MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Waddlia chondrophila WSU 86-1044 plasmid pWc

Total Repeats: 347

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014226	ACC	2	6	64	69	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_014226	TAT	2	6	70	75	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014226	TAA	2	6	84	89	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014226	CATC	2	8	108	115	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014226	AT	3	6	323	328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014226	AC	3	6	392	397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014226	AGT	2	6	421	426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297660607
8	NC_014226	AG	3	6	442	447	50 %	0 %	50 %	0 %	297660607
9	NC_014226	CT	3	6	503	508	0 %	50 %	0 %	50 %	297660607
10	NC_014226	TAT	2	6	517	522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297660607
11	NC_014226	ATC	2	6	602	607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297660607
12	NC_014226	TGC	2	6	652	657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297660607
13	NC_014226	ACA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297660607
14	NC_014226	AAGC	2	8	701	708	50 %	0 %	25 %	25 %	297660607
15	NC_014226	CATTT	2	10	724	733	20 %	60 %	0 %	20 %	297660607
16	NC_014226	AGA	2	6	749	754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297660607
17	NC_014226	AG	3	6	788	793	50 %	0 %	50 %	0 %	297660607
18	NC_014226	A	6	6	801	806	100 %	0 %	0 %	0 %	297660607
19	NC_014226	CAG	2	6	854	859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297660607
20	NC_014226	T	6	6	869	874	0 %	100 %	0 %	0 %	297660607
21	NC_014226	GAA	2	6	875	880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297660607
22	NC_014226	GGA	2	6	932	937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297660607
23	NC_014226	A	7	7	986	992	100 %	0 %	0 %	0 %	297660607
24	NC_014226	CCA	2	6	1006	1011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297660607
25	NC_014226	CAAA	2	8	1033	1040	75 %	0 %	0 %	25 %	297660607
26	NC_014226	TCT	2	6	1084	1089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297660607
27	NC_014226	ACA	2	6	1121	1126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297660607
28	NC_014226	CGT	2	6	1132	1137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297660607
29	NC_014226	AGC	2	6	1180	1185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297660607
30	NC_014226	CAT	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297660607
31	NC_014226	GAT	2	6	1303	1308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297660607
32	NC_014226	ATT	2	6	1385	1390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014226	ATT	2	6	1434	1439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014226	A	6	6	1487	1492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014226	AT	3	6	1498	1503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014226	TA	3	6	1509	1514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014226	GAAT	2	8	1532	1539	50 %	25 %	25 %	0 %	297660608
38	NC_014226	CGA	2	6	1560	1565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297660608
39	NC_014226	A	7	7	1602	1608	100 %	0 %	0 %	0 %	297660608
40	NC_014226	ATG	2	6	1703	1708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297660608
41	NC_014226	TAT	2	6	1720	1725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297660608
42	NC_014226	TTA	2	6	1756	1761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297660608
43	NC_014226	GGA	2	6	1762	1767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297660608
44	NC_014226	CAAG	2	8	1794	1801	50 %	0 %	25 %	25 %	297660608
45	NC_014226	CAAAA	2	10	2005	2014	80 %	0 %	0 %	20 %	297660609
46	NC_014226	AC	3	6	2096	2101	50 %	0 %	0 %	50 %	297660609
47	NC_014226	TGA	2	6	2110	2115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014226	TGA	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014226	T	6	6	2185	2190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014226	TCG	2	6	2208	2213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014226	TCA	2	6	2268	2273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014226	TAAA	2	8	2280	2287	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014226	A	6	6	2285	2290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014226	T	6	6	2295	2300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014226	A	6	6	2352	2357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014226	A	6	6	2359	2364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014226	A	6	6	2377	2382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014226	TAA	2	6	2405	2410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014226	AATA	2	8	2521	2528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014226	AAT	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014226	AAC	2	6	2596	2601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014226	A	6	6	2672	2677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014226	TGT	2	6	2708	2713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297660610
64	NC_014226	T	7	7	2757	2763	0 %	100 %	0 %	0 %	297660610
65	NC_014226	GTT	2	6	2814	2819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297660610
66	NC_014226	T	6	6	2851	2856	0 %	100 %	0 %	0 %	297660610
67	NC_014226	AAGG	2	8	2879	2886	50 %	0 %	50 %	0 %	297660610
68	NC_014226	GTA	2	6	2892	2897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297660610
69	NC_014226	T	10	10	2927	2936	0 %	100 %	0 %	0 %	297660611
70	NC_014226	TAA	2	6	2957	2962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297660611
71	NC_014226	CT	3	6	2974	2979	0 %	50 %	0 %	50 %	297660611
72	NC_014226	CCTG	2	8	3010	3017	0 %	25 %	25 %	50 %	297660611
