MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Weissella koreensis KACC 15510 plasmid WKp2903

Total Repeats: 312

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015756	ATA	2	6	613	618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339635251
2	NC_015756	CAC	2	6	644	649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339635251
3	NC_015756	A	7	7	683	689	100 %	0 %	0 %	0 %	339635251
4	NC_015756	AAT	2	6	701	706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339635251
5	NC_015756	ACT	2	6	732	737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339635251
6	NC_015756	TGAA	2	8	763	770	50 %	25 %	25 %	0 %	339635251
7	NC_015756	GAC	2	6	780	785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339635251
8	NC_015756	AAT	2	6	896	901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339635251
9	NC_015756	ATA	2	6	904	909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339635251
10	NC_015756	CAA	2	6	1089	1094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339635251
11	NC_015756	GAAC	2	8	1137	1144	50 %	0 %	25 %	25 %	339635251
12	NC_015756	CAA	2	6	1146	1151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339635251
13	NC_015756	AT	3	6	1165	1170	50 %	50 %	0 %	0 %	339635251
14	NC_015756	ATC	2	6	2168	2173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339635252
15	NC_015756	CAA	2	6	2178	2183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339635252
16	NC_015756	GAA	2	6	2335	2340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635252
17	NC_015756	T	6	6	2374	2379	0 %	100 %	0 %	0 %	339635252
18	NC_015756	T	6	6	2394	2399	0 %	100 %	0 %	0 %	339635252
19	NC_015756	TGA	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635252
20	NC_015756	AAG	2	6	2531	2536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635252
21	NC_015756	A	6	6	2589	2594	100 %	0 %	0 %	0 %	339635252
22	NC_015756	A	6	6	2665	2670	100 %	0 %	0 %	0 %	339635252
23	NC_015756	ACA	2	6	2720	2725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339635252
24	NC_015756	TGA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635252
25	NC_015756	GT	3	6	2879	2884	0 %	50 %	50 %	0 %	339635252
26	NC_015756	GAA	2	6	2895	2900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635252
27	NC_015756	GAA	2	6	2929	2934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635252
28	NC_015756	TATGC	2	10	3055	3064	20 %	40 %	20 %	20 %	339635252
29	NC_015756	ACTC	2	8	3156	3163	25 %	25 %	0 %	50 %	339635252
30	NC_015756	A	6	6	3169	3174	100 %	0 %	0 %	0 %	339635252
31	NC_015756	GAC	2	6	3201	3206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339635252
32	NC_015756	TAGAT	2	10	3243	3252	40 %	40 %	20 %	0 %	339635252
33	NC_015756	AATC	2	8	3279	3286	50 %	25 %	0 %	25 %	339635252
34	NC_015756	AC	3	6	3871	3876	50 %	0 %	0 %	50 %	339635253
35	NC_015756	GTC	2	6	3902	3907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339635253
36	NC_015756	C	6	6	4001	4006	0 %	0 %	0 %	100 %	339635253
37	NC_015756	TTTA	2	8	4020	4027	25 %	75 %	0 %	0 %	339635253
38	NC_015756	GTT	2	6	4039	4044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339635253
39	NC_015756	T	7	7	4048	4054	0 %	100 %	0 %	0 %	339635253
40	NC_015756	TGA	2	6	4060	4065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635253
41	NC_015756	CAA	2	6	4069	4074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339635253
42	NC_015756	AAG	2	6	4089	4094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635253
43	NC_015756	A	6	6	4101	4106	100 %	0 %	0 %	0 %	339635253
44	NC_015756	T	7	7	4120	4126	0 %	100 %	0 %	0 %	339635253
45	NC_015756	A	6	6	4133	4138	100 %	0 %	0 %	0 %	339635253
46	NC_015756	TTA	2	6	4161	4166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339635253
47	NC_015756	TAAT	2	8	4251	4258	50 %	50 %	0 %	0 %	339635253
48	NC_015756	AAT	2	6	4265	4270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339635253
49	NC_015756	AGTA	2	8	4310	4317	50 %	25 %	25 %	0 %	339635253
50	NC_015756	AAT	2	6	4321	4326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339635253
