MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Wolbachia endosymbiont strain TRS of Brugia malayi

Total Repeats: 25483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006833	GTT	2	6	69	74	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006833	ACT	4	12	81	92	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006833	ATT	2	6	93	98	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006833	AT	3	6	107	112	50 %	50 %	0 %	0 %	58584262
5	NC_006833	GAGC	2	8	122	129	25 %	0 %	50 %	25 %	58584262
6	NC_006833	AGT	2	6	144	149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584262
7	NC_006833	AGT	2	6	155	160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584262
8	NC_006833	AGG	2	6	175	180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58584262
9	NC_006833	GCAGG	2	10	185	194	20 %	0 %	60 %	20 %	58584262
10	NC_006833	ACA	2	6	289	294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58584262
11	NC_006833	GTA	2	6	303	308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584262
12	NC_006833	GCA	2	6	348	353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58584262
13	NC_006833	CGA	2	6	427	432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58584262
14	NC_006833	AGA	2	6	536	541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58584262
15	NC_006833	CATA	2	8	586	593	50 %	25 %	0 %	25 %	58584262
16	NC_006833	AGC	2	6	606	611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58584262
17	NC_006833	GAG	2	6	777	782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58584262
18	NC_006833	CAA	2	6	796	801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58584262
19	NC_006833	ATA	2	6	846	851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584262
20	NC_006833	CTG	2	6	865	870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58584262
21	NC_006833	ATT	2	6	886	891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584262
22	NC_006833	A	6	6	895	900	100 %	0 %	0 %	0 %	58584262
23	NC_006833	GT	3	6	904	909	0 %	50 %	50 %	0 %	58584262
24	NC_006833	ATA	2	6	1041	1046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584262
25	NC_006833	TGC	2	6	1121	1126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58584262
26	NC_006833	T	6	6	1168	1173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006833	TTA	2	6	1186	1191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006833	A	8	8	1305	1312	100 %	0 %	0 %	0 %	58584263
29	NC_006833	A	7	7	1362	1368	100 %	0 %	0 %	0 %	58584263
30	NC_006833	CTG	2	6	1409	1414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58584263
31	NC_006833	TGGA	2	8	1415	1422	25 %	25 %	50 %	0 %	58584263
32	NC_006833	AAT	2	6	1443	1448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584263
33	NC_006833	ATA	2	6	1466	1471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584263
34	NC_006833	TGGTGC	2	12	1503	1514	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	58584263
35	NC_006833	TAT	2	6	1523	1528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584263
36	NC_006833	TGG	2	6	1620	1625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58584263
37	NC_006833	TTG	2	6	1675	1680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58584263
38	NC_006833	A	7	7	1696	1702	100 %	0 %	0 %	0 %	58584263
39	NC_006833	CAG	2	6	1736	1741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58584263
40	NC_006833	TA	3	6	1748	1753	50 %	50 %	0 %	0 %	58584263
41	NC_006833	ATT	2	6	1810	1815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584263
42	NC_006833	ATATA	2	10	1835	1844	60 %	40 %	0 %	0 %	58584263
43	NC_006833	TTC	2	6	1855	1860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58584263
44	NC_006833	AGC	3	9	2037	2045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58584263
45	NC_006833	TTA	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584263
46	NC_006833	TTTG	2	8	2181	2188	0 %	75 %	25 %	0 %	58584263
47	NC_006833	TTG	2	6	2203	2208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58584263
48	NC_006833	TAA	2	6	2234	2239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584263
49	NC_006833	ATC	2	6	2276	2281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58584263
50	NC_006833	GAA	2	6	2316	2321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58584263
51	NC_006833	TTA	2	6	2324	2329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584263
52	NC_006833	AAC	2	6	2354	2359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58584263
53	NC_006833	ATT	2	6	2380	2385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584263
54	NC_006833	GTTAA	2	10	2400	2409	40 %	40 %	20 %	0 %	58584263
55	NC_006833	T	6	6	2411	2416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006833	T	6	6	2480	2485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006833	CAG	2	6	2531	2536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_006833	TAA	3	9	2560	2568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006833	ATTC	2	8	2618	2625	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_006833	GCA	2	6	2671	2676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_006833	T	7	7	2691	2697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006833	CATT	2	8	2718	2725	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_006833	ATT	2	6	2730	2735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006833	GTG	2	6	2739	2744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006833	AAAT	2	8	2775	2782	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006833	AT	4	8	2804	2811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006833	GTAAA	2	10	2825	2834	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006833	TTC	2	6	2948	2953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58584264
69	NC_006833	TTG	2	6	2966	2971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58584264
70	NC_006833	ATT	2	6	2984	2989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584264
71	NC_006833	CTA	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58584264
72	NC_006833	TCCT	2	8	3011	3018	0 %	50 %	0 %	50 %	58584264
73	NC_006833	TAATG	2	10	3043	3052	40 %	40 %	20 %	0 %	58584264
74	NC_006833	TTG	2	6	3057	3062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58584264
75	NC_006833	TCTT	2	8	3078	3085	0 %	75 %	0 %	25 %	58584264
76	NC_006833	T	6	6	3084	3089	0 %	100 %	0 %	0 %	58584264
77	NC_006833	TTA	2	6	3147	3152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006833	TCT	2	6	3174	3179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_006833	TTGA	2	8	3203	3210	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006833	TAT	2	6	3220	3225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006833	TTC	2	6	3226	3231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_006833	AT	3	6	3302	3307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006833	ATAA	2	8	3486	3493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006833	ATAA	2	8	3532	3539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006833	ATC	2	6	3562	3567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_006833	T	6	6	3578	3583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006833	AT	3	6	3585	3590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006833	TAG	2	6	3604	3609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006833	A	6	6	3640	3645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006833	AGC	2	6	3675	3680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_006833	TAAA	2	8	3786	3793	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006833	TGAGG	2	10	3813	3822	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006833	T	6	6	3840	3845	0 %	100 %	0 %	0 %	58584265
