035	NC_002488	CGG	2	6	196917	196922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77747493
4036	NC_002488	TGCC	2	8	196925	196932	0 %	25 %	25 %	50 %	77747493
4037	NC_002488	TGCAT	2	10	196938	196947	20 %	40 %	20 %	20 %	77747493
4038	NC_002488	ACCA	2	8	197076	197083	50 %	0 %	0 %	50 %	77747493
4039	NC_002488	TCC	2	6	197106	197111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77747493
4040	NC_002488	ACA	2	6	197137	197142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77747493
4041	NC_002488	GAT	2	6	197180	197185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77747493
4042	NC_002488	CTG	2	6	197338	197343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77747493
4043	NC_002488	TGC	2	6	197374	197379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836793
4044	NC_002488	GCA	2	6	197409	197414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836793
4045	NC_002488	TCT	2	6	197459	197464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836793
4046	NC_002488	TCG	2	6	197468	197473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836793
4047	NC_002488	ACCA	2	8	197510	197517	50 %	0 %	0 %	50 %	15836793
4048	NC_002488	GTA	2	6	197559	197564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836793
4049	NC_002488	CCT	3	9	197592	197600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836793
4050	NC_002488	CAG	2	6	197685	197690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836793
4051	NC_002488	AGT	2	6	197726	197731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836793
4052	NC_002488	CAC	3	9	197734	197742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836793
4053	NC_002488	GGC	2	6	197781	197786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836793
4054	NC_002488	GCT	2	6	197814	197819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836793
4055	NC_002488	GCC	2	6	197820	197825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836793
4056	NC_002488	ATC	2	6	197861	197866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836793
4057	NC_002488	AC	4	8	197889	197896	50 %	0 %	0 %	50 %	15836793
4058	NC_002488	TCA	2	6	197939	197944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836794
4059	NC_002488	GTG	2	6	198079	198084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836794
4060	NC_002488	TGGT	2	8	198093	198100	0 %	50 %	50 %	0 %	15836794
4061	NC_002488	CGT	2	6	198114	198119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836794
4062	NC_002488	CAG	2	6	198134	198139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836794
4063	NC_002488	TGG	2	6	198141	198146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836794
4064	NC_002488	GCA	2	6	198183	198188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836794
4065	NC_002488	CGC	2	6	198191	198196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836794
4066	NC_002488	CGG	2	6	198247	198252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836794
4067	NC_002488	TTG	2	6	198270	198275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836794
4068	NC_002488	CGCGC	2	10	198281	198290	0 %	0 %	40 %	60 %	15836794
4069	NC_002488	GTG	2	6	198391	198396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836794
4070	NC_002488	GCC	2	6	198588	198593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836794
4071	NC_002488	GC	3	6	198637	198642	0 %	0 %	50 %	50 %	15836794
4072	NC_002488	GCATGC	2	12	198676	198687	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15836794
4073	NC_002488	TGA	2	6	198833	198838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836794
4074	NC_002488	AGC	2	6	198841	198846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836794
4075	NC_002488	CAT	2	6	198851	198856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836794
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4078	NC_002488	GCA	2	6	198926	198931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836794
4079	NC_002488	CA	3	6	198982	198987	50 %	0 %	0 %	50 %	15836794
4080	NC_002488	CAT	2	6	199055	199060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836794
4081	NC_002488	CG	3	6	199082	199087	0 %	0 %	50 %	50 %	15836794
4082	NC_002488	CAA	2	6	199184	199189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836794
4083	NC_002488	GGCTT	2	10	199216	199225	0 %	40 %	40 %	20 %	15836794
4084	NC_002488	TGC	2	6	199238	199243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836794
4085	NC_002488	TGCT	2	8	199330	199337	0 %	50 %	25 %	25 %	15836794
4086	NC_002488	TGTCA	2	10	199388	199397	20 %	40 %	20 %	20 %	15836795
4087	NC_002488	TCC	2	6	199428	199433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836795
4088	NC_002488	ACC	2	6	199449	199454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836795
4089	NC_002488	TGC	2	6	199464	199469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836795
4090	NC_002488	ATT	2	6	199518	199523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836795
4091	NC_002488	GC	3	6	199562	199567	0 %	0 %	50 %	50 %	15836795
4092	NC_002488	GT	3	6	199586	199591	0 %	50 %	50 %	0 %	15836795
4093	NC_002488	CAC	2	6	199599	199604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836795
4094	NC_002488	AAC	2	6	199766	199771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836795
4095	NC_002488	CG	3	6	199806	199811	0 %	0 %	50 %	50 %	15836795
4096	NC_002488	TGAT	2	8	200114	200121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_002488	TTGT	2	8	200214	200221	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_002488	TGA	2	6	200241	200246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_002488	GAT	2	6	200247	200252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4101	NC_002488	TTA	2	6	200341	200346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836796
4102	NC_002488	GATTTT	2	12	200349	200360	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15836796
4103	NC_002488	CAT	2	6	200481	200486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_002488	TTC	2	6	200540	200545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_002488	GAT	2	6	200566	200571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_002488	ACG	2	6	200609	200614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_002488	AGA	2	6	200660	200665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_002488	GAA	2	6	200877	200882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_002488	T	6	6	200913	200918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_002488	AATT	2	8	200923	200930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_002488	TGA	2	6	200934	200939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_002488	GAT	2	6	200974	200979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_002488	ATC	2	6	201001	201006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_002488	TC	3	6	201104	201109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4115	NC_002488	ATGG	2	8	201130	201137	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_002488	AGG	2	6	201147	201152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_002488	T	6	6	201159	201164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_002488	TCC	2	6	201169	201174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4119	NC_002488	TCT	2	6	201192	201197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_002488	T	6	6	201228	201233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_002488	TGG	2	6	201329	201334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_002488	TGA	2	6	201357	201362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_002488	CAC	2	6	201407	201412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4124	NC_002488	GC	3	6	201496	201501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_002488	TGC	2	6	201551	201556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_002488	GCAAGT	2	12	201641	201652	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4127	NC_002488	TGAA	2	8	201670	201677	50 %	25 %	25 %	0 %	15836797
4128	NC_002488	TTG	2	6	201694	201699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836797
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4200	NC_002488	TG	3	6	205303	205308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4230	NC_002488	TGC	2	6	206412	206417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4232	NC_002488	TGA	3	9	206448	206456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_002488	T	7	7	206490	206496	0 %	100 %	0 %	0 %	15836803
4234	NC_002488	A	6	6	206501	206506	100 %	0 %	0 %	0 %	15836803
4235	NC_002488	CATA	2	8	206643	206650	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4236	NC_002488	GAT	2	6	206679	206684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4241	NC_002488	TGA	2	6	206792	206797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_002488	GAT	2	6	206901	206906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836804
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