MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Weissella koreensis KACC 15510 plasmid WKp2903

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015756	ATT	2	6	11	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015756	TGT	2	6	32	37	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015756	TA	4	8	56	63	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015756	CAA	2	6	79	84	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015756	ATT	2	6	94	99	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015756	AAT	2	6	103	108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015756	TTTTTA	2	12	144	155	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015756	CACTT	2	10	185	194	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_015756	A	6	6	197	202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015756	CT	3	6	267	272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015756	TAAA	2	8	320	327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015756	TTC	2	6	390	395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015756	T	7	7	499	505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015756	TA	3	6	592	597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015756	ATG	2	6	1182	1187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015756	TGT	2	6	1193	1198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015756	TG	3	6	1268	1273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015756	ATT	2	6	1279	1284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015756	A	7	7	1313	1319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015756	CGTAT	2	10	1351	1360	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015756	ATT	2	6	1412	1417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015756	AGA	2	6	1462	1467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015756	AAAG	2	8	1495	1502	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015756	TCG	2	6	1512	1517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015756	T	7	7	1536	1542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015756	TTA	2	6	1655	1660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015756	A	8	8	1672	1679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015756	GATA	2	8	1756	1763	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015756	T	6	6	1783	1788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015756	CCG	2	6	1895	1900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_015756	ATT	2	6	2015	2020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015756	T	6	6	2077	2082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015756	GAG	2	6	2083	2088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015756	AAT	2	6	3386	3391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015756	TAA	2	6	3423	3428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015756	CAAAA	2	10	3476	3485	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015756	TGTTT	2	10	3527	3536	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015756	T	6	6	3534	3539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015756	TAT	2	6	3565	3570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015756	TAT	2	6	3625	3630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015756	A	6	6	3658	3663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015756	TAA	2	6	3755	3760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015756	CAA	2	6	3807	3812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015756	A	6	6	5558	5563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015756	AGA	2	6	5568	5573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015756	TCT	2	6	5621	5626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015756	T	6	6	5654	5659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015756	AAT	2	6	5972	5977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015756	ATTT	2	8	5988	5995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015756	A	6	6	5996	6001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015756	ACGTTT	2	12	6042	6053	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015756	AGG	2	6	6070	6075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015756	AGG	2	6	6078	6083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015756	A	6	6	6554	6559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015756	ATAG	2	8	6733	6740	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015756	TAGA	2	8	6741	6748	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015756	TAATA	2	10	6827	6836	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015756	AGG	2	6	6837	6842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015756	T	7	7	8949	8955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015756	ACCA	2	8	9640	9647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015756	GCT	2	6	9651	9656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015756	ATC	2	6	9683	9688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015756	AATA	2	8	9713	9720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015756	TAA	2	6	9832	9837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015756	AATTTC	2	12	9843	9854	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015756	GAAA	2	8	9899	9906	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015756	ATT	2	6	10624	10629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015756	AAT	2	6	10652	10657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015756	GAA	2	6	11632	11637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015756	T	6	6	11639	11644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015756	TAA	2	6	11698	11703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015756	TA	3	6	11741	11746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015756	ATT	2	6	11757	11762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015756	AAG	2	6	11770	11775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015756	GAC	2	6	11817	11822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015756	TAA	2	6	11823	11828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015756	AG	3	6	12794	12799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015756	GGA	2	6	13603	13608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015756	ATA	2	6	14971	14976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015756	CTT	2	6	14978	14983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015756	CTTGT	2	10	15018	15027	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015756	T	6	6	15037	15042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015756	ATA	2	6	15049	15054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015756	TA	3	6	15101	15106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015756	TA	3	6	15123	15128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015756	CATA	2	8	15135	15142	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015756	AATG	2	8	15175	15182	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015756	ATTA	2	8	15243	15250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015756	T	8	8	15294	15301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015756	TAA	2	6	15311	15316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015756	CAA	2	6	15320	15325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015756	CAC	2	6	15446	15451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_015756	TAT	2	6	15496	15501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015756	TGA	2	6	15527	15532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015756	AATATA	2	12	15573	15584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015756	AT	3	6	15614	15619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015756	T	7	7	15619	15625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015756	TAA	2	6	15672	15677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015756	TAA	2	6	15694	15699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015756	A	6	6	15698	15703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015756	AT	3	6	15706	15711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015756	TTA	2	6	16393	16398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015756	CTG	2	6	16400	16405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015756	GA	4	8	16406	16413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015756	TTG	2	6	16437	16442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015756	TAT	2	6	16612	16617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015756	T	7	7	16640	16646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015756	TGTT	2	8	16650	16657	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015756	CCA	2	6	16661	16666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_015756	GGCT	2	8	18659	18666	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015756	CGTGGA	2	12	18740	18751	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_015756	T	6	6	18758	18763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015756	CTT	2	6	18785	18790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015756	TTG	2	6	18840	18845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015756	TGCT	2	8	18861	18868	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015756	AG	3	6	18875	18880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015756	TGAC	2	8	18911	18918	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015756	TGA	2	6	18933	18938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.