MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Wolbachia endosymbiont of Onchocerca ochengi

Total Repeats: 15381

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018267	TGCA	2	8	1713	1720	25 %	25 %	25 %	25 %	402496445
2	NC_018267	TA	4	8	1764	1771	50 %	50 %	0 %	0 %	402496445
3	NC_018267	CTG	3	9	1776	1784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402496445
4	NC_018267	CTG	2	6	1803	1808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402496445
5	NC_018267	ATTA	2	8	1813	1820	50 %	50 %	0 %	0 %	402496445
6	NC_018267	CAT	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402496445
7	NC_018267	AAT	2	6	1912	1917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402496445
8	NC_018267	GCA	2	6	1934	1939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402496445
9	NC_018267	GAA	2	6	2006	2011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402496445
10	NC_018267	TAAT	2	8	2051	2058	50 %	50 %	0 %	0 %	402496445
11	NC_018267	TAT	2	6	2077	2082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402496445
12	NC_018267	CTT	3	9	2100	2108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402496445
13	NC_018267	AGCA	2	8	2119	2126	50 %	0 %	25 %	25 %	402496445
14	NC_018267	TTA	2	6	2183	2188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402496445
15	NC_018267	A	6	6	2339	2344	100 %	0 %	0 %	0 %	402496445
16	NC_018267	TTG	2	6	2445	2450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402496445
17	NC_018267	CTA	2	6	2472	2477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402496445
18	NC_018267	AGA	2	6	2509	2514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402496445
19	NC_018267	GCTCCA	2	12	2531	2542	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	402496445
20	NC_018267	ACA	2	6	2546	2551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402496445
21	NC_018267	TCT	2	6	2554	2559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402496445
22	NC_018267	AAT	2	6	2596	2601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402496445
23	NC_018267	TCA	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402496445
24	NC_018267	T	6	6	2666	2671	0 %	100 %	0 %	0 %	402496445
25	NC_018267	AAG	2	6	2721	2726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402496445
26	NC_018267	AT	3	6	2897	2902	50 %	50 %	0 %	0 %	402496445
27	NC_018267	AAG	2	6	2907	2912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402496445
28	NC_018267	CCA	2	6	2960	2965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402496445
29	NC_018267	ACC	2	6	3034	3039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402496445
30	NC_018267	ACC	2	6	3043	3048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402496445
31	NC_018267	TAA	2	6	3054	3059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402496445
32	NC_018267	A	6	6	3079	3084	100 %	0 %	0 %	0 %	402496446
33	NC_018267	TAAA	2	8	3098	3105	75 %	25 %	0 %	0 %	402496446
34	NC_018267	TA	4	8	3128	3135	50 %	50 %	0 %	0 %	402496446
35	NC_018267	TTCAGA	2	12	3203	3214	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402496446
36	NC_018267	GCAT	2	8	3261	3268	25 %	25 %	25 %	25 %	402496446
37	NC_018267	AAC	2	6	3279	3284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402496446
38	NC_018267	TAT	2	6	3352	3357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402496446
39	NC_018267	A	7	7	3369	3375	100 %	0 %	0 %	0 %	402496446
40	NC_018267	ACC	2	6	3380	3385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402496446
41	NC_018267	AGA	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402496446
42	NC_018267	TTTG	2	8	3447	3454	0 %	75 %	25 %	0 %	402496446
43	NC_018267	AAC	2	6	3521	3526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402496446
44	NC_018267	GTA	2	6	3552	3557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402496446
45	NC_018267	CAC	2	6	3619	3624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402496446
46	NC_018267	TCA	2	6	3627	3632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402496446
47	NC_018267	TAT	2	6	3665	3670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402496446
48	NC_018267	TAT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402496446
49	NC_018267	TAC	2	6	3797	3802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402496446
50	NC_018267	TAT	2	6	3808	3813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402496446
51	NC_018267	TAC	2	6	3818	3823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402496446
52	NC_018267	ATT	2	6	3902	3907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402496446
53	NC_018267	A	8	8	3914	3921	100 %	0 %	0 %	0 %	402496446
54	NC_018267	TCC	2	6	3926	3931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	402496446
55	NC_018267	ATG	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402496446
56	NC_018267	T	10	10	3958	3967	0 %	100 %	0 %	0 %	402496446
57	NC_018267	ATCAAC	2	12	4007	4018	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402496446
58	NC_018267	CTA	2	6	4042	4047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402496446
59	NC_018267	T	6	6	4097	4102	0 %	100 %	0 %	0 %	402496446
60	NC_018267	CACT	2	8	4119	4126	25 %	25 %	0 %	50 %	402496446
61	NC_018267	ACT	2	6	4139	4144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402496446
62	NC_018267	ACA	3	9	4147	4155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402496446
63	NC_018267	AAC	2	6	4163	4168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402496446
64	NC_018267	CTAA	2	8	5557	5564	50 %	25 %	0 %	25 %	402496447
65	NC_018267	CTT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402496447
66	NC_018267	CCT	2	6	5574	5579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	402496447
67	NC_018267	TTTA	2	8	5581	5588	25 %	75 %	0 %	0 %	402496447
68	NC_018267	GCTT	2	8	5608	5615	0 %	50 %	25 %	25 %	402496447
69	NC_018267	TTC	2	6	5681	5686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402496447
