MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 56495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_002488	CAC	2	6	97856	97861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836704
2003	NC_002488	GAT	2	6	97953	97958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836704
2004	NC_002488	GTC	2	6	97971	97976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836704
2005	NC_002488	GC	3	6	97993	97998	0 %	0 %	50 %	50 %	15836704
2006	NC_002488	TGG	2	6	98063	98068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836704
2007	NC_002488	CAA	2	6	98110	98115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_002488	CCT	2	6	98153	98158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2009	NC_002488	CCCT	2	8	98212	98219	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2010	NC_002488	TTCTGG	2	12	98244	98255	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2011	NC_002488	AGAGA	2	10	98340	98349	60 %	0 %	40 %	0 %	15836705
2012	NC_002488	GCTGTA	7	42	98393	98434	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15836705
2013	NC_002488	AAC	2	6	98443	98448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836705
2014	NC_002488	GCA	2	6	98509	98514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836705
2015	NC_002488	AGC	2	6	98541	98546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836705
2016	NC_002488	GC	3	6	98545	98550	0 %	0 %	50 %	50 %	15836705
2017	NC_002488	GCTG	2	8	98568	98575	0 %	25 %	50 %	25 %	15836705
2018	NC_002488	CCTGCC	2	12	98582	98593	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	15836705
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2022	NC_002488	TGA	2	6	98879	98884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_002488	TCGT	2	8	98924	98931	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2024	NC_002488	ATG	2	6	98951	98956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_002488	ATG	2	6	98966	98971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_002488	CGT	2	6	99295	99300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836707
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2039	NC_002488	ACA	2	6	99872	99877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836707
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2043	NC_002488	CCG	2	6	100084	100089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836707
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2051	NC_002488	GTG	2	6	100572	100577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836708
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2064	NC_002488	GAT	2	6	101578	101583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836708
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2095	NC_002488	G	6	6	103216	103221	0 %	0 %	100 %	0 %	15836710
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2108	NC_002488	GCAA	2	8	103798	103805	50 %	0 %	25 %	25 %	15836710
2109	NC_002488	TGG	2	6	103898	103903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836710
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2115	NC_002488	GC	3	6	104154	104159	0 %	0 %	50 %	50 %	15836710
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2117	NC_002488	TGC	2	6	104513	104518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2119	NC_002488	TTTG	2	8	104643	104650	0 %	75 %	25 %	0 %	15836711
2120	NC_002488	CGC	2	6	104689	104694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836711
2121	NC_002488	CAG	2	6	104711	104716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836711
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2123	NC_002488	CAC	2	6	104900	104905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836711
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2125	NC_002488	TGG	2	6	105152	105157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836711
2126	NC_002488	ATT	2	6	105259	105264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836711
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2129	NC_002488	GGT	2	6	105479	105484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836711
2130	NC_002488	CTG	2	6	105521	105526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836711
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2133	NC_002488	ACTG	2	8	105874	105881	25 %	25 %	25 %	25 %	15836711
2134	NC_002488	CGTC	2	8	105889	105896	0 %	25 %	25 %	50 %	15836711
2135	NC_002488	GCG	2	6	105920	105925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836711
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2138	NC_002488	AG	3	6	106120	106125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2139	NC_002488	GTG	3	9	106217	106225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836712
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2142	NC_002488	CG	3	6	106337	106342	0 %	0 %	50 %	50 %	15836712
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2144	NC_002488	AATG	2	8	106454	106461	50 %	25 %	25 %	0 %	15836712
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2154	NC_002488	CAC	2	6	107075	107080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2189	NC_002488	GCGGA	2	10	108598	108607	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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2232	NC_002488	CGA	2	6	111210	111215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161378154
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2236	NC_002488	AAG	2	6	111324	111329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836720
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2238	NC_002488	CGG	2	6	111431	111436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836720
