MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 2581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021822	GGC	2	6	169	174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021822	GCG	2	6	244	249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021822	ATG	2	6	321	326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021822	CGA	2	6	419	424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021822	GAT	2	6	444	449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021822	GCA	2	6	493	498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021822	GAA	2	6	552	557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021822	ATT	2	6	616	621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021822	AGA	2	6	635	640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021822	CAG	2	6	661	666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021822	GGT	2	6	726	731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021822	GGC	2	6	872	877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021822	GAA	2	6	1115	1120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021822	TGC	2	6	1191	1196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021822	GTC	2	6	1203	1208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021822	GGA	2	6	1317	1322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021822	GAC	2	6	1330	1335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021822	TCA	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021822	GGC	2	6	1397	1402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021822	CGT	2	6	1436	1441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021822	CCT	2	6	1678	1683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_021822	GAT	2	6	1689	1694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021822	AGA	3	9	1743	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021822	CGG	2	6	1813	1818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021822	AGG	2	6	2001	2006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021822	CCA	2	6	2031	2036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_021822	CCA	2	6	2121	2126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_021822	ACA	2	6	2213	2218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021822	TTG	2	6	2224	2229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021822	CAT	2	6	2322	2327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021822	TCA	2	6	2361	2366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021822	GTA	2	6	2448	2453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021822	GTA	2	6	2476	2481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021822	AGG	2	6	2561	2566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021822	GCG	2	6	2633	2638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021822	CGA	2	6	2697	2702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021822	GAC	2	6	2726	2731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021822	TCC	2	6	2795	2800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_021822	TAC	2	6	2810	2815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021822	GGA	2	6	3104	3109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021822	TAC	2	6	3227	3232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021822	AAC	2	6	3358	3363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021822	TAC	2	6	3390	3395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021822	AGC	2	6	3447	3452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021822	CAT	2	6	3453	3458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021822	AGT	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021822	CCT	2	6	3664	3669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_021822	CTT	2	6	3779	3784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021822	ACG	2	6	3896	3901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021822	GGT	2	6	3996	4001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021822	TTA	2	6	4153	4158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021822	CGG	2	6	4279	4284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021822	ATG	2	6	4355	4360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021822	TAC	2	6	4453	4458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021822	ACC	2	6	4550	4555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_021822	TGG	2	6	4610	4615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021822	TCC	2	6	4636	4641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_021822	GGA	2	6	4653	4658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021822	GGT	2	6	4773	4778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021822	CGG	2	6	4860	4865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021822	TCA	2	6	4888	4893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021822	CGT	2	6	4968	4973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021822	GCT	2	6	5022	5027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021822	ACG	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021822	ACA	2	6	5282	5287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021822	AAC	2	6	5517	5522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021822	TGA	3	9	5541	5549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021822	AAG	2	6	5765	5770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021822	CTA	2	6	5965	5970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021822	AGC	2	6	5987	5992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021822	CTA	2	6	6567	6572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021822	TCC	2	6	6573	6578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_021822	CAT	2	6	7752	7757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021822	CTT	2	6	9049	9054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021822	CTT	2	6	9109	9114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021822	TCA	2	6	9150	9155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021822	TAG	2	6	10297	10302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021822	GTT	2	6	10347	10352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021822	TTC	2	6	12499	12504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021822	AAT	2	6	12636	12641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021822	TGA	2	6	19875	19880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021822	ACA	2	6	21092	21097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021822	GTG	2	6	26360	26365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021822	ATA	2	6	26387	26392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021822	TAC	2	6	26433	26438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021822	TGG	2	6	27653	27658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021822	TTG	2	6	30097	30102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021822	TCA	2	6	30180	30185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021822	ATT	2	6	31662	31667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021822	ATG	2	6	31684	31689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021822	ATC	2	6	34875	34880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021822	TGT	2	6	34893	34898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021822	CTG	2	6	34939	34944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021822	CAA	2	6	35798	35803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021822	CGA	2	6	36278	36283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021822	GTA	2	6	37291	37296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021822	GGT	2	6	37650	37655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021822	ATA	2	6	38627	38632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021822	GGT	2	6	38673	38678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021822	GCA	2	6	38747	38752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021822	CTA	2	6	38759	38764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021822	ATC	2	6	38857	38862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021822	TGA	2	6	39466	39471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021822	ATT	2	6	39494	39499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021822	ATT	2	6	40500	40505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021822	TAA	2	6	40589	40594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021822	TGT	2	6	40644	40649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021822	AAT	2	6	40667	40672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021822	AGA	2	6	40740	40745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021822	ACC	2	6	40917	40922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_021822	TCA	2	6	40953	40958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021822	GAT	2	6	41370	41375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021822	GGA	2	6	41539	41544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021822	CAT	2	6	41602	41607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021822	TCT	2	6	41650	41655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021822	CTT	2	6	41661	41666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021822	CAA	2	6	41673	41678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021822	AAG	2	6	47728	47733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021822	AAT	2	6	49167	49172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021822	ATG	2	6	50490	50495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021822	GTT	2	6	51882	51887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021822	CTT	2	6	51896	51901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021822	TTG	2	6	52235	52240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021822	TCA	2	6	52250	52255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021822	TGG	2	6	52306	52311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021822	TCG	2	6	52507	52512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021822	TGT	2	6	52638	52643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021822	TAA	2	6	52644	52649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021822	ATG	2	6	52659	52664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021822	TGG	2	6	57210	57215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021822	GAA	2	6	57679	57684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021822	AGG	2	6	57821	57826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021822	ACT	2	6	57894	57899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021822	TCT	2	6	57907	57912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021822	TCT	2	6	57923	57928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021822	AAG	3	9	60179	60187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021822	CAT	2	6	60276	60281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021822	AAG	2	6	60310	60315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021822	TGA	2	6	60526	60531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021822	GTT	2	6	60587	60592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021822	CAG	2	6	60648	60653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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410	NC_021822	AAC	3	9	245652	245660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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444	NC_021822	TGC	2	6	279839	279844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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