MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 9592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_022247	AAT	2	6	5740076	5740081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9502	NC_022247	ACACA	2	10	5740125	5740134	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9503	NC_022247	GCT	2	6	5740609	5740614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9504	NC_022247	ACGA	2	8	5740622	5740629	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9505	NC_022247	CTC	2	6	5740650	5740655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9506	NC_022247	CCTT	2	8	5740674	5740681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9507	NC_022247	AGC	2	6	5740710	5740715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9508	NC_022247	CGC	2	6	5740718	5740723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9509	NC_022247	ACA	2	6	5741857	5741862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9510	NC_022247	CGG	2	6	5742174	5742179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9511	NC_022247	TTG	2	6	5742283	5742288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9512	NC_022247	GC	3	6	5743725	5743730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9513	NC_022247	CTT	3	9	5743738	5743746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9514	NC_022247	GAT	2	6	5745086	5745091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9515	NC_022247	CG	4	8	5745097	5745104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9516	NC_022247	CGG	2	6	5745138	5745143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9517	NC_022247	CA	4	8	5745152	5745159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9518	NC_022247	CAA	2	6	5745162	5745167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9519	NC_022247	T	6	6	5745174	5745179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9520	NC_022247	CG	4	8	5745502	5745509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9521	NC_022247	GAG	2	6	5745550	5745555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9522	NC_022247	A	6	6	5746817	5746822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9523	NC_022247	TTG	2	6	5746842	5746847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9524	NC_022247	AGAA	2	8	5747904	5747911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9525	NC_022247	G	6	6	5750069	5750074	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9526	NC_022247	GCTC	2	8	5750093	5750100	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9527	NC_022247	CGG	2	6	5753636	5753641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9528	NC_022247	AG	3	6	5755021	5755026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9529	NC_022247	GCC	2	6	5755082	5755087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9530	NC_022247	GCC	2	6	5758264	5758269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9531	NC_022247	AGT	2	6	5758518	5758523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9532	NC_022247	GGGA	2	8	5760116	5760123	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9533	NC_022247	CTC	2	6	5761210	5761215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9534	NC_022247	T	7	7	5761222	5761228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9535	NC_022247	TGGCG	2	10	5761276	5761285	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9536	NC_022247	AGA	2	6	5761342	5761347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9537	NC_022247	CCA	2	6	5761352	5761357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9538	NC_022247	GTG	2	6	5763808	5763813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9539	NC_022247	CA	3	6	5764791	5764796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9540	NC_022247	GCA	2	6	5764838	5764843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9541	NC_022247	GCA	2	6	5764866	5764871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9542	NC_022247	GCC	2	6	5764883	5764888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9543	NC_022247	GCC	2	6	5765037	5765042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9544	NC_022247	GCA	2	6	5765057	5765062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9545	NC_022247	ACGA	2	8	5765097	5765104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9546	NC_022247	TCG	2	6	5770028	5770033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9547	NC_022247	GGA	2	6	5770034	5770039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9548	NC_022247	CGG	2	6	5770070	5770075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9549	NC_022247	GGA	2	6	5770093	5770098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9550	NC_022247	TCA	2	6	5772012	5772017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9551	NC_022247	TCGC	2	8	5773441	5773448	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9552	NC_022247	CA	3	6	5773485	5773490	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9553	NC_022247	CGA	2	6	5773973	5773978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9554	NC_022247	T	8	8	5774003	5774010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9555	NC_022247	GCG	3	9	5776126	5776134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9556	NC_022247	A	6	6	5777676	5777681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9557	NC_022247	GCG	2	6	5777718	5777723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9558	NC_022247	GAA	2	6	5778545	5778550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9559	NC_022247	CTC	2	6	5779087	5779092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9560	NC_022247	A	6	6	5782476	5782481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9561	NC_022247	GTT	2	6	5782507	5782512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9562	NC_022247	ACTG	2	8	5782518	5782525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9563	NC_022247	TTA	2	6	5782539	5782544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9564	NC_022247	GGC	2	6	5782575	5782580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9565	NC_022247	AG	4	8	5783167	5783174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9566	NC_022247	GT	3	6	5783257	5783262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9567	NC_022247	TG	3	6	5783283	5783288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9568	NC_022247	GGC	2	6	5783332	5783337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9569	NC_022247	CTG	2	6	5783365	5783370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9570	NC_022247	CGC	2	6	5783371	5783376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9571	NC_022247	CCGG	2	8	5783382	5783389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9572	NC_022247	GCA	2	6	5783441	5783446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9573	NC_022247	CCTC	2	8	5783490	5783497	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9574	NC_022247	GGA	2	6	5783511	5783516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9575	NC_022247	CG	3	6	5783538	5783543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9576	NC_022247	CA	3	6	5784182	5784187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9577	NC_022247	CGG	2	6	5787236	5787241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9578	NC_022247	GCCG	2	8	5787251	5787258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9579	NC_022247	AGC	2	6	5787281	5787286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9580	NC_022247	CCG	2	6	5789315	5789320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9581	NC_022247	GC	3	6	5789321	5789326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9582	NC_022247	GAC	2	6	5790296	5790301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9583	NC_022247	GGC	2	6	5790335	5790340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9584	NC_022247	CCGG	2	8	5790378	5790385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9585	NC_022247	GGC	3	9	5792429	5792437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9586	NC_022247	AGCCG	2	10	5794842	5794851	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9587	NC_022247	CCG	2	6	5794855	5794860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9588	NC_022247	GCTG	2	8	5794881	5794888	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9589	NC_022247	GCTGGC	2	12	5794894	5794905	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9590	NC_022247	GCT	2	6	5794912	5794917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9591	NC_022247	A	6	6	5795105	5795110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9592	NC_022247	CGC	3	9	5795237	5795245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.