MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Waddlia chondrophila WSU 86-1044 chromosome

Total Repeats: 43183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014225	ATG	2	6	57	62	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014225	T	8	8	64	71	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014225	TAT	2	6	76	81	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014225	ATAA	2	8	133	140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014225	T	6	6	174	179	0 %	100 %	0 %	0 %	297620247
6	NC_014225	CAA	2	6	196	201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297620247
7	NC_014225	CAA	2	6	219	224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297620247
8	NC_014225	AATCG	2	10	233	242	40 %	20 %	20 %	20 %	297620247
9	NC_014225	A	7	7	251	257	100 %	0 %	0 %	0 %	297620247
10	NC_014225	CTG	2	6	284	289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014225	A	7	7	361	367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014225	GAA	2	6	388	393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297620248
13	NC_014225	CAA	2	6	423	428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297620248
14	NC_014225	AACA	2	8	450	457	75 %	0 %	0 %	25 %	297620248
15	NC_014225	AGG	2	6	536	541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297620248
16	NC_014225	GAA	2	6	552	557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297620248
17	NC_014225	AGAGA	2	10	647	656	60 %	0 %	40 %	0 %	297620248
18	NC_014225	TTC	2	6	681	686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297620248
19	NC_014225	AGG	2	6	698	703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297620248
20	NC_014225	CT	3	6	877	882	0 %	50 %	0 %	50 %	297620248
21	NC_014225	AG	4	8	1025	1032	50 %	0 %	50 %	0 %	297620248
22	NC_014225	GCG	2	6	1069	1074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297620248
23	NC_014225	AGC	3	9	1161	1169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297620248
24	NC_014225	AGA	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297620248
25	NC_014225	GGC	2	6	1285	1290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297620248
26	NC_014225	GCA	2	6	1402	1407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297620248
27	NC_014225	CAA	2	6	1443	1448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297620248
28	NC_014225	CTA	2	6	1521	1526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620248
29	NC_014225	A	6	6	1535	1540	100 %	0 %	0 %	0 %	297620248
30	NC_014225	GAAAAA	2	12	1619	1630	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	297620248
31	NC_014225	ACA	2	6	1679	1684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014225	T	7	7	1827	1833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014225	AG	3	6	1876	1881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014225	GTT	2	6	1882	1887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014225	TACA	2	8	1934	1941	50 %	25 %	0 %	25 %	297620249
36	NC_014225	AGG	2	6	1964	1969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297620249
37	NC_014225	GC	3	6	1980	1985	0 %	0 %	50 %	50 %	297620249
38	NC_014225	AAAG	2	8	2079	2086	75 %	0 %	25 %	0 %	297620249
39	NC_014225	CGG	2	6	2183	2188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297620250
40	NC_014225	CTG	2	6	2224	2229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297620250
41	NC_014225	CCAT	2	8	2321	2328	25 %	25 %	0 %	50 %	297620250
42	NC_014225	AGG	2	6	2348	2353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297620250
43	NC_014225	CAAC	2	8	2382	2389	50 %	0 %	0 %	50 %	297620250
44	NC_014225	CTT	2	6	2434	2439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297620251
45	NC_014225	TCA	3	9	2443	2451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620251
46	NC_014225	TG	3	6	2522	2527	0 %	50 %	50 %	0 %	297620251
47	NC_014225	ATA	2	6	2528	2533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297620251
48	NC_014225	TCAA	2	8	2598	2605	50 %	25 %	0 %	25 %	297620251
49	NC_014225	AAT	2	6	2639	2644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297620251
50	NC_014225	ATT	2	6	2672	2677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297620251
51	NC_014225	T	6	6	2676	2681	0 %	100 %	0 %	0 %	297620251
52	NC_014225	CTT	2	6	2684	2689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297620251
53	NC_014225	T	7	7	2734	2740	0 %	100 %	0 %	0 %	297620251
54	NC_014225	T	6	6	2757	2762	0 %	100 %	0 %	0 %	297620251
55	NC_014225	A	6	6	2778	2783	100 %	0 %	0 %	0 %	297620251