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2242	NC_002488	CGG	2	6	111555	111560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836720
2243	NC_002488	GTCA	2	8	111588	111595	25 %	25 %	25 %	25 %	15836720
2244	NC_002488	AGC	2	6	111619	111624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836720
2245	NC_002488	TTTA	2	8	111671	111678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2246	NC_002488	TGACC	2	10	111727	111736	20 %	20 %	20 %	40 %	15836721
2247	NC_002488	TGATC	2	10	111739	111748	20 %	40 %	20 %	20 %	15836721
2248	NC_002488	AGA	2	6	111769	111774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836721
2249	NC_002488	CA	3	6	111868	111873	50 %	0 %	0 %	50 %	15836721
2250	NC_002488	GTGCTA	2	12	111890	111901	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15836721
2251	NC_002488	TCCC	2	8	111921	111928	0 %	25 %	0 %	75 %	15836721
2252	NC_002488	TGC	2	6	112039	112044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836721
2253	NC_002488	CTT	2	6	112051	112056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836721
2254	NC_002488	TGA	2	6	112105	112110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836721
2255	NC_002488	ATTG	2	8	112175	112182	25 %	50 %	25 %	0 %	15836721
2256	NC_002488	CTG	2	6	112226	112231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836721
2257	NC_002488	CGT	2	6	112241	112246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836721
2258	NC_002488	TGA	2	6	112378	112383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836721
2259	NC_002488	CAA	2	6	112438	112443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836721
2260	NC_002488	GGAA	2	8	112600	112607	50 %	0 %	50 %	0 %	15836721
2261	NC_002488	TCGCA	2	10	112615	112624	20 %	20 %	20 %	40 %	15836721
2262	NC_002488	GAA	2	6	112661	112666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836721
2263	NC_002488	GCG	2	6	112674	112679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836721
2264	NC_002488	GC	3	6	112713	112718	0 %	0 %	50 %	50 %	15836721
2265	NC_002488	TGA	2	6	112762	112767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836721
2266	NC_002488	TG	3	6	112771	112776	0 %	50 %	50 %	0 %	15836721
2267	NC_002488	TTGC	2	8	112829	112836	0 %	50 %	25 %	25 %	15836721
2268	NC_002488	GC	3	6	112874	112879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2269	NC_002488	CTT	2	6	112940	112945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836722
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2272	NC_002488	CCA	2	6	113177	113182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2273	NC_002488	TCA	2	6	113199	113204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2275	NC_002488	GCAACG	2	12	113326	113337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836723
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2279	NC_002488	GCA	2	6	113515	113520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836723
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2281	NC_002488	ACC	2	6	113642	113647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836723
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2284	NC_002488	ATTG	2	8	113746	113753	25 %	50 %	25 %	0 %	15836723
2285	NC_002488	CTG	2	6	113951	113956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836723
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2289	NC_002488	CATCG	2	10	114011	114020	20 %	20 %	20 %	40 %	15836723
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2300	NC_002488	GGAT	2	8	114498	114505	25 %	25 %	50 %	0 %	15836723
2301	NC_002488	GCA	2	6	114508	114513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836723
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2328	NC_002488	AAATTT	2	12	116171	116182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2329	NC_002488	T	7	7	116180	116186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2352	NC_002488	GT	3	6	117648	117653	0 %	50 %	50 %	0 %	15836726
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2356	NC_002488	GTTGCG	2	12	117735	117746	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15836726
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2359	NC_002488	GTC	2	6	117856	117861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836726
2360	NC_002488	CAT	2	6	117933	117938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836726
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2364	NC_002488	CCG	2	6	118036	118041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836726
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2366	NC_002488	ATGA	2	8	118090	118097	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2367	NC_002488	CAA	2	6	118104	118109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2368	NC_002488	TGA	2	6	118205	118210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2369	NC_002488	CATC	2	8	118289	118296	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2370	NC_002488	TGA	2	6	118312	118317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2371	NC_002488	GCT	2	6	118331	118336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2372	NC_002488	GTT	2	6	118352	118357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2374	NC_002488	TGCTG	2	10	118457	118466	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2499	NC_002488	CAG	2	6	124645	124650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2500	NC_002488	T	6	6	124657	124662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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