MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 4806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021822	T	6	6	337437	337442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021822	TTG	2	6	338104	338109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021822	TC	3	6	343055	343060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_021822	T	6	6	344588	344593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021822	CTGC	2	8	344672	344679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_021822	AAC	2	6	345157	345162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_021822	TAA	3	9	345174	345182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021822	AATA	2	8	345274	345281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_021822	T	6	6	345295	345300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021822	GTA	2	6	349697	349702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_021822	AAC	2	6	350819	350824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_021822	CAAA	2	8	351256	351263	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_021822	AG	3	6	354448	354453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021822	A	6	6	354535	354540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021822	GTGA	2	8	354581	354588	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021822	AAAT	2	8	356297	356304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021822	AAAT	2	8	356349	356356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021822	TTAT	2	8	356362	356369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021822	ATTA	2	8	356373	356380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021822	TAAA	2	8	356388	356395	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021822	TAA	2	6	356403	356408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021822	ATT	3	9	356452	356460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021822	TTA	2	6	356484	356489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_021822	TTC	2	6	356532	356537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_021822	AAT	2	6	356734	356739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021822	ACA	2	6	357808	357813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_021822	GCGG	2	8	357831	357838	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_021822	TTAG	2	8	358703	358710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021822	GAT	2	6	358776	358781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021822	TGA	2	6	358823	358828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021822	TCG	2	6	361318	361323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_021822	GC	3	6	361356	361361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_021822	GC	3	6	361369	361374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_021822	TCG	2	6	361745	361750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_021822	A	6	6	362016	362021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021822	A	6	6	362030	362035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_021822	TTC	2	6	362046	362051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_021822	TTATT	2	10	362145	362154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021822	GCC	2	6	362155	362160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_021822	CCT	2	6	362190	362195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_021822	T	7	7	363993	363999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021822	TCT	2	6	364038	364043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_021822	CAA	2	6	364047	364052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_021822	AAT	2	6	364164	364169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021822	TTG	2	6	364225	364230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021822	T	6	6	364250	364255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021822	GGC	2	6	366298	366303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_021822	GA	3	6	366322	366327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021822	TG	3	6	367616	367621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021822	AGG	2	6	368940	368945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021822	AAT	2	6	369710	369715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021822	CGG	2	6	369736	369741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_021822	AAG	2	6	370978	370983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021822	ACC	2	6	370996	371001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_021822	GATTG	2	10	371417	371426	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021822	AAT	2	6	371441	371446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021822	AAG	2	6	371452	371457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_021822	AAT	2	6	371571	371576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021822	AC	3	6	371647	371652	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_021822	AAT	2	6	371656	371661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021822	ACTA	2	8	371704	371711	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_021822	GTT	2	6	371751	371756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021822	AT	3	6	371760	371765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_021822	TGA	2	6	371854	371859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021822	TCA	2	6	371903	371908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_021822	ATTC	2	8	371938	371945	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_021822	ACC	2	6	371962	371967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_021822	TGC	2	6	371971	371976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_021822	AG	3	6	372019	372024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021822	TGC	2	6	372056	372061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_021822	CAG	2	6	372063	372068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_021822	GA	3	6	372071	372076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021822	GCC	2	6	373286	373291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_021822	T	6	6	373310	373315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_021822	GA	3	6	373339	373344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021822	CGT	2	6	373357	373362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_021822	AAC	2	6	373411	373416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_021822	TGA	2	6	373844	373849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_021822	TCT	2	6	375757	375762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1081	NC_021822	TGT	2	6	375865	375870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021822	T	6	6	375872	375877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021822	TGG	2	6	375896	375901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021822	CTG	2	6	375986	375991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_021822	GAG	2	6	376007	376012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_021822	TAT	2	6	376030	376035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_021822	T	6	6	376055	376060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_021822	A	6	6	376129	376134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_021822	TAC	2	6	377551	377556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_021822	AAT	2	6	377807	377812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_021822	TA	3	6	377913	