56	NC_014225	ATC	2	6	2807	2812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620251
57	NC_014225	AAT	2	6	2903	2908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014225	GATG	2	8	2923	2930	25 %	25 %	50 %	0 %	297620252
59	NC_014225	A	6	6	2963	2968	100 %	0 %	0 %	0 %	297620252
60	NC_014225	TAA	2	6	2972	2977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297620252
61	NC_014225	AG	3	6	3097	3102	50 %	0 %	50 %	0 %	297620252
62	NC_014225	TGA	2	6	3126	3131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297620252
63	NC_014225	A	6	6	3158	3163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014225	GTA	2	6	3167	3172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014225	AAATA	2	10	3173	3182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014225	A	9	9	3202	3210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014225	TTTG	2	8	3221	3228	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014225	TAAAA	2	10	3238	3247	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014225	A	6	6	3244	3249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014225	T	6	6	3254	3259	0 %	100 %	0 %	0 %	297620253
71	NC_014225	AG	3	6	3273	3278	50 %	0 %	50 %	0 %	297620253
72	NC_014225	ATC	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620253
73	NC_014225	ATC	3	9	3291	3299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620253
74	NC_014225	ATC	2	6	3316	3321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620253
75	NC_014225	CAT	2	6	3396	3401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620253
76	NC_014225	TCG	2	6	3415	3420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297620253
77	NC_014225	ATC	2	6	3447	3452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620253
78	NC_014225	CAT	2	6	3458	3463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620253
79	NC_014225	GTT	2	6	3572	3577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014225	CAC	2	6	3657	3662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_014225	ATA	2	6	3679	3684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014225	AGT	2	6	3771	3776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297620254
83	NC_014225	GCATCA	2	12	3843	3854	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	297620254
84	NC_014225	GTATCC	2	12	3866	3877	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	297620254
85	NC_014225	TCGC	2	8	3881	3888	0 %	25 %	25 %	50 %	297620254
86	NC_014225	GT	3	6	3910	3915	0 %	50 %	50 %	0 %	297620254
87	NC_014225	CGC	2	6	3966	3971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297620254
88	NC_014225	GTC	2	6	4030	4035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297620254
89	NC_014225	TCA	2	6	4044	4049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620254
90	NC_014225	T	6	6	4060	4065	0 %	100 %	0 %	0 %	297620254
91	NC_014225	CTTG	2	8	4125	4132	0 %	50 %	25 %	25 %	297620254
92	NC_014225	T	6	6	4145	4150	0 %	100 %	0 %	0 %	297620254
93	NC_014225	GTT	2	6	4151	4156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297620254
94	NC_014225	TAT	2	6	4238	4243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014225	TG	3	6	4253	4258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014225	GTT	2	6	4296	4301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014225	A	7	7	4306	4312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014225	A	6	6	4321	4326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014225	AAAAT	2	10	4333	4342	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014225	GATT	2	8	4472	4479	25 %	50 %	25 %	0 %	297620255
101	NC_014225	GAG	2	6	4488	4493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297620255
102	NC_014225	AGA	2	6	4496	4501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297620255
103	NC_014225	TG	3	6	4603	4608	0 %	50 %	50 %	0 %	297620255
104	NC_014225	TGG	2	6	4725	4730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297620255
105	NC_014225	CGAT	2	8	4822	4829	25 %	25 %	25 %	25 %	297620255
106	NC_014225	CA	3	6	4881	4886	50 %	0 %	0 %	50 %	297620255
107	NC_014225	CAA	2	6	4908	4913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297620255
108	NC_014225	GTAAAA	2	12	4929	4940	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	297620255
109	NC_014225	ATT	2	6	4973	4978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297620255
110	NC_014225	AACGAT	2	12	5003	5014	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	297620255
