MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Wigglesworthia glossinidia endosymbiont of Glossina brevipalpis plasmid pWb1

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003425	AAT	2	6	389	394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50470477
2	NC_003425	AGA	2	6	401	406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50470477
3	NC_003425	A	6	6	408	413	100 %	0 %	0 %	0 %	50470477
4	NC_003425	T	7	7	415	421	0 %	100 %	0 %	0 %	50470477
5	NC_003425	A	9	9	422	430	100 %	0 %	0 %	0 %	50470477
6	NC_003425	A	7	7	432	438	100 %	0 %	0 %	0 %	50470477
7	NC_003425	GAT	2	6	459	464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50470477
8	NC_003425	AAT	2	6	491	496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50470477
9	NC_003425	T	6	6	514	519	0 %	100 %	0 %	0 %	50470477
10	NC_003425	CAG	2	6	589	594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50470477
11	NC_003425	AT	3	6	622	627	50 %	50 %	0 %	0 %	50470477
12	NC_003425	AT	3	6	630	635	50 %	50 %	0 %	0 %	50470477
13	NC_003425	TAA	2	6	662	667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50470477
14	NC_003425	ATA	2	6	670	675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50470477
15	NC_003425	AAGCA	2	10	683	692	60 %	0 %	20 %	20 %	50470477
16	NC_003425	T	7	7	713	719	0 %	100 %	0 %	0 %	50470477
17	NC_003425	T	6	6	811	816	0 %	100 %	0 %	0 %	50470477
18	NC_003425	A	6	6	821	826	100 %	0 %	0 %	0 %	50470477
19	NC_003425	A	6	6	831	836	100 %	0 %	0 %	0 %	50470477
20	NC_003425	GATA	2	8	854	861	50 %	25 %	25 %	0 %	50470477
21	NC_003425	AGA	2	6	875	880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50470477
22	NC_003425	A	8	8	880	887	100 %	0 %	0 %	0 %	50470477
23	NC_003425	ATT	2	6	915	920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470477
24	NC_003425	A	6	6	947	952	100 %	0 %	0 %	0 %	50470477
25	NC_003425	ATAG	2	8	1002	1009	50 %	25 %	25 %	0 %	50470477
26	NC_003425	T	6	6	1053	1058	0 %	100 %	0 %	0 %	50470477
27	NC_003425	CTA	2	6	1066	1071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50470477
28	NC_003425	A	6	6	1071	1076	100 %	0 %	0 %	0 %	50470477
29	NC_003425	TTA	2	6	1104	1109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470477
30	NC_003425	A	6	6	1145	1150	100 %	0 %	0 %	0 %	50470477
31	NC_003425	TA	3	6	1183	1188	50 %	50 %	0 %	0 %	50470477
32	NC_003425	GAT	2	6	1406	1411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50470478
33	NC_003425	TCA	2	6	1423	1428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50470478
34	NC_003425	ATA	2	6	1434	1439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50470478
35	NC_003425	GAA	2	6	1466	1471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50470478
36	NC_003425	AGA	2	6	1535	1540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50470478
37	NC_003425	TAG	2	6	1575	1580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50470478
38	NC_003425	AAAT	2	8	1590	1597	75 %	25 %	0 %	0 %	50470478
39	NC_003425	TACA	2	8	1598	1605	50 %	25 %	0 %	25 %	50470478
40	NC_003425	ATT	2	6	1625	1630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470478
41	NC_003425	TA	3	6	1713	1718	50 %	50 %	0 %	0 %	50470478
42	NC_003425	GTA	2	6	1730	1735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50470478
43	NC_003425	ATTT	2	8	1763	1770	25 %	75 %	0 %	0 %	50470478
44	NC_003425	GAAG	2	8	1790	1797	50 %	0 %	50 %	0 %	50470478
45	NC_003425	TG	3	6	1848	1853	0 %	50 %	50 %	0 %	50470478
46	NC_003425	AAT	2	6	1862	1867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50470478
47	NC_003425	AATA	2	8	1874	1881	75 %	25 %	0 %	0 %	50470478
48	NC_003425	T	7	7	1927	1933	0 %	100 %	0 %	0 %	50470479
49	NC_003425	TTA	2	6	1958	1963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470479
