MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome I

Total Repeats: 9482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021847	ATTT	2	8	252213	252220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021847	CAA	2	6	252301	252306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_021847	TGC	2	6	252370	252375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_021847	AAG	2	6	252429	252434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021847	A	7	7	254934	254940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021847	T	6	6	254964	254969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_021847	CAA	2	6	256417	256422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_021847	AGAA	2	8	256513	256520	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_021847	GCT	2	6	256948	256953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_021847	T	7	7	256985	256991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_021847	GCT	2	6	258229	258234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_021847	GCC	2	6	258272	258277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_021847	TGA	2	6	258417	258422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021847	TG	3	6	258435	258440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021847	ATAA	2	8	258510	258517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021847	GCA	2	6	258541	258546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_021847	CTAT	2	8	258569	258576	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_021847	TCGA	2	8	258579	258586	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_021847	A	6	6	258591	258596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021847	TCA	2	6	259525	259530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_021847	AAG	2	6	259598	259603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021847	TAA	2	6	259661	259666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021847	TCA	2	6	259685	259690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_021847	T	6	6	262618	262623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021847	ATT	2	6	262630	262635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021847	A	6	6	262644	262649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021847	TTA	2	6	262697	262702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021847	TTA	2	6	262779	262784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021847	A	6	6	262791	262796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021847	TGT	2	6	263732	263737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021847	CGA	2	6	264340	264345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_021847	A	7	7	264345	264351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021847	AAC	2	6	264431	264436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_021847	CGC	2	6	264443	264448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_021847	TCG	2	6	264715	264720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_021847	CGC	2	6	265386	265391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_021847	CT	3	6	265474	265479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_021847	AAT	2	6	265492	265497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021847	TG	3	6	265539	265544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021847	A	6	6	265546	265551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021847	TG	3	6	265559	265564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021847	TTTG	2	8	265679	265686	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021847	AAC	2	6	265705	265710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_021847	ATAA	2	8	265722	265729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021847	CCA	2	6	265780	265785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_021847	TCA	2	6	265810	265815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_021847	ACC	2	6	265853	265858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_021847	ACCA	2	8	265915	265922	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_021847	A	6	6	265935	265940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021847	TTA	2	6	265956	265961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021847	A	6	6	265998	266003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021847	A	6	6	266044	266049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021847	TAAAAA	2	12	266284	266295	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021847	T	6	6	266313	266318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021847	CCT	2	6	266712	266717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_021847	CCTTC	2	10	266725	266734	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1057	NC_021847	TCATT	2	10	266740	266749	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1058	NC_021847	CCG	2	6	266835	266840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_021847	C	6	6	266852	266857	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1060	NC_021847	TTA	2	6	266860	266865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021847	CAA	2	6	268386	268391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_021847	CTG	2	6	268423	268428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_021847	AAGG	2	8	268528	268535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_021847	A	6	6	268935	268940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021847	TGTTC	2	10	268973	268982	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1066	NC_021847	TCA	2	6	268995	269000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_021847	ATC	2	6	270257	270262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_021847	ACCA	2	8	270290	270297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_021847	TAA	2	6	270356	270361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021847	ATG	2	6	270450	270455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021847	TA	3	6	272377	272382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_021847	TTTA	2	8	272399	272406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021847	AG	3	6	272463	272468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021847	TTC	2	6	274353	274358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_021847	GAT	2	6	274359	274364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021847	TC	3	6	275457	275462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_021847	GCAG	2	8	275547	275554	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_021847	AGTC	2	8	275590	275597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_021847	AAC	2	6	276493	276498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_021847	AAT	2	6	277031	277036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_021847	CGA	2	6	279223	279228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_021847	A	6	6	279232	279237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021847	T	7	7	279254	279260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021847	CTA	2	6	281780	281785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_021847	CAC	2	6	281804	281809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_021847	CGT	2	6	281819	281824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_021847	TGT	2	6	285094	285099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_021847	CTG	2	6	286382	286387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_021847	ATT	2	6	286547	286552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_021847	CAC	2	6	286575	286580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_021847	CAAAA	2	10	286940	286949	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1092	NC_021847	CTG	2	6	289552	289557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_021847	CTAA	2	8	289706	289713	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_021847	TCCT	2	8	289772	289779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_021847	TAAC	3	12	289793	289804	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_021847	AAC	2	6	293952	293957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_021847	T	6	6	293986	293991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_021847	ATTAA	2	10	294026	294035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021847	C	6	6	294048	294053	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1100	NC_021847	T	6	6	294090	294095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021847	CAC	2	6	294122	294127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_021847	CAA	2	6	294182	294187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_021847	GAA	2	6	294380	294385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021847	AGGA	2	8	294390	294397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021847	ATC	2	6	294433	294438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_021847	GTTG	2	8	294488	294495	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021847	CCA	2	6	294512	294517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_021847	ATC	2	6	294540	294545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_021847	GCGGA	2	10	294734	294743	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1110	NC_021847	AC	3	6	295101	295106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_021847	CGT	2	6	295119	295124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_021847	AGC	2	6	295300	295305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_021847	ACG	2	6	295354	295359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_021847	TGA	2	6	295434	295439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021847	CCG	2	6	295462	295467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_021847	ACC	2	6	295549	295554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_021847	CTC	2	6	295668	295673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_021847	GAG	2	6	295687	295692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_021847	CCA	2	6	295712	295717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_021847	GGT	2	6	295772	295777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021847	CA	3	6	295794	295799	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_021847	GTA	2	6	295869	295874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021847	ATTTCA	2	12	295928	295939	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1124	NC_021847	CAT	2	6	295967	295972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_021847	GCC	2	6	296042	296047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_021847	TAA	2	6	296169	296174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021847	TC	3	6	296296	296301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_021847	ACC	2	6	296326	296331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_021847	CGT	2	6	296426	296431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_021847	C	6	6	296526	296531	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1131	NC_021847	AAG	2	6	296543	296548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021847	GAG	2	6	296657	296662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021847	CA	3	6	296730	296735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_021847	TAC	2	6	296801	296806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1273	NC_021847	TAC	2	6	334808	334813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1399	NC_021847	T	8	8	341849	341856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1400	NC_021847	T	7	7	341859	341865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1401	NC_021847	GCA	2	6	341883	341888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1402	NC_021847	GATT	2	8	343911	343918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1403	NC_021847	A	6	6	344678	344683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1404	NC_021847	AACT	2	8	344713	344720	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1405	NC_021847	AGAATA	2	12	344735	344746	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1411	NC_021847	TGC	2	6	348390	348395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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