MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Wolbachia endosymbiont of Culex quinquefasciatus Pel chromosome

Total Repeats: 6597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010981	A	6	6	40	45	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010981	AGT	2	6	71	76	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010981	ATT	3	9	126	134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010981	TTA	2	6	1539	1544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010981	T	7	7	1566	1572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010981	ATT	2	6	1615	1620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010981	TA	3	6	1663	1668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010981	ATT	2	6	3077	3082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010981	TAT	2	6	3130	3135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010981	AT	3	6	3175	3180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010981	AGG	2	6	3187	3192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010981	T	6	6	5838	5843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010981	A	6	6	5881	5886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010981	ATTA	2	8	6601	6608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010981	TGTA	2	8	6613	6620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010981	ATT	3	9	6625	6633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010981	ACT	2	6	7180	7185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010981	TTA	2	6	7228	7233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010981	TAT	2	6	7265	7270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010981	CAA	2	6	7320	7325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010981	GA	3	6	7398	7403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010981	AAC	2	6	7406	7411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010981	A	6	6	7593	7598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010981	TGC	2	6	7653	7658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010981	TGT	2	6	7659	7664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010981	T	6	6	7685	7690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010981	TGC	3	9	8030	8038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010981	TAAG	2	8	8065	8072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010981	T	6	6	8074	8079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010981	CTTA	2	8	8090	8097	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010981	TA	4	8	8105	8112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010981	AGG	2	6	8117	8122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010981	GTT	2	6	8123	8128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010981	ACA	2	6	8686	8691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010981	T	6	6	8744	8749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010981	ATC	2	6	8754	8759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010981	TAAAA	2	10	8774	8783	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010981	TAA	2	6	8808	8813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010981	AAGA	2	8	8842	8849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010981	CAT	2	6	8863	8868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010981	TCT	2	6	8904	8909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010981	TTAAT	2	10	9764	9773	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010981	T	6	6	9773	9778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010981	AAT	3	9	9786	9794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010981	A	8	8	9810	9817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010981	A	7	7	10571	10577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010981	AGGA	2	8	12304	12311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010981	TTA	3	9	13940	13948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010981	ATATT	2	10	13949	13958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010981	AATTA	2	10	13965	13974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010981	AAT	2	6	13987	13992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010981	ATA	2	6	14015	14020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010981	TA	3	6	14019	14024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010981	AG	4	8	14036	14043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010981	TCT	2	6	14050	14055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010981	AAG	2	6	14056	14061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010981	TCA	2	6	14088	14093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010981	TAC	2	6	14100	14105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010981	CT	3	6	14174	14179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010981	ATA	2	6	14214	14219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010981	AATT	2	8	15015	15022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010981	ATA	2	6	15033	15038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010981	GTC	2	6	15055	15060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010981	A	6	6	15068	15073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010981	TAATA	2	10	15102	15111	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010981	AAT	2	6	15122	15127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010981	A	6	6	16165	16170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010981	A	6	6	16218	16223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010981	GAA	2	6	16311	16316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010981	CAC	2	6	16372	16377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_010981	AGAA	2	8	16401	16408	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010981	GTA	2	6	16417	16422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010981	GA	3	6	16427	16432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010981	ATTAA	2	10	16438	16447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010981	TTTA	2	8	16460	16467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010981	TA	3	6	16466	16471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010981	TG	3	6	16504	16509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010981	TAG	2	6	16511	16516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010981	GCA	2	6	16527	16532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010981	CTG	2	6	16609	16614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010981	TGA	2	6	16619	16624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010981	TTC	2	6	16663	16668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010981	AAATA	2	10	16669	16678	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010981	ATA	2	6	16684	16689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010981	TTG	2	6	16690	16695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010981	AAG	2	6	16707	16712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010981	A	6	6	16797	16802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010981	TCT	2	6	16893	16898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010981	TTAGC	2	10	17274	17283	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_010981	GTT	2	6	17294	17299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010981	T	9	9	17302	17310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010981	AAAT	2	8	17319	17326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010981	T	7	7	17351	17357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010981	TA	3	6	17367	17372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010981	TAT	2	6	17394	17399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010981	TA	3	6	17430	17435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010981	CTA	2	6	17438	17443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010981	TTA	2	6	17458	17463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010981	TAT	2	6	17525	17530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010981	A	6	6	17575	17580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010981	GAA	2	6	17594	17599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010981	CTT	2	6	17602	17607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010981	ACTAA	2	10	19814	19823	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_010981	TA	3	6	19829	19834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010981	T	6	6	19862	19867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010981	GAAA	2	8	21620	21627	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010981	ACT	2	6	21651	21656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010981	TA	3	6	21685	21690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010981	ATA	2	6	21700	21705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010981	TAG	2	6	21733	21738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010981	TAT	2	6	22621	22626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010981	TAAAAA	2	12	22646	22657	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010981	AAT	2	6	22658	22663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010981	AT	3	6	22662	22667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010981	ATATT	2	10	22704	22713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010981	TA	3	6	22725	22730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010981	TAT	2	6	22738	22743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010981	ATAG	2	8	22745	22752	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010981	ATT	2	6	22760	22765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010981	TTC	2	6	22766	22771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010981	TCAA	2	8	23418	23425	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010981	TA	3	6	24345	24350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010981	TA	3	6	24355	24360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010981	GTT	2	6	24408	24413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010981	TTGTGC	2	12	24433	24444	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_010981	TTG	2	6	24456	24461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010981	TG	3	6	24479	24484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010981	TCA	2	6	24504	24509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010981	CTT	2	6	24537	24542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010981	T	6	6	24620	24625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010981	AT	3	6	24629	24634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010981	TA	3	6	24932	24937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010981	TC	3	6	24950	24955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_010981	TCA	2	6	26353	26358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010981	ATA	2	6	26377	26382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010981	TTG	2	6	26426	26431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010981	TAA	2	6	26460	26465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010981	A	6	6	26607	26612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010981	TA	3	6	26618	26623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010981	AAT	2	6	26635	26640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010981	T	6	6	26648	26653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010981	TCA	2	6	26673	26678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_010981	TC	3	6	26708	26713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_010981	ATT	2	6	26747	26752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010981	GGA	2	6	26757	26762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010981	CTT	2	6	26804	26809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_010981	ATCT	2	8	26813	26820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_010981	AT	3	6	26823	26828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010981	ACT	2	6	26901	26906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_010981	T	6	6	26925	26930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010981	GCG	2	6	26968	26973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_010981	ATT	2	6	27016	27021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_010981	TTA	2	6	27231	27236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_010981	ATT	2	6	36311	36316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_010981	TAA	2	6	48374	48379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_010981	AAT	2	6	86186	86191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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