MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Wolbachia endosymbiont of Drosophila simulans wHa

Total Repeats: 23754

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021089	CTA	2	6	178	183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482891468
2	NC_021089	T	6	6	186	191	0 %	100 %	0 %	0 %	482891468
3	NC_021089	ATT	2	6	198	203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482891468
4	NC_021089	A	6	6	232	237	100 %	0 %	0 %	0 %	482891468
5	NC_021089	ATA	2	6	277	282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482891468
6	NC_021089	GCTG	2	8	283	290	0 %	25 %	50 %	25 %	482891468
7	NC_021089	CAA	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482891468
8	NC_021089	A	7	7	384	390	100 %	0 %	0 %	0 %	482891468
9	NC_021089	TAT	2	6	391	396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482891468
10	NC_021089	GAG	2	6	450	455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482891468
11	NC_021089	A	6	6	482	487	100 %	0 %	0 %	0 %	482891468
12	NC_021089	AG	3	6	489	494	50 %	0 %	50 %	0 %	482891468
13	NC_021089	CGC	2	6	517	522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482891468
14	NC_021089	CGG	2	6	583	588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482891468
15	NC_021089	GCA	2	6	625	630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482891468
16	NC_021089	TGG	2	6	647	652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482891468
17	NC_021089	ATGC	2	8	678	685	25 %	25 %	25 %	25 %	482891468
18	NC_021089	GTG	2	6	729	734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482891468
19	NC_021089	CAG	2	6	742	747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482891468
20	NC_021089	AT	3	6	764	769	50 %	50 %	0 %	0 %	482891468
21	NC_021089	GAT	2	6	840	845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482891468
22	NC_021089	AAG	2	6	877	882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482891468
23	NC_021089	T	6	6	885	890	0 %	100 %	0 %	0 %	482891468
24	NC_021089	GAA	2	6	972	977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482891468
25	NC_021089	TGG	2	6	1006	1011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482891468
26	NC_021089	AAC	2	6	1025	1030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482891468
27	NC_021089	ATGT	2	8	1080	1087	25 %	50 %	25 %	0 %	482891468
28	NC_021089	GAA	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482891468
29	NC_021089	TCT	2	6	1229	1234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482891468
30	NC_021089	GTCA	2	8	1250	1257	25 %	25 %	25 %	25 %	482891468
31	NC_021089	AGA	2	6	1262	1267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482891468
32	NC_021089	AAAG	2	8	1274	1281	75 %	0 %	25 %	0 %	482891468
33	NC_021089	A	6	6	1377	1382	100 %	0 %	0 %	0 %	482891468
34	NC_021089	A	6	6	1390	1395	100 %	0 %	0 %	0 %	482891468
35	NC_021089	TGG	2	6	1421	1426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482891468
36	NC_021089	TGA	2	6	1499	1504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482891468
37	NC_021089	AATC	2	8	1505	1512	50 %	25 %	0 %	25 %	482891468
38	NC_021089	A	8	8	1517	1524	100 %	0 %	0 %	0 %	482891468
39	NC_021089	GTTTAA	2	12	1592	1603	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	482891469
40	NC_021089	TCT	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482891469
41	NC_021089	ATC	2	6	1668	1673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482891469
42	NC_021089	CAAAGC	2	12	1688	1699	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	482891469
43	NC_021089	A	6	6	1701	1706	100 %	0 %	0 %	0 %	482891469
44	NC_021089	AGT	2	6	1727	1732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482891469
45	NC_021089	TCTTGA	2	12	1777	1788	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482891469
46	NC_021089	ATG	2	6	1796	1801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482891469
47	NC_021089	CAC	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482891469
48	NC_021089	TAA	2	6	1845	1850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482891469
49	NC_021089	GTA	2	6	1885	1890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482891469
50	NC_021089	T	7	7	1965	1971	0 %	100 %	0 %	0 %	482891469
51	NC_021089	A	6	6	2115	2120	100 %	0 %	0 %	0 %	482891469
52	NC_021089	AAAGG	2	10	2255	2264	60 %	0 %	40 %	0 %	482891469
53	NC_021089	CTT	2	6	2315	2320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482891469
54	NC_021089	T	6	6	2347	2352	0 %	100 %	0 %	0 %	482891469
55	NC_021089	TTTG	2	8	2365	2372	0 %	75 %	25 %	0 %	482891469
56	NC_021089	T	9	9	2437	2445	0 %	100 %	0 %	0 %	482891469
57	NC_021089	CTG	2	6	2475	2480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482891469
58	NC_021089	TTA	2	6	2527	2532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482891469
59	NC_021089	T	6	6	2536	2541	0 %	100 %	0 %	0 %	482891469
60	NC_021089	TTGT	2	8	2588	2595	0 %	75 %	25 %	0 %	482891469
61	NC_021089	AG	5	10	2797	2806	50 %	0 %	50 %	0 %	482891469
62	NC_021089	A	7	7	2809	2815	100 %	0 %	0 %	0 %	482891469
63	NC_021089	AT	3	6	3220	3225	50 %	50 %	0 %	0 %	482891470
64	NC_021089	TGC	3	9	3249	3257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482891470
65	NC_021089	ATTT	2	8	3275	3282	25 %	75 %	0 %	0 %	482891470
66	NC_021089	AAT	2	6	3388	3393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482891470
67	NC_021089	TGA	2	6	3396	3401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482891470
68	NC_021089	TAA	2	6	3413	3418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482891470
69	NC_021089	ATT	2	6	3504	3509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482891470
70	NC_021089	TCAT	2	8	3601	3608	25 %	50 %	0 %	25 %	482891470
71	NC_021089	AAT	2	6	3610	3615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482891470