111	NC_014225	GCA	2	6	5043	5048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297620255
112	NC_014225	TGG	2	6	5063	5068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297620255
113	NC_014225	AT	3	6	5072	5077	50 %	50 %	0 %	0 %	297620255
114	NC_014225	ATT	2	6	5125	5130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297620255
115	NC_014225	GCA	2	6	5141	5146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297620255
116	NC_014225	ATC	2	6	5167	5172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620255
117	NC_014225	T	6	6	5223	5228	0 %	100 %	0 %	0 %	297620255
118	NC_014225	GAA	2	6	5270	5275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297620255
119	NC_014225	ATT	2	6	5286	5291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297620255
120	NC_014225	GAAC	2	8	5304	5311	50 %	0 %	25 %	25 %	297620255
121	NC_014225	GATA	2	8	5312	5319	50 %	25 %	25 %	0 %	297620255
122	NC_014225	CGT	2	6	5373	5378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297620255
123	NC_014225	CGATC	2	10	5389	5398	20 %	20 %	20 %	40 %	297620255
124	NC_014225	ATCT	2	8	5488	5495	25 %	50 %	0 %	25 %	297620255
125	NC_014225	CAAA	2	8	5538	5545	75 %	0 %	0 %	25 %	297620255
126	NC_014225	G	6	6	5547	5552	0 %	0 %	100 %	0 %	297620255
127	NC_014225	GAAA	2	8	5566	5573	75 %	0 %	25 %	0 %	297620255
128	NC_014225	TCT	2	6	5594	5599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297620255
129	NC_014225	AATG	2	8	5606	5613	50 %	25 %	25 %	0 %	297620255
130	NC_014225	AGA	2	6	5682	5687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297620256
131	NC_014225	GGC	2	6	5694	5699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297620256
132	NC_014225	GCA	2	6	5811	5816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297620256
133	NC_014225	CAA	2	6	5852	5857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297620256
134	NC_014225	TGCC	2	8	5897	5904	0 %	25 %	25 %	50 %	297620256
135	NC_014225	CTA	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620256
136	NC_014225	A	6	6	5944	5949	100 %	0 %	0 %	0 %	297620256
137	NC_014225	GAAAAA	2	12	6028	6039	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	297620256
138	NC_014225	ACA	2	6	6088	6093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014225	T	6	6	6301	6306	0 %	100 %	0 %	0 %	297620257
140	NC_014225	AATG	2	8	6314	6321	50 %	25 %	25 %	0 %	297620257
141	NC_014225	TGT	2	6	6361	6366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297620257
142	NC_014225	T	8	8	6392	6399	0 %	100 %	0 %	0 %	297620257
143	NC_014225	ATTTG	2	10	6418	6427	20 %	60 %	20 %	0 %	297620257
144	NC_014225	TTC	2	6	6434	6439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297620257
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147	NC_014225	A	6	6	6596	6601	100 %	0 %	0 %	0 %	297620258
148	NC_014225	CTC	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297620258
149	NC_014225	CCTC	2	8	6706	6713	0 %	25 %	0 %	75 %	297620258
150	NC_014225	GTC	2	6	6746	6751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297620258
151	NC_014225	GCTT	2	8	6786	6793	0 %	50 %	25 %	25 %	297620258
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153	NC_014225	ATGA	2	8	6878	6885	50 %	25 %	25 %	0 %	297620258
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164	NC_014225	TAA	2	6	7409	7414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297620258
165	NC_014225	AGTT	2	8	7417	7424	25 %	50 %	25 %	0 %	297620258
166	NC_014225	T	7	7	7432	7438	0 %	100 %	0 %	0 %	297620258
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172	NC_014225	CTG	2	6	7981	7986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297620259
173	NC_014225	T	7	7	7996	8002	0 %	100 %	0 %	0 %	297620259
174	NC_014225	AAAGC	2	10	8007	8016	60 %	0 %	20 %	20 %	297620259
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176	NC_014225	GA	3	6	8066	8071	50 %	0 %	50 %	0 %	297620259
177	NC_014225	AAGA	2	8	8151	8158	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
178	NC_014225	TA	4	8	8164	8171	50 %	50 %	0 %	0 %	297620260
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183	NC_014225	TTGA	2	8	8541	8548	25 %	50 %	25 %	0 %	297620261
184	NC_014225	AAT	2	6	8591	8596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297620261
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252	NC_014225	AAT	2	6	11600	11605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297620262