51	NC_015756	CAAT	2	8	4354	4361	50 %	25 %	0 %	25 %	339635253
52	NC_015756	GA	3	6	4390	4395	50 %	0 %	50 %	0 %	339635253
53	NC_015756	TGA	2	6	4465	4470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635253
54	NC_015756	A	6	6	4494	4499	100 %	0 %	0 %	0 %	339635253
55	NC_015756	TGAA	2	8	4506	4513	50 %	25 %	25 %	0 %	339635253
56	NC_015756	AC	3	6	4534	4539	50 %	0 %	0 %	50 %	339635253
57	NC_015756	A	6	6	4568	4573	100 %	0 %	0 %	0 %	339635253
58	NC_015756	A	6	6	4610	4615	100 %	0 %	0 %	0 %	339635253
59	NC_015756	GAT	2	6	4625	4630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635253
60	NC_015756	GAT	2	6	4646	4651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635253
61	NC_015756	AAG	2	6	4680	4685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635253
62	NC_015756	AGA	2	6	4690	4695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635253
63	NC_015756	AT	3	6	4762	4767	50 %	50 %	0 %	0 %	339635253
64	NC_015756	TAC	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339635253
65	NC_015756	ACAA	2	8	4887	4894	75 %	0 %	0 %	25 %	339635253
66	NC_015756	A	6	6	4931	4936	100 %	0 %	0 %	0 %	339635253
67	NC_015756	GAG	2	6	5019	5024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339635254
68	NC_015756	ACAA	2	8	5070	5077	75 %	0 %	0 %	25 %	339635254
69	NC_015756	CAAA	2	8	5085	5092	75 %	0 %	0 %	25 %	339635254
70	NC_015756	GTT	2	6	5106	5111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339635254
71	NC_015756	AGA	2	6	5120	5125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635254
72	NC_015756	ACAA	2	8	5160	5167	75 %	0 %	0 %	25 %	339635254
73	NC_015756	ACAA	2	8	5194	5201	75 %	0 %	0 %	25 %	339635254
74	NC_015756	TGA	2	6	5252	5257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635254
75	NC_015756	CAA	2	6	5355	5360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339635254
76	NC_015756	GAA	2	6	5391	5396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635254
77	NC_015756	ATG	3	9	5443	5451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635254
78	NC_015756	AAG	2	6	5458	5463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635254
79	NC_015756	ACAA	2	8	5473	5480	75 %	0 %	0 %	25 %	339635254
80	NC_015756	AACCTA	2	12	5512	5523	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	339635254
81	NC_015756	GTG	2	6	5528	5533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339635254
82	NC_015756	A	6	6	5675	5680	100 %	0 %	0 %	0 %	339635255
83	NC_015756	TTG	2	6	5697	5702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339635255
84	NC_015756	GAA	2	6	5871	5876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635255
85	NC_015756	TAG	2	6	6102	6107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635256
86	NC_015756	ATC	2	6	6185	6190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339635256
87	NC_015756	GAAA	2	8	6199	6206	75 %	0 %	25 %	0 %	339635256
88	NC_015756	A	6	6	6204	6209	100 %	0 %	0 %	0 %	339635256
89	NC_015756	AAG	2	6	6282	6287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635256
90	NC_015756	ATTT	2	8	6295	6302	25 %	75 %	0 %	0 %	339635256
91	NC_015756	TAC	2	6	6304	6309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339635256
92	NC_015756	AGAA	2	8	6321	6328	75 %	0 %	25 %	0 %	339635256
93	NC_015756	GTA	2	6	6389	6394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635256
94	NC_015756	GAT	2	6	6428	6433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635256
95	NC_015756	AGA	2	6	6445	6450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635256
96	NC_015756	A	6	6	6464	6469	100 %	0 %	0 %	0 %	339635256
97	NC_015756	AGA	2	6	6481	6486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339635256
98	NC_015756	CAT	3	9	6530	6538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339635256
99	NC_015756	A	6	6	6620	6625	100 %	0 %	0 %	0 %	339635257
100	NC_015756	TGC	2	6	6670	6675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339635257
101	NC_015756	ACTA	2	8	6686	6693	50 %	25 %	0 %	25 %	339635257
102	NC_015756	AACA	2	8	6860	6867	75 %	0 %	0 %	25 %	339635258
