MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 56495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002488	AGA	2	6	23393	23398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_002488	GTT	2	6	23415	23420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_002488	TGA	2	6	23444	23449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_002488	CAA	2	6	23557	23562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_002488	TGC	2	6	23567	23572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_002488	AGATC	2	10	23583	23592	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
507	NC_002488	CAG	2	6	23599	23604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_002488	GCA	2	6	23617	23622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_002488	TCA	2	6	23663	23668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_002488	TCA	2	6	23726	23731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_002488	ATG	2	6	23732	23737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_002488	GAA	3	9	23738	23746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_002488	AGG	2	6	23750	23755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_002488	ACC	2	6	23797	23802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_002488	GCA	2	6	23848	23853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_002488	T	6	6	23875	23880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_002488	AAT	2	6	23953	23958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_002488	T	6	6	23975	23980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_002488	GTA	2	6	23986	23991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_002488	CAG	2	6	24142	24147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836633
521	NC_002488	AGTT	2	8	24156	24163	25 %	50 %	25 %	0 %	15836633
522	NC_002488	CTT	2	6	24165	24170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836633
523	NC_002488	TG	3	6	24217	24222	0 %	50 %	50 %	0 %	15836633
524	NC_002488	TGA	2	6	24229	24234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836633
525	NC_002488	AAC	2	6	24296	24301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836633
526	NC_002488	ATC	2	6	24302	24307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836633
527	NC_002488	GCG	2	6	24414	24419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836633
528	NC_002488	TATG	2	8	24444	24451	25 %	50 %	25 %	0 %	15836633
529	NC_002488	AAC	2	6	24470	24475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836633
530	NC_002488	GGC	2	6	24497	24502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836633
531	NC_002488	TC	3	6	24516	24521	0 %	50 %	0 %	50 %	15836633
532	NC_002488	A	6	6	24587	24592	100 %	0 %	0 %	0 %	15836634
533	NC_002488	TATT	2	8	24633	24640	25 %	75 %	0 %	0 %	15836634
534	NC_002488	CAA	2	6	24691	24696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836634
535	NC_002488	GC	3	6	24757	24762	0 %	0 %	50 %	50 %	15836634
536	NC_002488	AGCGA	2	10	24770	24779	40 %	0 %	40 %	20 %	15836634
537	NC_002488	ACA	2	6	24792	24797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836634
538	NC_002488	AATGG	2	10	24800	24809	40 %	20 %	40 %	0 %	15836634
539	NC_002488	TCG	2	6	24850	24855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836634
540	NC_002488	GGC	2	6	24877	24882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836634
541	NC_002488	AC	3	6	24898	24903	50 %	0 %	0 %	50 %	15836634
542	NC_002488	ATGC	2	8	24930	24937	25 %	25 %	25 %	25 %	15836634
543	NC_002488	GAG	2	6	25033	25038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836634
544	NC_002488	ATTGA	2	10	25093	25102	40 %	40 %	20 %	0 %	15836635
545	NC_002488	CTG	2	6	25123	25128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836635
546	NC_002488	GTC	2	6	25129	25134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836635
547	NC_002488	GTC	2	6	25163	25168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836635
548	NC_002488	ACG	3	9	25177	25185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836635
549	NC_002488	GCC	2	6	25196	25201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836635
550	NC_002488	GGT	2	6	25258	25263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836635
551	NC_002488	ACA	2	6	25274	25279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836635
552	NC_002488	GTT	2	6	25288	25293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836635
553	NC_002488	TCTG	2	8	25407	25414	0 %	50 %	25 %	25 %	15836635
554	NC_002488	ACAAT	2	10	25457	25466	60 %	20 %	0 %	20 %	15836635
555	NC_002488	ATG	2	6	25510	25515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836635
556	NC_002488	CAG	2	6	25528	25533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836635
557	NC_002488	CAGT	2	8	25571	25578	25 %	25 %	25 %	25 %	15836635
558	NC_002488	ACTT	2	8	25606	25613	25 %	50 %	0 %	25 %	15836635
559	NC_002488	ATC	2	6	25675	25680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836635
560	NC_002488	GTGCA	2	10	25691	25700	20 %	20 %	40 %	20 %	15836635
561	NC_002488	GCT	2	6	25852	25857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836635
562	NC_002488	GAC	2	6	25911	25916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836635
563	NC_002488	AAC	2	6	25936	25941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836635
564	NC_002488	ACAG	2	8	26017	26024	50 %	0 %	25 %	25 %	15836636
565	NC_002488	CTG	4	12	26052	26063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836636
566	NC_002488	ACG	2	6	26097	26102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836636
567	NC_002488	AGC	2	6	26165	26170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836636
568	NC_002488	GAG	2	6	26184	26189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836636
569	NC_002488	TCA	2	6	26191	26196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836636
570	NC_002488	ATC	2	6	26294	26299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836636
571	NC_002488	AGC	2	6	26307	26312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836636
572	NC_002488	TTG	2	6	26324	26329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836636
573	NC_002488	GC	3	6	26505	26510	0 %	0 %	50 %	50 %	15836636
574	NC_002488	AGC	2	6	26511	26516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836636
575	NC_002488	TGT	2	6	26546	26551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836636
