MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 56495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002488	ACC	2	6	70720	70725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_002488	TGG	2	6	70780	70785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_002488	TCC	2	6	70806	70811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1504	NC_002488	GGA	2	6	70823	70828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_002488	TG	3	6	70867	70872	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_002488	GGT	2	6	70943	70948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_002488	CGG	2	6	71030	71035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_002488	TCA	2	6	71058	71063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_002488	CGT	2	6	71138	71143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_002488	GCT	2	6	71192	71197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_002488	GC	3	6	71313	71318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_002488	GTG	2	6	71373	71378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_002488	GT	3	6	71389	71394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_002488	GCA	2	6	71399	71404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_002488	T	6	6	71465	71470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_002488	TCA	2	6	71516	71521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_002488	T	8	8	71550	71557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_002488	ACC	2	6	71611	71616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_002488	ATCCC	2	10	71619	71628	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1520	NC_002488	GTTT	2	8	71740	71747	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_002488	TGT	2	6	71753	71758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_002488	CT	3	6	71797	71802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_002488	GTC	2	6	71935	71940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836676
1524	NC_002488	GCATC	2	10	71948	71957	20 %	20 %	20 %	40 %	15836676
1525	NC_002488	ACT	2	6	71958	71963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836676
1526	NC_002488	GT	3	6	71964	71969	0 %	50 %	50 %	0 %	15836676
1527	NC_002488	TCA	2	6	72016	72021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836676
1528	NC_002488	CGT	2	6	72111	72116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836676
1529	NC_002488	CGC	2	6	72138	72143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836676
1530	NC_002488	AAG	2	6	72163	72168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836676
1531	NC_002488	GTCGGT	2	12	72306	72317	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15836676
1532	NC_002488	TGC	2	6	72326	72331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836676
1533	NC_002488	TC	3	6	72384	72389	0 %	50 %	0 %	50 %	15836676
1534	NC_002488	TCC	2	6	72427	72432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836676
1535	NC_002488	GGA	2	6	72450	72455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836676
1536	NC_002488	TTGT	2	8	72513	72520	0 %	75 %	25 %	0 %	15836676
1537	NC_002488	GTC	2	6	72526	72531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836676
1538	NC_002488	CCT	2	6	72560	72565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836676
1539	NC_002488	ACC	2	6	72573	72578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836676
1540	NC_002488	ACT	2	6	72591	72596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836676
1541	NC_002488	CCA	2	6	72657	72662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_002488	GAT	2	6	72669	72674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_002488	ATC	2	6	72696	72701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_002488	A	6	6	72851	72856	100 %	0 %	0 %	0 %	15836677
1545	NC_002488	CAT	2	6	72872	72877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836677
1546	NC_002488	GCCA	2	8	72913	72920	25 %	0 %	25 %	50 %	15836677
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1548	NC_002488	CAA	2	6	72989	72994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836677
1549	NC_002488	TC	3	6	73011	73016	0 %	50 %	0 %	50 %	15836677
1550	NC_002488	ACAA	2	8	73017	73024	75 %	0 %	0 %	25 %	15836677
1551	NC_002488	AACC	2	8	73060	73067	50 %	0 %	0 %	50 %	15836677
1552	NC_002488	AGC	2	6	73083	73088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836677
1553	NC_002488	TCAG	2	8	73098	73105	25 %	25 %	25 %	25 %	15836677
1554	NC_002488	CGG	2	6	73106	73111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836677
1555	NC_002488	CAC	2	6	73117	73122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836677
1556	NC_002488	GTG	2	6	73127	73132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836677
1557	NC_002488	CAT	2	6	73172	73177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836677
1558	NC_002488	TGC	2	6	73187	73192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836677
1559	NC_002488	GTGA	2	8	73267	73274	25 %	25 %	50 %	0 %	15836677
1560	NC_002488	AGCA	2	8	73292	73299	50 %	0 %	25 %	25 %	15836677
1561	NC_002488	TCCCCA	2	12	73336	73347	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	15836677
1562	NC_002488	TAAA	2	8	73357	73364	75 %	25 %	0 %	0 %	15836677
1563	NC_002488	A	6	6	73385	73390	100 %	0 %	0 %	0 %	15836677
1564	NC_002488	A	8	8	73408	73415	100 %	0 %	0 %	0 %	15836677
1565	NC_002488	A	6	6	73452	73457	100 %	0 %	0 %	0 %	15836677
1566	NC_002488	ACC	2	6	73463	73468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836677
1567	NC_002488	CCA	2	6	73483	73488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836677
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1569	NC_002488	A	6	6	73563	73568	100 %	0 %	0 %	0 %	15836677
1570	NC_002488	A	8	8	73574	73581	100 %	0 %	0 %	0 %	15836677
1571	NC_002488	AAC	2	6	73586	73591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836677
1572	NC_002488	AAC	2	6	73596	73601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836677
1573	NC_002488	TC	3	6	73701	73706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1575	NC_002488	CGG	2	6	73990	73995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836678
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1579	NC_002488	TGTGC	2	10	74159	74168	0 %	40 %	40 %	20 %	15836678
1580	NC_002488	TGC	2	6	74210	74215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836678
1581	NC_002488	AAG	2	6	74229	74234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836678
1582	NC_002488	TTG	2	6	74239	74244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836678
1583	NC_002488	CTG	2	6	74263	74268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836678
1584	NC_002488	GAT	2	6	74291	74296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836678
1585	NC_002488	TTGT	2	8	74343	74350	0 %	75 %	25 %	0 %	15836678
1586	NC_002488	GCT	2	6	74376	74381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836678
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1588	NC_002488	TTG	2	6	74506	74511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836678
1589	NC_002488	TCCA	2	8	74545	74552	25 %	25 %	0 %	50 %	15836678
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1601	NC_002488	TGG	3	9	74984	74992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836678
1602	NC_002488	ATG	2	6	75015	75020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836678
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1604	NC_002488	TGA	2	6	75057	75062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836678
1605	NC_002488	GGC	2	6	75157	75162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1607	NC_002488	GAT	2	6	75218	75223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_002488	TGA	2	6	75229	75234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_002488	TTA	2	6	75243	75248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_002488	T	6	6	75290	75295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_002488	TGC	2	6	75308	75313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_002488	GTAC	2	8	75435	75442	25 %	25 %	25 %	25 %	15836679
1613	NC_002488	TATC	2	8	75463	75470	25 %	50 %	0 %	25 %	15836679
1614	NC_002488	TGT	2	6	75494	75499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836679
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1616	NC_002488	TAC	2	6	75617	75622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836679
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1619	NC_002488	GAT	2	6	75762	75767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_002488	GCG	2	6	75882	75887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836680
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1622	NC_002488	GC	3	6	75928	75933	0 %	0 %	50 %	50 %	15836680
1623	NC_002488	GCA	2	6	76001	76006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836680
1624	NC_002488	TTG	2	6	76097	76102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836680
1625	NC_002488	GCT	2	6	76133	76138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836680
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1627	NC_002488	ATG	3	9	76263	76271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836680
1628	NC_002488	GCC	2	6	76272	76277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836680
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