70	NC_018267	CAG	2	6	5694	5699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402496447
71	NC_018267	CAT	2	6	5775	5780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402496447
72	NC_018267	CTTT	2	8	5855	5862	0 %	75 %	0 %	25 %	402496447
73	NC_018267	T	6	6	6042	6047	0 %	100 %	0 %	0 %	402496448
74	NC_018267	CTT	2	6	6069	6074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402496448
75	NC_018267	CAA	2	6	6080	6085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402496448
76	NC_018267	CTTA	2	8	6147	6154	25 %	50 %	0 %	25 %	402496448
77	NC_018267	CAT	2	6	6227	6232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402496448
78	NC_018267	TAA	2	6	6254	6259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402496448
79	NC_018267	TAA	2	6	6408	6413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402496448
80	NC_018267	ACT	2	6	6418	6423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402496448
81	NC_018267	TGAT	2	8	6441	6448	25 %	50 %	25 %	0 %	402496448
82	NC_018267	TTA	2	6	6449	6454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402496448
83	NC_018267	ATT	2	6	6477	6482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402496449
84	NC_018267	T	6	6	6481	6486	0 %	100 %	0 %	0 %	402496449
85	NC_018267	T	6	6	6488	6493	0 %	100 %	0 %	0 %	402496449
86	NC_018267	AAG	2	6	6501	6506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402496449
87	NC_018267	CAT	2	6	6600	6605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402496449
88	NC_018267	AGT	2	6	6673	6678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402496449
89	NC_018267	T	8	8	6678	6685	0 %	100 %	0 %	0 %	402496449
90	NC_018267	ACC	2	6	6688	6693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402496449
91	NC_018267	T	6	6	6720	6725	0 %	100 %	0 %	0 %	402496449
92	NC_018267	TTTC	2	8	6733	6740	0 %	75 %	0 %	25 %	402496449
93	NC_018267	TAA	3	9	6765	6773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402496449
94	NC_018267	CAC	2	6	6783	6788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402496449
95	NC_018267	A	6	6	6923	6928	100 %	0 %	0 %	0 %	402496449
96	NC_018267	TAG	2	6	6953	6958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402496449
97	NC_018267	TAG	2	6	7102	7107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402496450
98	NC_018267	A	6	6	7156	7161	100 %	0 %	0 %	0 %	402496450
99	NC_018267	AAC	2	6	7209	7214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402496450
100	NC_018267	AAT	2	6	7339	7344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402496450
101	NC_018267	GGC	2	6	7349	7354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402496450
102	NC_018267	TCT	2	6	7387	7392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402496450
103	NC_018267	CAA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402496450
104	NC_018267	AAG	2	6	7471	7476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402496450
105	NC_018267	GA	3	6	7495	7500	50 %	0 %	50 %	0 %	402496450
106	NC_018267	GAA	2	6	7540	7545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402496450
107	NC_018267	TGA	2	6	7690	7695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402496450
108	NC_018267	CAA	2	6	7765	7770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402496450
109	NC_018267	AGC	2	6	7783	7788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402496450
110	NC_018267	A	8	8	7796	7803	100 %	0 %	0 %	0 %	402496450
111	NC_018267	CTT	2	6	7848	7853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402496450
112	NC_018267	ACT	2	6	7913	7918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402496450
113	NC_018267	A	7	7	7999	8005	100 %	0 %	0 %	0 %	402496450
114	NC_018267	ATT	2	6	8016	8021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402496450
115	NC_018267	A	6	6	8032	8037	100 %	0 %	0 %	0 %	402496450
116	NC_018267	AG	3	6	8045	8050	50 %	0 %	50 %	0 %	402496450
117	NC_018267	TAT	2	6	8089	8094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402496450
118	NC_018267	AGC	3	9	8119	8127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402496450
119	NC_018267	CAAG	2	8	8146	8153	50 %	0 %	25 %	25 %	402496450
120	NC_018267	ATT	2	6	8206	8211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402496450
121	NC_018267	A	6	6	9016	9021	100 %	0 %	0 %	0 %	402496451
122	NC_018267	TAA	2	6	9023	9028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402496451
123	NC_018267	GATAGA	2	12	9062	9073	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402496451
124	NC_018267	TAA	2	6	9074	9079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402496451
125	NC_018267	A	6	6	9103	9108	100 %	0 %	0 %	0 %	402496451
126	NC_018267	TGG	2	6	9131	9136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402496451
127	NC_018267	ACA	2	6	9215	9220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402496451
128	NC_018267	AAAGG	2	10	9257	9266	60 %	0 %	40 %	0 %	402496451
129	NC_018267	AGC	2	6	9365	9370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402496451
130	NC_018267	GTA	2	6	9414	9419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402496451
131	NC_018267	A	8	8	9464	9471	100 %	0 %	0 %	0 %	402496451
132	NC_018267	AT	3	6	9528	9533	50 %	50 %	0 %	0 %	402496451
133	NC_018267	GCA	2	6	9556	9561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402496451
134	NC_018267	TAA	2	6	9673	9678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402496452
135	NC_018267	AT	3	6	9682	9687	50 %	50 %	0 %	0 %	402496452
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149	NC_018267	A	6	6	10555	10560	100 %	0 %	0 %	0 %	402496453
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159	NC_018267	TA	3	6	10845	10850	50 %	50 %	0 %	0 %	402496454
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262	NC_018267	CTTA	2	8	15246	15253	25 %	50 %	0 %	25 %	402496459
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289	NC_018267	AATT	2	8	18251	18258	50 %	50 %	0 %	0 %	402496461
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