MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 9592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022247	ACAA	2	8	653293	653300	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_022247	AGG	2	6	655270	655275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_022247	C	6	6	656907	656912	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1004	NC_022247	C	6	6	656945	656950	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1005	NC_022247	CGG	3	9	656983	656991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_022247	GCGCG	2	10	658935	658944	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1007	NC_022247	TCCC	2	8	658955	658962	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1008	NC_022247	GGC	2	6	658991	658996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_022247	CTGC	2	8	659013	659020	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_022247	GAAGGA	2	12	659042	659053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_022247	GACA	2	8	661035	661042	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_022247	AGC	2	6	673051	673056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_022247	ACA	2	6	677840	677845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_022247	GCG	2	6	682954	682959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_022247	GCC	2	6	682961	682966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_022247	GCTC	2	8	682975	682982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_022247	GC	3	6	682998	683003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_022247	AC	3	6	684176	684181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_022247	CGC	2	6	686399	686404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_022247	GTG	2	6	686426	686431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_022247	CTC	2	6	686478	686483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_022247	CCG	2	6	686500	686505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_022247	CGC	2	6	686507	686512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_022247	GAAT	2	8	686563	686570	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_022247	T	6	6	686583	686588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_022247	GAA	2	6	688332	688337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_022247	A	6	6	688336	688341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_022247	GAA	2	6	688342	688347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_022247	CGA	2	6	688348	688353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_022247	GTCG	2	8	688355	688362	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_022247	TC	3	6	690394	690399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_022247	TCAA	2	8	690411	690418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_022247	GCC	2	6	690425	690430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_022247	GGC	2	6	690439	690444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_022247	TG	3	6	690961	690966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_022247	CGG	2	6	691006	691011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_022247	GA	3	6	691030	691035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_022247	GCC	2	6	691079	691084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_022247	GT	3	6	692602	692607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_022247	A	9	9	693185	693193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_022247	GGA	2	6	697351	697356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_022247	CTG	2	6	697373	697378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_022247	TCG	2	6	697475	697480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_022247	TGC	2	6	697493	697498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_022247	GCAC	2	8	697541	697548	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_022247	CG	3	6	698266	698271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_022247	GCC	2	6	698276	698281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_022247	TCT	2	6	699620	699625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_022247	TTCT	3	12	699622	699633	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_022247	CT	3	6	699632	699637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_022247	CT	4	8	704129	704136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_022247	C	6	6	704354	704359	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1053	NC_022247	CAAT	2	8	704403	704410	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_022247	GCG	2	6	705831	705836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_022247	GGATG	2	10	706301	706310	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_022247	TGC	2	6	706313	706318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_022247	CGC	2	6	706360	706365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_022247	CCGCG	2	10	706393	706402	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1059	NC_022247	GCG	2	6	706406	706411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_022247	CG	3	6	706417	706422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_022247	GCCG	2	8	706481	706488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_022247	TGC	2	6	706490	706495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_022247	GAAG	2	8	706546	706553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_022247	GCGGGG	2	12	707394	707405	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
1065	NC_022247	GGA	2	6	708010	708015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_022247	AAG	2	6	708025	708030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_022247	CCT	2	6	708038	708043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_022247	CGC	2	6	708058	708063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_022247	GC	3	6	708108	708113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_022247	ACGC	2	8	708147	708154	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_022247	GCG	2	6	708165	708170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_022247	AGG	2	6	708192	708197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_022247	GCGCC	2	10	708483	708492	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1074	NC_022247	TTC	2	6	708558	708563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_022247	GCA	2	6	708584	708589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_022247	CGA	2	6	708625	708630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_022247	GCTGC	2	10	709156	709165	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1078	NC_022247	GTC	3	9	711268	711276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_022247	GAA	2	6	711303	711308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_022247	CG	3	6	711340	711345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_022247	ATGC	2	8	717658	717665	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_022247	GCCA	2	8	717690	717697	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_022247	CGT	2	6	717737	717742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_022247	GGC	2	6	717762	717767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_022247	TC	3	6	717871	717876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_022247	CGT	2	6	717885	717890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_022247	AG	3	6	717931	717936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_022247	GTC	2	6	717942	717947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_022247	CGG	2	6	717984	717989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_022247	GGC	2	6	718123	