MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 9505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021848	AAT	2	6	383145	383150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021848	CGC	2	6	383193	383198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_021848	ATT	2	6	383237	383242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021848	AAT	2	6	383281	383286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021848	CAA	2	6	383329	383334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_021848	AGGC	2	8	383358	383365	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_021848	G	7	7	383380	383386	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021848	ATC	2	6	385027	385032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_021848	TAT	2	6	385033	385038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021848	TG	3	6	385057	385062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_021848	A	7	7	385073	385079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_021848	A	6	6	386039	386044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021848	TTAT	2	8	387624	387631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021848	AAAC	2	8	388576	388583	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_021848	TGAG	2	8	388696	388703	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021848	TGG	2	6	388783	388788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021848	GGAG	2	8	388859	388866	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021848	GAAA	2	8	388872	388879	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021848	ACG	2	6	388893	388898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_021848	ATG	2	6	388928	388933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021848	GT	3	6	388953	388958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021848	GTT	2	6	389002	389007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021848	TTA	2	6	389062	389067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_021848	GCA	2	6	389096	389101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_021848	TTTGT	2	10	389136	389145	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021848	T	6	6	389176	389181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021848	TAAT	2	8	389230	389237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021848	TAA	2	6	389261	389266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021848	CGAA	2	8	389330	389337	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_021848	TTCG	2	8	389350	389357	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_021848	ATTT	2	8	390775	390782	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021848	A	7	7	391914	391920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021848	CTG	2	6	391936	391941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_021848	AAT	2	6	393043	393048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021848	CAT	2	6	393061	393066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_021848	AG	3	6	393069	393074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_021848	G	6	6	393091	393096	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_021848	TGTC	2	8	393144	393151	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_021848	TGA	2	6	393152	393157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021848	GGT	2	6	393173	393178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021848	AGAA	2	8	393233	393240	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021848	A	7	7	393278	393284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021848	GCG	2	6	393296	393301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_021848	GA	3	6	393704	393709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021848	AACT	2	8	393717	393724	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_021848	GTTT	2	8	394702	394709	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021848	AAT	2	6	394712	394717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021848	AT	3	6	394721	394726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021848	TAT	2	6	394745	394750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021848	T	6	6	395804	395809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021848	TA	3	6	397666	397671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021848	T	6	6	397708	397713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021848	T	6	6	397826	397831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021848	AGCT	2	8	397873	397880	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_021848	GAAG	2	8	401425	401432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021848	TTA	2	6	401676	401681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021848	AAT	2	6	401699	401704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_021848	GA	3	6	401708	401713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021848	AAG	2	6	407557	407562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021848	TCT	2	6	407581	407586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_021848	TAAG	2	8	407649	407656	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021848	AAC	2	6	407812	407817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_021848	ATC	2	6	407885	407890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_021848	GC	3	6	407929	407934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_021848	GT	3	6	407950	407955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021848	TAT	2	6	408043	408048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_021848	TTTA	2	8	409480	409487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_021848	AAT	2	6	409494	409499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021848	GGCAA	2	10	409519	409528	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1070	NC_021848	T	6	6	409529	409534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021848	CG	3	6	409598	409603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_021848	T	6	6	410138	410143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021848	TGT	2	6	410202	410207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021848	GAT	2	6	410221	410226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1076	NC_021848	GTC	2	6	410269	410274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_021848	CGT	2	6	410287	410292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1079	NC_021848	T	6	6	410323	410328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_021848	AAGA	2	8	411452	411459	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1082	NC_021848	ATC	2	6	411528	411533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_021848	A	6	6	412839	412844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021848	TAGCT	2	10	412852	412861	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1085	NC_021848	T	6	6	412870	412875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_021848	T	6	6	412893	412898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_021848	A	6	6	412909	412914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1092	NC_021848	T	6	6	416862	416867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_021848	CT	3	6	417714	417719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_021848	TGC	2	6	417751	417756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1096	NC_021848	GT	3	6	417839	417844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_021848	TTTA	2	8	417857	417864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_021848	TGTT	2	8	417875	417882	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021848	AATA	2	8	417895	417902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_021848	TAA	2	6	417985	417990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021848	TCA	2	6	418697	418702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_021848	CAG	2	6	418726	418731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_021848	GTT	2	6	418767	418772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021848	TGC	2	6	418820	418825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_021848	TCC	2	6	418884	418889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_021848	TCT	2	6	418890	418895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_021848	TTGATG	2	12	418971	418982	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021848	GGT	2	6	419142	419147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021848	CAG	2	6	419168	419173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_021848	AAAG	2	8	419215	419222	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021848	GGCA	2	8	419244	419251	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_021848	TAC	2	6	419254	419259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_021848	CGAT	2	8	419297	419304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_021848	AATG	2	8	419322	419329	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021848	TGA	2	6	419355	419360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021848	TGG	2	6	419370	419375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021848	TCT	2	6	419382	419387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_021848	TGA	2	6	419391	419396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_021848	GAA	2	6	419410	419415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021848	CGC	2	6	420700	420705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_021848	A	6	6	420717	420722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021848	GGT	2	6	420737	420742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021848	TTA	3	9	420743	420751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021848	ATT	2	6	424539	424544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021848	ATG	2	6	424552	424557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021848	TA	3	6	424744	424749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021848	CAT	2	6	424763	424768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1132	NC_021848	CT	3	6	431451	431456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_021848	ATT	2	6	431468	431473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021848	T	6	6	431472	431477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021848	CAA	3	9	431555	431563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_021848	T	6	6	432892	432897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1419	NC_021848	TCA	2	6	581774	581779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1421	NC_021848	TTG	2	6	581836	581841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1451	NC_021848	TTG	2	6	597119	597124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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