377918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021822	CCA	2	6	378687	378692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_021822	A	7	7	378767	378773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021822	ATA	2	6	378799	378804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_021822	TTA	2	6	379235	379240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_021822	TA	3	6	379347	379352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_021822	T	8	8	380027	380034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_021822	TTA	2	6	383347	383352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021822	ACG	2	6	383384	383389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_021822	AGT	2	6	383535	383540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021822	CA	3	6	383549	383554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_021822	TCC	2	6	384468	384473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_021822	AAT	2	6	384479	384484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021822	ATC	2	6	384506	384511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_021822	TCAA	2	8	385877	385884	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_021822	AGT	2	6	385925	385930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021822	A	6	6	386333	386338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021822	GAAA	2	8	386355	386362	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021822	ACGTG	2	10	386375	386384	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1110	NC_021822	TTG	2	6	386400	386405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021822	ACA	2	6	386418	386423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_021822	TTTCC	2	10	387303	387312	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1113	NC_021822	ATA	2	6	388257	388262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021822	A	7	7	388287	388293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021822	TGCATT	2	12	388380	388391	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1116	NC_021822	TATTTT	2	12	388440	388451	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021822	GTG	2	6	388518	388523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_021822	T	6	6	388539	388544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_021822	CAC	2	6	388603	388608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_021822	A	6	6	388609	388614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021822	TTA	2	6	389642	389647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021822	TGA	2	6	389686	389691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021822	AGAT	2	8	389717	389724	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021822	T	7	7	389814	389820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021822	ATC	2	6	389910	389915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_021822	TGAA	2	8	390001	390008	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021822	GGC	2	6	390093	390098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_021822	GTT	2	6	390100	390105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021822	TAA	2	6	390228	390233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_021822	TAA	2	6	390245	390250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021822	ATG	2	6	391312	391317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021822	T	6	6	391323	391328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021822	T	6	6	391331	391336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021822	GAA	2	6	391338	391343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021822	TGA	2	6	391362	391367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_021822	GTT	2	6	391426	391431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_021822	ATG	3	9	391450	391458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1410	NC_021822	TTG	2	6	503118	503123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_021822	TCA	2	6	503132	503137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1412	NC_021822	GACT	2	8	503164	503171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1413	NC_021822	CT	3	6	503170	503175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1414	NC_021822	T	6	6	503186	503191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_021822	TCTCT	2	10	503195	503204	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1416	NC_021822	TTG	2	6	504720	504725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_021822	TAAT	2	8	504791	504798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_021822	AAC	2	6	504799	504804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1419	NC_021822	TA	3	6	507251	507256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_021822	TGA	2	6	507357	507362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_021822	GGTG	2	8	507375	507382	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_021822	A	6	6	507407	507412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_021822	ATT	2	6	510708	510713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_021822	TC	3	6	510826	510831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1425	NC_021822	GCT	2	6	510837	510842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1427	NC_021822	CAA	2	6	511095	511100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1429	NC_021822	ATTT	2	8	511152	511159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_021822	CTT	2	6	511175	511180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1431	NC_021822	GAA	2	6	511219	511224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_021822	GCG	2	6	511247	511252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1433	NC_021822	ATG	2	6	511304	511309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1435	NC_021822	TTCC	2	8	511736	511743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1436	NC_021822	ATCC	2	8	511749	511756	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1439	NC_021822	CGATGA	2	12	511924	511935	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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1443	NC_021822	GGA	2	6	512708	512713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_021822	TAA	2	6	514122	514127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_021822	ATGAA	2	10	514160	514169	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1446	NC_021822	TTA	2	6	514707	514712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1447	NC_021822	CTGA	2	8	515214	515221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1449	NC_021822	TG	3	6	515300	515305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_021822	ACG	2	6	515371	515376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1454	NC_021822	TC	3	6	515507	515512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1455	NC_021822	AG	3	6	515551	515556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1456	NC_021822	T	7	7	516669	516675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_021822	TCCT	2	8	516839	516846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1462	NC_021822	TTG	2	6	521287	521292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1466	NC_021822	TTG	2	6	521901	521906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1481	NC_021822	TTCTT	2	10	526159	526168	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1500	NC_021822	A	6	6	545664	545669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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