MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio alginolyticus NBRC 15630 = ATCC 17749 chromosome 2

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022359	CTTTG	2	10	8934	8943	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_022359	CTCTT	2	10	9445	9454	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_022359	ATTTA	2	10	10832	10841	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022359	ATTTT	2	10	22123	22132	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022359	CCAAA	2	10	34220	34229	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_022359	AATCA	2	10	39940	39949	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022359	AGGAT	2	10	48680	48689	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022359	ATTGA	2	10	55319	55328	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022359	AGCCA	2	10	65508	65517	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_022359	GTGTT	2	10	71649	71658	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022359	ATTAT	2	10	97299	97308	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022359	AACGT	2	10	110775	110784	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_022359	AGAAA	2	10	112624	112633	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022359	CAAAA	2	10	128111	128120	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_022359	CTATT	2	10	130387	130396	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_022359	TCACT	2	10	133662	133671	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_022359	AATCA	2	10	135547	135556	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_022359	AAAAG	2	10	139353	139362	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022359	CTTTT	2	10	143361	143370	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_022359	CAAAT	2	10	151451	151460	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_022359	TCCTT	2	10	179233	179242	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_022359	TTATT	2	10	198636	198645	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022359	TAACT	2	10	205995	206004	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_022359	AAAAT	2	10	216028	216037	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022359	ATTTC	2	10	239879	239888	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_022359	GTCGC	2	10	239955	239964	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_022359	TCCTT	2	10	251014	251023	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_022359	GGACA	2	10	272869	272878	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_022359	GTTTT	2	10	272960	272969	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022359	TTAGG	2	10	273172	273181	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022359	TTCAC	2	10	273634	273643	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_022359	GTAAA	2	10	288200	288209	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022359	TACCT	2	10	295126	295135	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_022359	AAAAG	2	10	295513	295522	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022359	TCAAT	2	10	297269	297278	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_022359	TTTGT	2	10	301337	301346	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022359	AATTG	2	10	305054	305063	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022359	AATTA	2	10	308408	308417	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022359	CTTTT	2	10	347466	347475	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_022359	GAACA	2	10	369089	369098	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_022359	CAGCT	2	10	371357	371366	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_022359	AATTC	2	10	374405	374414	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_022359	TTTTA	2	10	375241	375250	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022359	TAGAG	2	10	378499	378508	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022359	GTTTT	2	10	387270	387279	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022359	TTATT	2	10	410493	410502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022359	CAAAA	2	10	416425	416434	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_022359	AAATA	2	10	429491	429500	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022359	AAGCC	2	10	432314	432323	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_022359	AGTGA	2	10	434823	434832	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022359	CGTCC	2	10	435434	435443	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
52	NC_022359	TTGGT	2	10	454703	454712	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022359	GTTTT	2	10	456926	456935	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022359	AGAGT	2	10	457179	457188	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022359	ATGGC	2	10	460653	460662	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_022359	ACGTC	2	10	488346	488355	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_022359	TTACT	2	10	493638	493647	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_022359	GTTTT	2	10	523816	523825	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022359	AGGGA	2	10	533592	533601	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022359	GTTTA	2	10	540358	540367	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022359	TTTGC	2	10	545488	545497	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_022359	TAAAT	2	10	555066	555075	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022359	GGGCT	2	10	565219	565228	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_022359	TTAAA	2	10	588124	588133	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022359	CGGAC	2	10	600381	600390	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_022359	TAATA	2	10	616960	616969	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022359	TTTTA	2	10	616989	616998	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022359	ATTTT	2	10	617078	617087	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022359	GAGCA	2	10	618167	618176	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_022359	CCTTA	2	10	622225	622234	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_022359	TTTAT	2	10	644566	644575	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022359	CAACG	2	10	650911	650920	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_022359	GTATT	2	10	658278	658287	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022359	AAGCG	2	10	659164	659173	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_022359	TACCT	2	10	659366	659375	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_022359	TTTCT	2	10	677039	677048	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022359	GAATG	2	10	678777	678786	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022359	ATTTA	2	10	679865	679874	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022359	AGTCT	2	10	690404	690413	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_022359	TCCTC	2	10	700768	700777	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
81	NC_022359	TGAAG	2	10	700811	700820	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022359	TTTTG	2	10	721086	721095	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022359	ATTTG	2	10	729646	729655	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022359	GTAAC	2	10	746029	746038	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_022359	ATCAA	2	10	755832	755841	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_022359	TTATA	2	10	788487	788496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022359	TAACA	2	10	788518	788527	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022359	GAGTT	2	10	792531	792540	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022359	AAAAG	2	10	792622	792631	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022359	TGGCT	2	10	804077	804086	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_022359	TAACT	2	10	806641	806650	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_022359	AGTTT	2	10	807898	807907	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022359	AGCTT	2	10	808278	808287	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_022359	CTGGG	2	10	808358	808367	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_022359	TTTGT	2	10	813822	813831	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022359	TAAAT	2	10	814010	814019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022359	ATTGT	2	10	814042	814051	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022359	AAATA	2	10	816786	816795	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022359	AAATG	2	10	824912	824921	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022359	AAACA	2	10	825927	825936	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_022359	CGCCC	2	10	828017	828026	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