103	NC_015756	TCA	2	6	6883	6888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339635258
104	NC_015756	GGA	2	6	7001	7006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339635258
105	NC_015756	ATG	2	6	7010	7015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635258
106	NC_015756	TCT	2	6	7155	7160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339635258
107	NC_015756	T	7	7	7177	7183	0 %	100 %	0 %	0 %	339635258
108	NC_015756	AGCC	2	8	7215	7222	25 %	0 %	25 %	50 %	339635258
109	NC_015756	ATG	3	9	7223	7231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635258
110	NC_015756	A	6	6	7430	7435	100 %	0 %	0 %	0 %	339635258
111	NC_015756	GAAA	2	8	7501	7508	75 %	0 %	25 %	0 %	339635258
112	NC_015756	CGTT	2	8	7548	7555	0 %	50 %	25 %	25 %	339635258
113	NC_015756	A	7	7	7595	7601	100 %	0 %	0 %	0 %	339635258
114	NC_015756	TGG	2	6	7618	7623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339635258
115	NC_015756	TCAA	2	8	7629	7636	50 %	25 %	0 %	25 %	339635258
116	NC_015756	AACC	2	8	7637	7644	50 %	0 %	0 %	50 %	339635258
117	NC_015756	TCAA	2	8	7686	7693	50 %	25 %	0 %	25 %	339635258
118	NC_015756	TGC	2	6	7777	7782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339635258
119	NC_015756	TCT	2	6	7797	7802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339635258
120	NC_015756	T	6	6	7809	7814	0 %	100 %	0 %	0 %	339635258
121	NC_015756	CTT	3	9	7844	7852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339635258
122	NC_015756	TTG	2	6	7908	7913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339635258
123	NC_015756	TTA	2	6	7949	7954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339635258
124	NC_015756	CAGAA	2	10	7958	7967	60 %	0 %	20 %	20 %	339635258
125	NC_015756	A	6	6	7977	7982	100 %	0 %	0 %	0 %	339635258
126	NC_015756	TTA	2	6	8055	8060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339635258
127	NC_015756	TGA	2	6	8068	8073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635258
128	NC_015756	GCA	2	6	8096	8101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339635258
129	NC_015756	GAAG	2	8	8105	8112	50 %	0 %	50 %	0 %	339635258
130	NC_015756	TCAA	2	8	8131	8138	50 %	25 %	0 %	25 %	339635258
131	NC_015756	GCT	2	6	8147	8152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339635258
132	NC_015756	ATG	2	6	8280	8285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635258
133	NC_015756	ATTTAG	2	12	8304	8315	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	339635258
134	NC_015756	AAC	2	6	8343	8348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339635258
135	NC_015756	TTA	2	6	8406	8411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339635258
136	NC_015756	TTA	2	6	8417	8422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339635258
137	NC_015756	ATA	2	6	8457	8462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339635258
138	NC_015756	A	6	6	8475	8480	100 %	0 %	0 %	0 %	339635258
139	NC_015756	AAAG	2	8	8560	8567	75 %	0 %	25 %	0 %	339635258
140	NC_015756	GTC	2	6	8678	8683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339635258
141	NC_015756	TCCAA	2	10	8693	8702	40 %	20 %	0 %	40 %	339635258
142	NC_015756	CAT	2	6	8785	8790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339635258
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254	NC_015756	TAA	2	6	14586	14591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339635267
255	NC_015756	AAC	2	6	14592	14597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339635267
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258	NC_015756	CTTT	2	8	14733	14740	0 %	75 %	0 %	25 %	339635267
259	NC_015756	GAT	2	6	14752	14757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635267
260	NC_015756	CACG	2	8	14758	14765	25 %	0 %	25 %	50 %	339635267
261	NC_015756	ATC	2	6	14792	14797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339635267
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264	NC_015756	GAT	2	6	14833	14838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339635267
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.