MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 9592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022247	GTAAT	2	10	1711496	1711505	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_022247	CATT	2	8	1715906	1715913	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3003	NC_022247	GA	4	8	1715964	1715971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_022247	TTC	2	6	1728146	1728151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_022247	CATC	2	8	1728157	1728164	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_022247	TCG	2	6	1729370	1729375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_022247	GCT	2	6	1729393	1729398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_022247	CCG	2	6	1729414	1729419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_022247	CCT	3	9	1729459	1729467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_022247	CAACA	2	10	1729586	1729595	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3011	NC_022247	GAAC	2	8	1730772	1730779	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3012	NC_022247	T	6	6	1732589	1732594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_022247	TCCA	2	8	1732603	1732610	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3014	NC_022247	GAT	2	6	1733813	1733818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_022247	GCC	2	6	1736687	1736692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_022247	GAT	2	6	1739846	1739851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_022247	ACA	3	9	1742065	1742073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_022247	GTT	2	6	1742097	1742102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_022247	ACC	2	6	1742187	1742192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_022247	CT	3	6	1742310	1742315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_022247	TCA	2	6	1742316	1742321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_022247	T	6	6	1742351	1742356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_022247	T	6	6	1742358	1742363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_022247	GCG	2	6	1742457	1742462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_022247	CGT	2	6	1742464	1742469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_022247	GCA	2	6	1742475	1742480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_022247	CG	3	6	1742499	1742504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_022247	GAGT	2	8	1742791	1742798	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_022247	GTTG	2	8	1743279	1743286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_022247	GCT	2	6	1743333	1743338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_022247	T	6	6	1743380	1743385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_022247	GCG	3	9	1743437	1743445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_022247	TCA	2	6	1743456	1743461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3035	NC_022247	GGC	2	6	1744236	1744241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_022247	T	6	6	1744255	1744260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_022247	TCC	2	6	1744300	1744305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3038	NC_022247	AGCG	2	8	1744320	1744327	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3039	NC_022247	GGA	2	6	1744365	1744370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_022247	CAG	2	6	1744578	1744583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_022247	GTA	2	6	1744589	1744594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_022247	GTG	2	6	1746056	1746061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_022247	CCG	2	6	1746104	1746109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_022247	CG	3	6	1746108	1746113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3045	NC_022247	CG	3	6	1746207	1746212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_022247	AAG	2	6	1746260	1746265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3048	NC_022247	CGG	2	6	1747067	1747072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_022247	GGA	2	6	1747934	1747939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3051	NC_022247	CG	3	6	1749761	1749766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_022247	CTT	2	6	1749767	1749772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_022247	TCA	2	6	1749814	1749819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_022247	GAAAG	2	10	1749875	1749884	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_022247	CGGGC	2	10	1750107	1750116	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3056	NC_022247	TCT	3	9	1753764	1753772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_022247	T	6	6	1759508	1759513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_022247	GGGA	2	8	1759573	1759580	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_022247	TAC	2	6	1759646	1759651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_022247	GATGG	2	10	1759816	1759825	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_022247	GAGGAT	2	12	1759830	1759841	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_022247	C	7	7	1759892	1759898	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3063	NC_022247	A	6	6	1759968	1759973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_022247	CGG	2	6	1761891	1761896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_022247	CCCGG	2	10	1761911	1761920	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3066	NC_022247	A	7	7	1761943	1761949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_022247	TGAT	2	8	1761976	1761983	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3069	NC_022247	GCCG	2	8	1762036	1762043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_022247	ACC	2	6	1762061	1762066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_022247	GCAG	2	8	1762780	1762787	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3072	NC_022247	GCG	2	6	1762860	1762865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_022247	GCG	2	6	1762893	1762898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3077	NC_022247	CCGG	2	8	1765939	1765946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3078	NC_022247	CGG	2	6	1765968	1765973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_022247	CGG	2	6	1765980	1765985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3082	NC_022247	GCG	2	6	1768318	1768323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_022247	