576	NC_002488	TCA	2	6	26566	26571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836636
577	NC_002488	TTAA	2	8	26572	26579	50 %	50 %	0 %	0 %	15836636
578	NC_002488	T	6	6	26585	26590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_002488	GGCGGT	2	12	26638	26649	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	15836637
580	NC_002488	GTG	2	6	26676	26681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836637
581	NC_002488	CAA	2	6	26848	26853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836637
582	NC_002488	GCC	2	6	26984	26989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836637
583	NC_002488	CGC	2	6	27110	27115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836637
584	NC_002488	GTT	2	6	27116	27121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836637
585	NC_002488	CGC	2	6	27139	27144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836637
586	NC_002488	AGTG	2	8	27325	27332	25 %	25 %	50 %	0 %	15836637
587	NC_002488	TTGA	2	8	27482	27489	25 %	50 %	25 %	0 %	15836637
588	NC_002488	TGG	2	6	27490	27495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836637
589	NC_002488	TTG	2	6	27519	27524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836637
590	NC_002488	GAA	2	6	27553	27558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836637
591	NC_002488	TGC	2	6	27625	27630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836637
592	NC_002488	TCA	2	6	27675	27680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836637
593	NC_002488	TAC	2	6	27752	27757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836637
594	NC_002488	CAG	2	6	27836	27841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836637
595	NC_002488	ACTG	2	8	27863	27870	25 %	25 %	25 %	25 %	15836637
596	NC_002488	G	6	6	27870	27875	0 %	0 %	100 %	0 %	15836637
597	NC_002488	TGCC	2	8	27889	27896	0 %	25 %	25 %	50 %	15836637
598	NC_002488	TGT	2	6	27904	27909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836637
599	NC_002488	GGC	3	9	28081	28089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836637
600	NC_002488	GCC	2	6	28136	28141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836637
601	NC_002488	GAC	2	6	28201	28206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836637
602	NC_002488	TGG	2	6	28221	28226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836637
603	NC_002488	CAAC	2	8	28254	28261	50 %	0 %	0 %	50 %	15836637
604	NC_002488	TGCC	2	8	28299	28306	0 %	25 %	25 %	50 %	15836637
605	NC_002488	GAG	2	6	28343	28348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836637
606	NC_002488	TGG	2	6	28352	28357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836637
607	NC_002488	GCGG	2	8	28402	28409	0 %	0 %	75 %	25 %	15836637
608	NC_002488	GCC	2	6	28424	28429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836637
609	NC_002488	TGG	2	6	28443	28448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836637
610	NC_002488	GGGAC	2	10	28499	28508	20 %	0 %	60 %	20 %	15836637
611	NC_002488	GTG	2	6	28581	28586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836637
612	NC_002488	GC	3	6	28620	28625	0 %	0 %	50 %	50 %	15836637
613	NC_002488	CAC	2	6	28690	28695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836637
614	NC_002488	A	8	8	28712	28719	100 %	0 %	0 %	0 %	15836637
615	NC_002488	GCA	2	6	28753	28758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836637
616	NC_002488	ATTA	2	8	28760	28767	50 %	50 %	0 %	0 %	15836637
617	NC_002488	GTG	2	6	28773	28778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836637
618	NC_002488	CAT	2	6	28828	28833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836637
619	NC_002488	TCG	2	6	28932	28937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836637
620	NC_002488	CAG	2	6	28940	28945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836637
621	NC_002488	GGT	2	6	28960	28965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836637
622	NC_002488	CG	3	6	29042	29047	0 %	0 %	50 %	50 %	15836637
623	NC_002488	TAC	2	6	29096	29101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836637
624	NC_002488	CCG	2	6	29118	29123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836637
625	NC_002488	TGG	2	6	29163	29168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836637
626	NC_002488	GGC	2	6	29183	29188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836637
627	NC_002488	GACC	2	8	29212	29219	25 %	0 %	25 %	50 %	15836637
628	NC_002488	GGC	2	6	29264	29269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836637
629	NC_002488	GAT	2	6	29293	29298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836637
630	NC_002488	TGA	2	6	29379	29384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836637
631	NC_002488	GTT	2	6	29414	29419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836637
632	NC_002488	TGC	2	6	29451	29456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836637
633	NC_002488	CCAG	2	8	29463	29470	25 %	0 %	25 %	50 %	15836637
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639	NC_002488	GAT	2	6	29899	29904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836637
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653	NC_002488	ATG	2	6	30308	30313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836638
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661	NC_002488	GAG	2	6	30754	30759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
662	NC_002488	AAG	2	6	30797	30802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
663	NC_002488	TG	3	6	30806	30811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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665	NC_002488	GAA	2	6	30850	30855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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672	NC_002488	CTT	2	6	31100	31105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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750	NC_002488	GTA	3	9	35124	35132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836644
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752	NC_002488	TTA	2	6	35183	35188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836644
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762	NC_002488	TGT	2	6	35578	35583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
763	NC_002488	AGC	2	6	35628	35633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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