94	NC_006833	TTA	2	6	3853	3858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584265
95	NC_006833	TA	3	6	3883	3888	50 %	50 %	0 %	0 %	58584265
96	NC_006833	TAA	2	6	3923	3928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584265
97	NC_006833	TGG	2	6	3966	3971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58584265
98	NC_006833	CTATA	2	10	3973	3982	40 %	40 %	0 %	20 %	58584265
99	NC_006833	TGT	2	6	4059	4064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58584265
100	NC_006833	TTG	2	6	4073	4078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58584265
101	NC_006833	TGA	2	6	4101	4106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584265
102	NC_006833	TAG	2	6	4125	4130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584265
103	NC_006833	AAT	2	6	4131	4136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584265
104	NC_006833	GTTGGA	2	12	4138	4149	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	58584265
105	NC_006833	A	6	6	4204	4209	100 %	0 %	0 %	0 %	58584265
106	NC_006833	TAG	2	6	4238	4243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584265
107	NC_006833	T	6	6	4281	4286	0 %	100 %	0 %	0 %	58584265
108	NC_006833	TTGG	2	8	4298	4305	0 %	50 %	50 %	0 %	58584265
109	NC_006833	TA	3	6	4314	4319	50 %	50 %	0 %	0 %	58584265
110	NC_006833	GTT	2	6	4337	4342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58584265
111	NC_006833	TTC	2	6	4360	4365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58584265
112	NC_006833	AGA	2	6	4388	4393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58584265
113	NC_006833	CAA	2	6	4437	4442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58584265
114	NC_006833	T	6	6	4462	4467	0 %	100 %	0 %	0 %	58584265
115	NC_006833	TGGT	2	8	4478	4485	0 %	50 %	50 %	0 %	58584265
116	NC_006833	TCT	2	6	4570	4575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58584265
117	NC_006833	ATT	2	6	4657	4662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584265
118	NC_006833	TGT	2	6	4725	4730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58584265
119	NC_006833	CTT	2	6	4741	4746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58584265
120	NC_006833	T	7	7	4869	4875	0 %	100 %	0 %	0 %	58584265
121	NC_006833	TAG	2	6	4895	4900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584265
122	NC_006833	GCT	2	6	4953	4958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58584265
123	NC_006833	ATT	2	6	4975	4980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58584265
124	NC_006833	T	6	6	5003	5008	0 %	100 %	0 %	0 %	58584265
125	NC_006833	TAT	2	6	5058	5063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006833	AG	3	6	5101	5106	50 %	0 %	50 %	0 %	58584266
127	NC_006833	TGA	2	6	5140	5145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584266
128	NC_006833	AG	5	10	5164	5173	50 %	0 %	50 %	0 %	58584266
129	NC_006833	TAA	2	6	5263	5268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584266
130	NC_006833	TA	3	6	5282	5287	50 %	50 %	0 %	0 %	58584266
131	NC_006833	ACT	2	6	5431	5436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58584266
132	NC_006833	GGA	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58584266
133	NC_006833	GCG	2	6	5498	5503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58584266
134	NC_006833	AAG	2	6	5644	5649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58584266
135	NC_006833	TAA	2	6	5826	5831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584266
136	NC_006833	ATG	2	6	5835	5840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58584266
137	NC_006833	A	6	6	5852	5857	100 %	0 %	0 %	0 %	58584266
138	NC_006833	CTG	3	9	6201	6209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58584266
139	NC_006833	ACA	2	6	6212	6217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58584266
140	NC_006833	TAA	2	6	6258	6263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584266
141	NC_006833	ATTA	2	8	6280	6287	50 %	50 %	0 %	0 %	58584266
142	NC_006833	AAC	2	6	6293	6298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58584266
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273	NC_006833	ACTAT	2	10	11814	11823	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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277	NC_006833	A	6	6	11998	12003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_006833	A	6	6	12131	12136	100 %	0 %	0 %	0 %	58584271
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286	NC_006833	A	6	6	12270	12275	100 %	0 %	0 %	0 %	58584271
287	NC_006833	CAAA	2	8	12294	12301	75 %	0 %	0 %	25 %	58584271
288	NC_006833	A	7	7	12346	12352	100 %	0 %	0 %	0 %	58584271
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421	NC_006833	GGT	2	6	18113	18118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58584273
422	NC_006833	GCAC	2	8	18134	18141	25 %	0 %	25 %	50 %	58584273
423	NC_006833	CTT	3	9	18165	18173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58584273
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425	NC_006833	T	7	7	18299	18305	0 %	100 %	0 %	0 %	58584273
426	NC_006833	ACC	2	6	18322	18327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58584273
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428	NC_006833	T	7	7	18363	18369	0 %	100 %	0 %	0 %	58584273
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443	NC_006833	TTG	2	6	19280	19285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58584273
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452	NC_006833	CATC	2	8	19657	19664	25 %	25 %	0 %	50 %	58584273
453	NC_006833	TTC	2	6	19694	19699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58584273
454	NC_006833	TCC	2	6	19747	19752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58584273
455	NC_006833	TCG	2	6	19805	19810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
456	NC_006833	CA	3	6	19864	19869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
457	NC_006833	ATA	3	9	19899	19907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_006833	ATA	2	6	19954	19959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_006833	TA	3	6	19958	19963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_006833	T	6	6	19999	20004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_006833	TAA	2	6	20123	20128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58584274
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482	NC_006833	T	6	6	21093	21098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_006833	AAT	2	6	21287	21292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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