MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Wigglesworthia glossinidia endosymbiont of Glossina brevipalpis plasmid pWb1

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003425	T	18	18	1	18	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003425	A	7	7	80	86	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003425	TGA	2	6	93	98	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003425	T	9	9	117	125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003425	TTA	2	6	227	232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003425	ATTT	2	8	236	243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003425	TAT	2	6	244	249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003425	TAAA	2	8	255	262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003425	AAT	2	6	281	286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003425	AT	3	6	304	309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003425	AAAT	2	8	315	322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003425	TTA	2	6	323	328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003425	TAA	2	6	331	336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003425	ATT	2	6	348	353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003425	TAAT	2	8	354	361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003425	T	6	6	361	366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003425	T	8	8	375	382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003425	AAT	2	6	389	394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50470477
19	NC_003425	AGA	2	6	401	406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50470477
20	NC_003425	A	6	6	408	413	100 %	0 %	0 %	0 %	50470477
21	NC_003425	T	7	7	415	421	0 %	100 %	0 %	0 %	50470477
22	NC_003425	A	9	9	422	430	100 %	0 %	0 %	0 %	50470477
23	NC_003425	A	7	7	432	438	100 %	0 %	0 %	0 %	50470477
24	NC_003425	GAT	2	6	459	464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50470477
25	NC_003425	AAT	2	6	491	496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50470477
26	NC_003425	T	6	6	514	519	0 %	100 %	0 %	0 %	50470477
27	NC_003425	CAG	2	6	589	594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50470477
28	NC_003425	AT	3	6	622	627	50 %	50 %	0 %	0 %	50470477
29	NC_003425	AT	3	6	630	635	50 %	50 %	0 %	0 %	50470477
30	NC_003425	TAA	2	6	662	667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50470477
31	NC_003425	ATA	2	6	670	675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50470477
32	NC_003425	AAGCA	2	10	683	692	60 %	0 %	20 %	20 %	50470477
33	NC_003425	T	7	7	713	719	0 %	100 %	0 %	0 %	50470477
34	NC_003425	T	6	6	811	816	0 %	100 %	0 %	0 %	50470477
35	NC_003425	A	6	6	821	826	100 %	0 %	0 %	0 %	50470477
36	NC_003425	A	6	6	831	836	100 %	0 %	0 %	0 %	50470477
37	NC_003425	GATA	2	8	854	861	50 %	25 %	25 %	0 %	50470477
38	NC_003425	AGA	2	6	875	880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50470477
39	NC_003425	A	8	8	880	887	100 %	0 %	0 %	0 %	50470477
40	NC_003425	ATT	2	6	915	920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470477
41	NC_003425	A	6	6	947	952	100 %	0 %	0 %	0 %	50470477
42	NC_003425	ATAG	2	8	1002	1009	50 %	25 %	25 %	0 %	50470477
43	NC_003425	T	6	6	1053	1058	0 %	100 %	0 %	0 %	50470477
44	NC_003425	CTA	2	6	1066	1071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50470477
45	NC_003425	A	6	6	1071	1076	100 %	0 %	0 %	0 %	50470477
46	NC_003425	TTA	2	6	1104	1109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470477
47	NC_003425	A	6	6	1145	1150	100 %	0 %	0 %	0 %	50470477
48	NC_003425	TA	3	6	1183	1188	50 %	50 %	0 %	0 %	50470477
49	NC_003425	A	6	6	1224	1229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003425	TTTA	2	8	1230	1237	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003425	AAAAT	2	10	1261	1270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003425	TGAT	2	8	1288	1295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003425	A	6	6	1309	1314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003425	ATT	2	6	1348	1353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003425	GAT	2	6	1406	1411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50470478
56	NC_003425	TCA	2	6	1423	1428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50470478
57	NC_003425	ATA	2	6	1434	1439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50470478
58	NC_003425	GAA	2	6	1466	1471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50470478
59	NC_003425	AGA	2	6	1535	1540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50470478
60	NC_003425	TAG	2	6	1575	1580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50470478
61	NC_003425	AAAT	2	8	1590	1597	75 %	25 %	0 %	0 %	50470478
62	NC_003425	TACA	2	8	1598	1605	50 %	25 %	0 %	25 %	50470478
63	NC_003425	ATT	2	6	1625	1630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470478
64	NC_003425	TA	3	6	1713	1718	50 %	50 %	0 %	0 %	50470478
65	NC_003425	GTA	2	6	1730	1735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50470478
66	NC_003425	ATTT	2	8	1763	1770	25 %	75 %	0 %	0 %	50470478
67	NC_003425	GAAG	2	8	1790	1797	50 %	0 %	50 %	0 %	50470478
68	NC_003425	TG	3	6	1848	1853	0 %	50 %	50 %	0 %	50470478
69	NC_003425	AAT	2	6	1862	1867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50470478
70	NC_003425	AATA	2	8	1874	1881	75 %	25 %	0 %	0 %	50470478
71	NC_003425	T	7	7	1927	1933	0 %	100 %	0 %	0 %	50470479
72	NC_003425	TTA	2	6	1958	1963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470479
73	NC_003425	AT	3	6	1972	1977	50 %	50 %	0 %	0 %	50470479
74	NC_003425	CTT	2	6	2004	2009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50470479
75	NC_003425	T	6	6	2030	2035	0 %	100 %	0 %	0 %	50470479
76	NC_003425	T	6	6	2037	2042	0 %	100 %	0 %	0 %	50470479
77	NC_003425	ACA	2	6	2117	2122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50470479
78	NC_003425	A	6	6	2140	2145	100 %	0 %	0 %	0 %	50470479
79	NC_003425	T	6	6	2157	2162	0 %	100 %	0 %	0 %	50470479
80	NC_003425	ATT	2	6	2170	2175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470479
