MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid

Total Repeats: 285

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022271	TAT	2	6	111	116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022271	TAT	2	6	156	161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022271	TTC	2	6	861	866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022271	TCA	2	6	1903	1908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022271	GGC	2	6	1988	1993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022271	TCC	2	6	2029	2034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_022271	TCC	2	6	2218	2223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_022271	AGA	2	6	2339	2344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022271	ACG	2	6	2374	2379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022271	GGC	2	6	3338	3343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022271	CGC	2	6	3347	3352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_022271	GCG	2	6	3522	3527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022271	TTG	2	6	3766	3771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022271	ATG	2	6	3819	3824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022271	TGA	2	6	3903	3908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022271	CAA	2	6	3981	3986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022271	AAC	2	6	4069	4074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022271	TGG	2	6	4132	4137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022271	CGT	2	6	4184	4189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022271	CTC	2	6	4194	4199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_022271	TCC	2	6	4384	4389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_022271	AGA	2	6	4505	4510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022271	ACG	2	6	4540	4545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022271	TTC	2	6	5334	5339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022271	TGT	2	6	5441	5446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022271	CTA	2	6	5450	5455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022271	CAC	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_022271	GGC	2	6	5510	5515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022271	AGA	2	6	7412	7417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022271	CTA	2	6	10954	10959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022271	TTC	2	6	10971	10976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022271	CGT	2	6	10987	10992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022271	CCA	2	6	11024	11029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_022271	TAT	2	6	11099	11104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022271	TAG	2	6	11233	11238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022271	AGC	2	6	11989	11994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022271	CTC	2	6	12000	12005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_022271	AAC	2	6	12007	12012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022271	TCA	2	6	12043	12048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022271	CTT	2	6	12089	12094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022271	TAT	2	6	13858	13863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022271	TAT	2	6	13903	13908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022271	TTC	2	6	14608	14613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022271	GTA	2	6	15206	15211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022271	CAG	2	6	15221	15226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022271	CGT	2	6	16656	16661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022271	AAG	2	6	16708	16713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022271	CTT	2	6	16744	16749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022271	GTA	2	6	17473	17478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022271	CAG	2	6	17488	17493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022271	TTC	2	6	17965	17970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022271	AGG	2	6	18129	18134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022271	GAA	2	6	18236	18241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022271	AGA	2	6	18251	18256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022271	ATG	2	6	18264	18269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022271	TCT	2	6	18291	18296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022271	ACT	2	6	18319	18324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022271	TGG	2	6	18406	18411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022271	GAG	2	6	18509	18514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022271	GCC	2	6	18535	18540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_022271	GGC	2	6	18788	18793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022271	GTT	2	6	19995	20000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022271	GAT	2	6	20110	20115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022271	AGC	2	6	20475	20480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_022271	CTC	2	6	20486	20491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_022271	AAC	2	6	20493	20498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022271	TCA	2	6	20529	20534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022271	CGC	2	6	20582	20587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_022271	CAG	2	6	20634	20639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022271	TGT	2	6	20665	20670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022271	GTT	2	6	20720	20725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022271	TCT	2	6	21928	21933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022271	TCG	2	6	21945	21950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022271	GGA	2	6	21979	21984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022271	GGT	2	6	22066	22071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022271	TCT	2	6	23359	23364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022271	TCA	2	6	23435	23440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022271	AGT	2	6	24822	24827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022271	CTA	2	6	26489	26494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022271	TGC	2	6	26496	26501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022271	TCC	2	6	26636	26641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_022271	AAC	2	6	26653	26658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022271	ACA	2	6	26674	26679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_022271	TAT	2	6	27509	27514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022271	GAA	3	9	27518	27526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022271	GAA	2	6	27586	27591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022271	TGG	2	6	28733	28738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022271	ATT	2	6	28804	28809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022271	TGC	2	6	28979	28984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022271	ATT	2	6	29035	29040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022271	CTG	2	6	29043	29048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022271	CAA	2	6	34891	34896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_022271	GGT	2	6	34959	34964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022271	GCG	2	6	37925	37930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022271	GAG	2	6	44754	44759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022271	AGT	2	6	47064	47069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022271	GTT	2	6	47083	47088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022271	TAA	2	6	47117	47122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022271	GTT	2	6	47151	47156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022271	CTA	2	6	47171	47176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_022271	GGT	2	6	47263	47268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022271	ACT	2	6	47389	47394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022271	ACC	2	6	47402	47407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_022271	GGA	2	6	48484	48489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022271	TAA	2	6	48504	48509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022271	CTT	2	6	48583	48588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022271	CCT	2	6	48601	48606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_022271	ACT	2	6	48863	48868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_022271	ATA	2	6	48891	48896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022271	ATT	2	6	48955	48960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022271	TTC	2	6	49103	49108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_022271	TGA	2	6	49574	49579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022271	GAC	2	6	49607	49612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_022271	TAT	2	6	49628	49633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022271	CAT	2	6	50830	50835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_022271	GTT	2	6	50862	50867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022271	TGT	2	6	50908	50913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022271	GTT	2	6	50916	50921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022271	AGT	2	6	50937	50942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022271	ATT	2	6	50982	50987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022271	TAA	2	6	51001	51006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022271	GGC	2	6	51916	51921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_022271	TGG	2	6	51928	51933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022271	TCT	2	6	51987	51992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_022271	TCT	2	6	52027	52032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_022271	TTC	2	6	52198	52203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_022271	CAA	2	6	52257	52262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_022271	GTT	2	6	52365	52370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022271	GTT	2	6	52447	52452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022271	TGT	3	9	53041	53049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022271	GTT	2	6	53124	53129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022271	TAA	2	6	53174	53179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022271	TGT	2	6	54231	54236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022271	CTT	2	6	54838	54843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_022271	TAT	2	6	56454	56459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022271	TAT	2	6	56498	56503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022271	TTC	2	6	57203	57208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_022271	CTT	2	6	57297	57302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022271	TAA	2	6	57929	57934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022271	AAC	2	6	57968	57973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_022271	TTA	2	6	58082	58087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_022271	GAT	2	6	88562	88567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_022271	TGT	2	6	88600	88605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_022271	GAC	2	6	88624	88629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_022271	GCA	2	6	88730	88735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_022271	GTC	2	6	88754	88759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_022271	CTT	2	6	88820	88825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_022271	GTC	2	6	88836	88841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_022271	CTT	2	6	88858	88863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.