73	NC_014226	CCAA	2	8	3034	3041	50 %	0 %	0 %	50 %	297660611
74	NC_014226	TCA	2	6	3084	3089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297660611
75	NC_014226	TCG	2	6	3147	3152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297660611
76	NC_014226	TGT	2	6	3171	3176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297660611
77	NC_014226	TAA	2	6	3283	3288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297660611
78	NC_014226	T	6	6	3289	3294	0 %	100 %	0 %	0 %	297660611
79	NC_014226	GGC	2	6	3316	3321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297660611
80	NC_014226	GAT	2	6	3337	3342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297660611
81	NC_014226	T	6	6	3372	3377	0 %	100 %	0 %	0 %	297660611
82	NC_014226	TTCAT	2	10	3411	3420	20 %	60 %	0 %	20 %	297660611
83	NC_014226	TTTGA	2	10	3479	3488	20 %	60 %	20 %	0 %	297660612
84	NC_014226	A	6	6	3513	3518	100 %	0 %	0 %	0 %	297660612
85	NC_014226	ATC	2	6	3536	3541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297660612
86	NC_014226	A	8	8	3588	3595	100 %	0 %	0 %	0 %	297660612
87	NC_014226	ATGG	2	8	3616	3623	25 %	25 %	50 %	0 %	297660612
88	NC_014226	GCAAA	2	10	3692	3701	60 %	0 %	20 %	20 %	297660612
89	NC_014226	A	6	6	3730	3735	100 %	0 %	0 %	0 %	297660612
90	NC_014226	A	7	7	3782	3788	100 %	0 %	0 %	0 %	297660612
91	NC_014226	TC	3	6	3820	3825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014226	CATT	2	8	3831	3838	25 %	50 %	0 %	25 %	297660613
93	NC_014226	TGGCTA	2	12	3875	3886	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	297660613
94	NC_014226	TTTC	2	8	3907	3914	0 %	75 %	0 %	25 %	297660613
95	NC_014226	CTC	2	6	3969	3974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297660613
96	NC_014226	T	8	8	4040	4047	0 %	100 %	0 %	0 %	297660613
97	NC_014226	TGT	2	6	4049	4054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297660613
98	NC_014226	GT	3	6	4053	4058	0 %	50 %	50 %	0 %	297660613
99	NC_014226	TAAA	2	8	4135	4142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014226	A	6	6	4187	4192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014226	TAAAT	2	10	4202	4211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014226	CAAAT	2	10	4283	4292	60 %	20 %	0 %	20 %	297660614
103	NC_014226	A	6	6	4310	4315	100 %	0 %	0 %	0 %	297660614
104	NC_014226	GAT	2	6	4375	4380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297660614
105	NC_014226	ATT	2	6	4396	4401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297660614
106	NC_014226	GAT	2	6	4432	4437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297660614
107	NC_014226	AATT	2	8	4482	4489	50 %	50 %	0 %	0 %	297660614
108	NC_014226	A	6	6	4503	4508	100 %	0 %	0 %	0 %	297660614
109	NC_014226	TCC	2	6	4602	4607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297660614
110	NC_014226	TCG	2	6	4618	4623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297660614
111	NC_014226	TCAT	2	8	4627	4634	25 %	50 %	0 %	25 %	297660614
112	NC_014226	TA	3	6	4636	4641	50 %	50 %	0 %	0 %	297660614
113	NC_014226	CTT	2	6	4644	4649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297660614
114	NC_014226	GCTAAC	2	12	4780	4791	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	297660614
115	NC_014226	TGG	2	6	4792	4797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297660614
116	NC_014226	AATA	2	8	4836	4843	75 %	25 %	0 %	0 %	297660614
117	NC_014226	TTC	3	9	4844	4852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297660614
118	NC_014226	TCA	2	6	4902	4907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297660614
119	NC_014226	GAAA	2	8	4994	5001	75 %	0 %	25 %	0 %	297660614
120	NC_014226	GTT	2	6	5017	5022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297660614
121	NC_014226	CTG	2	6	5033	5038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297660614
122	NC_014226	TCA	2	6	5072	5077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297660614
123	NC_014226	ATTA	2	8	5108	5115	50 %	50 %	0 %	0 %	297660614
124	NC_014226	AAG	2	6	5125	5130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297660615
125	NC_014226	CTGC	2	8	5263	5270	0 %	25 %	25 %	50 %	297660615
126	NC_014226	T	6	6	5290	5295	0 %	100 %	0 %	0 %	297660615
127	NC_014226	CAA	2	6	5304	5309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297660615
128	NC_014226	TGTC	2	8	5358	5365	0 %	50 %	25 %	25 %	297660615
129	NC_014226	CAA	2	6	5410	5415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297660615
130	NC_014226	ATC	2	6	5416	5421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297660615
131	NC_014226	AGT	2	6	5436	5441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297660615
132	NC_014226	TCC	2	6	5450	5455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297660615
133	NC_014226	T	6	6	5472	5477	0 %	100 %	0 %	0 %	297660615
134	NC_014226	CTG	2	6	5550	5555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297660615
135	NC_014226	ATT	2	6	5578	5583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297660615
136	NC_014226	T	6	6	5624	5629	0 %	100 %	0 %	0 %	297660615
137	NC_014226	AAC	2	6	5679	5684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297660616
138	NC_014226	TTCC	2	8	5701	5708	0 %	50 %	0 %	50 %	297660616
139	NC_014226	GAC	2	6	5727	5732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297660616
140	NC_014226	CT	3	6	5827	5832	0 %	50 %	0 %	50 %	297660616
141	NC_014226	TGTT	2	8	5852	5859	0 %	75 %	25 %	0 %	297660616
142	NC_014226	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297660617
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269	NC_014226	ATT	2	6	11600	11605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297660623
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.