81	NC_003425	TTC	2	6	2176	2181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50470479
82	NC_003425	TTA	2	6	2192	2197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470479
83	NC_003425	ATG	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50470479
84	NC_003425	ATC	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50470479
85	NC_003425	GTG	2	6	2245	2250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50470479
86	NC_003425	TAA	2	6	2251	2256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50470479
87	NC_003425	TAATT	2	10	2272	2281	40 %	60 %	0 %	0 %	50470479
88	NC_003425	AAT	2	6	2313	2318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50470479
89	NC_003425	CTT	2	6	2322	2327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50470479
90	NC_003425	ATA	2	6	2332	2337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50470479
91	NC_003425	TTA	2	6	2340	2345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470479
92	NC_003425	T	6	6	2414	2419	0 %	100 %	0 %	0 %	50470479
93	NC_003425	AT	3	6	2426	2431	50 %	50 %	0 %	0 %	50470479
94	NC_003425	AT	3	6	2458	2463	50 %	50 %	0 %	0 %	50470479
95	NC_003425	AT	3	6	2474	2479	50 %	50 %	0 %	0 %	50470479
96	NC_003425	T	8	8	2499	2506	0 %	100 %	0 %	0 %	50470479
97	NC_003425	TACA	2	8	2544	2551	50 %	25 %	0 %	25 %	50470479
98	NC_003425	ATT	2	6	2561	2566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470479
99	NC_003425	ATTT	2	8	2574	2581	25 %	75 %	0 %	0 %	50470479
100	NC_003425	T	6	6	2601	2606	0 %	100 %	0 %	0 %	50470479
101	NC_003425	ATTT	2	8	2640	2647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003425	ATTTTT	2	12	2663	2674	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003425	A	6	6	2685	2690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003425	CTT	2	6	2696	2701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_003425	AAT	2	6	2704	2709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003425	AAT	2	6	2727	2732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003425	T	6	6	2738	2743	0 %	100 %	0 %	0 %	50470480
108	NC_003425	TAAT	2	8	2764	2771	50 %	50 %	0 %	0 %	50470480
109	NC_003425	TAAA	2	8	2794	2801	75 %	25 %	0 %	0 %	50470480
110	NC_003425	AGA	2	6	2843	2848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50470480
111	NC_003425	T	7	7	2876	2882	0 %	100 %	0 %	0 %	50470480
112	NC_003425	GAT	2	6	2916	2921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50470480
113	NC_003425	ATT	2	6	2934	2939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470480
114	NC_003425	TAG	2	6	2941	2946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50470480
115	NC_003425	GCTTCT	2	12	2952	2963	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	50470480
116	NC_003425	TCTT	2	8	2969	2976	0 %	75 %	0 %	25 %	50470480
117	NC_003425	AT	3	6	3124	3129	50 %	50 %	0 %	0 %	50470480
118	NC_003425	CTG	2	6	3184	3189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50470480
119	NC_003425	TCA	2	6	3249	3254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50470480
120	NC_003425	TATATT	2	12	3272	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470480
121	NC_003425	TC	3	6	3285	3290	0 %	50 %	0 %	50 %	50470480
122	NC_003425	TAT	2	6	3356	3361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470480
123	NC_003425	AGC	2	6	3389	3394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50470480
124	NC_003425	ATT	2	6	3395	3400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470480
125	NC_003425	ATT	2	6	3462	3467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470480
126	NC_003425	CAT	2	6	3497	3502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50470480
127	NC_003425	TTTAT	2	10	3504	3513	20 %	80 %	0 %	0 %	50470480
128	NC_003425	CAA	2	6	3526	3531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50470480
129	NC_003425	TA	3	6	3569	3574	50 %	50 %	0 %	0 %	50470480
130	NC_003425	TAAT	2	8	3628	3635	50 %	50 %	0 %	0 %	50470480
131	NC_003425	TAAT	2	8	3655	3662	50 %	50 %	0 %	0 %	50470480
132	NC_003425	TGTTAT	2	12	3695	3706	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003425	TATT	2	8	3709	3716	25 %	75 %	0 %	0 %	50470481
134	NC_003425	TTTTGT	2	12	3768	3779	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	50470481
135	NC_003425	TATTTT	2	12	3787	3798	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	50470481
136	NC_003425	T	6	6	3795	3800	0 %	100 %	0 %	0 %	50470481
137	NC_003425	GTT	2	6	3815	3820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50470481
138	NC_003425	T	6	6	3832	3837	0 %	100 %	0 %	0 %	50470481
139	NC_003425	CTAA	2	8	3851	3858	50 %	25 %	0 %	25 %	50470481
140	NC_003425	A	6	6	3857	3862	100 %	0 %	0 %	0 %	50470481
141	NC_003425	AGA	2	6	3868	3873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50470481
142	NC_003425	T	7	7	3905	3911	0 %	100 %	0 %	0 %	50470481
143	NC_003425	T	7	7	3931	3937	0 %	100 %	0 %	0 %	50470481
144	NC_003425	ATT	3	9	3947	3955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470481
145	NC_003425	TTA	2	6	3993	3998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470481
146	NC_003425	TTC	2	6	4021	4026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50470481
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148	NC_003425	TAT	2	6	4059	4064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470481
149	NC_003425	ATT	4	12	4070	4081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50470481
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181	NC_003425	T	7	7	5104	5110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_003425	A	7	7	5154	5160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_003425	A	8	8	5184	5191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_003425	ATT	2	6	5195	5200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_003425	TTTAA	2	10	5201	5210	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_003425	ATT	2	6	5211	5216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_003425	AAAT	2	8	5224	5231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.