MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 9592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022247	CA	3	6	845068	845073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_022247	GGA	2	6	851694	851699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_022247	GC	3	6	851714	851719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_022247	GCC	2	6	853415	853420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_022247	GAC	2	6	853481	853486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_022247	TGCT	2	8	853501	853508	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_022247	T	7	7	853578	853584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_022247	GCG	2	6	853599	853604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_022247	GCA	2	6	853701	853706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_022247	CCG	2	6	853919	853924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_022247	GCC	2	6	853948	853953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_022247	CGG	2	6	856058	856063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_022247	TGC	3	9	856076	856084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_022247	TTG	2	6	856123	856128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_022247	TTG	2	6	856220	856225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_022247	CTGG	2	8	856269	856276	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1517	NC_022247	A	7	7	856286	856292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_022247	TA	3	6	856308	856313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_022247	CAA	2	6	856317	856322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_022247	CGC	2	6	856486	856491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_022247	CG	3	6	859101	859106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_022247	AAC	2	6	859856	859861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_022247	CATGTG	2	12	859886	859897	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1524	NC_022247	GCG	2	6	859927	859932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_022247	GC	3	6	859939	859944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_022247	GCA	2	6	860000	860005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_022247	GCG	2	6	860044	860049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_022247	GC	3	6	860080	860085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_022247	CTG	2	6	860101	860106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_022247	CTT	2	6	860145	860150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_022247	GGC	2	6	860175	860180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_022247	CGG	2	6	860261	860266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_022247	CAGC	2	8	860270	860277	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_022247	GCA	2	6	860297	860302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_022247	GGC	3	9	860316	860324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_022247	GGC	2	6	860403	860408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_022247	CAG	2	6	860418	860423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_022247	AGC	2	6	860428	860433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_022247	CCAG	2	8	860477	860484	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_022247	CAG	2	6	860511	860516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_022247	GCA	3	9	860552	860560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_022247	CGG	2	6	860567	860572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_022247	GCG	2	6	860620	860625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_022247	CAG	3	9	860628	860636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_022247	CGAG	2	8	860669	860676	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_022247	CAC	2	6	860712	860717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_022247	GAAA	2	8	860731	860738	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_022247	CGCC	2	8	860810	860817	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1549	NC_022247	GCC	2	6	860845	860850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_022247	GCC	2	6	860854	860859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_022247	CGGC	2	8	860864	860871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_022247	GC	3	6	860900	860905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_022247	CCG	2	6	860906	860911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_022247	CG	3	6	860910	860915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_022247	GCC	2	6	860931	860936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_022247	CGG	2	6	860963	860968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_022247	AGGCC	2	10	860972	860981	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1558	NC_022247	TGCGG	2	10	860982	860991	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1559	NC_022247	GC	3	6	860993	860998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_022247	GGT	2	6	860999	861004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_022247	CG	3	6	861016	861021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_022247	CAG	3	9	861072	861080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_022247	CCG	2	6	861082	861087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_022247	GCG	2	6	861131	861136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_022247	GAA	2	6	861145	861150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_022247	GAG	2	6	861154	861159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_022247	GCG	2	6	861163	861168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_022247	GGC	2	6	861177	861182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_022247	CTGC	2	8	861188	861195	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_022247	CG	4	8	861212	861219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_022247	GCG	3	9	861222	861230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_022247	GGCCG	2	10	861277	861286	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1573	NC_022247	CCA	2	6	861307	861312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_022247	GTC	2	6	861324	861329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_022247	GCGCT	2	10	861336	861345	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1576	NC_022247	CGG	2	6	861418	861423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_022247	GAA	2	6	861449	861454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_022247	GCGGCT	2	12	861547	861558	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_022247	CCAG	2	8	861667	861674	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_022247	GCG	2	6	861724	861729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_022247	GCT	2	6	861737	861742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_022247	GCCG	2	8	861842	861849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_022247	CGC	2	6	861853	861858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_022247	CAGTT	2	10	861870	861879	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1585	NC_022247	TTC	2	6	861906	861911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_022247	GACC	2	8	861949	861956	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_022247	CCA	2	6	861997	862002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1588	NC_022247	CG	3	6	862007	862012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1589	NC_022247	G	6	6	862018	862023	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_022247	ACC	2	6	862029	862034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_022247	CCGG	2	8	862039	862046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_022247	GCG	2	6	862080	862085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_022247	GCT	2	6	862086	862091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_022247	GCG	2	6	862934	862939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_022247	GCA	2	6	863043	863048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_022247	TGC	2	6	867851	867856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_022247	CG	3	6	874404	874409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_022247	CGG	2	6	874423	874428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_022247	TCC	2	6	875326	875331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1600	NC_022247	CGTG	2	8	875332	875339	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1601	NC_022247	TGC	2	6	875676	875681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_022247	CAC	2	6	876096	876101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1603	NC_022247	TCGT	2	8	876162	876169	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1604	NC_022247	TCG	2	6	876176	876181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_022247	GTC	2	6	876203	876208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_022247	TGCC	2	8	876253	876260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_022247	TCC	2	6	876262	876267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_022247	GAT	2	6	876349	876354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_022247	CGGCCG	2	12	879891	879902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_022247	GCG	2	6	883516	883521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_022247	TCT	2	6	885418	885423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_022247	GTGAG	2	10	885433	885442	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_022247	TCTT	2	8	887070	887077	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1614	NC_022247	AACCC	2	10	888583	888592	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1615	NC_022247	T	6	6	889322	889327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_022247	CTGC	2	8	890641	890648	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_022247	ACG	2	6	891987	891992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_022247	AGCA	2	8	892017	892024	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_022247	GAC	2	6	892029	892034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_022247	GA	3	6	892073	892078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_022247	A	6	6	892197	892202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_022247	GTA	2	6	892251	892256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_022247	GCC	2	6	892310	892315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_022247	GACAC	2	10	894365	894374	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1625	NC_022247	TG	3	6	895845	895850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_022247	CCG	2	6	898829	898834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_022247	CCG	2	6	901631	901636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_022247	TC	3	6	903965	903970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_022247	GGC	2	6	903977	903982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_022247	CAA	2	6	903999	904004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_022247	CCG	2	6	904006	904011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_022247	GTA	2	6	906147	906152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_022247	ATA	2	6	906229	906234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_022247	GC	3	6	910424	910429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1635	NC_022247	CTGAT	2	10	910435	910444	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1636	NC_022247	GAA	2	6	913446	913451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1945	NC_022247	CG	3	6	1110408	1110413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1946	NC_022247	TGCA	2	8	1110417	1110424	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1947	NC_022247	CT	3	6	1110426	1110431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2000	NC_022247	A	6	6	1150825	1150830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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