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254	NC_014225	TAT	2	6	11711	11716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297620262
255	NC_014225	GATTT	2	10	11730	11739	20 %	60 %	20 %	0 %	297620262
256	NC_014225	ATG	2	6	11746	11751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297620262
257	NC_014225	TCT	2	6	11815	11820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297620262
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259	NC_014225	GA	3	6	11875	11880	50 %	0 %	50 %	0 %	297620262
260	NC_014225	CTG	2	6	11978	11983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297620262
261	NC_014225	TTGA	2	8	11999	12006	25 %	50 %	25 %	0 %	297620262
262	NC_014225	TCT	2	6	12028	12033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297620262
263	NC_014225	A	6	6	12070	12075	100 %	0 %	0 %	0 %	297620262
264	NC_014225	T	6	6	12113	12118	0 %	100 %	0 %	0 %	297620262
265	NC_014225	T	7	7	12124	12130	0 %	100 %	0 %	0 %	297620262
266	NC_014225	AT	3	6	12147	12152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_014225	CAAA	2	8	12165	12172	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
268	NC_014225	TC	3	6	12177	12182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
269	NC_014225	T	6	6	12191	12196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_014225	TCCCA	2	10	12437	12446	20 %	20 %	0 %	60 %	297620263
271	NC_014225	CGGATT	2	12	12456	12467	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	297620263
272	NC_014225	GATG	2	8	12555	12562	25 %	25 %	50 %	0 %	297620263
273	NC_014225	TCA	2	6	12589	12594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620263
274	NC_014225	TG	3	6	12619	12624	0 %	50 %	50 %	0 %	297620263
275	NC_014225	CAGG	2	8	12683	12690	25 %	0 %	50 %	25 %	297620263
276	NC_014225	CTG	2	6	12848	12853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297620263
277	NC_014225	GAC	2	6	12858	12863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297620263
278	NC_014225	TG	3	6	12871	12876	0 %	50 %	50 %	0 %	297620263
279	NC_014225	TTAA	2	8	12907	12914	50 %	50 %	0 %	0 %	297620263
280	NC_014225	GCT	2	6	12937	12942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297620263
281	NC_014225	TCA	2	6	13145	13150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620263
282	NC_014225	ATC	2	6	13197	13202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297620263
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285	NC_014225	GTCC	2	8	13286	13293	0 %	25 %	25 %	50 %	297620263
286	NC_014225	CTTT	2	8	13374	13381	0 %	75 %	0 %	25 %	297620263
287	NC_014225	T	7	7	13379	13385	0 %	100 %	0 %	0 %	297620263
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292	NC_014225	TTTC	2	8	13685	13692	0 %	75 %	0 %	25 %	297620263
293	NC_014225	CTT	2	6	13754	13759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297620263
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303	NC_014225	T	7	7	14234	14240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_014225	ATCT	2	8	14307	14314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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306	NC_014225	TA	3	6	14363	14368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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312	NC_014225	GCTG	2	8	14672	14679	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
313	NC_014225	T	7	7	14779	14785	0 %	100 %	0 %	0 %	297620265
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389	NC_014225	CTCTTT	2	12	19290	19301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297620271
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394	NC_014225	TGTC	2	8	19537	19544	0 %	50 %	25 %	25 %	297620271
395	NC_014225	GC	3	6	19560	19565	0 %	0 %	50 %	50 %	297620271
396	NC_014225	CGG	2	6	19871	19876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297620271
397	NC_014225	TTC	2	6	19890	19895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297620271
398	NC_014225	GAG	2	6	19986	19991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297620271
399	NC_014225	GTA	2	6	20166	20171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297620271
400	NC_014225	GCAT	2	8	20174	20181	25 %	25 %	25 %	25 %	297620271
401	NC_014225	TCC	2	6	20413	20418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297620271
402	NC_014225	A	6	6	20426	20431	100 %	0 %	0 %	0 %	297620271
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404	NC_014225	T	8	8	20465	20472	0 %	100 %	0 %	0 %	297620271
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