MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 9592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022247	GATG	2	8	2950877	2950884	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_022247	GCG	3	9	2951795	2951803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_022247	GCC	2	6	2951810	2951815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5004	NC_022247	GCG	2	6	2951840	2951845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_022247	CTGC	2	8	2951861	2951868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5006	NC_022247	CCG	2	6	2951916	2951921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_022247	AGG	2	6	2952548	2952553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_022247	AG	3	6	2952580	2952585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_022247	CG	3	6	2953588	2953593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_022247	GC	3	6	2953611	2953616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5011	NC_022247	TCG	2	6	2953642	2953647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_022247	CCG	2	6	2953667	2953672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_022247	TCG	3	9	2953702	2953710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_022247	GTT	2	6	2953728	2953733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_022247	GT	3	6	2953738	2953743	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_022247	TGCGC	2	10	2953822	2953831	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5017	NC_022247	GCC	2	6	2954788	2954793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_022247	GCCG	2	8	2956731	2956738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_022247	TA	3	6	2957350	2957355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_022247	GCC	2	6	2957381	2957386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_022247	AGA	2	6	2959104	2959109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_022247	TCA	2	6	2959876	2959881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_022247	CCCGC	2	10	2961397	2961406	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5024	NC_022247	CCGGCC	2	12	2961419	2961430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_022247	GGC	2	6	2961441	2961446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_022247	CCG	2	6	2962051	2962056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_022247	T	6	6	2963383	2963388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_022247	TCG	2	6	2963441	2963446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_022247	CCA	2	6	2963450	2963455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_022247	CG	4	8	2963857	2963864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5031	NC_022247	ACC	2	6	2965258	2965263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_022247	TTTTC	2	10	2965746	2965755	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5033	NC_022247	CCAC	2	8	2974367	2974374	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5034	NC_022247	CCCG	2	8	2975070	2975077	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5035	NC_022247	A	7	7	2975111	2975117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_022247	CCCG	2	8	2975131	2975138	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5037	NC_022247	GTT	2	6	2976412	2976417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_022247	GC	3	6	2983637	2983642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_022247	CTG	2	6	2983643	2983648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_022247	CG	3	6	2983649	2983654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5041	NC_022247	CCT	2	6	2983655	2983660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_022247	CAGAA	2	10	2986503	2986512	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5043	NC_022247	CTGA	2	8	2987627	2987634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5044	NC_022247	GGTA	2	8	2987658	2987665	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_022247	CAA	2	6	2987752	2987757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_022247	GGA	2	6	2987760	2987765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_022247	CCCG	2	8	2987772	2987779	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5048	NC_022247	AGG	2	6	2987826	2987831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_022247	ACGCT	2	10	2988259	2988268	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5050	NC_022247	AGCG	2	8	2988689	2988696	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5051	NC_022247	GC	3	6	2988739	2988744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5052	NC_022247	GC	3	6	2988752	2988757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5053	NC_022247	CCGC	2	8	2988760	2988767	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5054	NC_022247	TGA	2	6	2989994	2989999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_022247	CGC	2	6	2990052	2990057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5056	NC_022247	CCCG	2	8	2990074	2990081	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5057	NC_022247	GC	3	6	2990091	2990096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_022247	T	7	7	2992500	2992506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_022247	CGATTC	4	24	2996156	2996179	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_022247	CGA	2	6	2997389	2997394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_022247	CCG	2	6	2997415	2997420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_022247	AAG	2	6	2997421	2997426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_022247	AAC	2	6	2997476	2997481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_022247	TGAA	2	8	2997682	2997689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_022247	CTT	2	6	2997710	2997715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_022247	T	8	8	2997714	2997721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_022247	CG	3	6	3001652	3001657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_022247	CGC	2	6	3001737	3001742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_022247	GGC	2	6	3001749	3001754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_022247	CCT	2	6	3001760	3001765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5071	NC_022247	C	6	6	3001774	3001779	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5072	NC_022247	GCC	2	6	3001790	3001795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5073	NC_022247	GAA	3	9	3001847	3001855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_022247	CG	3	6	3001859	3001864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5075	NC_022247	GCA	2	6	3001905	3001910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_022247	GCC	2	6	3001937	3001942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5077	NC_022247	TCG	2	6	3001946	3001951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_022247	GCG	2	6	3001959	3001964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_022247	CTT	2	6	3001966	3001971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_022247	TTTTCA	2	12	3001980	3001991	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5081	NC_022247	CG	3	6	3003985	3003990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5082	NC_022247	GCT	2	6	3005383	3005388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_022247	GAA	3	9	3007039	3007047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_022247	TTG	2	6	3007096	3007101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_022247	TCAT	2	8	3007144	3007151	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5086	NC_022247	GCT	2	6	3009275	3009280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_022247	T	6	6	3009294	3009299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_022247	CTTC	2	8	3010150	3010157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5089	NC_022247	ACA	2	6	3010168	3010173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_022247	GAG	2	6	3010180	3010185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_022247	