GAAA	2	8	1771207	1771214	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3085	NC_022247	GCAC	2	8	1771221	1771228	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3086	NC_022247	GGGA	2	8	1774674	1774681	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_022247	GC	3	6	1774711	1774716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3088	NC_022247	GCCG	2	8	1774720	1774727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3089	NC_022247	GCC	2	6	1774772	1774777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3092	NC_022247	GCTC	2	8	1775782	1775789	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3093	NC_022247	GC	3	6	1775797	1775802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3094	NC_022247	CTG	2	6	1776566	1776571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_022247	CGGGC	2	10	1776577	1776586	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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3097	NC_022247	CGA	2	6	1776635	1776640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3099	NC_022247	AGC	2	6	1777658	1777663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_022247	CGG	2	6	1778592	1778597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_022247	GGCG	2	8	1778598	1778605	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3102	NC_022247	CCGACA	2	12	1778625	1778636	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_022247	GAG	2	6	1778704	1778709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_022247	C	6	6	1780473	1780478	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3105	NC_022247	CCT	3	9	1780488	1780496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3107	NC_022247	GTAG	2	8	1788800	1788807	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_022247	AG	3	6	1788833	1788838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_022247	TCA	2	6	1788929	1788934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3112	NC_022247	GC	3	6	1789772	1789777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_022247	CGA	2	6	1789877	1789882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3115	NC_022247	CCG	2	6	1789963	1789968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3116	NC_022247	GCT	3	9	1789994	1790002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3121	NC_022247	GAA	2	6	1790255	1790260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3125	NC_022247	CGA	2	6	1790538	1790543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3127	NC_022247	CGG	2	6	1790629	1790634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_022247	GC	3	6	1792630	1792635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_022247	CGA	2	6	1792645	1792650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_022247	GCC	2	6	1792694	1792699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3131	NC_022247	GGA	2	6	1799062	1799067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_022247	A	6	6	1799092	1799097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_022247	GCA	2	6	1799189	1799194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_022247	GC	3	6	1799206	1799211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3135	NC_022247	AAG	2	6	1800473	1800478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_022247	ACG	2	6	1800483	1800488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3138	NC_022247	CGTTT	2	10	1802427	1802436	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3140	NC_022247	CGGCC	2	10	1803557	1803566	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3141	NC_022247	T	7	7	1803592	1803598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_022247	CG	3	6	1803610	1803615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3149	NC_022247	GCC	2	6	1807600	1807605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3150	NC_022247	TGCC	3	12	1810260	1810271	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3155	NC_022247	CCA	2	6	1812751	1812756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3156	NC_022247	TGA	2	6	1813613	1813618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3159	NC_022247	CG	3	6	1815002	1815007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3162	NC_022247	GCG	2	6	1821144	1821149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3163	NC_022247	GCG	2	6	1823505	1823510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3164	NC_022247	GCC	2	6	1823514	1823519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3220	NC_022247	GCCGC	2	10	1858717	1858726	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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3233	NC_022247	CAACTG	2	12	1859461	1859472	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3240	NC_022247	GCT	2	6	1862254	1862259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3244	NC_022247	GCCCAA	2	12	1862365	1862376	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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3247	NC_022247	GAT	2	6	1862731	1862736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_022247	GGT	2	6	1862819	1862824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_022247	CG	3	6	1862899	1862904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3250	NC_022247	AGC	2	6	1863220	1863225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3251	NC_022247	A	6	6	1863236	1863241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_022247	TGC	2	6	1863242	1863247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3253	NC_022247	CAA	2	6	1863256	1863261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3254	NC_022247	AGA	2	6	1863265	1863270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_022247	GAA	2	6	1863297	1863302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3256	NC_022247	CCGT	2	8	1863647	1863654	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3257	NC_022247	AGC	2	6	1863671	1863676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3258	NC_022247	TCG	2	6	1863770	1863775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3259	NC_022247	TGG	2	6	1863792	1863797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_022247	GC	3	6	1864315	1864320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3261	NC_022247	GCA	2	6	1865012	1865017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3263	NC_022247	T	8	8	1865114	1865121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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