MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome I

Total Repeats: 9482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_021847	TGA	2	6	3243817	3243822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_021847	ATG	2	6	3243856	3243861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_021847	ACAA	2	8	3243949	3243956	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9004	NC_021847	TTG	2	6	3243964	3243969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_021847	TGG	2	6	3244057	3244062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_021847	CCT	2	6	3244087	3244092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9007	NC_021847	AGGC	2	8	3244100	3244107	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9008	NC_021847	TGG	2	6	3244173	3244178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_021847	ACC	2	6	3244195	3244200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9010	NC_021847	ACC	2	6	3244230	3244235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9011	NC_021847	TG	3	6	3244283	3244288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_021847	ATC	2	6	3244306	3244311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9013	NC_021847	AGG	2	6	3244317	3244322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_021847	C	6	6	3244399	3244404	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9015	NC_021847	CTAC	2	8	3244415	3244422	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9016	NC_021847	GT	3	6	3244458	3244463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_021847	ACG	2	6	3244559	3244564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_021847	GT	3	6	3244627	3244632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_021847	ATG	2	6	3244652	3244657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_021847	CGT	2	6	3244664	3244669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9021	NC_021847	TCC	2	6	3244678	3244683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9022	NC_021847	GAC	2	6	3244792	3244797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_021847	GCA	2	6	3244804	3244809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9024	NC_021847	TTC	2	6	3244880	3244885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_021847	GCC	2	6	3245123	3245128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9026	NC_021847	C	6	6	3245187	3245192	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9027	NC_021847	ACC	2	6	3245269	3245274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9028	NC_021847	GCT	2	6	3245333	3245338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9029	NC_021847	CTT	2	6	3245358	3245363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_021847	AAT	2	6	3245379	3245384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_021847	ACTAC	2	10	3245395	3245404	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9032	NC_021847	CTT	2	6	3245442	3245447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9033	NC_021847	CA	3	6	3245448	3245453	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9034	NC_021847	CTG	2	6	3245501	3245506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_021847	ATC	2	6	3245551	3245556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9036	NC_021847	TCG	2	6	3245576	3245581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9037	NC_021847	CAT	2	6	3245674	3245679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_021847	CCG	2	6	3245750	3245755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9039	NC_021847	GCC	2	6	3245825	3245830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9040	NC_021847	ATC	2	6	3246002	3246007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9041	NC_021847	CA	3	6	3246018	3246023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9042	NC_021847	GCTT	2	8	3246050	3246057	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9043	NC_021847	TC	3	6	3246071	3246076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9044	NC_021847	GTT	2	6	3246104	3246109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_021847	T	6	6	3246122	3246127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_021847	CTG	2	6	3246166	3246171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9047	NC_021847	GAA	2	6	3246217	3246222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_021847	T	6	6	3246248	3246253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_021847	A	7	7	3246256	3246262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_021847	A	6	6	3246339	3246344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_021847	ACT	2	6	3247615	3247620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9052	NC_021847	TAG	3	9	3247647	3247655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_021847	TAAA	2	8	3247662	3247669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_021847	TCA	2	6	3247671	3247676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9055	NC_021847	TGT	2	6	3247720	3247725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_021847	TAA	2	6	3248789	3248794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_021847	AATG	2	8	3248797	3248804	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_021847	TC	4	8	3251294	3251301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9059	NC_021847	GCT	2	6	3251313	3251318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9060	NC_021847	AAT	2	6	3252700	3252705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_021847	ATATTT	2	12	3252716	3252727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_021847	ATT	2	6	3252753	3252758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_021847	AAT	2	6	3253116	3253121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_021847	A	6	6	3253128	3253133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_021847	T	6	6	3253189	3253194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_021847	AAT	2	6	3253195	3253200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_021847	ATTTAC	2	12	3253246	3253257	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9068	NC_021847	AT	3	6	3253266	3253271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_021847	TAC	2	6	3253272	3253277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9070	NC_021847	ATT	2	6	3253288	3253293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9071	NC_021847	CTA	2	6	3254607	3254612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9072	NC_021847	TCA	2	6	3254613	3254618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9073	NC_021847	GTA	2	6	3254620	3254625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_021847	T	6	6	3254652	3254657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9075	NC_021847	GCTC	2	8	3254694	3254701	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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9077	NC_021847	ACTG	2	8	3255246	3255253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9078	NC_021847	GTG	2	6	3255266	3255271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9079	NC_021847	AGA	2	6	3255461	3255466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9080	NC_021847	TTA	2	6	3255611	3255616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9081	NC_021847	CT	3	6	3255621	3255626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9082	NC_021847	TCA	2	6	3255665	3255670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9083	NC_021847	TAA	2	6	3255703	3255708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9084	NC_021847	TTAA	2	8	3255918	3255925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_021847	ATTG	2	8	3255949	3255956	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_021847	AAC	2	6	3256079	3256084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9087	NC_021847	CTT	2	6	3256150	3256155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9088	NC_021847	CGCT	2	8	3256252	3256259	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9089	NC_021847	CAT	2	6	3256272	3256277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9091	NC_021847	CTG	2	6	3256392	3256397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9092	NC_021847	TGGTTT	2	12	3256551	3256562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9093	NC_021847	ACAA	2	8	3256615	3256622	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9094	NC_021847	GTA	2	6	3256712	3256717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_021847	CTGTT	2	10	3256753	3256762	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9096	NC_021847	CTT	2	6	3256787	3256792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9097	NC_021847	GATT	2	8	3256820	3256827	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_021847	TGT	2	6	3256835	3256840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9099	NC_021847	AGTT	2	8	3256850	3256857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_021847	GAT	2	6	3256889	3256894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_021847	CAA	2	6	3256950	3256955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9102	NC_021847	AGA	2	6	3257033	3257038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_021847	CCT	2	6	3258925	3258930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9104	NC_021847	CT	3	6	3258989	3258994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9105	NC_021847	CTA	2	6	3259004	3259009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9106	NC_021847	ATCGA	2	10	3259041	3259050	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9107	NC_021847	GATT	2	8	3259098	3259105	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_021847	CATAA	2	10	3259132	3259141	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9109	NC_021847	ATA	2	6	3259144	3259149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_021847	ACC	2	6	3259225	3259230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9111	NC_021847	GTTCT	2	10	3259256	3259265	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9112	NC_021847	AAT	2	6	3259286	3259291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_021847	GA	3	6	3259420	3259425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_021847	ACA	2	6	3259480	3259485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9115	NC_021847	TCG	2	6	3259498	3259503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9116	NC_021847	CGT	2	6	3259577	3259582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9118	NC_021847	AAGCT	2	10	3259722	3259731	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9119	NC_021847	A	6	6	3259738	3259743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_021847	A	7	7	3259760	3259766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_021847	TCGT	2	8	3260471	3260478	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9122	NC_021847	TG	3	6	3260493	3260498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_021847	AGC	2	6	3260557	3260562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9124	NC_021847	ATTC	2	8	3262037	3262044	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9125	NC_021847	CAT	2	6	3262092	3262097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9126	NC_021847	CT	3	6	3262151	3262156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9127	NC_021847	A	6	6	3262710	3262715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9128	NC_021847	CCTT	2	8	3262729	3262736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9129	NC_021847	T	7	7	3264946	3264952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9131	NC_021847	T	7	7	3264988	3264994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9396	NC_021847	GCC	2	6	3356771	3356776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.