718128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_022247	TTA	2	6	718130	718135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_022247	CAT	2	6	718211	718216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_022247	GCT	2	6	718265	718270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_022247	GGAC	2	8	718320	718327	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_022247	TAC	2	6	718446	718451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_022247	GGA	2	6	718457	718462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_022247	A	8	8	718484	718491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_022247	TG	3	6	718495	718500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_022247	AAG	2	6	718519	718524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_022247	CGA	2	6	718527	718532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_022247	GCA	2	6	718553	718558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_022247	AGA	3	9	718573	718581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_022247	GCAG	2	8	718610	718617	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_022247	GTG	2	6	718734	718739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_022247	GTG	2	6	718782	718787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_022247	TCC	3	9	718879	718887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_022247	TC	3	6	718888	718893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_022247	TCG	2	6	718973	718978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_022247	CAC	2	6	718989	718994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_022247	GGA	2	6	719031	719036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_022247	GATG	2	8	719051	719058	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_022247	GAC	2	6	719070	719075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_022247	CAC	2	6	719076	719081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_022247	TCG	2	6	719102	719107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_022247	CGAC	2	8	719164	719171	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_022247	CG	3	6	719184	719189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_022247	GTCTC	2	10	719206	719215	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1118	NC_022247	ATGA	2	8	720425	720432	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_022247	GC	3	6	721366	721371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_022247	AC	3	6	721391	721396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_022247	CGC	2	6	722247	722252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_022247	TCG	2	6	722302	722307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_022247	ATC	3	9	722346	722354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_022247	GCC	2	6	722366	722371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_022247	CCT	2	6	722388	722393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_022247	TGC	2	6	722425	722430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_022247	CCGC	2	8	722433	722440	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1128	NC_022247	GGC	2	6	722441	722446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_022247	GCGAC	2	10	722563	722572	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1130	NC_022247	CTG	2	6	722655	722660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_022247	GC	3	6	722737	722742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_022247	TCGT	2	8	722771	722778	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_022247	CTGGT	2	10	722812	722821	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1134	NC_022247	GAG	2	6	722877	722882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_022247	TCCG	2	8	723770	723777	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1137	NC_022247	CGGCA	2	10	723849	723858	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1262	NC_022247	CGC	2	6	782748	782753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1267	NC_022247	TGG	2	6	782950	782955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_022247	GC	3	6	782964	782969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1269	NC_022247	CGTGC	2	10	782978	782987	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1270	NC_022247	GC	3	6	782992	782997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1272	NC_022247	TCCTAC	2	12	783237	783248	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1400	NC_022247	GGC	2	6	830571	830576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1402	NC_022247	ATGT	2	8	830878	830885	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1403	NC_022247	TGC	2	6	830900	830905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1404	NC_022247	AG	3	6	833174	833179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1405	NC_022247	GC	3	6	833183	833188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1406	NC_022247	GTCAAG	2	12	833227	833238	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1407	NC_022247	GGCC	2	8	833250	833257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1408	NC_022247	GGA	2	6	835807	835812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_022247	TCG	2	6	835911	835916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_022247	GAA	2	6	835932	835937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_022247	GGC	2	6	836856	836861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1412	NC_022247	CGC	2	6	836882	836887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1414	NC_022247	CGGG	2	8	837394	837401	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1415	NC_022247	A	6	6	838432	838437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1421	NC_022247	GTC	2	6	839928	839933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1428	NC_022247	CAC	2	6	840138	840143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1430	NC_022247	GCC	2	6	840222	840227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1433	NC_022247	GACC	2	8	840267	840274	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1434	NC_022247	CGGA	2	8	840278	840285	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1435	NC_022247	GCG	2	6	840314	840319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1436	NC_022247	TCG	2	6	840329	840334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1437	NC_022247	CTG	2	6	840361	840366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1438	NC_022247	TCG	2	6	840368	840373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1440	NC_022247	TGA	2	6	840455	840460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1441	NC_022247	GCG	2	6	840495	840500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1442	NC_022247	GC	6	12	840507	840518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1443	NC_022247	CTG	2	6	840523	840528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1444	NC_022247	TGG	2	6	840566	840571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_022247	TGC	2	6	840581	840586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1448	NC_022247	TTGC	2	8	840655	840662	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1450	NC_022247	CTG	2	6	840709	840714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1486	NC_022247	CTG	2	6	842154	842159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1488	NC_022247	GAC	2	6	842229	842234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1489	NC_022247	TCG	2	6	842250	842255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1490	NC_022247	TTC	2	6	842304	842309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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