50	NC_003425	AT	3	6	1972	1977	50 %	50 %	0 %	0 %	50470479
51	NC_003425	CTT	2	6	2004	2009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50470479
52	NC_003425	T	6	6	2030	2035	0 %	100 %	0 %	0 %	50470479
53	NC_003425	T	6	6	2037	2042	0 %	100 %	0 %	0 %	50470479
54	NC_003425	ACA	2	6	2117	2122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50470479
55	NC_003425	A	6	6	2140	2145	100 %	0 %	0 %	0 %	50470479
56	NC_003425	T	6	6	2157	2162	0 %	100 %	0 %	0 %	50470479
57	NC_003425	ATT	2	6	2170	2175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470479
58	NC_003425	TTC	2	6	2176	2181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50470479
59	NC_003425	TTA	2	6	2192	2197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470479
60	NC_003425	ATG	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50470479
61	NC_003425	ATC	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50470479
62	NC_003425	GTG	2	6	2245	2250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50470479
63	NC_003425	TAA	2	6	2251	2256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50470479
64	NC_003425	TAATT	2	10	2272	2281	40 %	60 %	0 %	0 %	50470479
65	NC_003425	AAT	2	6	2313	2318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50470479
66	NC_003425	CTT	2	6	2322	2327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50470479
67	NC_003425	ATA	2	6	2332	2337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50470479
68	NC_003425	TTA	2	6	2340	2345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470479
69	NC_003425	T	6	6	2414	2419	0 %	100 %	0 %	0 %	50470479
70	NC_003425	AT	3	6	2426	2431	50 %	50 %	0 %	0 %	50470479
71	NC_003425	AT	3	6	2458	2463	50 %	50 %	0 %	0 %	50470479
72	NC_003425	AT	3	6	2474	2479	50 %	50 %	0 %	0 %	50470479
73	NC_003425	T	8	8	2499	2506	0 %	100 %	0 %	0 %	50470479
74	NC_003425	TACA	2	8	2544	2551	50 %	25 %	0 %	25 %	50470479
75	NC_003425	ATT	2	6	2561	2566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470479
76	NC_003425	ATTT	2	8	2574	2581	25 %	75 %	0 %	0 %	50470479
77	NC_003425	T	6	6	2601	2606	0 %	100 %	0 %	0 %	50470479
78	NC_003425	T	6	6	2738	2743	0 %	100 %	0 %	0 %	50470480
79	NC_003425	TAAT	2	8	2764	2771	50 %	50 %	0 %	0 %	50470480
80	NC_003425	TAAA	2	8	2794	2801	75 %	25 %	0 %	0 %	50470480
81	NC_003425	AGA	2	6	2843	2848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50470480
82	NC_003425	T	7	7	2876	2882	0 %	100 %	0 %	0 %	50470480
83	NC_003425	GAT	2	6	2916	2921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50470480
84	NC_003425	ATT	2	6	2934	2939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470480
85	NC_003425	TAG	2	6	2941	2946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50470480
86	NC_003425	GCTTCT	2	12	2952	2963	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	50470480
87	NC_003425	TCTT	2	8	2969	2976	0 %	75 %	0 %	25 %	50470480
88	NC_003425	AT	3	6	3124	3129	50 %	50 %	0 %	0 %	50470480
89	NC_003425	CTG	2	6	3184	3189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50470480
90	NC_003425	TCA	2	6	3249	3254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50470480
91	NC_003425	TATATT	2	12	3272	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470480
92	NC_003425	TC	3	6	3285	3290	0 %	50 %	0 %	50 %	50470480
93	NC_003425	TAT	2	6	3356	3361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470480
94	NC_003425	AGC	2	6	3389	3394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50470480
95	NC_003425	ATT	2	6	3395	3400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470480
96	NC_003425	ATT	2	6	3462	3467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470480
97	NC_003425	CAT	2	6	3497	3502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50470480
