MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Wolbachia endosymbiont of Culex quinquefasciatus Pel chromosome

Total Repeats: 29149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010981	TAAC	2	8	159	166	50 %	25 %	0 %	25 %	190570479
2	NC_010981	CTA	2	6	177	182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190570479
3	NC_010981	T	6	6	185	190	0 %	100 %	0 %	0 %	190570479
4	NC_010981	ATT	2	6	197	202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190570479
5	NC_010981	A	6	6	231	236	100 %	0 %	0 %	0 %	190570479
6	NC_010981	GCTG	2	8	282	289	0 %	25 %	50 %	25 %	190570479
7	NC_010981	TGT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190570479
8	NC_010981	CAA	2	6	342	347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190570479
9	NC_010981	A	6	6	384	389	100 %	0 %	0 %	0 %	190570479
10	NC_010981	AATT	2	8	441	448	50 %	50 %	0 %	0 %	190570479
11	NC_010981	GAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190570479
12	NC_010981	AAATTC	2	12	457	468	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	190570479
13	NC_010981	A	6	6	481	486	100 %	0 %	0 %	0 %	190570479
14	NC_010981	AG	3	6	488	493	50 %	0 %	50 %	0 %	190570479
15	NC_010981	ATAATC	2	12	498	509	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	190570479
16	NC_010981	CAC	2	6	516	521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190570479
17	NC_010981	TGG	2	6	646	651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190570479
18	NC_010981	ATGC	2	8	677	684	25 %	25 %	25 %	25 %	190570479
19	NC_010981	AAAAG	2	10	719	728	80 %	0 %	20 %	0 %	190570479
20	NC_010981	CAG	2	6	741	746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190570479
21	NC_010981	AT	3	6	763	768	50 %	50 %	0 %	0 %	190570479
22	NC_010981	GAT	2	6	839	844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190570479
23	NC_010981	AAG	2	6	876	881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190570479
24	NC_010981	T	6	6	884	889	0 %	100 %	0 %	0 %	190570479
25	NC_010981	AGA	2	6	970	975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190570479
26	NC_010981	TTGG	2	8	993	1000	0 %	50 %	50 %	0 %	190570479
27	NC_010981	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190570479
28	NC_010981	GAAT	2	8	1071	1078	50 %	25 %	25 %	0 %	190570479
29	NC_010981	ATGT	2	8	1079	1086	25 %	50 %	25 %	0 %	190570479
30	NC_010981	GAA	2	6	1185	1190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190570479
31	NC_010981	TCT	2	6	1228	1233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190570479
32	NC_010981	AGA	2	6	1261	1266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190570479
33	NC_010981	A	7	7	1274	1280	100 %	0 %	0 %	0 %	190570479
34	NC_010981	AAG	2	6	1376	1381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190570479
35	NC_010981	A	6	6	1389	1394	100 %	0 %	0 %	0 %	190570479
36	NC_010981	GAA	2	6	1410	1415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190570479
37	NC_010981	TGG	2	6	1420	1425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190570479
38	NC_010981	TGA	2	6	1498	1503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190570479
39	NC_010981	AATC	2	8	1504	1511	50 %	25 %	0 %	25 %	190570479
40	NC_010981	A	6	6	1516	1521	100 %	0 %	0 %	0 %	190570479
41	NC_010981	T	6	6	1780	1785	0 %	100 %	0 %	0 %	190570480
42	NC_010981	TGC	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190570480
43	NC_010981	GAAT	2	8	1810	1817	50 %	25 %	25 %	0 %	190570480
44	NC_010981	CAAG	2	8	1864	1871	50 %	0 %	25 %	25 %	190570480
45	NC_010981	GAT	2	6	1872	1877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190570480
46	NC_010981	AG	3	6	1898	1903	50 %	0 %	50 %	0 %	190570480
47	NC_010981	ATT	2	6	2109	2114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190570480
48	NC_010981	T	7	7	2121	2127	0 %	100 %	0 %	0 %	190570480
49	NC_010981	TGG	2	6	2162	2167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190570480
50	NC_010981	AAT	2	6	2168	2173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190570480
51	NC_010981	ATG	2	6	2185	2190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190570480
52	NC_010981	TCA	2	6	2241	2246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190570480
53	NC_010981	TCAA	2	8	2277	2284	50 %	25 %	0 %	25 %	190570480
54	NC_010981	TA	3	6	2297	2302	50 %	50 %	0 %	0 %	190570480
55	NC_010981	A	8	8	2322	2329	100 %	0 %	0 %	0 %	190570480
56	NC_010981	TAC	2	6	2408	2413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190570480
57	NC_010981	TCT	2	6	2414	2419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190570480
58	NC_010981	TGC	2	6	2420	2425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190570480
59	NC_010981	ATA	2	6	2584	2589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190570481
60	NC_010981	TTA	2	6	2595	2600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190570481
61	NC_010981	TGAAA	2	10	2611	2620	60 %	20 %	20 %	0 %	190570481
62	NC_010981	AATG	2	8	2646	2653	50 %	25 %	25 %	0 %	190570481
63	NC_010981	CAT	2	6	2686	2691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190570481
64	NC_010981	A	6	6	2697	2702	100 %	0 %	0 %	0 %	190570481
65	NC_010981	AAC	2	6	2729	2734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190570481
66	NC_010981	AT	3	6	2765	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	190570481
67	NC_010981	CCTT	2	8	2951	2958	0 %	50 %	0 %	50 %	190570481
68	NC_010981	TAT	2	6	3035	3040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190570481
69	NC_010981	T	6	6	3060	3065	0 %	100 %	0 %	0 %	190570481
70	NC_010981	A	6	6	3222	3227	100 %	0 %	0 %	0 %	190570482
71	NC_010981	CAA	2	6	3239	3244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190570482
72	NC_010981	TTCT	2	8	3245	3252	0 %	75 %	0 %	25 %	190570482
73	NC_010981	TAT	2	6	3266	3271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190570482
