MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 4806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021822	CAAA	2	8	1156459	1156466	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_021822	T	7	7	1156527	1156533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_021822	AAG	2	6	1156899	1156904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_021822	ATT	2	6	1161513	1161518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_021822	TCG	2	6	1162533	1162538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_021822	ATAG	2	8	1162789	1162796	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_021822	CAT	2	6	1162811	1162816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_021822	TA	3	6	1162973	1162978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_021822	GAT	2	6	1162980	1162985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_021822	TTTAT	2	10	1166130	1166139	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_021822	TTTG	2	8	1166146	1166153	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_021822	TTA	2	6	1167771	1167776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_021822	ATT	2	6	1167800	1167805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_021822	TTA	2	6	1167810	1167815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_021822	TAT	2	6	1167835	1167840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_021822	ATC	2	6	1167868	1167873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_021822	TAA	2	6	1167913	1167918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_021822	A	6	6	1167921	1167926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_021822	ACA	2	6	1169172	1169177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_021822	TGC	2	6	1169285	1169290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_021822	TACTTC	2	12	1170349	1170360	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_021822	GTT	2	6	1170364	1170369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_021822	AGC	2	6	1170424	1170429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_021822	AAAT	2	8	1170509	1170516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_021822	CAAA	2	8	1170518	1170525	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3026	NC_021822	AAT	2	6	1170557	1170562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_021822	ATC	2	6	1170587	1170592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_021822	TAC	2	6	1170619	1170624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_021822	TAA	2	6	1170664	1170669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_021822	TTG	2	6	1170692	1170697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_021822	T	6	6	1170747	1170752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_021822	CAAT	2	8	1170789	1170796	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3033	NC_021822	CA	3	6	1171810	1171815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_021822	TCA	2	6	1171819	1171824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_021822	G	6	6	1171828	1171833	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_021822	ATG	2	6	1171874	1171879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_021822	TCT	2	6	1172541	1172546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_021822	AAC	2	6	1173054	1173059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_021822	T	6	6	1173095	1173100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_021822	ACA	2	6	1173118	1173123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_021822	CTA	2	6	1174897	1174902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_021822	TCAGC	2	10	1174980	1174989	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3043	NC_021822	TTG	2	6	1179324	1179329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_021822	AC	3	6	1179333	1179338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3045	NC_021822	ACAG	2	8	1179346	1179353	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3046	NC_021822	TAAT	2	8	1179401	1179408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_021822	TTCA	2	8	1179457	1179464	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3048	NC_021822	ATC	2	6	1179488	1179493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_021822	TCA	2	6	1179539	1179544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_021822	TTG	2	6	1179557	1179562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_021822	T	6	6	1180209	1180214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_021822	AATTG	2	10	1180241	1180250	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_021822	CAAA	2	8	1181547	1181554	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3054	NC_021822	GCC	2	6	1181652	1181657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_021822	TAA	2	6	1181667	1181672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_021822	T	6	6	1181723	1181728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_021822	CATA	2	8	1181755	1181762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3058	NC_021822	AT	3	6	1181783	1181788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_021822	TA	3	6	1182761	1182766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_021822	A	6	6	1182803	1182808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_021822	ATT	2	6	1182870	1182875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_021822	GAT	2	6	1182882	1182887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_021822	T	6	6	1183109	1183114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_021822	ATT	2	6	1183134	1183139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_021822	TAA	2	6	1183140	1183145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_021822	CCT	2	6	1185666	1185671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_021822	TTA	2	6	1185729	1185734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_021822	TA	3	6	1186277	1186282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_021822	GA	3	6	1186301	1186306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_021822	GCG	2	6	1189138	1189143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_021822	TTG	2	6	1190441	1190446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_021822	T	6	6	1190476	1190481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_021822	A	8	8	1190514	1190521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_021822	A	6	6	1192359	1192364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_021822	CGC	2	6	1192368	1192373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_021822	GCG	2	6	1192386	1192391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_021822	AGAA	2	8	1192767	1192774	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_021822	TGA	2	6	1194805	1194810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_021822	TTTA	2	8	1194832	1194839	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_021822	TGC	2	6	1194861	1194866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_021822	TTTTA	2	10	1194868	1194877	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_021822	A	6	6	1194907	1194912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_021822	GATT	2	8	1194930	1194937	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_021822	AAT	2	6	1195038	1195043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_021822	CATAT	2	10	1195049	1195058	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3086	NC_021822	TACA	2	8	1195062	1195069	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3087	NC_021822	CAG	2	6	1195073	1195078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_021822	AAT	3	9	1195148	1195156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_021822	ACAA	2	8	1195251	1195258	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3090	NC_021822	AT	3	6	1195279	1195284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_021822	GAA	2	6	1195291	1195296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_021822	TAT	2	6	1195335	1195340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_021822	ATTTTA	2	12	1195366	1195377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_021822	CTAA	2	8	1195397	1195404	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3095	NC_021822	GTA	2	6	1195428	1195433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_021822	TCA	2	6	1195485	1195490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_021822	A	7	7	1196405	1196411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_021822	CAT	2	6	1199211	1199216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_021822	TAA	2	6	1199241	1199246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_021822	AC	3	6	1199256	1199261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_021822	TCG	2	