MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 56495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_002488	A	6	6	124694	124699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_002488	TTGT	2	8	124720	124727	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_002488	TCA	2	6	124768	124773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_002488	TG	3	6	124799	124804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_002488	AGT	2	6	124825	124830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_002488	TGC	2	6	124861	124866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_002488	TTG	2	6	124915	124920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_002488	GCA	2	6	124976	124981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_002488	A	6	6	125000	125005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_002488	GTT	2	6	125015	125020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_002488	GC	3	6	125071	125076	0 %	0 %	50 %	50 %	15836732
2512	NC_002488	CTG	2	6	125101	125106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836732
2513	NC_002488	GCC	2	6	125117	125122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836732
2514	NC_002488	TCG	2	6	125136	125141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836732
2515	NC_002488	GC	3	6	125147	125152	0 %	0 %	50 %	50 %	15836732
2516	NC_002488	GCA	2	6	125190	125195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836732
2517	NC_002488	GTA	2	6	125234	125239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836732
2518	NC_002488	ACC	2	6	125252	125257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836732
2519	NC_002488	TCA	2	6	125322	125327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836732
2520	NC_002488	AGC	2	6	125385	125390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836732
2521	NC_002488	GC	3	6	125447	125452	0 %	0 %	50 %	50 %	15836732
2522	NC_002488	CTCCCA	2	12	125528	125539	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	15836732
2523	NC_002488	ACTG	2	8	125557	125564	25 %	25 %	25 %	25 %	15836732
2524	NC_002488	CCT	2	6	125677	125682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836732
2525	NC_002488	ACC	2	6	125742	125747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836732
2526	NC_002488	CGG	2	6	125775	125780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836732
2527	NC_002488	ATC	2	6	125789	125794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836732
2528	NC_002488	CGC	2	6	125806	125811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836732
2529	NC_002488	TCT	2	6	125919	125924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836732
2530	NC_002488	AAC	2	6	125961	125966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836732
2531	NC_002488	AGC	2	6	126243	126248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836732
2532	NC_002488	TGA	2	6	126279	126284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836732
2533	NC_002488	GCA	2	6	126306	126311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836732
2534	NC_002488	GTC	2	6	126371	126376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836732
2535	NC_002488	CTT	2	6	126440	126445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836732
2536	NC_002488	CG	3	6	126459	126464	0 %	0 %	50 %	50 %	15836732
2537	NC_002488	GCG	2	6	126501	126506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836732
2538	NC_002488	GGT	2	6	126512	126517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836732
2539	NC_002488	CGG	2	6	126613	126618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836732
2540	NC_002488	CCG	2	6	126633	126638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836732
2541	NC_002488	CAA	2	6	126664	126669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836732
2542	NC_002488	CTG	2	6	126762	126767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836732
2543	NC_002488	ACC	2	6	126825	126830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836732
2544	NC_002488	CG	3	6	126857	126862	0 %	0 %	50 %	50 %	15836732
2545	NC_002488	TAC	2	6	126893	126898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836732
2546	NC_002488	GCC	2	6	126945	126950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836732
2547	NC_002488	GGCC	2	8	126977	126984	0 %	0 %	50 %	50 %	15836732
2548	NC_002488	GGA	2	6	126997	127002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836732
2549	NC_002488	GAG	2	6	127034	127039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836732
2550	NC_002488	TG	3	6	127051	127056	0 %	50 %	50 %	0 %	15836732
2551	NC_002488	TCT	2	6	127057	127062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_002488	CAG	2	6	127161	127166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836733
2553	NC_002488	ATC	2	6	127169	127174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836733
2554	NC_002488	CA	3	6	127257	127262	50 %	0 %	0 %	50 %	15836733
2555	NC_002488	TGC	2	6	127306	127311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836733
2556	NC_002488	GCA	2	6	127317	127322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836733
2557	NC_002488	CACC	2	8	127323	127330	25 %	0 %	0 %	75 %	15836733
2558	NC_002488	GCC	2	6	127348	127353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836733
2559	NC_002488	AGCG	2	8	127368	127375	25 %	0 %	50 %	25 %	15836733
2560	NC_002488	GCC	2	6	127391	127396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836733
2561	NC_002488	ATC	2	6	127421	127426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836733
2562	NC_002488	C	6	6	127493	127498	0 %	0 %	0 %	100 %	15836733