74	NC_010981	ATT	2	6	3277	3282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190570482
75	NC_010981	AGCCAA	2	12	3304	3315	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	190570482
76	NC_010981	TCT	2	6	3346	3351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190570482
77	NC_010981	ATT	2	6	3391	3396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190570482
78	NC_010981	CTA	2	6	3401	3406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190570482
79	NC_010981	AG	3	6	3413	3418	50 %	0 %	50 %	0 %	190570482
80	NC_010981	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190570482
81	NC_010981	TAAC	2	8	3488	3495	50 %	25 %	0 %	25 %	190570482
82	NC_010981	TTC	3	9	3513	3521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190570482
83	NC_010981	GTG	2	6	3529	3534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190570482
84	NC_010981	TCAA	2	8	3647	3654	50 %	25 %	0 %	25 %	190570482
85	NC_010981	ATTT	2	8	3665	3672	25 %	75 %	0 %	0 %	190570482
86	NC_010981	TTTA	2	8	3693	3700	25 %	75 %	0 %	0 %	190570482
87	NC_010981	ATT	2	6	3748	3753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190570482
88	NC_010981	AATC	2	8	3798	3805	50 %	25 %	0 %	25 %	190570482
89	NC_010981	ATA	2	6	3815	3820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190570482
90	NC_010981	TAA	2	6	3917	3922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190570482
91	NC_010981	A	6	6	3938	3943	100 %	0 %	0 %	0 %	190570482
92	NC_010981	TTGGT	2	10	3945	3954	0 %	60 %	40 %	0 %	190570482
93	NC_010981	AAAT	2	8	4004	4011	75 %	25 %	0 %	0 %	190570482
94	NC_010981	TAA	2	6	4035	4040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190570482
95	NC_010981	ACT	2	6	4115	4120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190570482
96	NC_010981	T	6	6	4120	4125	0 %	100 %	0 %	0 %	190570482
97	NC_010981	AAG	2	6	4135	4140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190570482
98	NC_010981	TTTAT	2	10	4214	4223	20 %	80 %	0 %	0 %	190570482
99	NC_010981	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190570482
100	NC_010981	AT	3	6	4344	4349	50 %	50 %	0 %	0 %	190570482
101	NC_010981	AGC	2	6	4424	4429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190570482
102	NC_010981	GTT	2	6	4446	4451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190570482
103	NC_010981	T	6	6	4513	4518	0 %	100 %	0 %	0 %	190570482
104	NC_010981	TAT	2	6	4532	4537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190570482
105	NC_010981	TTTA	2	8	4568	4575	25 %	75 %	0 %	0 %	190570482
106	NC_010981	CAA	2	6	4604	4609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190570482
107	NC_010981	ATT	2	6	4620	4625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190570482
108	NC_010981	GTT	2	6	4629	4634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190570482
109	NC_010981	CAG	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190570482
110	NC_010981	GAT	2	6	4735	4740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190570482
111	NC_010981	T	6	6	4787	4792	0 %	100 %	0 %	0 %	190570482
112	NC_010981	CTT	2	6	4793	4798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190570482
113	NC_010981	AT	3	6	4816	4821	50 %	50 %	0 %	0 %	190570482
114	NC_010981	CAA	2	6	4852	4857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190570482
115	NC_010981	TAA	2	6	4862	4867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190570482
116	NC_010981	GAAT	2	8	4892	4899	50 %	25 %	25 %	0 %	190570482
117	NC_010981	TAT	2	6	4928	4933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190570483
118	NC_010981	ATA	2	6	4986	4991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190570483
119	NC_010981	ATG	2	6	5076	5081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190570483
120	NC_010981	GTG	2	6	5109	5114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190570483
121	NC_010981	CAT	2	6	5177	5182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190570483
122	NC_010981	AAT	2	6	5203	5208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190570483
123	NC_010981	CAG	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190570483
124	NC_010981	TGG	2	6	5266	5271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190570483
125	NC_010981	GGA	2	6	5328	5333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190570484
126	NC_010981	A	6	6	5347	5352	100 %	0 %	0 %	0 %	190570484
127	NC_010981	AAG	2	6	5364	5369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190570484
128	NC_010981	ACA	2	6	5423	5428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190570484
129	NC_010981	AT	3	6	5486	5491	50 %	50 %	0 %	0 %	190570484
130	NC_010981	GAA	2	6	5500	5505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190570484
131	NC_010981	GAA	2	6	5557	5562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190570484
132	NC_010981	ATA	2	6	5572	5577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190570484
133	NC_010981	TTA	2	6	5690	5695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190570484
134	NC_010981	CAAA	2	8	5735	5742	75 %	0 %	0 %	25 %	190570484
135	NC_010981	TTA	2	6	5750	5755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190570484
136	NC_010981	GTT	2	6	5760	5765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190570484
137	NC_010981	TAAA	2	8	5792	5799	75 %	25 %	0 %	0 %	190570484
138	NC_010981	TAA	2	6	5923	5928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190570485
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264	NC_010981	GTG	2	6	12514	12519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190570495
265	NC_010981	ATC	2	6	12545	12550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190570495
266	NC_010981	CTT	2	6	12579	12584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190570495
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