MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Wolbachia endosymbiont of Drosophila simulans wHa

Total Repeats: 6804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021089	A	6	6	40	45	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021089	GTAT	2	8	61	68	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021089	AGT	2	6	71	76	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021089	ATT	2	6	126	131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021089	T	6	6	134	139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021089	TAA	2	6	1551	1556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021089	TAG	2	6	2863	2868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021089	ACAA	2	8	2924	2931	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021089	ATT	2	6	2939	2944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021089	TA	3	6	3006	3011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021089	GTG	2	6	3034	3039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021089	TCT	2	6	3099	3104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021089	T	6	6	4229	4234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021089	ACT	2	6	4241	4246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021089	TTA	2	6	4264	4269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021089	AGT	2	6	8297	8302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021089	AAT	2	6	10339	10344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021089	TAAT	2	8	10370	10377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021089	ATTAG	2	10	10382	10391	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021089	AGT	2	6	10408	10413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021089	A	7	7	10424	10430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021089	TTG	2	6	10457	10462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021089	CAA	2	6	10466	10471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021089	GTA	2	6	10506	10511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021089	GTCA	2	8	10614	10621	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021089	TGC	2	6	10656	10661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021089	AAC	2	6	10696	10701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021089	TTC	2	6	10731	10736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021089	ATA	2	6	10748	10753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021089	TAA	2	6	10812	10817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021089	TGC	2	6	10836	10841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021089	ATC	2	6	10889	10894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021089	CAA	2	6	10949	10954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021089	GAC	2	6	11119	11124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021089	TAA	2	6	11127	11132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021089	A	8	8	11137	11144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021089	AAAT	2	8	11183	11190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021089	AC	3	6	11212	11217	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021089	A	6	6	11277	11282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021089	GTC	2	6	11300	11305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021089	AGT	2	6	11345	11350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021089	GAT	2	6	11385	11390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021089	ATA	2	6	11396	11401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021089	A	7	7	11414	11420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021089	TTTC	2	8	12282	12289	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021089	ACT	2	6	12396	12401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021089	GAC	2	6	12497	12502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021089	ACT	2	6	12552	12557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021089	CCTC	2	8	12593	12600	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_021089	AAGC	2	8	12650	12657	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021089	ACA	2	6	12679	12684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021089	A	10	10	12789	12798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021089	AAG	2	6	12804	12809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021089	T	6	6	12841	12846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021089	GCT	2	6	12869	12874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021089	A	7	7	12925	12931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021089	CT	3	6	12964	12969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021089	TA	3	6	13027	13032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021089	TGT	2	6	13049	13054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021089	A	6	6	13079	13084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021089	TGT	2	6	13114	13119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021089	AAGT	2	8	13192	13199	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021089	T	6	6	13199	13204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021089	AAG	2	6	13245	13250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021089	ATT	2	6	13283	13288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021089	AGT	2	6	13291	13296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021089	TAT	2	6	13328	13333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021089	TAAT	2	8	14249	14256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021089	TAA	2	6	16342	16347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021089	TAAG	2	8	20296	20303	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021089	TTAA	2	8	32206	32213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021089	A	7	7	32232	32238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021089	ATA	2	6	32245	32250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021089	TAG	2	6	32255	32260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021089	AT	3	6	32268	32273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021089	GGT	2	6	34930	34935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021089	T	6	6	35070	35075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021089	TA	3	6	35080	35085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021089	CATCTA	2	12	35111	35122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021089	A	6	6	35173	35178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021089	T	7	7	35233	35239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021089	CTT	2	6	35252	35257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021089	AGTT	2	8	35274	35281	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021089	AGC	2	6	35291	35296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021089	A	6	6	35327	35332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021089	ATA	2	6	35352	35357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021089	CTT	2	6	35367	35372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021089	T	8	8	35378	35385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021089	GCT	2	6	35435	35440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021089	CGG	2	6	35465	35470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021089	TCTT	2	8	37231	37238	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_021089	CT	3	6	37261	37266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021089	TAG	2	6	37356	37361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021089	ACC	2	6	37362	37367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_021089	A	6	6	37401	37406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021089	GAA	2	6	37432	37437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021089	TAGCTA	2	12	37447	37458	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021089	GCT	2	6	37494	37499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021089	CGG	2	6	37524	37529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021089	CGG	2	6	37560	37565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021089	TAA	2	6	37607	37612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021089	TAA	3	9	37618	37626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021089	TAA	2	6	37631	37636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021089	GTA	2	6	38592	38597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021089	GTT	2	6	38677	38682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021089	ATT	2	6	38789	38794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021089	TAAA	2	8	43094	43101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021089	TGT	2	6	43215	43220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021089	AAG	2	6	43267	43272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021089	ATT	2	6	43286	43291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021089	TGAG	2	8	43305	43312	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021089	A	6	6	43316	43321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021089	AT	3	6	44541	44546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021089	AATT	2	8	44700	44707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021089	TTAAG	2	10	45660	45669	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021089	ATTAA	2	10	45670	45679	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021089	TAT	2	6	45688	45693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021089	AGA	2	6	45754	45759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021089	GGT	2	6	45778	45783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021089	A	6	6	45839	45844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021089	CTT	2	6	45872	45877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021089	ATTAA	2	10	45925	45934	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021089	T	6	6	45958	45963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021089	CTT	3	9	46019	46027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021089	ATT	2	6	46039	46044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021089	TTC	2	6	46047	46052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021089	CTA	2	6	46058	46063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021089	TAT	2	6	46113	46118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021089	T	6	6	46145	46150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021089	T	7	7	46156	46162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021089	ATAGAA	2	12	46210	46221	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021089	TG	3	6	46284	46289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021089	AT	4	8	47330	47337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021089	GA	3	6	47364	47369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021089	TC	3	6	47460	47465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021089	CAG	2	6	47575	47580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021089	ATT	2	6	47613	47618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021089	TTA	2	6	47635	47640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021089	TTA	2	6	47682	47687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021089	GAA	2	6	47694	47699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021089	CTA	2	6	47752	47757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_021089	AAG	2	6	47761	47766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021089	TGC	2	6	47923	47928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021089	TGC	2	6	48008	48013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_021089	CTTTTT	2	12	48075	48086	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_021089	CAA	2	6	48096	48101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_021089	TAC	2	6	48117	48122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_021089	CTC	2	6	48188	48193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_021089	TAC	2	6	48225	48230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_021089	T	6	6	48313	48318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021089	CCTTT	2	10	48375	48384	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
152	NC_021089	T	6	6	48458	48463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021089	A	7	7	48593	48599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021089	CT	3	6	48632	48637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_021089	A	6	6	48747	48752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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