MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 56495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_002488	TCA	2	6	47302	47307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836655
1003	NC_002488	TCC	2	6	47319	47324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836655
1004	NC_002488	TAGGA	2	10	47364	47373	40 %	20 %	40 %	0 %	15836655
1005	NC_002488	ATG	2	6	47391	47396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836655
1006	NC_002488	TCG	2	6	47406	47411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836655
1007	NC_002488	CTT	2	6	47497	47502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836655
1008	NC_002488	GCA	3	9	47530	47538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836655
1009	NC_002488	CTGG	2	8	47567	47574	0 %	25 %	50 %	25 %	15836655
1010	NC_002488	GTT	2	6	47587	47592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836655
1011	NC_002488	GC	4	8	47628	47635	0 %	0 %	50 %	50 %	15836655
1012	NC_002488	GCA	2	6	47772	47777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836655
1013	NC_002488	GAA	2	6	47840	47845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836655
1014	NC_002488	GCC	2	6	47852	47857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836655
1015	NC_002488	CTT	2	6	47893	47898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836655
1016	NC_002488	CG	3	6	47903	47908	0 %	0 %	50 %	50 %	15836655
1017	NC_002488	TAC	2	6	47920	47925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836655
1018	NC_002488	GCC	2	6	47954	47959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836655
1019	NC_002488	CGA	2	6	47986	47991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836655
1020	NC_002488	TCA	2	6	48003	48008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836655
1021	NC_002488	GGC	2	6	48020	48025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836655
1022	NC_002488	GCGCC	2	10	48213	48222	0 %	0 %	40 %	60 %	15836655
1023	NC_002488	GTC	2	6	48239	48244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836655
1024	NC_002488	TCG	2	6	48327	48332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836655
1025	NC_002488	GT	3	6	48362	48367	0 %	50 %	50 %	0 %	15836655
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1030	NC_002488	GCG	2	6	48527	48532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836655
1031	NC_002488	CCA	2	6	48557	48562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836655
1032	NC_002488	G	7	7	48575	48581	0 %	0 %	100 %	0 %	15836655
1033	NC_002488	TCG	2	6	48639	48644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836655
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1036	NC_002488	CGG	2	6	48790	48795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836655
1037	NC_002488	CAT	2	6	48818	48823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836655
1038	NC_002488	TGGG	2	8	48828	48835	0 %	25 %	75 %	0 %	15836655
1039	NC_002488	CGATG	2	10	48862	48871	20 %	20 %	40 %	20 %	15836655
1040	NC_002488	GCA	2	6	48933	48938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836655
1041	NC_002488	GA	3	6	48979	48984	50 %	0 %	50 %	0 %	15836655
1042	NC_002488	GTG	2	6	49005	49010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_002488	GAT	2	6	49015	49020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_002488	GAG	2	6	49057	49062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_002488	TAA	2	6	49209	49214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_002488	AATG	2	8	49260	49267	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_002488	CCG	2	6	49285	49290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1049	NC_002488	GTG	2	6	49375	49380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1056	NC_002488	GT	3	6	49487	49492	0 %	50 %	50 %	0 %	15836656
1057	NC_002488	GT	3	6	49495	49500	0 %	50 %	50 %	0 %	15836656
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1084	NC_002488	GT	3	6	49711	49716	0 %	50 %	50 %	0 %	15836656
1085	NC_002488	GT	3	6	49719	49724	0 %	50 %	50 %	0 %	15836656
1086	NC_002488	GTG	2	6	49727	49732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836656
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1088	NC_002488	GTGA	2	8	49822	49829	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_002488	AAGC	2	8	49836	49843	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1090	NC_002488	AG	3	6	49892	49897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1093	NC_002488	GTG	2	6	50061	50066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_002488	TTA	2	6	50077	50082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_002488	A	6	6	50107	50112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_002488	ATG	2	6	50114	50119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_002488	TGA	2	6	50375	50380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836657
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1101	NC_002488	T	6	6	50435	50440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_002488	GT	3	6	50457	50462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_002488	AAATAA	2	12	50463	50474	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_002488	ATC	2	6	50505	50510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_002488	CAT	2	6	50558	50563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836658
1106	NC_002488	ATT	2	6	50604	50609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836658
1107	NC_002488	CAT	2	6	50628	50633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836658
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1109	NC_002488	ATCC	2	8	50824	50831	25 %	25 %	0 %	50 %	15836658
1110	NC_002488	A	6	6	50875	50880	100 %	0 %	0 %	0 %	15836658
1111	NC_002488	GGTG	2	8	51001	51008	0 %	25 %	75 %	0 %	15836658
1112	NC_002488	GGC	2	6	51017	51022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836658
1113	NC_002488	TGC	2	6	51074	51079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836658
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1115	NC_002488	CGC	2	6	51296	51301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836658
1116	NC_002488	T	6	6	51312	51317	0 %	100 %	0 %	0 %	15836658
1117	NC_002488	TGG	2	6	51357	51362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836658
1118	NC_002488	ATG	2	6	51388	51393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836658
1119	NC_002488	GGTAT	2	10	51426	51435	20 %	40 %	40 %	0 %	15836658
1120	NC_002488	GATG	2	8	51468	51475	25 %	25 %	50 %	0 %	15836658
1121	NC_002488	ACG	2	6	51520	51525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836658
1122	NC_002488	CGT	2	6	51538	51543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836658
1123	NC_002488	GAT	2	6	51550	51555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836658
1124	NC_002488	ATTG	2	8	51577	51584	25 %	50 %	25 %	0 %	15836658
1125	NC_002488	CTT	2	6	51642	51647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836658
1126	NC_002488	TGATC	2	10	51663	51672	20 %	40 %	20 %	20 %	15836658
1127	NC_002488	CAG	2	6	51686	51691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836658
1128	NC_002488	GATG	2	8	51720	51727	25 %	25 %	50 %	0 %	15836658
1129	NC_002488	CTA	2	6	51755	51760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836659
1130	NC_002488	GCATT	2	10	51773	51782	20 %	40 %	20 %	20 %	15836659
1131	NC_002488	TAT	2	6	51796	51801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836659
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1133	NC_002488	A	6	6	51822	51827	100 %	0 %	0 %	0 %	15836659
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1266	NC_002488	CTT	2	6	58175	58180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836669
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1288	NC_002488	TCTT	2	8	59509	59516	0 %	75 %	0 %	25 %	15836671
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1373	NC_002488	GAA	2	6	63783	63788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1395	NC_002488	ATT	2	6	64894	64899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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