MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Wolbachia endosymbiont of Drosophila simulans wNo

Total Repeats: 6094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021084	A	6	6	40	45	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021084	GTAT	2	8	61	68	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021084	AGT	2	6	71	76	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021084	ATT	2	6	126	131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021084	TTCT	2	8	133	140	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021084	TTA	2	6	1539	1544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021084	T	8	8	1566	1573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021084	ATT	2	6	1616	1621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021084	TA	3	6	1664	1669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021084	ATT	2	6	3078	3083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021084	TAT	2	6	3131	3136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021084	AT	3	6	3176	3181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021084	AGG	2	6	3188	3193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021084	T	6	6	5839	5844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021084	A	6	6	5882	5887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021084	A	6	6	6588	6593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021084	TTA	2	6	6594	6599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021084	ACT	2	6	7148	7153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021084	TTA	2	6	7176	7181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021084	A	6	6	7249	7254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021084	T	6	6	7304	7309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021084	T	6	6	7311	7316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021084	ATT	2	6	7357	7362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021084	ATT	2	6	7378	7383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021084	T	6	6	7420	7425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021084	TTA	2	6	7439	7444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021084	GAG	2	6	7460	7465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021084	ACC	2	6	7529	7534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_021084	A	6	6	7594	7599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021084	GAT	2	6	7631	7636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021084	TTTG	2	8	7677	7684	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021084	T	6	6	7702	7707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021084	T	7	7	7718	7724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021084	TGC	3	9	8047	8055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021084	TAAG	2	8	8082	8089	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021084	T	6	6	8091	8096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021084	CTTA	2	8	8107	8114	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021084	TA	4	8	8122	8129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021084	AGG	2	6	8134	8139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021084	GTT	2	6	8140	8145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021084	ACA	2	6	8703	8708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021084	T	6	6	8761	8766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021084	ATC	2	6	8771	8776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021084	TGT	2	6	8781	8786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021084	TAAAA	2	10	8791	8800	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021084	TAA	2	6	8825	8830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021084	AAGA	2	8	8859	8866	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021084	CAT	2	6	8880	8885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021084	TCT	2	6	8921	8926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021084	GAT	2	6	8958	8963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021084	TTAAT	2	10	9781	9790	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021084	T	6	6	9790	9795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021084	AAT	3	9	9803	9811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021084	A	8	8	10595	10602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021084	AGGAA	2	10	12311	12320	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021084	TTA	3	9	14111	14119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021084	TAA	3	9	14129	14137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021084	ATT	2	6	14142	14147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021084	AAT	2	6	14158	14163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021084	ATA	2	6	14186	14191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021084	AG	4	8	14205	14212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021084	TCT	2	6	14219	14224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021084	AAG	2	6	14225	14230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021084	TCA	2	6	14257	14262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021084	TAC	2	6	14269	14274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021084	CT	3	6	14351	14356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021084	ATA	2	6	14391	14396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021084	AAG	2	6	14922	14927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021084	TAGT	2	8	14937	14944	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021084	TAG	2	6	16194	16199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021084	AGC	2	6	16220	16225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021084	AGAA	2	8	16254	16261	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021084	TCA	2	6	16298	16303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021084	CAA	2	6	17252	17257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021084	A	6	6	17279	17284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021084	T	6	6	18872	18877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021084	A	8	8	19025	19032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021084	TAAT	2	8	19061	19068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021084	TAA	2	6	19868	19873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021084	ATT	2	6	19878	19883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021084	A	7	7	19935	19941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021084	AGG	2	6	19951	19956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021084	TAA	3	9	20472	20480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021084	ATT	2	6	20485	20490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021084	A	6	6	20495	20500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021084	ATT	2	6	20513	20518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021084	ATA	2	6	20526	20531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021084	CCT	2	6	21708	21713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_021084	AAAAT	2	10	21717	21726	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021084	A	6	6	21798	21803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021084	AAC	2	6	21885	21890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021084	TGCC	2	8	21921	21928	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021084	T	6	6	21940	21945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021084	A	7	7	22006	22012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021084	TTG	2	6	22026	22031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021084	A	7	7	22036	22042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021084	GTAGT	2	10	22044	22053	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021084	ATACT	2	10	22069	22078	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021084	T	7	7	22105	22111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021084	T	7	7	22122	22128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021084	AGA	2	6	22145	22150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021084	ATC	2	6	22221	22226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021084	AGA	2	6	22296	22301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021084	A	8	8	22373	22380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021084	CTG	2	6	22449	22454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021084	ATAC	2	8	22460	22467	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_021084	T	8	8	23194	23201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021084	ATA	2	6	23202	23207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021084	TTG	2	6	23215	