2563	NC_002488	GTT	2	6	127510	127515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836733
2564	NC_002488	TGCA	2	8	127533	127540	25 %	25 %	25 %	25 %	15836733
2565	NC_002488	GAA	2	6	127555	127560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836733
2566	NC_002488	GTGAC	2	10	127595	127604	20 %	20 %	40 %	20 %	15836733
2567	NC_002488	GCA	2	6	127634	127639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836733
2568	NC_002488	CA	3	6	127661	127666	50 %	0 %	0 %	50 %	15836733
2569	NC_002488	AGG	2	6	127671	127676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836733
2570	NC_002488	GC	3	6	127736	127741	0 %	0 %	50 %	50 %	15836733
2571	NC_002488	GCA	2	6	127814	127819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836733
2572	NC_002488	C	6	6	127858	127863	0 %	0 %	0 %	100 %	15836733
2573	NC_002488	GCC	2	6	127995	128000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836733
2574	NC_002488	AAC	2	6	128036	128041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836733
2575	NC_002488	GGA	2	6	128188	128193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836733
2576	NC_002488	T	6	6	128308	128313	0 %	100 %	0 %	0 %	15836734
2577	NC_002488	ACCC	2	8	128317	128324	25 %	0 %	0 %	75 %	15836734
2578	NC_002488	GCC	2	6	128349	128354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836734
2579	NC_002488	GCA	2	6	128357	128362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836734
2580	NC_002488	A	6	6	128388	128393	100 %	0 %	0 %	0 %	15836734
2581	NC_002488	CTG	2	6	128491	128496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2582	NC_002488	ACTGC	2	10	128546	128555	20 %	20 %	20 %	40 %	15836735
2583	NC_002488	GCA	2	6	128585	128590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836735
2584	NC_002488	CCT	2	6	128591	128596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836735
2585	NC_002488	C	6	6	128608	128613	0 %	0 %	0 %	100 %	15836735
2586	NC_002488	GC	3	6	128636	128641	0 %	0 %	50 %	50 %	15836735
2587	NC_002488	TCA	2	6	128692	128697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836735
2588	NC_002488	TAC	3	9	128747	128755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77747488
2589	NC_002488	CAG	2	6	128785	128790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77747488
2590	NC_002488	CAT	2	6	128875	128880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77747488
2591	NC_002488	GCA	2	6	128905	128910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77747488
2592	NC_002488	GCCAT	2	10	128918	128927	20 %	20 %	20 %	40 %	77747488
2593	NC_002488	GCA	2	6	128948	128953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77747488
2594	NC_002488	ACAGC	2	10	128976	128985	40 %	0 %	20 %	40 %	77747488
2595	NC_002488	CTC	2	6	129004	129009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77747488
2596	NC_002488	CTTG	2	8	129166	129173	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2597	NC_002488	TTCCC	3	15	129224	129238	0 %	40 %	0 %	60 %	15836737
2598	NC_002488	CGC	2	6	129291	129296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836737
2599	NC_002488	GCC	2	6	129345	129350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836737
2600	NC_002488	GCG	2	6	129357	129362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836737
2601	NC_002488	CGGA	2	8	129411	129418	25 %	0 %	50 %	25 %	15836737
2602	NC_002488	TAA	2	6	129438	129443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836737
2603	NC_002488	TGA	2	6	129521	129526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836737
2604	NC_002488	ATGG	2	8	129565	129572	25 %	25 %	50 %	0 %	15836737
2605	NC_002488	CTAT	2	8	129615	129622	25 %	50 %	0 %	25 %	15836737
2606	NC_002488	GGCC	2	8	129687	129694	0 %	0 %	50 %	50 %	15836737
2607	NC_002488	ATT	2	6	129709	129714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836737
2608	NC_002488	GCC	2	6	129726	129731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836737
2609	NC_002488	C	6	6	129730	129735	0 %	0 %	0 %	100 %	15836737
2610	NC_002488	TCC	2	6	129758	129763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836737
2611	NC_002488	GGAC	2	8	129776	129783	25 %	0 %	50 %	25 %	15836737
2612	NC_002488	A	7	7	129814	129820	100 %	0 %	0 %	0 %	15836737
2613	NC_002488	ACA	2	6	129833	129838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836737
2614	NC_002488	TTC	2	6	129862	129867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836737
2615	NC_002488	CAC	2	6	129894	129899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836737
2616	NC_002488	CCG	2	6	129909	129914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836737
2617	NC_002488	ATACCT	2	12	129968	129979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836737
2618	NC_002488	CTG	2	6	129982	129987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836737
2619	NC_002488	CAC	2	6	129993	129998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836737
2620	NC_002488	CTGGA	2	10	130011	130020	20 %	20 %	40 %	20 %	15836737
2621	NC_002488	ATG	2	6	130187	130192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836737
2622	NC_002488	C	6	6	130298	130303	0 %	0 %	0 %	100 %	15836737
2623	NC_002488	GCCA	2	8	130441	130448	25 %	0 %	25 %	50 %	15836737
2624	NC_002488	GCCA	2	8	130450	130457	25 %	0 %	25 %	50 %	15836737
2625	NC_002488	CGG	2	6	130499	130504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836737
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2723	NC_002488	GCG	2	6	135530	135535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2872	NC_002488	TACCGT	2	12	142112	142123	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15836746
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