MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022543	TTCGAT	2	12	52450	52461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022543	AGAGAT	2	12	72725	72736	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022543	TTCATT	2	12	104558	104569	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022543	CTGAAT	2	12	115780	115791	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022543	AGAGAT	2	12	115861	115872	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022543	TGGTTT	2	12	116679	116690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022543	AAGTCA	2	12	168785	168796	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022543	CTATAA	2	12	228015	228026	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022543	GAAAGA	2	12	237266	237277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022543	TTTATT	2	12	241837	241848	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022543	AATTCA	2	12	258733	258744	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022543	TGATAT	2	12	284102	284113	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022543	CCGTTC	2	12	289334	289345	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_022543	ATCAAT	2	12	314854	314865	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022543	CAAGAT	2	12	317258	317269	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022543	AGAAAA	2	12	322028	322039	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022543	TTTATA	2	12	342141	342152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022543	TGATAA	2	12	478579	478590	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022543	GGATAT	2	12	514617	514628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022543	ATCATT	2	12	539167	539178	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022543	ATTTTT	2	12	555373	555384	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022543	AAGACA	2	12	598689	598700	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022543	TTTATT	2	12	599791	599802	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022543	TTATCC	2	12	607277	607288	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022543	ATCATT	2	12	636680	636691	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_022543	TATATT	2	12	660306	660317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022543	ACCTTC	2	12	682082	682093	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_022543	ATCAAT	2	12	686655	686666	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022543	TTAAAT	2	12	688040	688051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022543	ATTGTT	2	12	699653	699664	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022543	GTTGAC	2	12	742919	742930	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_022543	GGCTTT	2	12	750416	750427	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022543	AAGATC	2	12	757970	757981	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022543	AAATGA	2	12	808437	808448	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022543	AATAGG	2	12	839402	839413	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022543	TTAATC	2	12	847544	847555	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022543	AGGTGA	2	12	859299	859310	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022543	AGATTT	2	12	933412	933423	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022543	TTTATC	2	12	940747	940758	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_022543	TTTTTC	2	12	940899	940910	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022543	TTAGAA	2	12	953441	953452	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022543	TCAAAA	2	12	1074817	1074828	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022543	ATTTTT	2	12	1080814	1080825	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022543	TAATTC	2	12	1080931	1080942	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022543	TCAAAC	2	12	1086000	1086011	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022543	TCTTTT	2	12	1154970	1154981	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022543	CTCAGA	2	12	1210489	1210500	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022543	AGTATC	2	12	1228696	1228707	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_022543	TCCAGT	2	12	1328716	1328727	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022543	AAATAA	2	12	1337706	1337717	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022543	TAATCA	2	12	1369213	1369224	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022543	TATTTA	2	12	1370735	1370746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022543	TTCAGA	2	12	1384034	1384045	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_022543	ATTTCA	2	12	1410781	1410792	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022543	CCCTAA	2	12	1440017	1440028	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022543	AAAAAG	2	12	1449628	1449639	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022543	TAACAT	2	12	1453601	1453612	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022543	AAAAAT	2	12	1513723	1513734	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022543	ACAAAA	2	12	1555917	1555928	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_022543	AGCCAA	2	12	1573468	1573479	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022543	TTATTG	2	12	1635245	1635256	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022543	CCTGAT	2	12	1706546	1706557	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022543	ATTCTT	2	12	1720740	1720751	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022543	TGGATG	2	12	1726011	1726022	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022543	CGAAAA	2	12	1750245	1750256	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_022543	TAAAGT	2	12	1750366	1750377	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022543	ACATAA	2	12	1754709	1754720	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022543	AAAAGG	2	12	1810950	1810961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022543	GCGAAT	2	12	1849629	1849640	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022543	GAAAAC	2	12	1944642	1944653	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_022543	ATACTT	2	12	2020049	2020060	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022543	GCCAAA	2	12	2062213	2062224	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022543	TTTATG	2	12	2068001	2068012	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022543	TTCAAT	2	12	2198539	2198550	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022543	TGGCAG	2	12	2207491	2207502	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.