AG	3	6	3010184	3010189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_022247	CCT	2	6	3013474	3013479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5093	NC_022247	GTG	2	6	3013488	3013493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_022247	GCC	2	6	3013518	3013523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5095	NC_022247	CGGGC	2	10	3013525	3013534	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5096	NC_022247	CTGC	2	8	3015595	3015602	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_022247	GTC	2	6	3016114	3016119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_022247	CGC	2	6	3016141	3016146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_022247	CGT	2	6	3016182	3016187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_022247	CAG	2	6	3016225	3016230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_022247	GC	3	6	3016239	3016244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5102	NC_022247	CGC	2	6	3016321	3016326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_022247	GC	4	8	3016325	3016332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_022247	CGT	2	6	3017239	3017244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_022247	TCAGG	2	10	3017275	3017284	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5106	NC_022247	TCC	2	6	3017342	3017347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5107	NC_022247	CTC	2	6	3017348	3017353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_022247	CAG	2	6	3017354	3017359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_022247	GCCC	2	8	3017371	3017378	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5110	NC_022247	T	7	7	3017391	3017397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_022247	A	6	6	3017423	3017428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_022247	CTT	2	6	3017446	3017451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_022247	GCT	2	6	3017509	3017514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_022247	T	6	6	3017544	3017549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_022247	GGA	2	6	3018442	3018447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_022247	CCG	2	6	3018450	3018455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_022247	CTC	2	6	3019733	3019738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5118	NC_022247	AC	3	6	3021126	3021131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_022247	CCG	2	6	3021222	3021227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_022247	CTT	2	6	3029137	3029142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_022247	AAGC	2	8	3029923	3029930	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5122	NC_022247	GC	3	6	3029948	3029953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5123	NC_022247	CGGC	2	8	3029958	3029965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_022247	CGAT	2	8	3031840	3031847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5125	NC_022247	GAC	2	6	3033424	3033429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_022247	CGGG	2	8	3042006	3042013	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5127	NC_022247	CCT	2	6	3043002	3043007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_022247	AGG	2	6	3043047	3043052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_022247	CTGC	2	8	3043067	3043074	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5130	NC_022247	CTG	2	6	3045822	3045827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_022247	A	6	6	3045875	3045880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_022247	CCG	2	6	3045885	3045890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5133	NC_022247	TGCCG	2	10	3045896	3045905	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5134	NC_022247	CGG	2	6	3046966	3046971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_022247	GAC	2	6	3046976	3046981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5137	NC_022247	CT	3	6	3050481	3050486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5138	NC_022247	GGC	3	9	3050487	3050495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5142	NC_022247	CTGCG	2	10	3056553	3056562	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5143	NC_022247	AGCG	2	8	3057897	3057904	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5144	NC_022247	GGA	2	6	3059938	3059943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5156	NC_022247	A	7	7	3068712	3068718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5157	NC_022247	GAA	6	18	3068775	3068792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5166	NC_022247	T	6	6	3072217	3072222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5167	NC_022247	GTTG	2	8	3072230	3072237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5211	NC_022247	A	8	8	3116491	3116498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5252	NC_022247	GC	3	6	3135781	3135786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5253	NC_022247	CGA	2	6	3138309	3138314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5256	NC_022247	GCC	2	6	3138451	3138456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5257	NC_022247	GT	3	6	3142741	3142746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_022247	TGCTC	2	10	3142784	3142793	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5259	NC_022247	CCT	3	9	3142817	3142825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5260	NC_022247	GTT	2	6	3142862	3142867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5262	NC_022247	GCG	2	6	3142897	3142902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5264	NC_022247	GCAC	2	8	3143002	3143009	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5397	NC_022247	ACG	2	6	3250250	3250255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5398	NC_022247	GGAG	2	8	3252136	3252143	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5399	NC_022247	CTAC	2	8	3253335	3253342	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5400	NC_022247	GAA	2	6	3264615	3264620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5401	NC_022247	GCGG	2	8	3264626	3264633	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5402	NC_022247	TGG	2	6	3268920	3268925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5404	NC_022247	AAG	2	6	3270868	3270873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5411	NC_022247	GC	3	6	3279446	3279451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5418	NC_022247	CTCG	2	8	3281475	3281482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5433	NC_022247	GAA	2	6	3300750	3300755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5435	NC_022247	C	6	6	3302563	3302568	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5438	NC_022247	CGGC	2	8	3305614	3305621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5439	NC_022247	CCG	2	6	3305638	3305643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5441	NC_022247	CACC	2	8	3305688	3305695	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5442	NC_022247	TCG	2	6	3305697	3305702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5487	NC_022247	CGGGT	2	10	3334396	3334405	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5488	NC_022247	AGTGA	2	10	3334407	3334416	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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5493	NC_022247	AAG	2	6	3341343	3341348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5495	NC_022247	CG	3	6	3341438	3341443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5496	NC_022247	GCA	2	6	3341473	3341478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5497	NC_022247	CCA	2	6	3341487	3341492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5498	NC_022247	TCC	2	6	3341497	3341502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5499	NC_022247	CTT	2	6	3341666	3341671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5500	NC_022247	CAG	2	6	3341731	3341736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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