MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 56495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002488	CAT	2	6	171053	171058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836774
3502	NC_002488	GCT	2	6	171091	171096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836774
3503	NC_002488	GCC	2	6	171160	171165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836774
3504	NC_002488	TGA	2	6	171199	171204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836774
3505	NC_002488	CTG	2	6	171227	171232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836774
3506	NC_002488	GCA	2	6	171356	171361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836774
3507	NC_002488	GGT	2	6	171391	171396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836774
3508	NC_002488	AAC	3	9	171410	171418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836774
3509	NC_002488	AGA	2	6	171432	171437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836774
3510	NC_002488	TTG	2	6	171473	171478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836774
3511	NC_002488	GAGC	2	8	171530	171537	25 %	0 %	50 %	25 %	15836774
3512	NC_002488	GAT	2	6	171563	171568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836774
3513	NC_002488	CTT	2	6	171648	171653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836774
3514	NC_002488	TGG	2	6	171771	171776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_002488	TAC	2	6	171779	171784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_002488	GTCC	2	8	171808	171815	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3517	NC_002488	ATA	2	6	171831	171836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_002488	T	6	6	171887	171892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_002488	TTA	2	6	171932	171937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_002488	T	6	6	171990	171995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_002488	T	6	6	171999	172004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_002488	GAA	2	6	172019	172024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_002488	CTGG	2	8	172034	172041	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3524	NC_002488	AGT	2	6	172046	172051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_002488	GGC	2	6	172067	172072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_002488	TG	3	6	172121	172126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_002488	TTGTT	2	10	172140	172149	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_002488	TATT	2	8	172190	172197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_002488	T	6	6	172249	172254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_002488	GGC	2	6	172311	172316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_002488	GCA	2	6	172342	172347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_002488	GTA	2	6	172353	172358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_002488	CGA	2	6	172550	172555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_002488	GAT	2	6	172575	172580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_002488	GCA	2	6	172624	172629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_002488	GAA	2	6	172683	172688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_002488	GAA	2	6	172720	172725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_002488	GTT	2	6	172746	172751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_002488	CAG	2	6	172792	172797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_002488	GGT	2	6	172857	172862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_002488	TGT	2	6	172873	172878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_002488	AGG	2	6	172982	172987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_002488	GGC	2	6	173003	173008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_002488	ACACTG	2	12	173020	173031	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_002488	CGC	2	6	173151	173156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_002488	GAA	2	6	173247	173252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_002488	TGC	2	6	173323	173328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_002488	GTC	2	6	173335	173340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_002488	TCGTG	2	10	173344	173353	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3550	NC_002488	TGG	2	6	173413	173418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_002488	GGA	2	6	173449	173454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_002488	TCA	2	6	173474	173479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_002488	AC	3	6	173500	173505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3554	NC_002488	TAC	2	6	173507	173512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_002488	TGC	2	6	173640	173645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_002488	AC	3	6	173670	173675	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3557	NC_002488	TTG	2	6	173697	173702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_002488	GAG	2	6	173728	173733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_002488	CCT	2	6	173811	173816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_002488	GTC	2	6	173970	173975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_002488	CCA	2	6	173995	174000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_002488	GGT	2	6	174028	174033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_002488	GGT	2	6	174063	174068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_002488	TCC	2	6	174074	174079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_002488	CCA	2	6	174085	174090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_002488	ATT	2	6	174102	174107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_002488	T	6	6	174126	174131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_002488	TGA	2	6	174174	174179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_002488	TAA	2	6	174205	174210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_002488	TGG	2	6	174305	174310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_002488	CAA	2	6	174373	174378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_002488	AGG	2	6	174451	174456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_002488	AGT	2	6	174519	174524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_002488	AGG	2	6	174594	174599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_002488	G	6	6	174675	174680	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_002488	TCC	2	6	174685	174690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_002488	GACC	2	8	174707	174714	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3578	NC_002488	AC	3	6	175207	175212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_002488	CGTC	2	8	175225	175232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_002488	AAC	2	6	175244	175249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_002488	AGG	2	6	175318	175323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_002488	AGC	2	6	175334	175339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_002488	AAAG	2	8	175348	175355	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_002488	ATA	2	6	175533	175538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_002488	GTTG	2	8	175714	175721	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_002488	AGG	2	6	175732	175737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_002488	T	6	6	175797	175802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_002488	ACCGT	2	10	175861	175870	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3589	NC_002488	AGGT	2	8	175881	175888	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_002488	GA	3	6	175912	175917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_002488	TGG	2	6	175978	175983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_002488	CGG	2	6	176165	176170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_002488	GCG	2	6	176247	176252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_002488	TGAAAT	2	12	176274	176285	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_002488	TGG	2	6	176415	176420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_002488	ACC	2	6	176436	176441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_002488	TGG	2	6	176496	176501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_002488	TCC	2	6	176522	176527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_002488	GGA	2	6	176539	176544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_002488	TG	3	6	176583	176588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_002488	GGT	2	6	176659	176664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_002488	CGG	2	6	176746	176751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_002488	TCA	2	6	176774	176779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_002488	CGT	2	6	176854	176859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_002488	GCT	2	6	176908	176913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_002488	GC	3	6	177029	177034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3607	NC_002488	GTG	2	6	177089	177094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_002488	GT	3	6	177105	177110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_002488	GCA	2	6	177115	177120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_002488	T	6	6	177181	177186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_002488	TCA	2	6	177232	177237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_002488	T	8	8	177266	177273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_002488	ACC	2	6	177327	177332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3614	NC_002488	ATCCC	2	10	177335	177344	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3615	NC_002488	GTTT	2	8	177456	177463	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_002488	TGT	2	6	177469	177474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_002488	CT	3	6	177513	177518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_002488	GTC	2	6	177651	177656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836775
3619	NC_002488	GCATC	2	10	177664	177673	20 %	20 %	20 %	40 %	15836775
3620	NC_002488	ACT	2	6	177674	177679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836775
3621	NC_002488	GT	3	6	177680	177685	0 %	50 %	50 %	0 %	15836775
3622	NC_002488	TCA	2	6	177732	177737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836775
3623	NC_002488	CGT	2	6	177827	177832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836775
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3625	NC_002488	AAG	2	6	177879	177884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836775
3626	NC_002488	GTCGGT	2	12	178022	178033	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15836775
3627	NC_002488	TGC	2	6	178042	178047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836775
3628	NC_002488	TC	3	6	178100	178105	0 %	50 %	0 %	50 %	15836775
3629	NC_002488	TCC	2	6	178143	178148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836775
3630	NC_002488	GGA	2	6	178166	178171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836775
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3632	NC_002488	GTC	2	6	178242	178247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836775
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3875	NC_002488	GTC	2	6	189127	189132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836784
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3877	NC_002488	GCT	2	6	189190	189195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836784
3878	NC_002488	GTGCT	2	10	189349	189358	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3879	NC_002488	CT	3	6	189388	189393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3880	NC_002488	GCAG	2	8	189407	189414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3881	NC_002488	TCA	2	6	189489	189494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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