98	NC_003425	TTTAT	2	10	3504	3513	20 %	80 %	0 %	0 %	50470480
99	NC_003425	CAA	2	6	3526	3531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50470480
100	NC_003425	TA	3	6	3569	3574	50 %	50 %	0 %	0 %	50470480
101	NC_003425	TAAT	2	8	3628	3635	50 %	50 %	0 %	0 %	50470480
102	NC_003425	TAAT	2	8	3655	3662	50 %	50 %	0 %	0 %	50470480
103	NC_003425	TATT	2	8	3709	3716	25 %	75 %	0 %	0 %	50470481
104	NC_003425	TTTTGT	2	12	3768	3779	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	50470481
105	NC_003425	TATTTT	2	12	3787	3798	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	50470481
106	NC_003425	T	6	6	3795	3800	0 %	100 %	0 %	0 %	50470481
107	NC_003425	GTT	2	6	3815	3820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50470481
108	NC_003425	T	6	6	3832	3837	0 %	100 %	0 %	0 %	50470481
109	NC_003425	CTAA	2	8	3851	3858	50 %	25 %	0 %	25 %	50470481
110	NC_003425	A	6	6	3857	3862	100 %	0 %	0 %	0 %	50470481
111	NC_003425	AGA	2	6	3868	3873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50470481
112	NC_003425	T	7	7	3905	3911	0 %	100 %	0 %	0 %	50470481
113	NC_003425	T	7	7	3931	3937	0 %	100 %	0 %	0 %	50470481
114	NC_003425	ATT	3	9	3947	3955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470481
115	NC_003425	TTA	2	6	3993	3998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470481
116	NC_003425	TTC	2	6	4021	4026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50470481
117	NC_003425	AAT	2	6	4029	4034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50470481
118	NC_003425	TAT	2	6	4059	4064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470481
119	NC_003425	ATT	4	12	4070	4081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470481
120	NC_003425	TAA	2	6	4192	4197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50470481
121	NC_003425	GCA	2	6	4205	4210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50470481
122	NC_003425	GCA	2	6	4256	4261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50470481
123	NC_003425	TAT	2	6	4273	4278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470481
124	NC_003425	AAG	2	6	4308	4313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50470481
125	NC_003425	A	7	7	4356	4362	100 %	0 %	0 %	0 %	50470481
126	NC_003425	ATT	2	6	4370	4375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470481
127	NC_003425	T	6	6	4403	4408	0 %	100 %	0 %	0 %	50470481
128	NC_003425	TATC	2	8	4530	4537	25 %	50 %	0 %	25 %	50470481
129	NC_003425	TA	4	8	4542	4549	50 %	50 %	0 %	0 %	50470481
130	NC_003425	T	6	6	4554	4559	0 %	100 %	0 %	0 %	50470481
131	NC_003425	TTA	2	6	4629	4634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470482
132	NC_003425	TTC	2	6	4656	4661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50470482
133	NC_003425	T	6	6	4675	4680	0 %	100 %	0 %	0 %	50470482
134	NC_003425	AAAG	2	8	4707	4714	75 %	0 %	25 %	0 %	50470482
135	NC_003425	ATTTT	2	10	4748	4757	20 %	80 %	0 %	0 %	50470482
136	NC_003425	T	6	6	4795	4800	0 %	100 %	0 %	0 %	50470482
137	NC_003425	ATTT	2	8	4821	4828	25 %	75 %	0 %	0 %	50470482
138	NC_003425	T	8	8	4826	4833	0 %	100 %	0 %	0 %	50470482
139	NC_003425	TTTCTT	3	18	4835	4852	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	50470482
140	NC_003425	T	6	6	4851	4856	0 %	100 %	0 %	0 %	50470482
141	NC_003425	TAT	2	6	4880	4885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470482
142	NC_003425	TTA	2	6	4886	4891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470482
143	NC_003425	TTC	2	6	4905	4910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50470482
144	NC_003425	T	6	6	4911	4916	0 %	100 %	0 %	0 %	50470482
145	NC_003425	TAAA	2	8	5018	5025	75 %	25 %	0 %	0 %	50470482

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.