6	1199329	1199334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_021822	TAA	2	6	1201342	1201347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_021822	AACCA	2	10	1201363	1201372	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3104	NC_021822	AAT	2	6	1201398	1201403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_021822	CG	3	6	1201414	1201419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_021822	T	6	6	1201420	1201425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_021822	TAA	2	6	1201451	1201456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_021822	GAT	2	6	1201476	1201481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_021822	AGT	2	6	1201553	1201558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_021822	AATT	2	8	1202891	1202898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_021822	ATG	2	6	1202950	1202955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_021822	AAT	2	6	1202970	1202975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_021822	TGA	2	6	1203969	1203974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_021822	ACC	2	6	1205756	1205761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_021822	T	6	6	1206839	1206844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_021822	TTAG	2	8	1207356	1207363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_021822	GAA	2	6	1207427	1207432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_021822	GAAA	2	8	1207453	1207460	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_021822	AGC	2	6	1207519	1207524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_021822	T	7	7	1211218	1211224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_021822	GTTT	2	8	1211299	1211306	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_021822	GAACA	2	10	1211329	1211338	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3123	NC_021822	AAG	2	6	1211410	1211415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_021822	AATA	2	8	1211456	1211463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_021822	GCC	2	6	1211471	1211476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_021822	GGC	2	6	1211483	1211488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_021822	TTA	2	6	1212532	1212537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_021822	GGTC	2	8	1212689	1212696	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3129	NC_021822	TGA	2	6	1212933	1212938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_021822	CCA	2	6	1213096	1213101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3131	NC_021822	TGAT	2	8	1213160	1213167	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_021822	TGT	2	6	1213191	1213196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_021822	AAG	2	6	1215029	1215034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_021822	CTT	2	6	1215049	1215054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_021822	ACTAG	2	10	1218798	1218807	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3136	NC_021822	CA	3	6	1218811	1218816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3137	NC_021822	TAA	2	6	1218818	1218823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_021822	TGA	2	6	1218831	1218836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3140	NC_021822	CGG	2	6	1218886	1218891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3141	NC_021822	T	6	6	1218929	1218934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_021822	ATC	2	6	1218936	1218941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3143	NC_021822	A	6	6	1218942	1218947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3144	NC_021822	AGC	2	6	1218980	1218985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3146	NC_021822	A	7	7	1219116	1219122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_021822	TTA	2	6	1219132	1219137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3148	NC_021822	AAT	2	6	1219186	1219191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3149	NC_021822	CA	3	6	1219260	1219265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3150	NC_021822	ATT	2	6	1219268	1219273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3151	NC_021822	CCA	2	6	1219292	1219297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3152	NC_021822	AGT	2	6	1219325	1219330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3154	NC_021822	ATA	2	6	1220870	1220875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3155	NC_021822	TGA	2	6	1220919	1220924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3156	NC_021822	TCGT	2	8	1220940	1220947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3157	NC_021822	CTT	2	6	1221312	1221317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3159	NC_021822	A	7	7	1221374	1221380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3160	NC_021822	ATTT	2	8	1223604	1223611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3163	NC_021822	GCA	2	6	1223700	1223705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3164	NC_021822	TA	3	6	1223719	1223724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3165	NC_021822	CT	4	8	1226457	1226464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3166	NC_021822	CCTG	2	8	1227306	1227313	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3167	NC_021822	GA	3	6	1227376	1227381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3169	NC_021822	GCTG	2	8	1228826	1228833	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3170	NC_021822	AATC	2	8	1230258	1230265	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3173	NC_021822	GTT	2	6	1230437	1230442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3174	NC_021822	TA	3	6	1230467	1230472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3175	NC_021822	T	7	7	1230501	1230507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3182	NC_021822	TTTTC	2	10	1230727	1230736	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3185	NC_021822	CATT	2	8	1230806	1230813	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3251	NC_021822	ATCA	2	8	1246333	1246340	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3252	NC_021822	AAT	2	6	1246344	1246349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_021822	T	6	6	1248440	1248445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3254	NC_021822	AAC	2	6	1248517	1248522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3255	NC_021822	ATGC	2	8	1249570	1249577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3256	NC_021822	T	6	6	1249578	1249583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_021822	CAT	2	6	1249618	1249623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3260	NC_021822	TCA	2	6	1249744	1249749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3261	NC_021822	CCA	2	6	1249750	1249755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3262	NC_021822	TAA	2	6	1249760	1249765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3263	NC_021822	T	7	7	1251024	1251030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3264	NC_021822	CAG	2	6	1251031	1251036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3265	NC_021822	TCA	2	6	1251075	1251080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3266	NC_021822	TG	3	6	1251131	1251136	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3267	NC_021822	TAT	2	6	1251666	1251671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3268	NC_021822	TCAAC	2	10	1251829	1251838	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3272	NC_021822	T	7	7	1251980	1251986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3273	NC_021822	CAA	2	6	1252039	1252044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3274	NC_021822	ATTG	2	8	1252047	1252054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3275	NC_021822	ATTT	2	8	1252067	1252074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3279	NC_021822	ATC	2	6	1252630	1252635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3280	NC_021822	A	6	6	1252769	1252774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3281	NC_021822	GTTT	2	8	1254192	1254199	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3282	NC_021822	CAAA	2	8	1254238	1254245	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3283	NC_021822	TCA	2	6	1254273	1254278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3285	NC_021822	CTT	2	6	1256267	1256272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3293	NC_021822	ATTT	2	8	1256504	1256511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3398	NC_021822	TGT	2	6	1268796	1268801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3399	NC_021822	CAA	2	6	1268849	1268854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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