MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 5198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021848	GTA	2	6	69	74	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021848	GTA	2	6	97	102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021848	AGG	2	6	182	187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021848	GCG	2	6	254	259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021848	CGA	2	6	318	323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021848	GAC	2	6	347	352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021848	TCC	2	6	416	421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021848	TAC	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021848	GGA	2	6	725	730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021848	TAC	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021848	AAC	2	6	979	984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021848	TAC	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021848	AGC	2	6	1068	1073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021848	CAT	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021848	AGT	2	6	1141	1146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021848	CCT	2	6	1285	1290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_021848	CTT	2	6	1400	1405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021848	ACG	2	6	1517	1522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021848	GGT	2	6	1617	1622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021848	TTA	2	6	1774	1779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021848	CGG	2	6	1900	1905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021848	ATG	2	6	1976	1981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021848	TAC	2	6	2074	2079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021848	ACC	2	6	2171	2176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_021848	TGG	2	6	2231	2236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021848	TCC	2	6	2257	2262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_021848	GGA	2	6	2274	2279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021848	GGT	2	6	2394	2399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021848	CGG	2	6	2481	2486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021848	TCA	2	6	2509	2514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021848	CGT	2	6	2589	2594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021848	GCT	2	6	2643	2648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021848	ACG	2	6	2824	2829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021848	ACA	2	6	2903	2908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021848	ACA	2	6	3280	3285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021848	AGC	2	6	3308	3313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021848	TTA	2	6	3437	3442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021848	GAT	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021848	TGA	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021848	TCT	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021848	CTC	2	6	3740	3745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_021848	ATG	2	6	3777	3782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021848	TTA	2	6	3786	3791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021848	TGG	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021848	TTC	2	6	4166	4171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021848	CAG	2	6	4272	4277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021848	GAG	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021848	ATA	2	6	4380	4385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021848	TTG	2	6	4386	4391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021848	GCT	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021848	AAG	2	6	5888	5893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021848	AAT	2	6	5901	5906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021848	GTT	2	6	9724	9729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021848	TCA	2	6	11263	11268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021848	TGA	2	6	11277	11282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021848	ACT	2	6	11348	11353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021848	CAA	2	6	11550	11555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021848	AAT	2	6	11642	11647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021848	AAT	2	6	11698	11703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021848	CTT	2	6	11715	11720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021848	GTT	2	6	14780	14785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021848	TGA	2	6	17787	17792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021848	GAG	2	6	18813	18818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021848	GTC	2	6	18903	18908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021848	ATG	2	6	20593	20598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021848	ATA	2	6	22634	22639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021848	AGA	2	6	26726	26731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021848	TAA	2	6	32177	32182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021848	AAT	2	6	32228	32233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021848	TGC	2	6	32300	32305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021848	ATT	2	6	33250	33255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021848	TCT	2	6	39981	39986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021848	CTT	2	6	41088	41093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021848	AAT	2	6	41161	41166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021848	TCG	2	6	52385	52390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021848	CAA	2	6	52522	52527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021848	TAA	2	6	52530	52535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021848	TAT	2	6	52763	52768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021848	CAA	2	6	52793	52798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021848	TAA	2	6	52817	52822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021848	TGT	2	6	57100	57105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021848	TCA	2	6	61253	61258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021848	TTG	2	6	61276	61281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021848	TCC	2	6	62651	62656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_021848	AAT	2	6	62683	62688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021848	TAA	2	6	62710	62715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021848	ATT	2	6	62737	62742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021848	TTA	2	6	69152	69157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021848	AAC	2	6	70205	70210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021848	TGA	2	6	70277	70282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021848	TAA	2	6	70412	70417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021848	GCG	2	6	70428	70433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021848	AGA	2	6	70506	70511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021848	GAT	2	6	70512	70517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021848	CAG	2	6	75094	75099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021848	GAA	2	6	76449	76454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021848	TTA	2	6	76471	76476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021848	TCT	2	6	77997	78002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021848	TGA	2	6	78015	78020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021848	CAT	2	6	78243	78248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021848	AAT	2	6	79344	79349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021848	CAA	2	6	80989	80994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021848	TCT	2	6	81029	81034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021848	GAA	2	6	81103	81108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021848	TAA	2	6	83529	83534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021848	ATG	2	6	83579	83584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021848	ATA	2	6	84073	84078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021848	GTG	2	6	84099	84104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021848	AGG	2	6	84136	84141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021848	ATG	2	6	84178	84183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021848	GAA	2	6	87700	87705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021848	TAA	2	6	87714	87719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021848	TTG	2	6	89324	89329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021848	GAT	2	6	92289	92294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021848	GCT	2	6	92333	92338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021848	TGA	2	6	93721	93726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021848	TGC	2	6	93823	93828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021848	TCC	2	6	94649	94654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_021848	GTG	2	6	94787	94792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021848	ACG	2	6	94805	94810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021848	TCG	2	6	94897	94902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021848	CAA	2	6	95077	95082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021848	AGA	2	6	95133	95138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021848	TGA	2	6	95213	95218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021848	TTA	2	6	95235	95240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021848	TTA	2	6	95338	95343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021848	CAA	2	6	98791	98796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021848	AAC	2	6	98992	98997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021848	CAC	2	6	99065	99070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_021848	ACT	2	6	99135	99140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021848	ATG	2	6	99143	99148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021848	TAG	2	6	99150	99155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021848	TAA	2	6	100468	100473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021848	AGT	2	6	100484	100489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021848	ATT	2	6	100562	100567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021848	ATT	2	6	100641	100646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021848	AAT	2	6	101004	101009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021848	TCA	2	6	101030	101035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021848	ATT	2	6	101057	101062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021848	AGC	2	6	102444	102449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021848	TTA	2	6	104968	104973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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