102	NC_022359	TTTCG	2	10	832504	832513	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_022359	GAAAA	2	10	838699	838708	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022359	ATTTG	2	10	840328	840337	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022359	CGGTT	2	10	840401	840410	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_022359	ATTTT	2	10	843882	843891	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022359	CTCAT	2	10	849723	849732	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_022359	CGCTA	2	10	853229	853238	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_022359	GTGTT	2	10	865366	865375	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022359	CTTCA	2	10	873641	873650	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_022359	AAAGC	2	10	891110	891119	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_022359	AATAC	2	10	893197	893206	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_022359	ACTTT	2	10	902124	902133	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_022359	GTTTA	2	10	911271	911280	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022359	TTTTG	2	10	917109	917118	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022359	ACTAT	2	10	928147	928156	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_022359	TTAAG	2	10	929660	929669	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022359	TAAAA	2	10	929718	929727	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022359	AAATG	2	10	936291	936300	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022359	AAATT	2	10	936485	936494	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022359	ACCTC	2	10	966360	966369	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
122	NC_022359	TAAAT	2	10	966577	966586	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022359	TTTTC	2	10	974557	974566	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_022359	AAACA	2	10	979331	979340	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_022359	AAATT	2	10	1000293	1000302	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022359	GATCT	2	10	1082197	1082206	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_022359	AAAAG	2	10	1090068	1090077	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022359	CTTTC	2	10	1091094	1091103	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_022359	AGTGA	2	10	1094727	1094736	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022359	GTTTG	5	25	1094923	1094947	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022359	AGGTA	2	10	1098125	1098134	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022359	TTCTT	2	10	1116033	1116042	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_022359	CTAAA	2	10	1135786	1135795	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_022359	ATTTA	2	10	1148477	1148486	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022359	ATCAA	2	10	1163617	1163626	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_022359	ATTGT	2	10	1167416	1167425	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022359	CGAAG	2	10	1167593	1167602	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_022359	AATAC	2	10	1175325	1175334	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_022359	AAAAG	2	10	1191551	1191560	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022359	CTCAA	2	10	1193087	1193096	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_022359	CTAGG	2	10	1194437	1194446	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_022359	TGATT	2	10	1195875	1195884	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022359	CACGA	2	10	1198386	1198395	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_022359	TTATT	2	10	1212380	1212389	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022359	AACAA	2	10	1222593	1222602	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_022359	TGTGC	2	10	1228648	1228657	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_022359	GCATA	2	10	1230394	1230403	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_022359	TAAAT	2	10	1233531	1233540	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022359	TCACT	2	10	1264784	1264793	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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157	NC_022359	TTTTG	2	10	1294823	1294832	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_022359	AATTA	2	10	1338181	1338190	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022359	CTCTA	2	10	1346013	1346022	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
164	NC_022359	TTAAT	2	10	1347155	1347164	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_022359	AAAAC	2	10	1348619	1348628	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_022359	GAATA	2	10	1354739	1354748	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_022359	AAAAT	2	10	1368288	1368297	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_022359	GAAAA	2	10	1369878	1369887	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
169	NC_022359	CTGCG	2	10	1388233	1388242	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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172	NC_022359	ATCAA	2	10	1415160	1415169	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
173	NC_022359	ATAAC	2	10	1415300	1415309	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
174	NC_022359	CTTAT	2	10	1417994	1418003	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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177	NC_022359	TACTG	2	10	1467946	1467955	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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184	NC_022359	CTATC	2	10	1591988	1591997	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
185	NC_022359	TAACA	2	10	1595344	1595353	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
186	NC_022359	TGTTA	2	10	1597117	1597126	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
187	NC_022359	AGTCA	2	10	1602620	1602629	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
188	NC_022359	TAACA	2	10	1602740	1602749	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
189	NC_022359	CTGCC	2	10	1611792	1611801	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
190	NC_022359	ACATC	2	10	1619609	1619618	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
191	NC_022359	TTTTC	2	10	1624992	1625001	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
192	NC_022359	ACAAA	2	10	1629981	1629990	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
193	NC_022359	GCAAT	2	10	1633912	1633921	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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195	NC_022359	TAAAA	2	10	1634965	1634974	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_022359	GAACC	2	10	1635174	1635183	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
197	NC_022359	ATTCC	2	10	1657290	1657299	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
198	NC_022359	TGTGG	2	10	1691976	1691985	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
199	NC_022359	TACCC	2	10	1698858	1698867	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
200	NC_022359	CAAAA	2	10	1714017	1714026	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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203	NC_022359	TAAAC	2	10	1726188	1726197	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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205	NC_022359	TAAAA	2	10	1775528	1775537	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
206	NC_022359	TCAAA	2	10	1779963	1779972	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
207	NC_022359	AGCCA	2	10	1786170	1786179	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
208	NC_022359	TAAAT	2	10	1790454	1790463	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
209	NC_022359	CAATT	2	10	1795267	1795276	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
210	NC_022359	AAAGA	2	10	1795525	1795534	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
211	NC_022359	AGATT	2	10	1812126	1812135	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.