MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 9505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021848	TGGAT	2	10	1488818	1488827	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_021848	ATTT	2	8	1488833	1488840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_021848	AAAT	2	8	1490357	1490364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_021848	AACC	2	8	1490389	1490396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_021848	ACCT	2	8	1490471	1490478	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4006	NC_021848	TCA	2	6	1490542	1490547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_021848	AAATAA	2	12	1490557	1490568	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_021848	AAT	2	6	1490577	1490582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_021848	ATC	2	6	1490589	1490594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_021848	GC	3	6	1492208	1492213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_021848	CTG	2	6	1492637	1492642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_021848	TTG	2	6	1494396	1494401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_021848	ACA	2	6	1499707	1499712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_021848	CAT	2	6	1499724	1499729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_021848	CAA	2	6	1499737	1499742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_021848	TAG	2	6	1499755	1499760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_021848	ACTTTC	2	12	1499858	1499869	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_021848	CAA	2	6	1499889	1499894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_021848	GAA	2	6	1499913	1499918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_021848	TAG	2	6	1499924	1499929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_021848	GA	3	6	1499952	1499957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_021848	AAG	2	6	1500232	1500237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_021848	AT	3	6	1501129	1501134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_021848	AT	3	6	1501151	1501156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_021848	T	7	7	1501156	1501162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_021848	CAGG	2	8	1501213	1501220	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4027	NC_021848	A	7	7	1503795	1503801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_021848	TTTTA	2	10	1503820	1503829	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_021848	CGG	2	6	1506728	1506733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_021848	TAA	2	6	1506740	1506745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_021848	TGC	2	6	1506766	1506771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_021848	T	6	6	1506861	1506866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_021848	T	6	6	1506967	1506972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_021848	CGG	2	6	1506973	1506978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_021848	ACA	2	6	1506995	1507000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_021848	ACC	2	6	1507067	1507072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_021848	TCA	2	6	1507108	1507113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_021848	AATCG	2	10	1508960	1508969	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4039	NC_021848	TCC	2	6	1508981	1508986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_021848	TTC	2	6	1509014	1509019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_021848	GCT	2	6	1509030	1509035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_021848	TTC	2	6	1509037	1509042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_021848	GTTC	2	8	1512106	1512113	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4044	NC_021848	ACG	2	6	1512147	1512152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_021848	GAC	2	6	1512170	1512175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_021848	GA	3	6	1512180	1512185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_021848	TTG	2	6	1512231	1512236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_021848	AAT	2	6	1512268	1512273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_021848	A	6	6	1512345	1512350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_021848	A	6	6	1512392	1512397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_021848	TAA	2	6	1512444	1512449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_021848	CAA	2	6	1512465	1512470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_021848	GA	4	8	1512501	1512508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_021848	GTC	2	6	1512528	1512533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_021848	AAGC	2	8	1512547	1512554	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4056	NC_021848	T	7	7	1512630	1512636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_021848	CTA	2	6	1512720	1512725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_021848	TC	3	6	1513505	1513510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4059	NC_021848	ATCT	2	8	1513530	1513537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4060	NC_021848	TA	3	6	1513593	1513598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_021848	A	6	6	1513608	1513613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_021848	TGC	2	6	1515033	1515038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_021848	TTTTCA	2	12	1515086	1515097	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4064	NC_021848	TCC	2	6	1517728	1517733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4065	NC_021848	GCT	2	6	1517855	1517860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_021848	TTAT	2	8	1517905	1517912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_021848	TG	3	6	1517953	1517958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_021848	ATT	2	6	1517995	1518000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_021848	TC	3	6	1518027	1518032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4070	NC_021848	ACA	2	6	1518991	1518996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_021848	T	6	6	1519005	1519010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_021848	A	6	6	1519017	1519022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_021848	TCA	2	6	1519082	1519087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_021848	CAA	2	6	1520298	1520303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_021848	A	7	7	1520306	1520312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_021848	CTTTT	2	10	1520334	1520343	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4077	NC_021848	T	7	7	1521090	1521096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_021848	GAT	2	6	1521134	1521139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_021848	AAAGA	2	10	1521190	1521199	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_021848	TCC	2	6	1521223	1521228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4081	NC_021848	ATAA	2	8	1521271	1521278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_021848	GCAA	2	8	1521333	1521340	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4083	NC_021848	ACA	2	6	1522149	1522154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_021848	ACC	2	6	1522157	1522162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_021848	GGT	2	6	1522170	1522175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_021848	CATA	2	8	1522203	1522210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4087	NC_021848	CAA	2	6	1522618	1522623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_021848	T	6	6	1522676	1522681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_021848	ATT	2	6	1522713	1522718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_021848	T	6	6	1522741	1522746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_021848	A	6	6	1522768	1522773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_021848	AAT	2	6	1522796	1522801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_021848	AACAA	2	10	1522802	1522811	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4094	NC_021848	TAA	2	6	1522826	1522831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_021848	TGTA	2	8	1522895	1522902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_021848	A	7	7	1524091	1524097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_021848	TGA	2	6	1526562	1526567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_021848	GTA	2	6	1527583	1527588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_021848	T	6	6	1527608	1527613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_021848	TAG	2	6	1527626	1527631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_021848	AGA	2	6	1527668	1527673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_021848	A	7	7	1527704	1527710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_021848	ATAA	2	8	1527766	1527773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_021848	TAC	2	6	1528996	1529001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_021848	CGA	2	6	1529011	1529016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_021848	AGT	2	6	1529104	1529109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_021848	AAT	2	6	1529113	1529118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_021848	ATG	2	6	1529132	1529137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_021848	ATT	2	6	1529139	1529144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_021848	A	6	6	1533589	1533594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_021848	CAGC	2	8	1533596	1533603	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4112	NC_021848	CT	3	6	1533639	1533644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4113	NC_021848	TTC	2	6	1533648	1533653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_021848	CAT	2	6	1533662	1533667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_021848	A	6	6	1533709	1533714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_021848	ATC	2	6	1533719	1533724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_021848	CA	3	6	1534559	1534564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4118	NC_021848	ATA	2	6	1534643	1534648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_021848	A	6	6	1534653	1534658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_021848	GA	3	6	1534770	1534775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_021848	GA	3	6	1534843	1534848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_021848	CTA	2	6	1535671	1535676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_021848	TTA	2	6	1535726	1535731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_021848	TAA	2	6	1535756	1535761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_021848	CAA	2	6	1535780	1535785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_021848	TA	4	8	1535834	1535841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_021848	TAA	3	9	1535853	1535861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_021848	AAG	2	6	1535917	1535922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_021848	AGCC	2	8	1535970	1535977	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4130	NC_021848	A	6	6	1536006	1536011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_021848	T	7	7	1536033	1536039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_021848	GAA	2	6	1536100	1536105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_021848	ACC	2	6	1536492	1536497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4253	NC_021848	TAGA	2	8	1572875	1572882	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4258	NC_021848	A	7	7	1574923	1574929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_021848	GA	3	6	1575143	1575148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4394	NC_021848	CT	3	6	1634095	1634100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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