MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 chromosome II

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022270	CAAAGC	2	12	22682	22693	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022270	GTAAAG	2	12	56384	56395	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022270	GCATTT	2	12	92507	92518	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022270	TATAAG	2	12	105138	105149	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022270	AAATAT	2	12	110288	110299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022270	CTGGAT	2	12	134387	134398	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_022270	TGAAAT	2	12	139237	139248	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022270	TAATCT	2	12	147749	147760	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022270	TTGCTA	2	12	149213	149224	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022270	ATCTGT	2	12	160993	161004	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022270	TCAATA	2	12	215826	215837	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022270	TTTAAG	2	12	286613	286624	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022270	ACTGAA	2	12	298454	298465	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022270	AGATGA	2	12	300338	300349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022270	ATCTGT	2	12	340880	340891	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022270	TCGCCA	2	12	342485	342496	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022270	CAAAAA	2	12	353842	353853	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022270	ATTTTT	2	12	357252	357263	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022270	CGAGAG	2	12	360128	360139	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022270	GTTTCG	2	12	360272	360283	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022270	GTGTTT	2	12	382188	382199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022270	AATACT	2	12	397371	397382	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022270	TGGTTT	2	12	399137	399148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022270	TTATCT	2	12	402883	402894	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022270	AAGTGA	2	12	446585	446596	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022270	ATAAAA	2	12	460562	460573	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022270	ATCTGT	2	12	464427	464438	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_022270	TCCTAT	3	18	501645	501662	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022270	AAGAAA	2	12	575214	575225	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022270	GCTTTT	2	12	579576	579587	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022270	AGAACA	2	12	590237	590248	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_022270	GAAGTA	2	12	630484	630495	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022270	GTTTTA	2	12	633158	633169	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022270	GAACTA	2	12	636174	636185	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_022270	CTTGAA	2	12	677055	677066	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022270	ACTCTG	2	12	688826	688837	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022270	CATTTA	2	12	691931	691942	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_022270	GTTTTT	2	12	713629	713640	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022270	CCAGAG	2	12	732490	732501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022270	CATATT	2	12	830388	830399	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022270	TAAGGT	2	12	833668	833679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022270	AACTCG	2	12	849141	849152	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022270	TTCCCT	2	12	943494	943505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_022270	GCTATG	2	12	950126	950137	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022270	CAGAGC	2	12	983511	983522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022270	TGTAAT	2	12	997938	997949	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022270	TTCCAA	2	12	1031976	1031987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022270	TGATGG	2	12	1053058	1053069	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022270	AAAACG	2	12	1064291	1064302	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022270	AATGTA	2	12	1069374	1069385	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022270	TTACCT	2	12	1118346	1118357	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022270	GCAGAG	2	12	1119306	1119317	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_022270	AGAAAA	2	12	1145183	1145194	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022270	CACTGA	2	12	1147959	1147970	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022270	GAGTCT	2	12	1151956	1151967	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022270	GTTTGT	2	12	1190234	1190245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022270	TGCATA	2	12	1201026	1201037	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022270	AAGAGA	2	12	1204679	1204690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022270	TCACCG	2	12	1235167	1235178	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_022270	TCACCG	2	12	1235761	1235772	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_022270	AGTAAA	2	12	1236506	1236517	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022270	TTTTTC	2	12	1237411	1237422	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022270	GTAACA	2	12	1237613	1237624	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022270	TCACCA	5	30	1240694	1240723	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022270	AACTCG	2	12	1241938	1241949	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022270	AAGTAT	2	12	1242087	1242098	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022270	GATTCA	2	12	1283400	1283411	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022270	CTTTTG	2	12	1307713	1307724	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022270	ACCTCA	2	12	1310676	1310687	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_022270	TTACGT	2	12	1319566	1319577	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_022270	TTCATT	2	12	1324400	1324411	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022270	CTAAAA	2	12	1330038	1330049	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_022270	GGATGC	2	12	1343918	1343929	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022270	ACGTAA	2	12	1378999	1379010	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022270	CATTCA	2	12	1384806	1384817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022270	ATTTAT	2	12	1386643	1386654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022270	TAAGCG	2	12	1399202	1399213	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_022270	AAAAAT	2	12	1433084	1433095	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022270	GCTTTT	2	12	1442064	1442075	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_022270	TTTCGC	2	12	1451393	1451404	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022270	AAATAC	2	12	1485112	1485123	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_022270	TAAGTT	2	12	1486359	1486370	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022270	ATTTTT	4	24	1538081	1538104	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022270	ATTTTT	2	12	1569030	1569041	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022270	ACTATT	2	12	1626195	1626206	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_022270	AGAAAA	2	12	1644589	1644600	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022270	TAAAAA	2	12	1644618	1644629	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022270	ACATCT	2	12	1649395	1649406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_022270	CTTGCC	2	12	1706005	1706016	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_022270	AACGAA	2	12	1715849	1715860	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_022270	AAAAGT	2	12	1731531	1731542	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022270	CAGTAA	2	12	1740859	1740870	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022270	TTCATA	2	12	1742542	1742553	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_022270	CCAGTT	2	12	1747440	1747451	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022270	TCTGAT	2	12	1747645	1747656	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_022270	ACAAAA	2	12	1800777	1800788	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_022270	AATTTA	2	12	1807305	1807316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022270	GCTTGT	2	12	1813272	1813283	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_022270	GATATA	2	12	1856322	1856333	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022270	TTCCTT	2	12	1875894	1875905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_022270	TAATGA	2	12	1939934	1939945	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022270	AAACTA	2	12	1967389	1967400	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_022270	TATTTT	2	12	1975770	1975781	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022270	AACTAC	2	12	1998447	1998458	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022270	AGCTGA	2	12	2020101	2020112	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_022270	CAAATT	2	12	2066602	2066613	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_022270	TGTAAA	2	12	2067591	2067602	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022270	TTGTTT	2	12	2087378	2087389	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022270	TTTATA	2	12	2093538	2093549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022270	AAAACA	2	12	2111958	2111969	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_022270	AGATTG	2	12	2121548	2121559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022270	AAATAG	2	12	2134957	2134968	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022270	ATCATG	2	12	2153504	2153515	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_022270	AAAAGC	2	12	2154483	2154494	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_022270	ACTGCG	2	12	2156902	2156913	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_022270	ATCATT	3	18	2158645	2158662	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_022270	TATATT	2	12	2161286	2161297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022270	AGAAGT	7	42	2183201	2183242	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022270	TGCTTG	2	12	2187965	2187976	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_022270	TGAAGT	2	12	2192956	2192967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022270	TGCGAG	2	12	2193176	2193187	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.