23220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021084	CAG	2	6	24410	24415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021084	TA	3	6	24421	24426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021084	CTAA	2	8	24501	24508	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_021084	TAGTA	2	10	26632	26641	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021084	TTTAG	2	10	29190	29199	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021084	TACAA	2	10	29206	29215	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_021084	ATA	2	6	29250	29255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021084	T	7	7	29943	29949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021084	GTT	2	6	29980	29985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021084	ATT	2	6	30014	30019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021084	ATGA	2	8	31408	31415	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021084	ACA	2	6	31420	31425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021084	TGC	2	6	31445	31450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021084	TCCATT	2	12	31452	31463	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021084	GTA	2	6	31474	31479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021084	ATT	2	6	31537	31542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021084	GTAT	2	8	31634	31641	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021084	ATA	2	6	35089	35094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021084	CAT	2	6	35117	35122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021084	GTACT	2	10	35126	35135	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_021084	TA	3	6	35141	35146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021084	CAG	2	6	35159	35164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021084	AGA	2	6	35165	35170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021084	ATGA	2	8	35196	35203	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021084	CAG	2	6	35215	35220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021084	TAA	2	6	36732	36737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021084	AAT	2	6	36812	36817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021084	TAC	2	6	36826	36831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021084	TA	3	6	36853	36858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021084	TGC	2	6	36870	36875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021084	A	6	6	36877	36882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021084	TAG	2	6	36889	36894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021084	CTTT	2	8	37909	37916	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021084	CTAT	2	8	37961	37968	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021084	TG	3	6	38510	38515	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021084	AGT	2	6	38540	38545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021084	A	6	6	40080	40085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021084	A	7	7	40109	40115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021084	AC	3	6	40119	40124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021084	AGT	2	6	40126	40131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021084	TAT	2	6	40133	40138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021084	ATT	2	6	40145	40150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021084	ACTT	2	8	40286	40293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_021084	TTA	2	6	40341	40346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021084	TTA	2	6	40369	40374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021084	TAT	3	9	40470	40478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021084	TTA	2	6	40481	40486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021084	A	7	7	40493	40499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021084	ATC	2	6	40505	40510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_021084	TA	4	8	40581	40588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_021084	TTA	2	6	40589	40594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_021084	AGTT	2	8	40598	40605	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_021084	A	6	6	40613	40618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021084	TCT	2	6	43874	43879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_021084	AAT	2	6	43880	43885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_021084	GCA	2	6	43893	43898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_021084	T	8	8	43900	43907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021084	ATA	2	6	43914	43919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021084	ATTC	2	8	43995	44002	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
169	NC_021084	GAAAG	2	10	47381	47390	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
170	NC_021084	TTA	2	6	47395	47400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_021084	TAA	2	6	49845	49850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021084	CTAA	2	8	49862	49869	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
173	NC_021084	ATT	2	6	49874	49879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_021084	TTA	2	6	51036	51041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_021084	T	6	6	51078	51083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021084	ATT	2	6	51084	51089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_021084	AATT	2	8	51093	51100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_021084	AGA	2	6	51156	51161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
179	NC_021084	CTTAAT	2	12	51239	51250	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
180	NC_021084	GAAA	2	8	51256	51263	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
181	NC_021084	CTA	2	6	52631	52636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_021084	TCA	2	6	52661	52666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_021084	AGTC	2	8	52668	52675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
184	NC_021084	AT	4	8	52704	52711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_021084	GAAG	2	8	53694	53701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
186	NC_021084	AAT	2	6	53721	53726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_021084	ACA	2	6	53752	53757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_021084	ATT	2	6	56439	56444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_021084	AGAA	2	8	57808	57815	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
192	NC_021084	ATCA	2	8	57857	57864	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
193	NC_021084	ATT	2	6	57868	57873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_021084	GAA	2	6	57956	57961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
195	NC_021084	TTA	2	6	58013	58018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_021084	GTA	2	6	58062	58067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_021084	ATTAA	2	10	58083	58092	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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203	NC_021084	TAG	2	6	58156	58161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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210	NC_021084	TTG	2	6	58327	58332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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237	NC_021084	T	7	7	61407	61413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_021084	A	8	8	62396	62403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_021084	AT	3	6	64100	64105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_021084	TTAC	2	8	64117	64124	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
282	NC_021084	TCC	2	6	64135	64140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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288	NC_021084	TTC	2	6	64471	64476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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290	NC_021084	GCTT	2	8	64529	64536	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
291	NC_021084	CCTT	2	8	64588	64595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
292	NC_021084	GAT	2	6	64604	64609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_021084	TTTA	2	8	64725	64732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_021084	T	6	6	85737	85742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_021084	AT	3	6	87258	87263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_021084	TAA	3	9	87266	87274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_021084	AT	3	6	87989	87994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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