72	NC_021089	CAT	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482891470
73	NC_021089	AAG	2	6	3677	3682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482891470
74	NC_021089	ATATC	2	10	3686	3695	40 %	40 %	0 %	20 %	482891470
75	NC_021089	GTG	2	6	3710	3715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482891470
76	NC_021089	CAT	2	6	3724	3729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482891470
77	NC_021089	ATTC	2	8	3778	3785	25 %	50 %	0 %	25 %	482891470
78	NC_021089	TAT	2	6	3882	3887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482891470
79	NC_021089	TAA	2	6	3927	3932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482891470
80	NC_021089	GAT	2	6	4006	4011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482891470
81	NC_021089	TGT	2	6	4023	4028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482891470
82	NC_021089	TTAC	2	8	4072	4079	25 %	50 %	0 %	25 %	482891470
83	NC_021089	AGT	2	6	4111	4116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482891470
84	NC_021089	TAA	2	6	4158	4163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482891470
85	NC_021089	AT	3	6	4176	4181	50 %	50 %	0 %	0 %	482891470
86	NC_021089	T	6	6	4220	4225	0 %	100 %	0 %	0 %	482891470
87	NC_021089	T	6	6	4309	4314	0 %	100 %	0 %	0 %	482891471
88	NC_021089	GA	3	6	4319	4324	50 %	0 %	50 %	0 %	482891471
89	NC_021089	ATT	2	6	4422	4427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482891471
90	NC_021089	ATT	2	6	4583	4588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482891471
91	NC_021089	TA	3	6	4600	4605	50 %	50 %	0 %	0 %	482891471
92	NC_021089	ATTATA	2	12	4634	4645	50 %	50 %	0 %	0 %	482891471
93	NC_021089	TAT	2	6	4648	4653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482891471
94	NC_021089	GTT	2	6	4665	4670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482891471
95	NC_021089	TA	3	6	4705	4710	50 %	50 %	0 %	0 %	482891471
96	NC_021089	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482891471
97	NC_021089	T	6	6	4816	4821	0 %	100 %	0 %	0 %	482891471
98	NC_021089	A	6	6	4857	4862	100 %	0 %	0 %	0 %	482891471
99	NC_021089	TTA	2	6	4871	4876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482891471
100	NC_021089	ATGA	2	8	4903	4910	50 %	25 %	25 %	0 %	482891471
101	NC_021089	AT	3	6	4920	4925	50 %	50 %	0 %	0 %	482891471
102	NC_021089	GAT	2	6	4963	4968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482891471
103	NC_021089	ATT	2	6	4984	4989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482891472
104	NC_021089	AGTTTT	2	12	4990	5001	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	482891472
105	NC_021089	ATTA	2	8	5030	5037	50 %	50 %	0 %	0 %	482891472
106	NC_021089	TAG	2	6	5059	5064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482891472
107	NC_021089	GGT	2	6	5104	5109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482891472
108	NC_021089	TAG	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482891472
109	NC_021089	ATT	2	6	5261	5266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482891472
110	NC_021089	A	7	7	5276	5282	100 %	0 %	0 %	0 %	482891472
111	NC_021089	ATT	2	6	5361	5366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482891472
112	NC_021089	CTG	2	6	5367	5372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482891472
113	NC_021089	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	482891472
114	NC_021089	GTA	2	6	5390	5395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482891472
115	NC_021089	TAT	2	6	5402	5407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482891472
116	NC_021089	AAG	3	9	5412	5420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482891472
117	NC_021089	TAC	2	6	5473	5478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482891472
118	NC_021089	A	6	6	5490	5495	100 %	0 %	0 %	0 %	482891472
119	NC_021089	AT	3	6	5530	5535	50 %	50 %	0 %	0 %	482891472
120	NC_021089	TGA	2	6	5536	5541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482891472
121	NC_021089	GGT	2	6	5543	5548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482891472
122	NC_021089	TGA	2	6	5578	5583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482891472
123	NC_021089	ATA	3	9	5613	5621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482891472
124	NC_021089	GGA	2	6	5647	5652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482891472
125	NC_021089	TGA	2	6	5677	5682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482891472
126	NC_021089	TAA	2	6	5691	5696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482891472
127	NC_021089	GAT	2	6	5732	5737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482891472
128	NC_021089	AAAG	2	8	5790	5797	75 %	0 %	25 %	0 %	482891473
129	NC_021089	AGA	2	6	5810	5815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482891473
130	NC_021089	GTA	2	6	5838	5843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482891473
131	NC_021089	TGGT	2	8	5899	5906	0 %	50 %	50 %	0 %	482891473
132	NC_021089	TAT	2	6	5913	5918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482891473
133	NC_021089	TTA	2	6	5956	5961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482891473
134	NC_021089	A	6	6	5961	5966	100 %	0 %	0 %	0 %	482891473
135	NC_021089	AGAA	2	8	6038	6045	75 %	0 %	25 %	0 %	482891473
136	NC_021089	TAA	2	6	6046	6051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482891473
137	NC_021089	ACC	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482891473
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161	NC_021089	A	6	6	7185	7190	100 %	0 %	0 %	0 %	482891473
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172	NC_021089	A	9	9	7712	7720	100 %	0 %	0 %	0 %	482891474
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